EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000002998 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: URB2
Alias: -
Full Name: URB2 ribosome biogenesis homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 16443 bases
Position: chrKB743153.1:1449416-1465858
Accession: 101804822
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000002448	Urb2	PF10441.9	1.1e-25	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000003037	URB2-201	4968	XM_005020234	ENSAPLP00000002448	1493 (aa)	-	U3I5C7

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000002998's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000002998's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000002998	URB2	100	51.000	ENSG00000135763	URB2	99	72.619	Homo_sapiens
ENSAPLG00000002998	URB2	91	38.138	ENSAPOG00000000608	urb2	94	38.207	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000002998	URB2	99	49.769	ENSAMEG00000009206	URB2	97	49.901	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000002998	URB2	99	49.180	ENSAOCG00000019961	urb2	93	49.180	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000002998	URB2	99	49.180	ENSAPEG00000005263	urb2	93	49.180	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000002998	URB2	99	36.196	ENSATEG00000020930	urb2	98	35.957	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000002998	URB2	100	57.256	ENSACAG00000001285	URB2	97	57.256	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000002998	URB2	100	50.933	ENSANAG00000033963	URB2	97	50.933	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000002998	URB2	91	36.939	ENSACLG00000009254	urb2	94	36.630	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000002998	URB2	100	37.795	ENSAMXG00000003474	urb2	97	37.795	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000002998	URB2	99	48.037	ENSBTAG00000010180	URB2	97	48.005	Bos_taurus
ENSAPLG00000002998	URB2	95	70.423	ENSCJAG00000010968	URB2	97	50.766	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000002998	URB2	100	49.667	ENSCAFG00000012118	URB2	97	49.667	Canis_familiaris
ENSAPLG00000002998	URB2	96	49.655	ENSCAFG00020027217	URB2	99	49.655	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000002998	URB2	99	48.040	ENSCHIG00000014513	URB2	97	48.040	Capra_hircus
ENSAPLG00000002998	URB2	99	49.667	ENSTSYG00000006924	URB2	97	49.634	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000002998	URB2	61	54.196	ENSCPOG00000020777	-	96	54.196	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000002998	URB2	100	51.333	ENSCCAG00000023932	URB2	97	51.333	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000002998	URB2	100	50.533	ENSCATG00000043366	URB2	97	50.766	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000002998	URB2	100	49.103	ENSCLAG00000006268	URB2	97	49.103	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000002998	URB2	100	50.600	ENSCSAG00000010599	URB2	97	50.833	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000002998	URB2	70	54.633	ENSCHOG00000010163	URB2	71	54.633	Choloepus_hoffmanni
ENSAPLG00000002998	URB2	100	69.155	ENSCPBG00000006191	URB2	97	69.155	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000002998	URB2	100	50.467	ENSCANG00000023711	URB2	97	50.700	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000002998	URB2	100	47.082	ENSCGRG00001009591	Urb2	97	47.082	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000002998	URB2	100	47.082	ENSCGRG00000011259	Urb2	97	47.082	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000002998	URB2	99	33.272	ENSCSEG00000000299	urb2	97	33.496	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000002998	URB2	99	35.210	ENSCVAG00000011011	urb2	97	34.944	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000002998	URB2	99	38.083	ENSDARG00000003217	urb2	87	57.014	Danio_rerio
ENSAPLG00000002998	URB2	99	45.200	ENSDNOG00000043064	URB2	99	45.503	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000002998	URB2	100	47.748	ENSDORG00000014975	Urb2	97	47.654	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000002998	URB2	95	46.309	ENSETEG00000002869	URB2	92	46.202	Echinops_telfairi
ENSAPLG00000002998	URB2	99	49.900	ENSEASG00005012060	URB2	97	49.669	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000002998	URB2	92	69.014	ENSECAG00000012338	URB2	97	69.014	Equus_caballus
ENSAPLG00000002998	URB2	92	65.493	ENSEEUG00000002669	URB2	89	65.493	Erinaceus_europaeus
ENSAPLG00000002998	URB2	99	41.281	ENSELUG00000014647	urb2	99	40.996	Esox_lucius
