EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000003744 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: RNA polymerase II subunit J
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1380 bases
Position: chrKB742489.1:869079-870458
Accession: 101795435
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000003232	RNA_pol_L_2	PF13656.6	1.1e-29	1	1
ENSAPLP00000003232	RNA_pol_L	PF01193.24	1.2e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000003831	-	393	XM_005010677	ENSAPLP00000003232	101 (aa)	XP_005010734	U3I7L1

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000003744's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
apla03020	RNA polymerase	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000003744's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000003744	-	89	97.778	ENSG00000228049	POLR2J2	80	94.565	Homo_sapiens
ENSAPLG00000003744	-	100	98.020	ENSG00000005075	POLR2J	86	98.020	Homo_sapiens
ENSAPLG00000003744	-	100	92.079	ENSAPOG00000019538	polr2j	86	92.079	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000003744	-	100	89.189	ENSAMEG00000015480	-	87	89.189	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000003744	-	92	64.894	ENSACIG00000014549	POLR2J2	77	64.894	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000003744	-	100	91.089	ENSAOCG00000006937	polr2j	86	91.089	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000003744	-	100	92.079	ENSAPEG00000021761	polr2j	86	92.079	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000003744	-	100	92.079	ENSATEG00000013312	-	86	92.079	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000003744	-	100	92.079	ENSATEG00000009731	polr2j	86	92.079	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000003744	-	100	88.119	ENSACAG00000000251	POLR2J	86	88.119	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000003744	-	100	92.079	ENSACLG00000014564	polr2j	86	92.079	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000003744	-	100	94.059	ENSAMXG00000007517	polr2j	86	94.059	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000003744	-	68	66.667	ENSBTAG00000048046	-	58	66.667	Bos_taurus
ENSAPLG00000003744	-	93	68.085	WBGene00012187	rpb-11	77	68.085	Caenorhabditis_elegans
ENSAPLG00000003744	-	100	98.020	ENSCJAG00000016203	-	86	98.020	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000003744	-	100	98.020	ENSCAFG00000013683	-	86	98.020	Canis_familiaris
ENSAPLG00000003744	-	98	100.000	ENSTSYG00000029243	-	85	100.000	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000003744	-	100	98.020	ENSCPOG00000001401	-	86	98.020	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000003744	-	88	85.870	ENSCATG00000016595	-	97	85.870	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000003744	-	100	98.020	ENSCLAG00000005238	-	86	98.020	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000003744	-	100	98.020	ENSCSAG00000018092	-	86	98.020	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000003744	-	100	78.218	ENSCING00000020531	-	86	78.218	Ciona_intestinalis
ENSAPLG00000003744	-	100	78.218	ENSCSAVG00000006948	-	86	78.218	Ciona_savignyi
ENSAPLG00000003744	-	100	98.020	ENSCGRG00001012814	Polr2j	86	98.020	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000003744	-	100	80.198	ENSCGRG00000008433	Polr2j	86	80.198	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000003744	-	100	91.089	ENSCSEG00000020352	polr2j	86	91.089	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000003744	-	100	91.089	ENSCVAG00000014267	polr2j	86	91.089	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000003744	-	100	93.069	ENSDARG00000035146	polr2j	86	93.069	Danio_rerio
ENSAPLG00000003744	-	100	98.020	ENSDORG00000005934	Polr2j	86	98.020	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000003744	-	98	74.747	FBgn0032634	Rpb11	85	74.747	Drosophila_melanogaster
ENSAPLG00000003744	-	70	83.099	ENSEBUG00000016100	polr2j	82	83.099	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000003744	-	100	98.020	ENSEASG00005016864	-	86	98.020	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000003744	-	100	93.069	ENSELUG00000012822	polr2j	86	93.069	Esox_lucius
