EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000005180 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: RNA binding motif protein 7
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2601 bases
Position: chrKB743619.1:394894-397494
Accession: 101797918
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000004733	RRM_1	PF00076.22	2.2e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000005353	-	979	XM_005024518	ENSAPLP00000004733	223 (aa)	XP_005024575	U3IBW1

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000005180's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000005180's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000005180	-	100	56.277	ENSG00000076053	RBM7	79	65.833	Homo_sapiens
ENSAPLG00000005180	-	61	47.482	ENSAPOG00000012768	rbm7	51	47.482	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000005180	-	100	56.034	ENSAMEG00000013276	-	85	56.034	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000005180	-	88	44.393	ENSACAG00000011589	-	79	45.327	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000005180	-	57	65.625	ENSANAG00000031340	-	80	65.625	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000005180	-	53	66.387	ENSANAG00000031879	-	74	66.387	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000005180	-	60	51.773	ENSAMXG00000037251	rbm7	53	51.773	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000005180	-	100	53.913	ENSBTAG00000008219	RBM7	84	54.348	Bos_taurus
ENSAPLG00000005180	-	100	57.080	ENSCJAG00000011949	-	76	67.227	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000005180	-	100	55.022	ENSCAFG00000013514	-	85	56.710	Canis_familiaris
ENSAPLG00000005180	-	100	55.022	ENSCAFG00020002518	-	85	56.710	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000005180	-	100	53.913	ENSCHIG00000008632	-	84	54.348	Capra_hircus
ENSAPLG00000005180	-	100	53.913	ENSCHIG00000010879	-	84	54.348	Capra_hircus
ENSAPLG00000005180	-	100	54.585	ENSTSYG00000013731	-	84	56.710	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000005180	-	99	56.522	ENSCAPG00000012045	-	95	56.522	Cavia_aperea
ENSAPLG00000005180	-	100	56.710	ENSCPOG00000034273	-	93	56.710	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000005180	-	100	57.080	ENSCCAG00000036534	-	84	59.211	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000005180	-	100	56.769	ENSCATG00000037361	-	84	58.874	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000005180	-	100	54.936	ENSCLAG00000014875	-	84	54.936	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000005180	-	100	56.710	ENSCSAG00000002756	-	84	58.798	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000005180	-	53	65.000	ENSCHOG00000012747	-	79	65.000	Choloepus_hoffmanni
ENSAPLG00000005180	-	100	68.619	ENSCPBG00000009366	-	73	75.735	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000005180	-	100	56.769	ENSCANG00000031398	-	84	58.874	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000005180	-	100	56.522	ENSCGRG00001019236	Rbm7	84	56.522	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000005180	-	100	56.522	ENSCGRG00000005045	Rbm7	84	56.522	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000005180	-	64	42.177	ENSCVAG00000023415	rbm7	54	42.177	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000005180	-	91	38.350	ENSDARG00000020841	rbm7	74	39.320	Danio_rerio
ENSAPLG00000005180	-	100	57.143	ENSDNOG00000018423	-	84	57.143	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000005180	-	100	56.277	ENSDORG00000029149	Rbm7	84	56.277	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000005180	-	99	51.770	ENSETEG00000015869	-	83	54.386	Echinops_telfairi
ENSAPLG00000005180	-	100	57.143	ENSEASG00005006676	-	84	57.143	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000005180	-	100	57.143	ENSECAG00000004636	-	84	57.143	Equus_caballus
ENSAPLG00000005180	-	99	53.070	ENSEEUG00000015854	-	83	53.070	Erinaceus_europaeus
ENSAPLG00000005180	-	80	35.106	ENSELUG00000020964	-	59	34.043	Esox_lucius
ENSAPLG00000005180	-	100	54.978	ENSFCAG00000040484	-	84	55.411	Felis_catus
ENSAPLG00000005180	-	100	54.867	ENSFALG00000010039	-	67	54.867	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000005180	-	97	51.556	ENSFDAG00000010616	-	83	51.556	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000005180	-	100	77.578	ENSGALG00000007017	RBM7	77	77.578	Gallus_gallus
