EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000004996 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SF3B3
Alias: -
Full Name: splicing factor 3b subunit 3
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 24339 bases
Position: chrKB742399.1:620704-645042
Accession: 101793926
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000004567	CPSF_A	PF03178.15	1.7e-31	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000005183	SF3B3-201	2961	XM_005009084	ENSAPLP00000004567	987 (aa)	XP_005009141	U3IBE5

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000004996's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
apla03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000004996's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.176	ENSG00000189091	SF3B3	100	100.000	Homo_sapiens
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	93.293	ENSAPOG00000006172	sf3b3	82	93.293	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	97.778	ENSAMEG00000002187	SF3B3	81	97.778	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000004996	SF3B3	90	94.589	ENSACIG00000016487	sf3b3	82	94.589	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	93.293	ENSAOCG00000007158	sf3b3	81	93.293	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	93.293	ENSAPEG00000022786	sf3b3	81	93.293	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	93.394	ENSATEG00000013708	sf3b3	81	93.394	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	97.568	ENSACAG00000001817	SF3B3	81	97.568	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.176	ENSANAG00000028001	SF3B3	81	98.176	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	92.988	ENSACLG00000022555	sf3b3	82	94.250	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	93.293	ENSAMXG00000003410	sf3b3	81	93.293	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.176	ENSBTAG00000010627	SF3B3	82	98.176	Bos_taurus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	59.919	WBGene00019323	teg-4	81	59.919	Caenorhabditis_elegans
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.176	ENSCJAG00000014773	SF3B3	81	98.176	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.075	ENSCAFG00000020151	SF3B3	81	98.075	Canis_familiaris
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.075	ENSCAFG00020020912	SF3B3	81	98.075	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.075	ENSCHIG00000019822	SF3B3	81	98.075	Capra_hircus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.176	ENSTSYG00000007910	SF3B3	81	98.176	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000004996	SF3B3	80	77.295	ENSCAPG00000001484	SF3B3	67	77.295	Cavia_aperea
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	96.555	ENSCPOG00000000586	SF3B3	81	96.555	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.176	ENSCCAG00000017736	SF3B3	81	98.176	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.176	ENSCATG00000036562	SF3B3	81	98.176	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.176	ENSCLAG00000003921	SF3B3	81	98.176	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.176	ENSCSAG00000004371	SF3B3	81	98.176	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	88	88.785	ENSCHOG00000001878	SF3B3	71	88.785	Choloepus_hoffmanni
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	96.960	ENSCPBG00000015853	SF3B3	81	96.960	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	80.812	ENSCING00000001342	-	81	80.812	Ciona_intestinalis
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	79.817	ENSCSAVG00000011454	-	86	79.817	Ciona_savignyi
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.176	ENSCANG00000042920	SF3B3	83	98.176	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.075	ENSCGRG00001015908	Sf3b3	81	98.075	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.075	ENSCGRG00000010180	Sf3b3	81	98.075	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	92.690	ENSCSEG00000014192	sf3b3	98	92.690	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	92.683	ENSCVAG00000010459	sf3b3	81	92.683	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	93.394	ENSDARG00000103553	sf3b3	81	93.394	Danio_rerio
ENSAPLG00000004996	SF3B3	82	99.380	ENSDNOG00000043626	SF3B3	78	99.380	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.176	ENSDORG00000014176	Sf3b3	81	98.176	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	75.855	FBgn0035162	Sf3b3	81	75.855	Drosophila_melanogaster
ENSAPLG00000004996	SF3B3	80	98.925	ENSETEG00000002729	SF3B3	65	98.925	Echinops_telfairi
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	87.195	ENSEBUG00000006117	sf3b3	81	87.195	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.075	ENSEASG00005013376	SF3B3	81	98.075	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.075	ENSECAG00000014053	SF3B3	81	98.075	Equus_caballus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	91	98.788	ENSEEUG00000015611	SF3B3	74	98.788	Erinaceus_europaeus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	90.679	ENSELUG00000015417	sf3b3	99	84.919	Esox_lucius
