EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000003387 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: pre-mRNA processing factor 18
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 16509 bases
Position: chrKB743037.1:557878-574386
Accession: 101793342
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000002892	PRP4	PF08799.11	2.9e-13	1	1
ENSAPLP00000002892	Prp18	PF02840.15	1.2e-62	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000003486	-	1560	XM_005018848	ENSAPLP00000002892	342 (aa)	-	U3I6M1

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000003387's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
apla03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000003387's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000003387	-	99	91.471	ENSG00000165630	PRPF18	99	91.471	Homo_sapiens
ENSAPLG00000003387	-	99	83.529	ENSAPOG00000024177	prpf18	99	83.529	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000003387	-	99	91.176	ENSAMEG00000013591	-	99	91.176	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000003387	-	99	83.529	ENSACIG00000001186	prpf18	99	83.529	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000003387	-	97	83.183	ENSAOCG00000006572	prpf18	93	81.471	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000003387	-	99	83.529	ENSAPEG00000004564	prpf18	99	83.529	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000003387	-	99	82.059	ENSATEG00000000303	prpf18	99	82.059	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000003387	-	99	90.936	ENSACAG00000000818	-	99	90.936	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000003387	-	99	91.471	ENSANAG00000037445	-	99	91.471	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000003387	-	99	82.941	ENSACLG00000026296	prpf18	99	82.941	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000003387	-	99	82.759	ENSAMXG00000012848	prpf18	99	82.759	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000003387	-	99	90.882	ENSBTAG00000017244	PRPF18	99	90.882	Bos_taurus
ENSAPLG00000003387	-	97	37.609	WBGene00009320	F32B6.3	96	37.609	Caenorhabditis_elegans
ENSAPLG00000003387	-	99	91.471	ENSCJAG00000009432	-	99	91.471	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000003387	-	99	91.176	ENSCAFG00000004735	-	99	91.176	Canis_familiaris
ENSAPLG00000003387	-	99	91.176	ENSCAFG00020007712	-	99	91.176	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000003387	-	99	90.882	ENSCHIG00000000499	-	99	90.882	Capra_hircus
ENSAPLG00000003387	-	99	90.882	ENSTSYG00000003517	-	99	90.882	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000003387	-	99	91.471	ENSCPOG00000021069	-	99	91.471	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000003387	-	99	91.471	ENSCCAG00000036822	-	99	91.471	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000003387	-	99	80.882	ENSCATG00000016633	-	99	80.882	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000003387	-	99	91.176	ENSCLAG00000011770	-	99	91.176	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000003387	-	99	89.112	ENSCSAG00000013109	-	99	89.112	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000003387	-	99	89.548	ENSCPBG00000003100	-	99	90.113	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000003387	-	99	54.227	ENSCING00000020481	-	98	53.448	Ciona_intestinalis
ENSAPLG00000003387	-	99	53.779	ENSCSAVG00000010546	-	99	53.644	Ciona_savignyi
ENSAPLG00000003387	-	99	91.176	ENSCANG00000034900	-	99	91.176	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000003387	-	99	91.471	ENSCGRG00001023665	Prpf18	99	91.471	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000003387	-	99	91.471	ENSCGRG00000014690	Prpf18	99	91.471	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000003387	-	99	80.882	ENSCSEG00000005536	prpf18	99	80.882	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000003387	-	99	82.059	ENSCVAG00000012401	prpf18	99	82.059	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000003387	-	99	83.529	ENSDARG00000058306	prpf18	99	83.529	Danio_rerio
ENSAPLG00000003387	-	99	91.471	ENSDNOG00000035607	-	99	91.471	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000003387	-	99	90.882	ENSDORG00000000858	Prpf18	99	90.882	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000003387	-	99	50.148	FBgn0027784	Prp18	97	50.148	Drosophila_melanogaster
ENSAPLG00000003387	-	99	80.882	ENSETEG00000015060	-	99	80.882	Echinops_telfairi
ENSAPLG00000003387	-	99	67.733	ENSEBUG00000016502	prpf18	98	66.570	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000003387	-	99	91.176	ENSEASG00005019373	-	99	91.176	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000003387	-	99	91.176	ENSECAG00000006997	PRPF18	99	91.176	Equus_caballus
ENSAPLG00000003387	-	92	56.688	ENSEEUG00000001171	-	99	56.688	Erinaceus_europaeus
ENSAPLG00000003387	-	99	80.645	ENSELUG00000022190	prpf18	99	80.645	Esox_lucius
ENSAPLG00000003387	-	99	91.176	ENSFCAG00000004436	-	99	91.176	Felis_catus