ENSAPLG00000005180	-	60	44.203	ENSGAFG00000000870	rbm7	50	44.203	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000005180	-	100	67.782	ENSGAGG00000021127	-	79	67.782	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000005180	-	60	59.701	ENSGGOG00000009941	-	59	59.701	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000005180	-	100	55.411	ENSHGLG00000018700	RBM7	84	55.411	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000005180	-	100	52.609	ENSHGLG00000016655	-	86	53.247	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000005180	-	100	51.515	ENSHGLG00000014428	-	83	51.515	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000005180	-	55	52.846	ENSHGLG00000013918	-	75	52.846	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000005180	-	100	45.923	ENSHGLG00000002486	-	79	45.923	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000005180	-	55	52.846	ENSHGLG00100015249	-	75	52.846	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000005180	-	88	44.949	ENSHGLG00100005739	-	73	44.949	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000005180	-	100	51.515	ENSHGLG00100011703	-	83	51.515	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000005180	-	100	52.609	ENSHGLG00100009317	-	86	53.247	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000005180	-	100	54.978	ENSHGLG00100005358	-	84	54.978	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000005180	-	100	45.923	ENSHGLG00100011792	-	79	45.923	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000005180	-	95	43.721	ENSIPUG00000009397	rbm7	79	45.116	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000005180	-	96	51.643	ENSSTOG00000031973	-	81	51.643	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000005180	-	92	54.930	ENSSTOG00000012459	-	82	54.930	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000005180	-	100	48.052	ENSJJAG00000016540	-	83	48.052	Jaculus_jaculus
ENSAPLG00000005180	-	100	57.576	ENSJJAG00000011823	-	84	57.576	Jaculus_jaculus
ENSAPLG00000005180	-	98	51.948	ENSLACG00000018620	-	84	51.948	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000005180	-	100	42.478	ENSLOCG00000002408	rbm7	80	43.860	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000005180	-	100	54.468	ENSLAFG00000012444	-	84	54.468	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000005180	-	100	56.769	ENSMFAG00000000965	-	84	58.874	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000005180	-	100	56.332	ENSMMUG00000012270	RBM7	85	58.442	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000005180	-	100	56.769	ENSMNEG00000005397	-	84	58.874	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000005180	-	100	57.205	ENSMLEG00000041953	-	84	59.307	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000005180	-	100	76.682	ENSMGAG00000003004	-	77	76.682	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000005180	-	100	54.783	ENSMAUG00000001942	-	84	54.783	Mesocricetus_auratus
ENSAPLG00000005180	-	54	64.167	ENSMAUG00000017938	-	75	64.167	Mesocricetus_auratus
ENSAPLG00000005180	-	96	56.364	ENSMICG00000042981	-	78	57.727	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000005180	-	100	56.957	ENSMOCG00000009674	Rbm7	84	56.957	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000005180	-	54	49.587	ENSMMOG00000004967	rbm7	52	65.455	Mola_mola
ENSAPLG00000005180	-	99	58.898	ENSMODG00000013918	-	84	58.898	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000005180	-	100	54.978	MGP_CAROLIEiJ_G0032167	Rbm7	84	54.978	Mus_caroli
ENSAPLG00000005180	-	100	56.087	ENSMUSG00000042396	Rbm7	84	56.087	Mus_musculus
ENSAPLG00000005180	-	100	55.652	MGP_PahariEiJ_G0015035	Rbm7	84	55.652	Mus_pahari
ENSAPLG00000005180	-	96	57.078	MGP_SPRETEiJ_G0033306	Rbm7	80	57.078	Mus_spretus
ENSAPLG00000005180	-	100	55.217	ENSMPUG00000003941	-	85	56.466	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000005180	-	96	55.708	ENSMLUG00000023234	-	79	55.708	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000005180	-	100	56.277	ENSNGAG00000006244	-	84	56.277	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000005180	-	100	57.143	ENSNLEG00000029494	-	84	59.307	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000005180	-	99	50.000	ENSMEUG00000006187	-	83	50.000	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000005180	-	96	56.364	ENSOPRG00000011060	-	80	56.818	Ochotona_princeps
