EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000004630 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SMARCAD1
Alias: -
Full Name: SWI/SNF-related%2C matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C containing DEAD/H box 1
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 33161 bases
Position: chrKB743609.1:1985701-2018861
Accession: 101796513
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000004209	ResIII	PF04851.15	2.2e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000004820	SMARCAD1-201	3077	XM_005024418	ENSAPLP00000004209	959 (aa)	-	U3IAD8

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000004630's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000004630's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	52	30.459	ENSAPLG00000006105	ERCC6L2	75	30.459
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	56	36.879	ENSAPLG00000002649	HELLS	71	36.879
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	53	33.706	ENSAPLG00000014366	-	55	33.700
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	54	36.000	ENSAPLG00000009976	CHD1L	51	35.946

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.467	ENSG00000163104	SMARCAD1	100	84.757	Homo_sapiens
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	90	62.709	ENSAPOG00000011446	smarcad1a	78	65.611	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.354	ENSAMEG00000005844	SMARCAD1	94	71.737	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	72	69.346	ENSACIG00000018326	smarcad1a	87	67.200	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	99	63.390	ENSAOCG00000019762	smarcad1a	85	65.611	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	99	63.380	ENSAPEG00000003889	smarcad1a	85	65.762	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	83	66.109	ENSATEG00000015608	smarcad1a	78	68.160	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.981	ENSACAG00000013554	SMARCAD1	93	72.981	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.012	ENSANAG00000020488	SMARCAD1	96	75.485	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	90	62.707	ENSACLG00000017063	smarcad1a	80	67.601	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	81	59.375	ENSAMXG00000019130	smarcad1b	85	60.075	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	73	61.582	ENSAMXG00000015470	smarcad1a	91	64.079	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.325	ENSBTAG00000017061	SMARCAD1	94	71.605	Bos_taurus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	64	43.109	WBGene00010845	M03C11.8	63	42.746	Caenorhabditis_elegans
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.962	ENSCJAG00000006778	SMARCAD1	94	72.239	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.456	ENSCAFG00000010026	SMARCAD1	94	71.737	Canis_familiaris
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	91	76.283	ENSCAFG00020003994	SMARCAD1	98	75.485	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.400	ENSCHIG00000012905	SMARCAD1	94	71.679	Capra_hircus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.887	ENSTSYG00000002706	SMARCAD1	94	72.268	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	97	60.107	ENSCAPG00000016744	SMARCAD1	96	59.338	Cavia_aperea
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.417	ENSCPOG00000011398	SMARCAD1	93	71.562	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.467	ENSCCAG00000022264	SMARCAD1	100	84.925	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.467	ENSCATG00000035663	SMARCAD1	98	75.599	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	87	76.331	ENSCSAG00000004186	SMARCAD1	100	75.503	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	81.677	ENSCPBG00000013203	SMARCAD1	93	80.952	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	69	49.776	ENSCING00000001688	-	99	49.477	Ciona_intestinalis
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.364	ENSCANG00000003556	SMARCAD1	100	84.757	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.182	ENSCGRG00001015056	Smarcad1	94	72.079	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.182	ENSCGRG00000014087	Smarcad1	94	72.079	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	99	62.059	ENSCSEG00000014419	-	83	65.217	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	98	61.582	ENSCSEG00000017903	smarcad1a	83	65.839	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	98	52.045	ENSDARG00000014041	smarcad1a	99	52.020	Danio_rerio
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	82	59.273	ENSDARG00000073721	smarcad1b	98	52.347	Danio_rerio
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.577	ENSDNOG00000000806	-	94	72.474	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	71.546	ENSDORG00000012331	Smarcad1	93	70.829	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	67	46.166	FBgn0032157	Etl1	78	45.821	Drosophila_melanogaster
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	65	46.967	ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	47.087	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.812	ENSEASG00005012382	SMARCAD1	94	72.194	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.812	ENSECAG00000011562	SMARCAD1	94	72.194	Equus_caballus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	91	54.565	ENSELUG00000018535	smarcad1a	90	54.674	Esox_lucius
