EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000004946 (Gene tree)
Gene ID: 101793985
Gene Symbol: PUSL1
Alias: -
Full Name: pseudouridine synthase like 1
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 23745 bases
Position: chrKB742382.1:433484-457228
Accession: 101793985
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000004494	PseudoU_synth_1	PF01416.20	1.1e-35	1	2
ENSAPLP00000004494	PseudoU_synth_1	PF01416.20	1.1e-35	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000005110	PUSL1-201	897	XM_005008821	ENSAPLP00000004494	299 (aa)	XP_005008878	U3IB72

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000004946's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000004946's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000004946	PUSL1	96	54.325	ENSG00000169972	PUSL1	97	52.846	Homo_sapiens
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	51.812	ENSAPOG00000016290	pusl1	92	51.812	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	54.745	ENSAMEG00000013752	PUSL1	90	54.745	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	50.000	ENSACIG00000015240	pusl1	100	50.000	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	50.725	ENSAOCG00000019419	pusl1	83	50.725	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	50.725	ENSAPEG00000005452	pusl1	92	50.725	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	52.899	ENSATEG00000024154	pusl1	92	52.899	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	86	61.868	ENSACAG00000014111	PUSL1	97	61.868	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000004946	PUSL1	96	54.671	ENSANAG00000037456	PUSL1	94	54.671	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	51.986	ENSACLG00000008675	pusl1	92	51.986	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000004946	PUSL1	93	53.069	ENSAMXG00000044007	pusl1	94	53.069	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	93	55.357	ENSBTAG00000007619	PUSL1	95	55.357	Bos_taurus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	96	54.325	ENSCJAG00000010972	PUSL1	94	54.325	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	96	50.523	ENSCAFG00000019291	PUSL1	94	50.523	Canis_familiaris
ENSAPLG00000004946	PUSL1	96	51.389	ENSCAFG00020011568	PUSL1	94	51.389	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	55.957	ENSCHIG00000012615	PUSL1	95	55.957	Capra_hircus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	97	53.584	ENSCPOG00000005149	PUSL1	94	53.584	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	96	55.017	ENSCCAG00000027475	PUSL1	94	55.017	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	96	55.017	ENSCATG00000018260	PUSL1	94	55.017	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	55.235	ENSCLAG00000005232	PUSL1	90	55.235	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000004946	PUSL1	96	55.017	ENSCSAG00000000680	PUSL1	94	55.017	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	94	71.986	ENSCPBG00000022621	PUSL1	97	71.986	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000004946	PUSL1	96	54.671	ENSCANG00000034373	PUSL1	94	54.671	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	53.237	ENSCGRG00001012429	Pusl1	94	53.237	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	52.708	ENSCGRG00000006466	Pusl1	94	52.708	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	52.000	ENSCSEG00000005159	pusl1	92	52.000	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000004946	PUSL1	80	43.333	ENSCVAG00000012923	pusl1	91	43.333	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	94	54.448	ENSDARG00000074565	pusl1	98	54.448	Danio_rerio
ENSAPLG00000004946	PUSL1	64	30.000	ENSDNOG00000045576	PUS1	52	30.000	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	33.333	FBgn0083976	CG34140	99	33.333	Drosophila_melanogaster
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	55.072	ENSECAG00000006248	PUSL1	90	55.072	Equus_caballus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	91	52.878	ENSEEUG00000000837	PUSL1	93	52.878	Erinaceus_europaeus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	94	54.286	ENSELUG00000015945	pusl1	95	54.286	Esox_lucius
ENSAPLG00000004946	PUSL1	97	52.941	ENSFCAG00000007617	PUSL1	96	52.941	Felis_catus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	51.986	ENSFHEG00000006370	pusl1	92	51.986	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	54.513	ENSGMOG00000019388	pusl1	98	54.513	Gadus_morhua