ENSAPLG00000005180	-	79	50.270	ENSODEG00000016844	-	79	50.270	Octodon_degus
ENSAPLG00000005180	-	100	40.000	ENSODEG00000000186	-	79	41.202	Octodon_degus
ENSAPLG00000005180	-	54	66.116	ENSODEG00000010164	-	78	66.116	Octodon_degus
ENSAPLG00000005180	-	100	56.904	ENSOANG00000001755	-	80	56.904	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPLG00000005180	-	100	58.009	ENSOCUG00000003342	-	84	58.009	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000005180	-	100	56.957	ENSOGAG00000016857	-	84	56.957	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000005180	-	100	53.913	ENSOARG00000000924	-	83	54.348	Ovis_aries
ENSAPLG00000005180	-	100	56.277	ENSPPAG00000027572	-	84	58.442	Pan_paniscus
ENSAPLG00000005180	-	100	55.844	ENSPPRG00000004372	-	84	55.844	Panthera_pardus
ENSAPLG00000005180	-	100	55.844	ENSPTIG00000013512	-	84	55.844	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000005180	-	100	51.082	ENSPTRG00000049329	-	85	53.680	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000005180	-	100	56.277	ENSPTRG00000004305	RBM7	84	58.442	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000005180	-	100	58.874	ENSPANG00000009431	-	84	58.874	Papio_anubis
ENSAPLG00000005180	-	56	37.903	ENSPKIG00000019177	-	52	37.903	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000005180	-	91	44.395	ENSPKIG00000016648	rbm7	86	44.395	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000005180	-	56	48.819	ENSPMGG00000001523	rbm7	62	63.636	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPLG00000005180	-	94	55.093	ENSPEMG00000011553	-	83	55.093	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000005180	-	99	60.000	ENSPCIG00000011225	-	70	60.000	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000005180	-	60	44.203	ENSPMEG00000003603	rbm7	50	44.203	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000005180	-	60	44.521	ENSPREG00000015610	rbm7	50	44.521	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000005180	-	100	56.710	ENSPPYG00000003894	-	84	58.874	Pongo_abelii
ENSAPLG00000005180	-	99	50.870	ENSPCAG00000003270	-	97	50.870	Procavia_capensis
ENSAPLG00000005180	-	100	56.957	ENSPVAG00000005294	-	84	57.391	Pteropus_vampyrus
ENSAPLG00000005180	-	54	52.419	ENSPNAG00000012813	rbm7	53	48.936	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000005180	-	100	57.205	ENSRBIG00000044762	-	84	59.307	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000005180	-	100	57.205	ENSRROG00000032280	-	84	59.307	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000005180	-	100	56.195	ENSSBOG00000027830	-	84	57.895	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000005180	-	99	60.000	ENSSHAG00000008426	-	84	60.000	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000005180	-	91	42.035	ENSSFOG00015008458	rbm7	84	43.612	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000005180	-	61	45.139	ENSSDUG00000005361	rbm7	52	45.139	Seriola_dumerili
ENSAPLG00000005180	-	61	45.139	ENSSLDG00000003221	rbm7	52	45.139	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPLG00000005180	-	99	59.746	ENSSPUG00000006032	-	86	60.924	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000005180	-	61	48.611	ENSSPAG00000019320	rbm7	51	48.611	Stegastes_partitus
ENSAPLG00000005180	-	100	56.087	ENSSSCG00000027905	-	84	56.087	Sus_scrofa
ENSAPLG00000005180	-	100	57.456	ENSTGUG00000000117	-	78	58.333	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000005180	-	59	44.604	ENSTRUG00000020355	rbm7	54	44.604	Takifugu_rubripes
ENSAPLG00000005180	-	100	49.784	ENSTBEG00000008650	-	84	49.784	Tupaia_belangeri
ENSAPLG00000005180	-	100	55.411	ENSTTRG00000001515	-	84	55.411	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000005180	-	100	57.018	ENSUAMG00000019095	-	84	57.018	Ursus_americanus
ENSAPLG00000005180	-	100	57.018	ENSUMAG00000003774	-	84	57.018	Ursus_maritimus
ENSAPLG00000005180	-	100	57.328	ENSVPAG00000006300	-	84	57.328	Vicugna_pacos
ENSAPLG00000005180	-	96	53.153	ENSXETG00000012654	rbm7	86	53.153	Xenopus_tropicalis
ENSAPLG00000005180	-	60	42.029	ENSXMAG00000000970	rbm7	50	42.029	Xiphophorus_maculatus