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	84	56.988	ENSELUG00000019154	smarcad1b	83	56.522	Esox_lucius
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.503	ENSFCAG00000003958	SMARCAD1	100	84.757	Felis_catus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	83.368	ENSFALG00000006089	SMARCAD1	93	83.368	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.962	ENSFDAG00000017027	SMARCAD1	94	72.239	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	90	65.825	ENSFHEG00000012778	smarcad1a	80	63.223	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	89	56.747	ENSGMOG00000018995	smarcad1a	97	56.912	Gadus_morhua
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	86	86.185	ENSGALG00000037339	SMARCAD1	100	86.185	Gallus_gallus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	89	63.722	ENSGAFG00000013498	smarcad1a	80	67.035	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	91	58.032	ENSGACG00000007327	smarcad1a	99	58.523	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	82.006	ENSGAGG00000008582	SMARCAD1	93	81.282	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.467	ENSGGOG00000023001	SMARCAD1	94	71.750	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	89	63.165	ENSHBUG00000011042	smarcad1a	78	67.601	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.990	ENSHGLG00000005070	SMARCAD1	93	72.268	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.990	ENSHGLG00100006812	SMARCAD1	93	72.268	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	82	65.373	ENSHCOG00000007848	smarcad1a	84	65.373	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	53.579	ENSIPUG00000022817	smarcad1b	98	53.579	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	90	60.354	ENSIPUG00000000242	smarcad1a	95	52.345	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.467	ENSSTOG00000001227	SMARCAD1	94	71.853	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.784	ENSJJAG00000022342	Smarcad1	94	72.680	Jaculus_jaculus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	82	64.264	ENSKMAG00000021351	smarcad1a	74	65.683	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	87	63.932	ENSLBEG00000008088	smarcad1a	80	65.879	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	99	58.385	ENSLOCG00000012909	smarcad1a	96	58.617	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	71.340	ENSLAFG00000000040	SMARCAD1	94	70.619	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.887	ENSMFAG00000042606	SMARCAD1	98	75.599	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	91	76.397	ENSMMUG00000022242	SMARCAD1	98	75.599	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.990	ENSMNEG00000038117	SMARCAD1	100	84.925	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.467	ENSMLEG00000038333	SMARCAD1	100	84.757	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	88	64.345	ENSMAMG00000000933	smarcad1a	87	67.119	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	90	62.707	ENSMZEG00005005203	smarcad1a	80	67.601	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	73.375	ENSMGAG00000005577	SMARCAD1	100	73.375	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.389	ENSMAUG00000008417	Smarcad1	94	72.285	Mesocricetus_auratus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.915	ENSMICG00000009746	SMARCAD1	94	72.325	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	71.768	ENSMOCG00000017142	Smarcad1	94	71.665	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	81	60.103	ENSMMOG00000000275	smarcad1a	97	59.202	Mola_mola
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	74.741	ENSMODG00000019268	SMARCAD1	93	73.990	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	88	75.118	MGP_CAROLIEiJ_G0028458	-	72	75.000	Mus_caroli
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	71.606	ENSMUSG00000029920	Smarcad1	94	71.503	Mus_musculus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	71.710	MGP_PahariEiJ_G0022198	Smarcad1	94	71.606	Mus_pahari
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	71.503	MGP_SPRETEiJ_G0029462	Smarcad1	94	71.399	Mus_spretus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.251	ENSMPUG00000002111	SMARCAD1	94	71.634	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	71.840	ENSMLUG00000000425	SMARCAD1	94	71.120	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	71.414	ENSNGAG00000000810	Smarcad1	94	71.311	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	68	65.802	ENSNBRG00000012749	smarcad1a	74	67.360	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.467	ENSNLEG00000014225	SMARCAD1	100	84.757	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.262	ENSODEG00000004334	SMARCAD1	93	71.546	Octodon_degus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	90	58.039	ENSONIG00000015059	smarcad1a	89	58.581	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	85	79.904	ENSOANG00000013764	SMARCAD1	99	80.144	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.652	ENSOCUG00000017283	SMARCAD1	94	71.930	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	96	66.511	ENSORLG00000004869	smarcad1a	83	66.511	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	89	64.759	ENSORLG00020020569	smarcad1a	77	66.511	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	89	64.608	ENSORLG00015009045	smarcad1a	77	66.355	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	89	65.967	ENSOMEG00000023032	smarcad1a	79	66.058	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.194	ENSOGAG00000011444	SMARCAD1	94	71.473	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.400	ENSOARG00000017851	SMARCAD1	94	71.679	Ovis_aries