ENSAPLG00000003387	-	92	94.118	ENSFALG00000001912	-	97	94.118	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000003387	-	93	94.671	ENSFDAG00000014026	-	99	94.671	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000003387	-	90	64.423	ENSFDAG00000010713	-	88	64.423	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000003387	-	80	87.546	ENSFHEG00000020125	prpf18	98	87.640	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000003387	-	99	79.351	ENSGMOG00000012210	prpf18	99	79.351	Gadus_morhua
ENSAPLG00000003387	-	99	98.824	ENSGALG00000043593	-	99	98.824	Gallus_gallus
ENSAPLG00000003387	-	99	81.176	ENSGAFG00000006034	prpf18	99	81.176	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000003387	-	99	80.000	ENSGACG00000012232	prpf18	99	80.000	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000003387	-	99	93.235	ENSGAGG00000016878	-	99	93.235	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000003387	-	92	90.764	ENSGGOG00000025188	-	96	90.764	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000003387	-	99	82.941	ENSHBUG00000010264	prpf18	99	82.941	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000003387	-	99	91.176	ENSHGLG00000018534	PRPF18	99	91.176	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000003387	-	93	94.357	ENSHGLG00100012161	-	98	94.357	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000003387	-	99	82.059	ENSHCOG00000015987	prpf18	99	82.059	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000003387	-	99	81.429	ENSIPUG00000007432	prpf18	99	83.143	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000003387	-	99	90.882	ENSSTOG00000008735	-	99	90.882	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000003387	-	99	65.797	ENSJJAG00000015191	-	99	65.982	Jaculus_jaculus
ENSAPLG00000003387	-	99	91.471	ENSJJAG00000024041	-	99	91.471	Jaculus_jaculus
ENSAPLG00000003387	-	99	82.647	ENSKMAG00000012124	prpf18	99	82.647	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000003387	-	96	83.180	ENSLBEG00000028466	prpf18	98	81.682	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000003387	-	99	86.176	ENSLACG00000009885	prpf18	99	86.176	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000003387	-	99	88.235	ENSLOCG00000016736	prpf18	99	88.235	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000003387	-	99	91.471	ENSLAFG00000007753	-	99	91.471	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000003387	-	99	91.471	ENSMFAG00000000540	-	99	91.471	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000003387	-	99	91.471	ENSMMUG00000015071	PRPF18	99	93.210	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000003387	-	99	91.471	ENSMNEG00000024679	-	99	91.471	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000003387	-	99	76.176	ENSMLEG00000031715	-	99	76.176	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000003387	-	99	82.353	ENSMAMG00000006610	prpf18	99	82.353	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000003387	-	99	82.941	ENSMZEG00005019392	prpf18	99	82.941	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000003387	-	99	98.824	ENSMGAG00000005023	-	99	98.824	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000003387	-	99	91.176	ENSMICG00000006572	-	99	91.176	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000003387	-	99	91.471	ENSMOCG00000021468	Prpf18	99	91.471	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000003387	-	99	82.353	ENSMMOG00000013012	prpf18	99	82.353	Mola_mola
ENSAPLG00000003387	-	99	82.006	ENSMODG00000024043	-	99	82.006	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000003387	-	96	86.607	ENSMODG00000016902	-	92	86.607	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000003387	-	99	74.561	ENSMALG00000005486	prpf18	99	75.146	Monopterus_albus
ENSAPLG00000003387	-	99	90.882	MGP_CAROLIEiJ_G0023143	Prpf18	100	95.890	Mus_caroli
ENSAPLG00000003387	-	99	90.588	ENSMUSG00000039449	Prpf18	100	95.890	Mus_musculus
ENSAPLG00000003387	-	99	91.176	MGP_PahariEiJ_G0019203	Prpf18	100	95.890	Mus_pahari
ENSAPLG00000003387	-	99	90.294	MGP_SPRETEiJ_G0024061	Prpf18	100	95.890	Mus_spretus
ENSAPLG00000003387	-	99	90.882	ENSMPUG00000000938	-	99	90.882	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000003387	-	99	90.588	ENSMLUG00000009200	-	99	90.588	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000003387	-	99	90.882	ENSNGAG00000012500	-	99	90.882	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000003387	-	67	88.261	ENSNGAG00000023550	-	82	88.261	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000003387	-	99	82.647	ENSNBRG00000001778	prpf18	99	82.647	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000003387	-	99	91.471	ENSNLEG00000012186	-	99	91.471	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000003387	-	76	77.992	ENSMEUG00000005032	-	75	77.992	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000003387	-	77	71.483	ENSOPRG00000002153	-	99	71.483	Ochotona_princeps
ENSAPLG00000003387	-	99	91.176	ENSODEG00000003770	-	99	91.176	Octodon_degus