ENSAPLG00000004946	PUSL1	94	86.525	ENSGALG00000001714	PUSL1	97	86.525	Gallus_gallus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	51.986	ENSGAFG00000007546	pusl1	94	51.986	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000004946	PUSL1	98	48.299	ENSGACG00000007848	pusl1	96	48.299	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	94	72.340	ENSGAGG00000004730	PUSL1	97	72.340	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000004946	PUSL1	85	54.688	ENSGGOG00000005364	PUSL1	98	54.688	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	51.986	ENSHBUG00000001264	pusl1	92	51.986	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	55.596	ENSHGLG00000017570	PUSL1	90	55.596	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000004946	PUSL1	88	55.303	ENSHGLG00100007641	PUSL1	87	55.303	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	52.174	ENSHCOG00000010077	pusl1	100	52.174	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000004946	PUSL1	94	54.643	ENSIPUG00000023921	pusl1	96	54.643	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	93	54.093	ENSSTOG00000001783	PUSL1	87	54.093	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	54.874	ENSJJAG00000020471	Pusl1	93	54.874	Jaculus_jaculus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	88	51.136	ENSKMAG00000005154	pusl1	89	51.136	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	95	52.265	ENSLBEG00000013469	pusl1	98	52.265	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000004946	PUSL1	64	57.292	ENSLACG00000018795	PUSL1	95	57.292	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000004946	PUSL1	98	55.973	ENSLOCG00000002210	pusl1	96	57.092	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	87	53.435	ENSLAFG00000013685	PUSL1	97	53.435	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000004946	PUSL1	96	55.017	ENSMFAG00000046288	PUSL1	94	55.017	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000004946	PUSL1	96	47.619	ENSMMUG00000016279	PUSL1	94	47.619	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000004946	PUSL1	96	55.017	ENSMNEG00000037989	PUSL1	94	55.017	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000004946	PUSL1	93	52.878	ENSMAMG00000016538	pusl1	91	52.878	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	51.986	ENSMZEG00005026990	pusl1	92	51.986	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000004946	PUSL1	77	30.204	ENSMGAG00000000851	PUS3	56	30.204	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000004946	PUSL1	94	85.461	ENSMGAG00000003037	PUSL1	96	85.461	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	53.430	ENSMAUG00000019924	Pusl1	94	53.430	Mesocricetus_auratus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	53.091	ENSMICG00000014171	PUSL1	93	53.091	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	53.791	ENSMOCG00000005602	Pusl1	94	53.791	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	50.896	ENSMMOG00000003269	pusl1	99	50.896	Mola_mola
ENSAPLG00000004946	PUSL1	93	53.405	ENSMALG00000021686	pusl1	92	53.405	Monopterus_albus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	52.708	MGP_CAROLIEiJ_G0026911	Pusl1	94	52.708	Mus_caroli
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	52.708	ENSMUSG00000051557	Pusl1	94	52.708	Mus_musculus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	53.069	MGP_PahariEiJ_G0029260	Pusl1	94	53.069	Mus_pahari
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	53.069	MGP_SPRETEiJ_G0027906	Pusl1	94	53.069	Mus_spretus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	97	52.414	ENSMPUG00000014313	PUSL1	95	52.414	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000004946	PUSL1	91	56.522	ENSNGAG00000004647	Pusl1	82	56.522	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000004946	PUSL1	83	49.600	ENSNBRG00000014762	pusl1	91	49.600	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000004946	PUSL1	88	55.133	ENSNLEG00000000051	PUSL1	95	55.133	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	41.091	ENSMEUG00000005176	-	99	41.091	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000004946	PUSL1	94	52.313	ENSMEUG00000011649	-	98	52.313	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	54.513	ENSODEG00000008247	PUSL1	88	54.513	Octodon_degus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	52.708	ENSONIG00000019361	pusl1	93	51.957	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	51.625	ENSORLG00000016228	pusl1	93	51.625	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	52.347	ENSORLG00020013710	pusl1	93	52.347	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	51.986	ENSORLG00015008715	pusl1	97	51.986	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	50.542	ENSOMEG00000018897	pusl1	95	50.542	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000004946	PUSL1	91	55.636	ENSOGAG00000031692	PUSL1	95	55.636	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000004946	PUSL1	87	55.513	ENSOARG00000004905	PUSL1	98	55.513	Ovis_aries