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.467	ENSPPAG00000035715	SMARCAD1	94	71.750	Pan_paniscus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.503	ENSPPRG00000024756	SMARCAD1	100	84.757	Panthera_pardus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.354	ENSPTIG00000017868	SMARCAD1	94	71.634	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.467	ENSPTRG00000023126	SMARCAD1	100	84.757	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	71.531	ENSPANG00000019757	SMARCAD1	94	70.816	Papio_anubis
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	80.124	ENSPSIG00000010255	SMARCAD1	92	79.400	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	67	65.683	ENSPMGG00000010735	smarcad1a	91	65.683	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	92	65.062	ENSPEMG00000001854	Smarcad1	90	63.407	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	90	51.302	ENSPMAG00000003516	smarcad1a	87	51.299	Petromyzon_marinus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	82	81.749	ENSPCIG00000008137	SMARCAD1	98	81.781	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	88	67.134	ENSPFOG00000019116	smarcad1a	70	67.134	Poecilia_formosa
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	88	66.978	ENSPLAG00000000108	smarcad1a	70	66.978	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	88	67.134	ENSPMEG00000009155	smarcad1a	70	67.134	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	88	67.290	ENSPREG00000018185	smarcad1a	76	67.290	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.606	ENSPPYG00000014935	SMARCAD1	94	71.885	Pongo_abelii
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	83	71.527	ENSPCOG00000020478	SMARCAD1	90	70.564	Propithecus_coquereli
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	71.679	ENSPVAG00000001760	SMARCAD1	94	70.988	Pteropus_vampyrus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	72	62.554	ENSPNYG00000010087	smarcad1a	74	67.040	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	86	58.186	ENSPNAG00000010099	smarcad1b	89	57.497	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	90	56.004	ENSPNAG00000001663	smarcad1a	90	55.780	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	71.591	ENSRNOG00000006391	Smarcad1	94	71.488	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.364	ENSRBIG00000041989	SMARCAD1	94	71.648	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.364	ENSRROG00000035309	SMARCAD1	94	71.648	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.364	ENSSBOG00000032114	SMARCAD1	100	84.925	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	74.534	ENSSHAG00000001279	SMARCAD1	93	73.782	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	80	59.481	ENSSFOG00015020909	smarcad1a	100	59.610	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	99	52.888	ENSSFOG00015016814	smarcad1b	96	52.480	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	90	64.714	ENSSMAG00000001326	smarcad1a	77	68.380	Scophthalmus_maximus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	74	63.483	ENSSDUG00000022338	smarcad1a	76	67.134	Seriola_dumerili
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	89	62.729	ENSSLDG00000024986	smarcad1a	77	66.355	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	62	88.442	ENSSPUG00000004633	SMARCAD1	100	88.442	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	91	63.725	ENSSPAG00000001970	smarcad1a	77	67.073	Stegastes_partitus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.867	ENSSSCG00000009193	SMARCAD1	100	75.414	Sus_scrofa
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	81	86.473	ENSTGUG00000003127	SMARCAD1	100	86.473	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	90	57.798	ENSTNIG00000017585	smarcad1a	99	57.011	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	90	86.310	ENSTBEG00000002789	SMARCAD1	84	86.310	Tupaia_belangeri
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.503	ENSTTRG00000000226	SMARCAD1	96	71.649	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.251	ENSUAMG00000022262	SMARCAD1	92	78.649	Ursus_americanus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.531	ENSUMAG00000004549	SMARCAD1	94	71.811	Ursus_maritimus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	100	72.251	ENSVVUG00000007271	SMARCAD1	100	75.059	Vulpes_vulpes
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	91	65.045	ENSXETG00000019214	smarcad1	100	65.643	Xenopus_tropicalis
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	79	60.841	ENSXCOG00000005232	smarcad1a	78	65.823	Xiphophorus_couchianus
ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	85	63.150	ENSXMAG00000015350	smarcad1a	72	66.822	Xiphophorus_maculatus