EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000004681 (Gene tree)
Gene ID: 101800472
Gene Symbol: FDXACB1
Alias: -
Full Name: ferredoxin-fold anticodon binding domain containing 1
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3646 bases
Position: chrKB746795.1:24711-28356
Accession: 101800472
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000004196	FDX-ACB	PF03147.14	8.5e-16	1	1
ENSAPLP00000004200	FDX-ACB	PF03147.14	8.7e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000004810	FDXACB1-202	1827	XM_005030870	ENSAPLP00000004200	608 (aa)	-	U3IAC9
ENSAPLT00000004805	FDXACB1-201	1866	XM_005030869	ENSAPLP00000004196	621 (aa)	XP_005030926	U3IAC5

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	47.528	ENSG00000255561	FDXACB1	100	47.528	Homo_sapiens
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	100	35.456	ENSAPOG00000009041	FDXACB1	100	35.456	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	100	35.456	ENSAPOG00000009726	fdxacb1	100	35.456	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	100	36.207	ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	36.193	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	100	36.538	ENSAOCG00000007455	fdxacb1	100	36.735	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	100	36.095	ENSAPEG00000023857	fdxacb1	100	36.095	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	100	34.599	ENSATEG00000020757	fdxacb1	100	34.934	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	47.368	ENSANAG00000022744	FDXACB1	100	47.368	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	100	35.714	ENSACLG00000020497	fdxacb1	100	35.714	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	100	35.714	ENSACLG00000027415	-	100	35.714	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	100	40.096	ENSAMXG00000038372	fdxacb1	100	40.096	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	48.160	ENSBTAG00000004949	FDXACB1	100	48.160	Bos_taurus
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	47.049	ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	47.049	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	48.800	ENSCAFG00020006314	FDXACB1	100	48.800	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	48.558	ENSCHIG00000017261	FDXACB1	100	48.558	Capra_hircus
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	47.764	ENSTSYG00000029218	FDXACB1	100	47.764	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	53	39.701	ENSCAPG00000010478	-	86	39.701	Cavia_aperea
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	46.538	ENSCPOG00000032584	FDXACB1	99	46.538	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	46.805	ENSCCAG00000024232	FDXACB1	100	46.805	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	46.965	ENSCATG00000035600	FDXACB1	100	46.965	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	47.596	ENSCLAG00000015613	FDXACB1	100	47.596	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	47.049	ENSCSAG00000002878	FDXACB1	100	47.049	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	46.486	ENSCHOG00000003037	FDXACB1	99	46.805	Choloepus_hoffmanni
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	100	61.404	ENSCPBG00000009087	FDXACB1	100	61.404	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	47.049	ENSCANG00000043844	FDXACB1	100	47.049	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	100	46.571	ENSCGRG00001023825	Fdxacb1	98	46.571	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	100	46.571	ENSCGRG00000001752	Fdxacb1	98	46.571	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	100	34.891	ENSCSEG00000006964	fdxacb1	100	34.891	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	100	37.199	ENSCVAG00000013005	fdxacb1	100	37.160	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	100	40.872	ENSDARG00000095750	fdxacb1	100	40.872	Danio_rerio
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	46.582	ENSDNOG00000037748	FDXACB1	100	46.423	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	45.440	ENSDORG00000028060	Fdxacb1	100	45.440	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	48.243	ENSETEG00000004898	FDXACB1	99	48.243	Echinops_telfairi
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	48.160	ENSEASG00005007198	FDXACB1	100	48.160	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	48.320	ENSECAG00000009561	FDXACB1	100	48.320	Equus_caballus
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	83	56.881	ENSEEUG00000009839	FDXACB1	83	56.881	Erinaceus_europaeus
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	79	40.708	ENSELUG00000011250	fdxacb1	96	33.994	Esox_lucius
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	48.160	ENSFCAG00000024559	FDXACB1	100	48.160	Felis_catus
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	71.036	ENSFALG00000006177	FDXACB1	99	71.036	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	46.549	ENSFDAG00000016115	FDXACB1	100	46.709	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	100	36.637	ENSFHEG00000016602	fdxacb1	100	36.637	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	80.161	ENSGALG00000007967	FDXACB1	100	80.161	Gallus_gallus
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	100	37.160	ENSGAFG00000001162	fdxacb1	95	37.160	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	100	36.392	ENSGACG00000020639	fdxacb1	99	36.392	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	100	61.404	ENSGAGG00000020645	FDXACB1	98	61.863	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	47.687	ENSGGOG00000037643	FDXACB1	100	47.687	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	100	35.565	ENSHBUG00000003489	fdxacb1	100	35.565	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	46.388	ENSHGLG00000004171	FDXACB1	100	46.388	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	46.388	ENSHGLG00100017458	FDXACB1	100	46.388	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	34.585	ENSHCOG00000018986	fdxacb1	99	34.585	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	100	40.968	ENSIPUG00000022559	FDXACB1	100	40.968	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	47.596	ENSJJAG00000010367	Fdxacb1	100	47.596	Jaculus_jaculus