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.075	ENSFCAG00000009487	SF3B3	81	98.075	Felis_catus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.176	ENSFALG00000007372	SF3B3	81	98.176	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.176	ENSFDAG00000002608	SF3B3	81	98.176	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	93.191	ENSFHEG00000017824	sf3b3	81	93.191	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	88.731	ENSGMOG00000008139	sf3b3	81	88.731	Gadus_morhua
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.480	ENSGALG00000002531	SF3B3	81	98.480	Gallus_gallus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	92.792	ENSGAFG00000015206	sf3b3	98	92.792	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	93.198	ENSGACG00000002646	sf3b3	81	93.198	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	96.960	ENSGAGG00000006746	SF3B3	82	96.960	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.176	ENSGGOG00000003246	SF3B3	81	98.176	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000004996	SF3B3	90	88.162	ENSHBUG00000005960	sf3b3	81	89.628	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.176	ENSHGLG00000010135	SF3B3	81	98.176	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	95.513	ENSHGLG00100011148	SF3B3	81	95.513	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	92.581	ENSHCOG00000011981	sf3b3	82	91.789	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	93.089	ENSIPUG00000020435	sf3b3	81	93.089	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.176	ENSSTOG00000007065	SF3B3	81	98.176	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.176	ENSJJAG00000003948	Sf3b3	81	98.176	Jaculus_jaculus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	93.089	ENSKMAG00000004066	sf3b3	83	93.089	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	93.293	ENSLBEG00000018302	sf3b3	89	93.293	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000004996	SF3B3	98	91.881	ENSLACG00000012501	SF3B3	81	91.881	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	93.706	ENSLOCG00000007566	sf3b3	81	93.706	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.075	ENSLAFG00000012219	SF3B3	81	98.075	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.176	ENSMFAG00000045487	SF3B3	81	98.176	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.176	ENSMMUG00000017812	SF3B3	81	98.176	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.176	ENSMNEG00000033385	SF3B3	81	98.176	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	93.820	ENSMLEG00000043891	SF3B3	81	93.820	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	93.496	ENSMAMG00000016837	sf3b3	81	93.496	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	86	94.340	ENSMZEG00005026015	sf3b3	80	94.340	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	92.988	ENSMZEG00005010836	sf3b3	82	94.250	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.480	ENSMGAG00000001597	SF3B3	81	98.480	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000004996	SF3B3	81	79.026	ENSMAUG00000013618	Sf3b3	75	79.526	Mesocricetus_auratus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	96.764	ENSMICG00000001363	SF3B3	81	96.764	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.075	ENSMOCG00000006108	Sf3b3	81	98.075	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000004996	SF3B3	86	94.811	ENSMMOG00000002598	sf3b3	79	94.811	Mola_mola
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	92.510	ENSMODG00000014363	SF3B3	81	92.510	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	93.089	ENSMALG00000008014	sf3b3	81	93.089	Monopterus_albus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	97.974	MGP_CAROLIEiJ_G0031563	Sf3b3	81	97.974	Mus_caroli
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.075	ENSMUSG00000033732	Sf3b3	81	98.075	Mus_musculus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	97.974	MGP_SPRETEiJ_G0032681	Sf3b3	81	97.974	Mus_spretus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.075	ENSMPUG00000010277	SF3B3	81	98.075	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	97.974	ENSMLUG00000014607	SF3B3	81	97.974	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.176	ENSNGAG00000021903	Sf3b3	81	98.176	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000004996	SF3B3	80	91.667	ENSNBRG00000007197	sf3b3	79	91.667	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	96.356	ENSNLEG00000016127	SF3B3	81	96.356	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000004996	SF3B3	91	96.644	ENSMEUG00000004479	SF3B3	75	96.644	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000004996	SF3B3	98	95.223	ENSOPRG00000009847	SF3B3	81	95.223	Ochotona_princeps
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.176	ENSODEG00000014154	SF3B3	81	98.176	Octodon_degus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	93.293	ENSONIG00000011198	sf3b3	81	93.293	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	97.872	ENSOANG00000001161	-	81	97.872	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	95.339	ENSOCUG00000004139	SF3B3	81	95.339	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	93.598	ENSORLG00000013472	sf3b3	82	94.927	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	93.598	ENSORLG00020017473	sf3b3	82	94.927	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	93.699	ENSORLG00015007710	sf3b3	82	95.039	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	93.293	ENSOMEG00000014483	sf3b3	81	93.293	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	97.677	ENSOGAG00000016051	SF3B3	81	97.677	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	97.778	ENSOARG00000004816	SF3B3	81	97.778	Ovis_aries