ENSAPLG00000003744	-	100	98.020	ENSFCAG00000000377	-	86	98.020	Felis_catus
ENSAPLG00000003744	-	100	98.020	ENSFALG00000009523	POLR2J	86	98.020	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000003744	-	100	98.020	ENSFDAG00000010507	-	86	98.020	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000003744	-	100	92.079	ENSFHEG00000006625	polr2j	86	92.079	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000003744	-	100	92.079	ENSGMOG00000018207	polr2j	86	92.079	Gadus_morhua
ENSAPLG00000003744	-	100	98.020	ENSGALG00000030808	-	86	98.020	Gallus_gallus
ENSAPLG00000003744	-	100	92.079	ENSGAFG00000019555	polr2j	86	92.079	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000003744	-	100	92.079	ENSGACG00000003310	polr2j	86	92.079	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000003744	-	99	100.000	ENSGAGG00000018304	-	91	100.000	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000003744	-	99	96.000	ENSGGOG00000004519	-	80	96.000	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000003744	-	100	92.079	ENSHBUG00000008467	polr2j	86	92.079	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000003744	-	100	98.020	ENSHGLG00000013598	POLR2J	86	98.020	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000003744	-	100	98.020	ENSHGLG00100011242	POLR2J	86	98.020	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000003744	-	100	92.079	ENSHCOG00000014827	polr2j	59	92.079	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000003744	-	100	94.059	ENSIPUG00000023960	polr2j	86	94.059	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000003744	-	100	98.020	ENSSTOG00000006377	POLR2J	86	98.020	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000003744	-	100	92.079	ENSJJAG00000018834	-	86	92.079	Jaculus_jaculus
ENSAPLG00000003744	-	100	98.020	ENSJJAG00000013854	-	86	98.020	Jaculus_jaculus
ENSAPLG00000003744	-	100	92.079	ENSKMAG00000014581	polr2j	68	92.079	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000003744	-	100	92.079	ENSLBEG00000005885	polr2j	86	92.079	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000003744	-	100	94.059	ENSLOCG00000001885	polr2j	77	94.059	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000003744	-	100	98.020	ENSLAFG00000021507	-	86	98.020	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000003744	-	100	86.842	ENSMMUG00000012019	POLR2J	82	98.592	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000003744	-	100	92.079	ENSMAMG00000009374	polr2j	86	92.079	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000003744	-	100	92.079	ENSMZEG00005011932	polr2j	86	92.079	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000003744	-	100	98.020	ENSMGAG00000003534	POLR2J	86	98.020	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000003744	-	100	98.020	ENSMAUG00000013049	Polr2j	86	98.020	Mesocricetus_auratus
ENSAPLG00000003744	-	91	95.652	ENSMICG00000026811	-	92	95.652	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000003744	-	100	98.020	ENSMOCG00000001294	Polr2j	86	98.020	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000003744	-	100	91.089	ENSMMOG00000013265	polr2j	86	91.089	Mola_mola
ENSAPLG00000003744	-	100	88.393	ENSMODG00000013617	-	88	88.393	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000003744	-	100	92.079	ENSMALG00000020749	polr2j	86	92.079	Monopterus_albus
ENSAPLG00000003744	-	100	98.020	MGP_CAROLIEiJ_G0027851	Polr2j	86	98.020	Mus_caroli
ENSAPLG00000003744	-	100	98.020	ENSMUSG00000039771	Polr2j	86	98.020	Mus_musculus
ENSAPLG00000003744	-	100	98.020	MGP_PahariEiJ_G0024434	Polr2j	86	98.020	Mus_pahari
ENSAPLG00000003744	-	100	98.020	MGP_SPRETEiJ_G0028853	Polr2j	86	98.020	Mus_spretus
ENSAPLG00000003744	-	100	98.020	ENSMLUG00000010467	POLR2J	86	98.020	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000003744	-	100	98.020	ENSNGAG00000023412	Polr2j	86	98.020	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000003744	-	100	98.020	ENSODEG00000015648	-	86	98.020	Octodon_degus
ENSAPLG00000003744	-	100	73.267	ENSODEG00000008559	-	85	73.267	Octodon_degus