ENSAPLG00000002998	URB2	100	50.333	ENSFCAG00000007662	URB2	97	50.333	Felis_catus
ENSAPLG00000002998	URB2	100	76.381	ENSFALG00000003385	URB2	97	76.381	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000002998	URB2	100	48.168	ENSFDAG00000021079	URB2	97	48.168	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000002998	URB2	99	35.776	ENSFHEG00000010357	urb2	97	36.217	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000002998	URB2	50	40.052	ENSGMOG00000012459	urb2	97	37.003	Gadus_morhua
ENSAPLG00000002998	URB2	100	84.288	ENSGALG00000011101	URB2	97	84.288	Gallus_gallus
ENSAPLG00000002998	URB2	99	37.974	ENSGACG00000016179	urb2	97	38.235	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000002998	URB2	100	68.758	ENSGAGG00000021879	URB2	97	68.758	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000002998	URB2	100	50.933	ENSGGOG00000025643	URB2	97	50.898	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000002998	URB2	99	46.341	ENSHBUG00000018469	urb2	93	46.341	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000002998	URB2	100	48.212	ENSHGLG00000016561	URB2	99	48.212	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000002998	URB2	100	46.623	ENSHGLG00100001838	URB2	97	46.623	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000002998	URB2	99	37.696	ENSIPUG00000020315	urb2	97	37.696	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000002998	URB2	100	48.772	ENSSTOG00000025323	URB2	97	48.640	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000002998	URB2	100	48.301	ENSJJAG00000011998	Urb2	97	48.235	Jaculus_jaculus
ENSAPLG00000002998	URB2	99	35.055	ENSKMAG00000020129	urb2	97	34.843	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000002998	URB2	100	51.966	ENSLACG00000002038	URB2	97	51.966	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000002998	URB2	100	42.942	ENSLOCG00000015462	urb2	97	42.914	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000002998	URB2	99	49.934	ENSLAFG00000012484	URB2	97	49.835	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000002998	URB2	100	50.267	ENSMFAG00000039905	URB2	97	50.500	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000002998	URB2	100	50.333	ENSMMUG00000009509	URB2	97	50.566	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000002998	URB2	100	50.533	ENSMNEG00000038762	URB2	97	50.766	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000002998	URB2	100	50.533	ENSMLEG00000043252	URB2	97	50.766	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000002998	URB2	99	35.221	ENSMAMG00000020365	urb2	97	35.445	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000002998	URB2	99	46.341	ENSMZEG00005011027	urb2	93	46.341	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000002998	URB2	97	79.138	ENSMGAG00000012073	URB2	100	79.138	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000002998	URB2	95	66.901	ENSMAUG00000017980	Urb2	97	66.901	Mesocricetus_auratus
ENSAPLG00000002998	URB2	99	50.367	ENSMICG00000033302	URB2	97	50.300	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000002998	URB2	100	47.215	ENSMOCG00000020369	Urb2	97	47.281	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000002998	URB2	99	36.271	ENSMALG00000006529	urb2	97	36.369	Monopterus_albus
ENSAPLG00000002998	URB2	100	47.125	ENSMUSG00000031976	Urb2	97	46.927	Mus_musculus
ENSAPLG00000002998	URB2	100	49.900	ENSMPUG00000012438	URB2	97	49.834	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000002998	URB2	100	47.739	ENSNGAG00000016524	Urb2	97	47.939	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000002998	URB2	100	50.600	ENSNLEG00000014450	URB2	97	50.699	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000002998	URB2	94	56.502	ENSMEUG00000016434	URB2	94	56.502	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000002998	URB2	88	54.167	ENSOPRG00000009906	URB2	85	54.167	Ochotona_princeps
ENSAPLG00000002998	URB2	100	48.908	ENSODEG00000005593	URB2	97	49.040	Octodon_degus