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.176	ENSPPAG00000026807	SF3B3	81	98.176	Pan_paniscus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.075	ENSPPRG00000001686	SF3B3	81	98.075	Panthera_pardus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	87	99.300	ENSPTIG00000020382	SF3B3	81	99.300	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.176	ENSPTRG00000008308	SF3B3	81	98.176	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.176	ENSPANG00000024075	SF3B3	81	98.176	Papio_anubis
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	92.683	ENSPKIG00000002712	sf3b3	82	93.687	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000004996	SF3B3	87	98.483	ENSPSIG00000002232	SF3B3	79	98.483	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.075	ENSPEMG00000008603	Sf3b3	81	98.075	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	91.895	ENSPMAG00000001793	sf3b3	81	91.895	Petromyzon_marinus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	97.872	ENSPCIG00000014927	SF3B3	81	97.872	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	92.886	ENSPFOG00000015516	sf3b3	81	92.886	Poecilia_formosa
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	92.893	ENSPLAG00000014330	sf3b3	98	92.893	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	92.886	ENSPMEG00000019856	sf3b3	81	92.886	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	92.589	ENSPREG00000019669	sf3b3	97	92.589	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000004996	SF3B3	94	99.247	ENSPPYG00000007539	SF3B3	80	99.247	Pongo_abelii
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	74.772	ENSPCAG00000002623	SF3B3	81	74.772	Procavia_capensis
ENSAPLG00000004996	SF3B3	81	99.065	ENSPCOG00000026582	SF3B3	78	99.065	Propithecus_coquereli
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.075	ENSPVAG00000000684	SF3B3	81	98.075	Pteropus_vampyrus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	92.988	ENSPNYG00000003528	sf3b3	82	94.250	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	93.496	ENSPNAG00000015419	sf3b3	81	93.496	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.075	ENSRNOG00000017724	Sf3b3	81	98.075	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.176	ENSRBIG00000021904	SF3B3	81	98.176	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.176	ENSRROG00000045703	SF3B3	81	98.176	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.176	ENSSBOG00000029156	SF3B3	81	98.176	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	97.872	ENSSHAG00000000372	SF3B3	81	97.872	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	93.598	ENSSFOG00015012877	sf3b3	82	94.814	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	93.089	ENSSMAG00000014386	sf3b3	81	93.089	Scophthalmus_maximus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	93.598	ENSSDUG00000021201	sf3b3	98	90.863	Seriola_dumerili
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	93.496	ENSSLDG00000017532	sf3b3	99	90.964	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.075	ENSSARG00000006917	SF3B3	81	98.075	Sorex_araneus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	97.670	ENSSPUG00000006253	SF3B3	81	97.670	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	83.841	ENSSPAG00000003125	sf3b3	80	83.841	Stegastes_partitus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.075	ENSSSCG00000025323	SF3B3	98	98.274	Sus_scrofa
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	98.577	ENSTGUG00000006082	SF3B3	81	98.577	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000004996	SF3B3	53	85.143	ENSTRUG00000015623	sf3b3	78	85.143	Takifugu_rubripes
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	93.293	ENSTNIG00000004857	sf3b3	90	93.293	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	80.851	ENSTBEG00000002946	SF3B3	87	80.851	Tupaia_belangeri
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	97.062	ENSTTRG00000005855	SF3B3	81	97.062	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.075	ENSUAMG00000006780	SF3B3	81	98.075	Ursus_americanus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	98.075	ENSUMAG00000017757	SF3B3	84	98.075	Ursus_maritimus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	81.098	ENSVPAG00000003202	SF3B3	81	81.098	Vicugna_pacos
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	97.974	ENSVVUG00000017922	SF3B3	81	97.974	Vulpes_vulpes
ENSAPLG00000004996	SF3B3	100	95.846	ENSXETG00000032869	SF3B3	81	95.846	Xenopus_tropicalis
ENSAPLG00000004996	SF3B3	95	93.206	ENSXCOG00000013628	sf3b3	97	93.206	Xiphophorus_couchianus
ENSAPLG00000004996	SF3B3	99	92.893	ENSXMAG00000006334	sf3b3	99	92.893	Xiphophorus_maculatus