ENSAPLG00000003744	-	100	92.079	ENSONIG00000000259	polr2j	86	92.079	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000003744	-	100	95.050	ENSOANG00000020912	POLR2J	86	95.050	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPLG00000003744	-	100	89.189	ENSOCUG00000023609	POLR2J	87	89.189	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000003744	-	100	92.079	ENSORLG00000029046	polr2j	72	92.079	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000003744	-	100	92.079	ENSORLG00020007625	polr2j	72	92.079	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000003744	-	100	92.079	ENSORLG00015003457	polr2j	72	92.079	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000003744	-	100	91.089	ENSOMEG00000002097	polr2j	86	91.089	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000003744	-	77	80.682	ENSOGAG00000008250	-	69	80.682	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000003744	-	100	98.020	ENSOARG00000014204	-	84	98.020	Ovis_aries
ENSAPLG00000003744	-	100	98.020	ENSPPRG00000012439	-	86	98.020	Panthera_pardus
ENSAPLG00000003744	-	98	100.000	ENSPTIG00000018714	-	96	100.000	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000003744	-	99	100.000	ENSPSIG00000010173	-	100	100.000	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000003744	-	100	92.079	ENSPMGG00000021256	polr2j	86	92.079	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPLG00000003744	-	100	98.020	ENSPEMG00000015733	Polr2j	86	98.020	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000003744	-	100	98.020	ENSPCIG00000009026	-	86	98.020	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000003744	-	100	92.079	ENSPFOG00000012001	polr2j	86	92.079	Poecilia_formosa
ENSAPLG00000003744	-	100	92.079	ENSPLAG00000014075	polr2j	86	92.079	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000003744	-	100	92.079	ENSPMEG00000020585	polr2j	86	92.079	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000003744	-	100	92.079	ENSPREG00000015255	polr2j	86	92.079	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000003744	-	100	98.020	ENSPCOG00000024573	-	86	98.020	Propithecus_coquereli
ENSAPLG00000003744	-	99	91.000	ENSPVAG00000017770	-	57	91.000	Pteropus_vampyrus
ENSAPLG00000003744	-	100	92.079	ENSPNYG00000014832	polr2j	86	92.079	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000003744	-	100	91.089	ENSPNAG00000016595	polr2j	86	91.089	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000003744	-	100	98.020	ENSRNOG00000001430	Polr2j	86	98.020	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000003744	-	100	98.020	ENSSBOG00000025579	-	86	98.020	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000003744	-	68	100.000	ENSSHAG00000010443	-	81	100.000	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000003744	-	92	91.398	ENSSFOG00015003371	polr2j	70	91.398	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000003744	-	100	92.079	ENSSMAG00000006729	polr2j	86	92.079	Scophthalmus_maximus
ENSAPLG00000003744	-	100	92.079	ENSSDUG00000018490	polr2j	86	92.079	Seriola_dumerili
ENSAPLG00000003744	-	100	92.079	ENSSLDG00000022354	polr2j	86	92.079	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPLG00000003744	-	99	100.000	ENSSPUG00000010802	-	85	100.000	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000003744	-	100	92.079	ENSSPAG00000021953	polr2j	86	92.079	Stegastes_partitus
ENSAPLG00000003744	-	99	84.000	ENSSSCG00000003703	-	71	84.000	Sus_scrofa
ENSAPLG00000003744	-	100	98.020	ENSSSCG00000007688	-	86	98.020	Sus_scrofa
ENSAPLG00000003744	-	99	100.000	ENSTGUG00000004501	-	100	100.000	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000003744	-	68	100.000	ENSTGUG00000004510	-	100	100.000	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000003744	-	100	93.069	ENSTRUG00000020842	polr2j	86	93.069	Takifugu_rubripes
ENSAPLG00000003744	-	100	92.079	ENSTNIG00000002994	polr2j	86	92.079	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPLG00000003744	-	90	76.923	ENSTBEG00000005797	-	60	76.923	Tupaia_belangeri
ENSAPLG00000003744	-	100	98.020	ENSUAMG00000011310	-	86	98.020	Ursus_americanus
ENSAPLG00000003744	-	100	98.020	ENSUMAG00000012594	-	86	98.020	Ursus_maritimus
ENSAPLG00000003744	-	100	96.040	ENSXETG00000001108	polr2j	86	96.040	Xenopus_tropicalis
ENSAPLG00000003744	-	100	92.079	ENSXMAG00000012422	polr2j	86	92.079	Xiphophorus_maculatus