EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000002975 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: poly(rC) binding protein 3
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 17331 bases
Position: chrKB743649.1:152814-170144
Accession: 101790607
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000002479	KH_1	PF00013.29	5.8e-56	1	3
ENSAPLP00000002479	KH_1	PF00013.29	5.8e-56	2	3
ENSAPLP00000002479	KH_1	PF00013.29	5.8e-56	3	3
ENSAPLP00000002479	KH_2	PF07650.17	1.4e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000003068	-	1151	XM_005024746	ENSAPLP00000002479	333 (aa)	XP_005024810	U3I5F8

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000002975's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000002975's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAPLG00000002975	-	95	35.075	ENSAPLG00000003217	IGF2BP2	71	35.075
ENSAPLG00000002975	-	95	32.000	ENSAPLG00000011238	FUBP3	62	32.000
ENSAPLG00000002975	-	74	52.857	ENSAPLG00000010856	-	63	52.857
ENSAPLG00000002975	-	76	51.316	ENSAPLG00000010986	-	86	30.000
ENSAPLG00000002975	-	51	34.307	ENSAPLG00000013290	IGF2BP3	59	34.307
ENSAPLG00000002975	-	95	35.036	ENSAPLG00000012620	IGF2BP1	66	35.036
ENSAPLG00000002975	-	97	76.216	ENSAPLG00000008951	-	80	76.216
ENSAPLG00000002975	-	62	40.625	ENSAPLG00000005965	FUBP1	55	40.625

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000002975	-	98	87.768	ENSAPOG00000020003	pcbp3	87	87.768	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000002975	-	95	93.082	ENSAPOG00000016582	-	98	89.489	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000002975	-	100	93.787	ENSAMEG00000001697	-	100	86.066	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000002975	-	95	82.991	ENSACIG00000010933	pcbp3	97	80.818	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000002975	-	98	88.657	ENSACIG00000002739	-	98	88.657	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000002975	-	96	92.542	ENSAOCG00000007806	-	100	92.542	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000002975	-	95	92.114	ENSAOCG00000008592	-	96	92.114	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000002975	-	98	91.463	ENSAPEG00000005209	-	98	91.463	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000002975	-	95	85.924	ENSAPEG00000008011	pcbp3	93	85.924	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000002975	-	95	83.529	ENSATEG00000015787	-	98	83.529	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000002975	-	98	90.854	ENSATEG00000009833	-	98	90.854	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000002975	-	100	88.674	ENSACAG00000004607	-	100	88.674	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000002975	-	99	82.254	ENSACAG00000009819	-	99	82.254	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000002975	-	96	92.857	ENSANAG00000030702	-	100	92.857	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000002975	-	98	92.683	ENSACLG00000003801	-	98	92.683	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000002975	-	95	85.630	ENSACLG00000011835	pcbp3	93	85.630	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000002975	-	97	64.689	ENSAMXG00000001760	zgc:110045	73	64.689	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000002975	-	95	86.804	ENSAMXG00000003440	pcbp3	93	86.804	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000002975	-	95	88.013	ENSAMXG00000013588	-	98	88.013	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000002975	-	88	98.283	ENSCAFG00020019472	-	83	98.283	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000002975	-	100	94.294	ENSCSAG00000007440	-	91	94.294	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000002975	-	100	94.690	ENSCPBG00000012151	-	100	94.690	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000002975	-	97	81.739	ENSCPBG00000000733	-	73	81.739	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000002975	-	98	76.590	ENSCSEG00000016984	-	98	76.590	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000002975	-	95	88.328	ENSCSEG00000000822	pcbp3	97	88.328	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000002975	-	99	92.771	ENSCVAG00000005262	-	99	92.771	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000002975	-	95	85.630	ENSCVAG00000014482	pcbp3	93	85.630	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000002975	-	99	87.324	ENSDARG00000054378	pcbp3	99	87.324	Danio_rerio
ENSAPLG00000002975	-	100	81.381	ENSETEG00000015988	-	100	81.381	Echinops_telfairi
ENSAPLG00000002975	-	96	71.331	ENSEBUG00000016192	pcbp3	99	71.631	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000002975	-	98	78.852	ENSEBUG00000007485	-	92	83.105	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000002975	-	92	70.968	ENSEBUG00000005495	pcbp3	73	70.968	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000002975	-	95	86.471	ENSELUG00000003521	pcbp3	93	86.471	Esox_lucius
ENSAPLG00000002975	-	95	93.060	ENSELUG00000001560	-	97	83.095	Esox_lucius