ENSAPLG00000002998	URB2	99	38.653	ENSONIG00000017078	urb2	97	38.210	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000002998	URB2	100	45.303	ENSOANG00000013732	URB2	97	45.037	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPLG00000002998	URB2	99	50.901	ENSOCUG00000010700	URB2	97	51.101	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000002998	URB2	99	35.661	ENSORLG00000010915	urb2	99	35.723	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000002998	URB2	99	35.802	ENSORLG00020003361	urb2	97	35.864	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000002998	URB2	99	35.359	ENSORLG00015001534	urb2	97	35.359	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000002998	URB2	99	35.723	ENSOMEG00000010076	urb2	97	35.786	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000002998	URB2	99	49.599	ENSOGAG00000003021	URB2	97	49.434	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000002998	URB2	99	48.336	ENSOARG00000003102	URB2	97	48.336	Ovis_aries
ENSAPLG00000002998	URB2	100	51.031	ENSPPAG00000040629	URB2	97	50.996	Pan_paniscus
ENSAPLG00000002998	URB2	100	50.365	ENSPPRG00000012767	URB2	97	50.365	Panthera_pardus
ENSAPLG00000002998	URB2	95	68.182	ENSPTIG00000012577	URB2	97	68.182	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000002998	URB2	100	50.832	ENSPTRG00000002092	URB2	97	50.797	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000002998	URB2	100	49.033	ENSPANG00000002245	URB2	97	49.267	Papio_anubis
ENSAPLG00000002998	URB2	100	42.310	ENSPKIG00000005787	urb2	97	42.310	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000002998	URB2	100	67.217	ENSPSIG00000002690	URB2	97	67.217	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000002998	URB2	96	46.468	ENSPEMG00000019551	Urb2	97	46.372	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000002998	URB2	100	52.660	ENSPCIG00000030071	URB2	97	52.660	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000002998	URB2	99	35.912	ENSPFOG00000014330	urb2	97	36.440	Poecilia_formosa
ENSAPLG00000002998	URB2	99	35.125	ENSPLAG00000014654	urb2	97	35.597	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000002998	URB2	99	35.094	ENSPMEG00000012356	urb2	97	35.606	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000002998	URB2	99	35.290	ENSPREG00000010268	urb2	97	35.457	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000002998	URB2	99	50.500	ENSPPYG00000000123	URB2	97	50.666	Pongo_abelii
ENSAPLG00000002998	URB2	99	50.834	ENSPCOG00000023537	URB2	97	50.834	Propithecus_coquereli
ENSAPLG00000002998	URB2	100	45.985	ENSPVAG00000002108	URB2	97	45.853	Pteropus_vampyrus
ENSAPLG00000002998	URB2	91	37.390	ENSPNYG00000016840	urb2	94	37.082	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000002998	URB2	100	39.566	ENSPNAG00000013684	urb2	97	39.316	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000002998	URB2	100	47.024	ENSRNOG00000026853	Urb2	95	46.892	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000002998	URB2	100	50.267	ENSRBIG00000037937	URB2	97	50.500	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000002998	URB2	100	50.400	ENSRROG00000039854	URB2	97	50.633	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000002998	URB2	100	50.733	ENSSBOG00000023055	URB2	97	50.733	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000002998	URB2	100	52.159	ENSSHAG00000014735	URB2	97	52.159	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000002998	URB2	99	41.831	ENSSFOG00015015432	urb2	98	41.963	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000002998	URB2	91	36.242	ENSSMAG00000004984	urb2	95	35.892	Scophthalmus_maximus
ENSAPLG00000002998	URB2	99	35.910	ENSSDUG00000000902	urb2	98	36.228	Seriola_dumerili
ENSAPLG00000002998	URB2	100	63.161	ENSSPUG00000018549	URB2	97	63.161	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000002998	URB2	99	37.333	ENSSPAG00000013632	urb2	97	37.515	Stegastes_partitus
ENSAPLG00000002998	URB2	99	49.501	ENSSSCG00000010186	URB2	97	49.501	Sus_scrofa
ENSAPLG00000002998	URB2	100	76.372	ENSTGUG00000009990	URB2	97	76.238	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000002998	URB2	99	33.696	ENSTRUG00000008173	urb2	97	33.596	Takifugu_rubripes
ENSAPLG00000002998	URB2	99	36.405	ENSTNIG00000017689	urb2	97	36.464	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPLG00000002998	URB2	96	47.715	ENSTTRG00000014864	URB2	93	47.715	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000002998	URB2	99	50.166	ENSUAMG00000015022	URB2	97	50.299	Ursus_americanus
ENSAPLG00000002998	URB2	99	49.967	ENSUMAG00000004728	URB2	97	50.199	Ursus_maritimus
ENSAPLG00000002998	URB2	62	66.667	ENSVPAG00000001750	-	60	66.667	Vicugna_pacos
ENSAPLG00000002998	URB2	100	49.267	ENSVVUG00000006747	URB2	99	49.133	Vulpes_vulpes
ENSAPLG00000002998	URB2	100	46.291	ENSXETG00000023331	urb2	97	46.291	Xenopus_tropicalis
ENSAPLG00000002998	URB2	99	35.593	ENSXMAG00000015059	urb2	97	35.714	Xiphophorus_maculatus