EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000005533 (Gene tree)
Gene ID: 101801761
Gene Symbol: POLR3F
Alias: -
Full Name: RNA polymerase III subunit F
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 7494 bases
Position: chrKB742580.1:2957257-2964750
Accession: 101801761
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000005126	RNA_pol_Rpc34	PF05158.12	1.5e-98	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000005754	POLR3F-201	1532	XM_005012103	ENSAPLP00000005126	275 (aa)	XP_005012160	U3ID04

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000005533's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
apla03020	RNA polymerase	KEGG
apla04623	Cytosolic DNA-sensing pathway	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000005533's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	95.273	ENSG00000132664	POLR3F	87	95.273	Homo_sapiens
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	88.727	ENSAPOG00000008271	polr3f	90	88.727	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	94.909	ENSAMEG00000005222	POLR3F	87	94.909	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	84.727	ENSACIG00000006705	polr3f	89	84.727	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	89.091	ENSAOCG00000000687	polr3f	87	89.091	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	88.727	ENSAPEG00000015263	polr3f	87	88.727	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	90.545	ENSATEG00000015539	polr3f	100	90.545	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	93.455	ENSACAG00000014293	POLR3F	89	93.455	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	95.636	ENSANAG00000026726	POLR3F	87	95.636	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	89.818	ENSACLG00000003615	polr3f	87	89.818	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	90.182	ENSAMXG00000036020	polr3f	88	90.182	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	95.273	ENSBTAG00000008825	POLR3F	87	95.273	Bos_taurus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	99	35.897	WBGene00021112	W09C3.4	86	35.897	Caenorhabditis_elegans
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	95.636	ENSCJAG00000005159	POLR3F	87	95.636	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	94.909	ENSCAFG00000005420	POLR3F	87	94.909	Canis_familiaris
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	94.909	ENSCAFG00020027500	POLR3F	87	94.909	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	95.273	ENSCHIG00000014743	POLR3F	87	95.273	Capra_hircus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	95.273	ENSTSYG00000004207	POLR3F	87	95.273	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000005533	POLR3F	80	80.519	ENSCAPG00000008423	POLR3F	93	80.519	Cavia_aperea
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	96.364	ENSCPOG00000002400	POLR3F	87	96.364	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	82.545	ENSCCAG00000021800	POLR3F	85	82.545	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	95.636	ENSCATG00000019507	POLR3F	87	95.636	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	95.636	ENSCLAG00000016296	POLR3F	87	95.636	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	95.636	ENSCSAG00000011513	POLR3F	87	95.636	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	69	96.078	ENSCHOG00000013268	POLR3F	60	96.078	Choloepus_hoffmanni
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	94.182	ENSCPBG00000023473	POLR3F	100	94.182	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000005533	POLR3F	99	66.912	ENSCING00000001212	-	86	66.912	Ciona_intestinalis
ENSAPLG00000005533	POLR3F	68	65.775	ENSCSAVG00000003340	-	96	66.272	Ciona_savignyi
ENSAPLG00000005533	POLR3F	91	95.600	ENSCANG00000037390	POLR3F	86	95.600	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	95.273	ENSCGRG00001002032	Polr3f	87	95.273	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	95.273	ENSCGRG00000010852	Polr3f	87	95.273	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	87.273	ENSCSEG00000001247	polr3f	87	87.273	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	87.636	ENSCVAG00000007611	polr3f	87	87.636	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	90.182	ENSDARG00000012572	polr3f	88	90.182	Danio_rerio
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	92.364	ENSDNOG00000010719	POLR3F	87	92.364	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	95.636	ENSDORG00000016352	Polr3f	87	95.636	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000005533	POLR3F	99	52.364	FBgn0038951	CG5380	90	52.364	Drosophila_melanogaster
ENSAPLG00000005533	POLR3F	91	54.000	ENSETEG00000015485	-	89	54.000	Echinops_telfairi
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	80.000	ENSEBUG00000006783	polr3f	88	80.000	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	95.273	ENSEASG00005002022	POLR3F	87	95.273	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	95.273	ENSECAG00000009920	POLR3F	87	95.273	Equus_caballus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	77	88.000	ENSEEUG00000000184	POLR3F	67	88.000	Erinaceus_europaeus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	90.545	ENSELUG00000001558	polr3f	88	90.545	Esox_lucius
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	94.909	ENSFCAG00000013828	POLR3F	87	94.909	Felis_catus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	97.455	ENSFALG00000007623	POLR3F	100	97.455	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	95.273	ENSFDAG00000002528	POLR3F	87	95.273	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	86.909	ENSFHEG00000006450	polr3f	87	86.909	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	99.273	ENSGALG00000008749	POLR3F	88	99.273	Gallus_gallus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	87.636	ENSGAFG00000003698	polr3f	87	87.636	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	94.545	ENSGAGG00000006151	POLR3F	88	94.545	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	95.273	ENSGGOG00000011543	POLR3F	87	95.273	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	90.182	ENSHBUG00000013806	polr3f	87	90.182	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	95.273	ENSHGLG00000011867	POLR3F	87	95.273	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	95.273	ENSHGLG00100012577	POLR3F	87	95.273	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	78.182	ENSHCOG00000011751	polr3f	87	78.182	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	90.545	ENSIPUG00000013347	polr3f	88	90.545	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	94.909	ENSSTOG00000013588	POLR3F	87	94.909	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	94.909	ENSJJAG00000017513	Polr3f	87	94.909	Jaculus_jaculus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	82.909	ENSKMAG00000016495	polr3f	100	82.909	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	