ENSAPLG00000002975	-	100	95.195	ENSFALG00000003949	-	100	95.195	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000002975	-	97	76.216	ENSFALG00000004411	-	75	76.216	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000002975	-	96	89.062	ENSFHEG00000016615	pcbp3	94	89.062	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000002975	-	99	90.663	ENSFHEG00000006539	-	99	90.663	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000002975	-	95	78.274	ENSGMOG00000011992	pcbp3	95	80.183	Gadus_morhua
ENSAPLG00000002975	-	95	69.725	ENSGMOG00000008611	-	98	69.725	Gadus_morhua
ENSAPLG00000002975	-	98	81.073	ENSGALG00000013155	-	99	79.539	Gallus_gallus
ENSAPLG00000002975	-	100	87.328	ENSGALG00000004394	-	98	92.935	Gallus_gallus
ENSAPLG00000002975	-	95	92.767	ENSGAFG00000010274	-	93	92.767	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000002975	-	97	81.159	ENSGAFG00000011430	pcbp3	95	81.159	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000002975	-	98	90.746	ENSGACG00000002266	-	98	90.746	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000002975	-	98	79.109	ENSGACG00000014955	-	98	79.109	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000002975	-	76	89.744	ENSGAGG00000006956	-	78	89.744	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000002975	-	92	87.189	ENSGAGG00000000271	-	100	87.189	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000002975	-	98	92.683	ENSHBUG00000021782	-	98	92.683	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000002975	-	95	88.959	ENSHBUG00000010697	pcbp3	96	88.959	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000002975	-	95	85.630	ENSHCOG00000017868	pcbp3	93	85.630	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000002975	-	98	88.720	ENSHCOG00000006067	-	98	88.720	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000002975	-	99	90.964	ENSIPUG00000006238	pcbp3	99	90.964	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000002975	-	95	92.138	ENSKMAG00000018530	-	93	92.138	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000002975	-	95	85.924	ENSKMAG00000003046	pcbp3	93	85.924	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000002975	-	98	88.308	ENSLBEG00000006201	pcbp3	96	88.308	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000002975	-	98	77.177	ENSLBEG00000006542	-	98	77.177	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000002975	-	97	76.294	ENSLACG00000010804	zgc:110045	74	76.294	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000002975	-	97	82.385	ENSLACG00000010386	pcbp3	75	82.385	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000002975	-	97	80.870	ENSLOCG00000005058	zgc:110045	81	80.870	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000002975	-	100	92.625	ENSLOCG00000009369	pcbp3	100	92.625	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000002975	-	98	90.549	ENSMAMG00000011620	-	98	90.549	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000002975	-	95	89.274	ENSMAMG00000022336	pcbp3	91	89.274	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000002975	-	95	83.186	ENSMZEG00005008993	pcbp3	96	83.186	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000002975	-	98	82.799	ENSMZEG00005014882	-	98	83.382	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000002975	-	97	76.486	ENSMGAG00000006794	-	75	76.486	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000002975	-	97	83.714	ENSMGAG00000001883	-	97	84.000	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000002975	-	95	88.401	ENSMMOG00000000730	pcbp3	86	88.401	Mola_mola
ENSAPLG00000002975	-	98	89.939	ENSMMOG00000005216	-	98	89.939	Mola_mola
ENSAPLG00000002975	-	72	81.860	ENSMODG00000027884	-	93	81.860	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000002975	-	95	83.776	ENSMALG00000000691	pcbp3	98	79.567	Monopterus_albus
ENSAPLG00000002975	-	100	87.316	ENSMPUG00000001779	-	92	87.316	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000002975	-	95	82.698	ENSNBRG00000016409	-	93	82.698	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000002975	-	99	83.673	ENSNBRG00000016714	-	100	83.673	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000002975	-	96	84.900	ENSOPRG00000003431	-	100	84.900	Ochotona_princeps