ENSAPLG00000003387	-	97	82.282	ENSONIG00000014854	prpf18	95	82.282	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000003387	-	99	91.765	ENSOANG00000015404	-	99	91.765	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPLG00000003387	-	99	91.471	ENSOCUG00000027756	-	96	93.272	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000003387	-	99	79.885	ENSORLG00000010293	prpf18	99	79.885	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000003387	-	99	81.471	ENSORLG00020001530	prpf18	99	81.471	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000003387	-	99	81.471	ENSORLG00015013705	prpf18	99	81.471	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000003387	-	99	83.235	ENSOMEG00000009167	prpf18	99	83.235	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000003387	-	99	90.882	ENSOGAG00000007294	-	99	90.882	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000003387	-	99	89.706	ENSOARG00000006243	-	99	89.706	Ovis_aries
ENSAPLG00000003387	-	99	91.471	ENSPPAG00000041959	-	99	91.471	Pan_paniscus
ENSAPLG00000003387	-	99	91.176	ENSPPRG00000000107	-	99	91.176	Panthera_pardus
ENSAPLG00000003387	-	99	91.471	ENSPTIG00000021094	-	99	91.471	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000003387	-	99	91.471	ENSPTRG00000002306	PRPF18	99	91.471	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000003387	-	99	91.176	ENSPANG00000023346	-	99	91.176	Papio_anubis
ENSAPLG00000003387	-	85	98.113	ENSPKIG00000014128	prpf18	95	80.516	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000003387	-	99	93.529	ENSPSIG00000016064	-	99	93.529	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000003387	-	99	77.059	ENSPMGG00000016486	prpf18	99	77.059	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPLG00000003387	-	99	91.176	ENSPEMG00000013704	Prpf18	99	91.176	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000003387	-	99	73.547	ENSPMAG00000000204	prpf18	99	73.547	Petromyzon_marinus
ENSAPLG00000003387	-	92	92.357	ENSPCIG00000012963	-	98	92.357	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000003387	-	99	80.172	ENSPFOG00000017611	prpf18	99	80.172	Poecilia_formosa
ENSAPLG00000003387	-	99	81.765	ENSPLAG00000000369	prpf18	99	81.765	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000003387	-	99	81.765	ENSPMEG00000005183	prpf18	99	81.765	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000003387	-	99	81.765	ENSPREG00000015232	prpf18	99	81.765	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000003387	-	99	91.176	ENSPPYG00000002101	PRPF18	99	91.176	Pongo_abelii
ENSAPLG00000003387	-	99	73.235	ENSPCAG00000010833	-	99	73.235	Procavia_capensis
ENSAPLG00000003387	-	86	94.558	ENSPCOG00000013057	-	93	94.558	Propithecus_coquereli
ENSAPLG00000003387	-	99	55.294	ENSPVAG00000002947	-	99	55.294	Pteropus_vampyrus
ENSAPLG00000003387	-	99	82.647	ENSPNYG00000003554	prpf18	99	82.647	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000003387	-	99	84.241	ENSPNAG00000023151	prpf18	99	84.241	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000003387	-	99	91.176	ENSRNOG00000018396	Prpf18	99	91.176	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000003387	-	99	90.882	ENSRBIG00000028028	-	99	90.882	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000003387	-	99	91.176	ENSRROG00000040695	-	99	91.176	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000003387	-	99	91.471	ENSSBOG00000034482	-	99	91.471	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000003387	-	99	76.696	ENSSHAG00000009669	-	99	76.696	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000003387	-	99	92.647	ENSSHAG00000016463	-	99	92.647	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000003387	-	77	44.528	ENSSFOG00015021154	-	89	48.498	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000003387	-	98	82.216	ENSSFOG00015022118	prpf18	99	76.522	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000003387	-	99	80.882	ENSSMAG00000005308	prpf18	99	80.882	Scophthalmus_maximus
ENSAPLG00000003387	-	99	82.353	ENSSDUG00000015428	prpf18	99	82.353	Seriola_dumerili
ENSAPLG00000003387	-	99	82.353	ENSSLDG00000023989	prpf18	99	82.353	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPLG00000003387	-	99	62.059	ENSSARG00000005307	-	99	62.059	Sorex_araneus
ENSAPLG00000003387	-	99	92.353	ENSSPUG00000002619	-	99	92.353	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000003387	-	99	82.353	ENSSPAG00000019502	prpf18	99	82.353	Stegastes_partitus
ENSAPLG00000003387	-	99	91.176	ENSSSCG00000026354	-	99	91.176	Sus_scrofa
ENSAPLG00000003387	-	99	97.059	ENSTGUG00000002286	-	99	97.059	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000003387	-	99	81.765	ENSTRUG00000011278	prpf18	99	81.765	Takifugu_rubripes
ENSAPLG00000003387	-	99	83.529	ENSTNIG00000000911	prpf18	99	83.529	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPLG00000003387	-	79	100.000	ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	Tupaia_belangeri
ENSAPLG00000003387	-	99	91.765	ENSTTRG00000011117	PRPF18	99	91.765	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000003387	-	91	94.212	ENSUAMG00000001815	-	93	94.212	Ursus_americanus
ENSAPLG00000003387	-	99	86.471	ENSUMAG00000012329	-	99	86.471	Ursus_maritimus
ENSAPLG00000003387	-	99	85.294	ENSVPAG00000011486	-	99	85.294	Vicugna_pacos
ENSAPLG00000003387	-	99	91.176	ENSVVUG00000005453	-	99	91.176	Vulpes_vulpes
ENSAPLG00000003387	-	99	79.300	ENSXETG00000024057	prpf18	99	79.300	Xenopus_tropicalis
ENSAPLG00000003387	-	99	80.409	ENSXCOG00000020414	prpf18	99	80.409	Xiphophorus_couchianus
ENSAPLG00000003387	-	99	81.176	ENSXMAG00000004713	prpf18	90	81.176	Xiphophorus_maculatus