ENSAPLG00000004946	PUSL1	96	54.671	ENSPPAG00000029283	PUSL1	94	54.671	Pan_paniscus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	97	52.595	ENSPPRG00000023329	PUSL1	96	52.595	Panthera_pardus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	87	54.826	ENSPTIG00000018532	PUSL1	96	54.826	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000004946	PUSL1	96	54.325	ENSPTRG00000000021	PUSL1	94	54.325	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000004946	PUSL1	96	54.325	ENSPANG00000000591	PUSL1	94	54.325	Papio_anubis
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	53.623	ENSPKIG00000002447	pusl1	96	53.623	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000004946	PUSL1	87	69.615	ENSPSIG00000002781	PUSL1	96	69.615	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000004946	PUSL1	94	46.619	ENSPMGG00000011051	pusl1	99	48.188	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	53.069	ENSPEMG00000013541	Pusl1	94	53.069	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000004946	PUSL1	94	54.804	ENSPCIG00000007816	-	64	54.804	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	52.347	ENSPFOG00000015448	pusl1	94	50.929	Poecilia_formosa
ENSAPLG00000004946	PUSL1	94	52.297	ENSPLAG00000004348	pusl1	95	52.297	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000004946	PUSL1	94	52.297	ENSPMEG00000000931	pusl1	95	52.297	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000004946	PUSL1	94	51.943	ENSPREG00000002324	pusl1	95	51.943	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000004946	PUSL1	87	53.846	ENSPPYG00000002014	PUSL1	92	53.846	Pongo_abelii
ENSAPLG00000004946	PUSL1	63	55.263	ENSPCAG00000002272	PUSL1	77	55.263	Procavia_capensis
ENSAPLG00000004946	PUSL1	66	61.429	ENSPVAG00000001016	PUSL1	65	61.429	Pteropus_vampyrus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	79	52.966	ENSPNYG00000006588	pusl1	98	52.966	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	57.455	ENSPNAG00000024441	pusl1	95	57.455	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	53.261	ENSRNOG00000022354	Pusl1	94	53.261	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	96	54.671	ENSRBIG00000036842	PUSL1	94	54.671	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000004946	PUSL1	96	54.671	ENSRROG00000030704	PUSL1	94	54.671	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	53.091	ENSSBOG00000032249	PUSL1	98	53.091	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000004946	PUSL1	56	50.898	ENSSHAG00000004840	-	86	50.898	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000004946	PUSL1	94	53.546	ENSSFOG00015008281	pusl1	93	53.546	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	98	48.299	ENSSMAG00000007187	pusl1	97	48.299	Scophthalmus_maximus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	52.708	ENSSDUG00000000287	pusl1	93	49.638	Seriola_dumerili
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	53.069	ENSSLDG00000009605	pusl1	88	53.069	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPLG00000004946	PUSL1	60	54.749	ENSSARG00000005323	-	94	54.749	Sorex_araneus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	94	45.392	ENSSPAG00000002528	pusl1	99	48.175	Stegastes_partitus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	55.797	ENSSSCG00000003338	PUSL1	90	55.797	Sus_scrofa
ENSAPLG00000004946	PUSL1	91	72.527	ENSTGUG00000003214	PUSL1	98	71.685	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	51.625	ENSTRUG00000010102	pusl1	93	51.625	Takifugu_rubripes
ENSAPLG00000004946	PUSL1	62	49.730	ENSTNIG00000005789	pusl1	83	49.730	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPLG00000004946	PUSL1	59	52.514	ENSTBEG00000005001	PUSL1	74	52.514	Tupaia_belangeri
ENSAPLG00000004946	PUSL1	97	48.288	ENSTTRG00000017030	PUSL1	95	48.288	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	81	55.602	ENSUAMG00000012801	PUSL1	79	55.602	Ursus_americanus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	81	55.187	ENSUMAG00000002084	PUSL1	79	55.187	Ursus_maritimus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	96	51.042	ENSVVUG00000004320	PUSL1	94	45.260	Vulpes_vulpes
ENSAPLG00000004946	PUSL1	93	31.206	ENSXETG00000024532	pus3	50	31.206	Xenopus_tropicalis
ENSAPLG00000004946	PUSL1	77	63.319	ENSXETG00000011145	pusl1	100	63.319	Xenopus_tropicalis
ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	50.181	ENSXCOG00000017748	pusl1	97	50.181	Xiphophorus_couchianus
ENSAPLG00000004946	PUSL1	94	52.297	ENSXMAG00000018846	pusl1	95	52.297	Xiphophorus_maculatus