ENSAPLG00000002975	-	98	92.683	ENSONIG00000004611	-	98	92.683	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000002975	-	95	84.682	ENSONIG00000012122	-	96	84.682	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000002975	-	100	93.994	ENSOCUG00000002696	-	91	93.994	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000002975	-	98	92.988	ENSORLG00000022739	-	98	92.988	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000002975	-	95	92.114	ENSORLG00000000059	pcbp3	98	92.114	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000002975	-	98	92.683	ENSORLG00020006124	-	98	92.683	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000002975	-	98	90.798	ENSORLG00020012671	pcbp3	97	90.798	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000002975	-	98	90.798	ENSORLG00015000429	pcbp3	97	90.798	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000002975	-	98	91.692	ENSORLG00015008051	-	95	91.692	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000002975	-	98	92.683	ENSOMEG00000020162	-	98	92.683	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000002975	-	95	88.816	ENSOMEG00000020811	pcbp3	99	88.816	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000002975	-	100	85.598	ENSOGAG00000008044	-	100	85.598	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000002975	-	77	84.103	ENSPKIG00000020913	-	84	84.103	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000002975	-	98	91.463	ENSPKIG00000019329	pcbp3	98	91.463	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000002975	-	100	86.012	ENSPSIG00000014970	-	100	86.607	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000002975	-	92	78.846	ENSPSIG00000008350	-	68	78.846	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000002975	-	95	85.546	ENSPMGG00000022383	pcbp3	93	85.546	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPLG00000002975	-	76	89.119	ENSPMAG00000004637	-	100	89.119	Petromyzon_marinus
ENSAPLG00000002975	-	98	71.646	ENSPMAG00000004551	pcbp3	91	71.646	Petromyzon_marinus
ENSAPLG00000002975	-	100	89.045	ENSPCIG00000028092	-	99	93.694	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000002975	-	98	91.159	ENSPLAG00000004074	-	91	91.159	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000002975	-	97	80.627	ENSPLAG00000011449	pcbp3	87	80.627	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000002975	-	95	85.380	ENSPMEG00000021239	pcbp3	93	85.380	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000002975	-	100	86.994	ENSPMEG00000006653	-	100	87.283	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000002975	-	95	87.461	ENSPREG00000015736	pcbp3	97	87.461	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000002975	-	98	90.854	ENSPREG00000020585	-	98	90.854	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000002975	-	98	90.244	ENSPNYG00000013205	-	98	90.244	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000002975	-	95	89.274	ENSPNYG00000012326	pcbp3	93	89.274	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000002975	-	99	93.072	ENSPNAG00000015104	pcbp3	99	93.072	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000002975	-	95	88.571	ENSPNAG00000008541	-	96	88.571	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000002975	-	100	94.595	ENSRNOG00000001245	Pcbp3	100	94.595	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000002975	-	100	84.058	ENSRBIG00000028177	-	100	78.667	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000002975	-	100	94.100	ENSSHAG00000007890	-	100	94.100	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000002975	-	95	93.082	ENSSFOG00015010205	pcbp3	93	93.082	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000002975	-	95	85.337	ENSSFOG00015014706	pcbp3	93	85.337	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000002975	-	99	80.422	ENSSFOG00015007118	-	97	80.422	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000002975	-	95	89.590	ENSSMAG00000011929	pcbp3	95	89.590	Scophthalmus_maximus
ENSAPLG00000002975	-	98	92.988	ENSSMAG00000003135	-	98	92.988	Scophthalmus_maximus
ENSAPLG00000002975	-	95	83.529	ENSSDUG00000011608	pcbp3	97	83.529	Seriola_dumerili
ENSAPLG00000002975	-	95	86.604	ENSSDUG00000008502	-	98	82.075	Seriola_dumerili
ENSAPLG00000002975	-	95	93.082	ENSSLDG00000020161	-	93	93.082	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPLG00000002975	-	95	83.529	ENSSLDG00000008518	pcbp3	97	83.529	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPLG00000002975	-	93	79.672	ENSSPUG00000013214	-	92	85.854	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000002975	-	96	92.881	ENSSPAG00000004190	-	100	92.881	Stegastes_partitus
ENSAPLG00000002975	-	95	72.434	ENSSPAG00000023341	-	93	72.434	Stegastes_partitus
ENSAPLG00000002975	-	99	87.651	ENSTGUG00000008158	-	100	87.651	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000002975	-	100	92.353	ENSTGUG00000003316	-	100	92.353	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000002975	-	95	86.405	ENSTRUG00000013604	pcbp3	93	86.405	Takifugu_rubripes
ENSAPLG00000002975	-	96	92.384	ENSTRUG00000006280	-	92	92.384	Takifugu_rubripes
ENSAPLG00000002975	-	100	87.328	ENSTTRG00000015075	-	100	87.328	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000002975	-	91	75.714	ENSXETG00000010491	pcbp2	74	75.714	Xenopus_tropicalis
ENSAPLG00000002975	-	100	92.035	ENSXETG00000011483	pcbp1	100	92.035	Xenopus_tropicalis
ENSAPLG00000002975	-	95	85.380	ENSXCOG00000020481	pcbp3	93	85.380	Xiphophorus_couchianus
ENSAPLG00000002975	-	95	93.082	ENSXMAG00000028711	-	93	93.082	Xiphophorus_maculatus
ENSAPLG00000002975	-	95	85.924	ENSXMAG00000008175	pcbp3	93	85.924	Xiphophorus_maculatus