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	100	38.622	ENSKMAG00000022235	fdxacb1	100	38.622	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	100	35.044	ENSLBEG00000016100	fdxacb1	100	35.044	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	88	61.905	ENSLACG00000018780	FDXACB1	99	61.905	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	47.687	ENSLAFG00000014650	FDXACB1	100	47.687	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	47.368	ENSMFAG00000002448	FDXACB1	100	47.368	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	47.209	ENSMNEG00000041539	FDXACB1	100	47.209	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	100	34.261	ENSMAMG00000018674	fdxacb1	99	34.261	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	100	35.714	ENSMZEG00005018799	fdxacb1	100	35.714	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	46.388	ENSMAUG00000019310	Fdxacb1	99	46.388	Mesocricetus_auratus
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	48.397	ENSMICG00000045510	FDXACB1	100	48.397	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	47.910	ENSMOCG00000011835	Fdxacb1	99	47.910	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	38.126	ENSMMOG00000018749	fdxacb1	99	38.126	Mola_mola
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	62	50.000	ENSMALG00000007153	fdxacb1	82	50.000	Monopterus_albus
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	46.795	MGP_CAROLIEiJ_G0032197	Fdxacb1	99	46.795	Mus_caroli
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	46.795	ENSMUSG00000037845	Fdxacb1	99	46.795	Mus_musculus
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	46.635	MGP_PahariEiJ_G0015065	Fdxacb1	99	46.635	Mus_pahari
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	46.795	MGP_SPRETEiJ_G0033336	Fdxacb1	99	46.795	Mus_spretus
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	50.000	ENSMPUG00000003585	FDXACB1	100	50.000	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	46.326	ENSMLUG00000014872	FDXACB1	100	46.326	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	46.154	ENSNGAG00000014606	Fdxacb1	100	46.154	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	100	36.834	ENSNBRG00000006939	fdxacb1	100	36.834	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	47.687	ENSNLEG00000030387	FDXACB1	100	47.687	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	100	47.937	ENSMEUG00000003077	FDXACB1	99	47.937	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	46.006	ENSOPRG00000012593	FDXACB1	99	46.006	Ochotona_princeps
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	47.756	ENSODEG00000010360	FDXACB1	100	47.756	Octodon_degus
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	100	36.977	ENSONIG00000004939	fdxacb1	100	36.977	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	100	44.283	ENSOANG00000003844	-	100	44.283	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	100	35.182	ENSORLG00020008420	fdxacb1	100	35.371	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	100	38.024	ENSOMEG00000019353	fdxacb1	100	38.209	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	48.558	ENSOARG00000015064	FDXACB1	99	48.558	Ovis_aries
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	47.528	ENSPPAG00000030196	FDXACB1	100	47.528	Pan_paniscus
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	47.680	ENSPPRG00000005967	FDXACB1	100	47.680	Panthera_pardus
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	47.840	ENSPTIG00000016420	FDXACB1	100	47.840	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	47.528	ENSPTRG00000004272	FDXACB1	100	47.528	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	46.730	ENSPANG00000019268	FDXACB1	100	46.730	Papio_anubis
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	100	42.448	ENSPKIG00000009407	fdxacb1	100	42.448	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	89	47.387	ENSPMGG00000004912	fdxacb1	99	47.387	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	46.250	ENSPEMG00000020188	Fdxacb1	99	46.250	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	100	37.331	ENSPFOG00000022156	fdxacb1	100	37.331	Poecilia_formosa
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	100	37.331	ENSPLAG00000019966	fdxacb1	100	37.331	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	100	37.331	ENSPMEG00000002110	fdxacb1	100	37.331	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	100	36.186	ENSPREG00000017453	fdxacb1	100	36.186	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	47.528	ENSPPYG00000003866	FDXACB1	99	47.528	Pongo_abelii
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	100	47.680	ENSPCAG00000000333	FDXACB1	100	47.695	Procavia_capensis
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	48.320	ENSPCOG00000027443	FDXACB1	100	48.320	Propithecus_coquereli
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	48.083	ENSPVAG00000009610	FDXACB1	99	48.083	Pteropus_vampyrus
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	100	35.661	ENSPNYG00000012981	fdxacb1	100	35.661	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	100	40.829	ENSPNAG00000003284	fdxacb1	100	40.829	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	37.480	ENSRNOG00000010743	Fdxacb1	97	37.480	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	47.209	ENSRBIG00000014195	FDXACB1	100	47.209	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	47.209	ENSRROG00000045453	FDXACB1	100	47.209	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	47.528	ENSSBOG00000027732	FDXACB1	100	47.528	Saimiri_boliviensis_boliviensis
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