84	93.103	ENSLBEG00000011998	polr3f	100	93.103	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	92.364	ENSLACG00000009371	POLR3F	88	92.364	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	92.364	ENSLOCG00000015701	polr3f	88	92.364	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	94.909	ENSLAFG00000004929	POLR3F	87	94.909	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	95.636	ENSMFAG00000002227	POLR3F	87	95.636	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	95.636	ENSMMUG00000004143	POLR3F	100	95.636	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	95.636	ENSMNEG00000033404	POLR3F	87	95.636	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	95.636	ENSMLEG00000021905	POLR3F	87	95.636	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	88.727	ENSMAMG00000017975	polr3f	87	88.727	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	89.818	ENSMZEG00005015134	polr3f	87	89.818	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	98.545	ENSMGAG00000006691	POLR3F	88	98.545	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	95.636	ENSMAUG00000020176	Polr3f	87	95.636	Mesocricetus_auratus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	94.909	ENSMICG00000044519	POLR3F	87	94.909	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	95.273	ENSMOCG00000018352	Polr3f	87	95.273	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	89.531	ENSMMOG00000018477	polr3f	93	89.531	Mola_mola
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	96.364	ENSMODG00000005624	POLR3F	87	96.364	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	89.818	ENSMALG00000006685	polr3f	87	89.818	Monopterus_albus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	94.545	MGP_CAROLIEiJ_G0024385	Polr3f	87	94.545	Mus_caroli
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	94.545	ENSMUSG00000027427	Polr3f	87	94.545	Mus_musculus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	94.545	MGP_PahariEiJ_G0025829	Polr3f	87	94.545	Mus_pahari
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	94.545	MGP_SPRETEiJ_G0025304	Polr3f	87	94.545	Mus_spretus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	70.070	ENSMPUG00000001252	-	87	70.070	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	94.909	ENSMLUG00000014844	POLR3F	87	94.909	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	94.909	ENSNGAG00000010898	Polr3f	87	94.909	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	90.182	ENSNBRG00000020796	polr3f	87	90.182	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	95.273	ENSNLEG00000009778	POLR3F	87	95.273	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	89.455	ENSMEUG00000010320	POLR3F	93	89.455	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	95.273	ENSOPRG00000003385	POLR3F	87	95.273	Ochotona_princeps
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	95.273	ENSODEG00000011521	POLR3F	87	95.273	Octodon_degus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	89.818	ENSONIG00000006858	polr3f	87	89.818	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	95.636	ENSOANG00000001253	POLR3F	87	95.636	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	95.636	ENSOCUG00000015067	POLR3F	87	95.636	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	88.364	ENSORLG00000022412	polr3f	87	88.364	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	88.364	ENSORLG00020021944	polr3f	87	88.364	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	93.818	ENSOGAG00000002916	POLR3F	87	93.818	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	95.273	ENSOARG00000000315	-	87	95.273	Ovis_aries
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	54.545	ENSOARG00000008647	-	84	54.545	Ovis_aries
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	95.273	ENSPPAG00000036681	POLR3F	87	95.273	Pan_paniscus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	94.909	ENSPPRG00000024604	POLR3F	87	94.909	Panthera_pardus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	94.909	ENSPTIG00000020292	POLR3F	87	94.909	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	95.273	ENSPTRG00000013287	POLR3F	87	95.273	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	95.636	ENSPANG00000025015	POLR3F	87	95.636	Papio_anubis
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	90.545	ENSPKIG00000004427	polr3f	88	90.545	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	95.273	ENSPSIG00000016613	POLR3F	100	95.273	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	50.909	ENSPMGG00000018350	polr3f	84	54.182	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	94.909	ENSPEMG00000006966	Polr3f	87	94.909	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	82.909	ENSPMAG00000005530	polr3f	88	82.909	Petromyzon_marinus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	96.000	ENSPCIG00000000908	POLR3F	74	96.000	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	88.000	ENSPFOG00000018334	polr3f	87	88.000	Poecilia_formosa
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	88.000	ENSPLAG00000021803	polr3f	87	88.000	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	88.000	ENSPMEG00000013150	polr3f	87	88.000	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	88.000	ENSPREG00000005278	polr3f	87	88.000	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	95.273	ENSPPYG00000010737	POLR3F	87	95.273	Pongo_abelii
ENSAPLG00000005533	POLR3F	54	95.270	ENSPCAG00000004893	POLR3F	51	95.270	Procavia_capensis
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	94.909	ENSPCOG00000004543	POLR3F	87	94.909	Propithecus_coquereli
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	94.545	ENSPVAG00000000403	POLR3F	87	94.545	Pteropus_vampyrus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	90.182	ENSPNYG00000016276	polr3f	87	90.182	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	90.909	ENSPNAG00000005164	polr3f	88	90.909	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	94.909	ENSRNOG00000007548	Polr3f	74	94.909	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	95.636	ENSRBIG00000021268	POLR3F	87	95.636	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	95.636	ENSRROG00000039911	POLR3F	87	95.636	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000005533	POLR3F	71	31.034	YNR003C	RPC34	64	31.034	Saccharomyces_cerevisiae
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	95.636	ENSSBOG00000018207	POLR3F	87	95.636	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000005533	POLR3F	81	92.444	ENSSHAG00000018160	POLR3F	75	90.909	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	92.364	ENSSFOG00015022433	polr3f	88	92.364	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	87.636	ENSSMAG00000021029	polr3f	87	87.636	Scophthalmus_maximus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	78.182	ENSSDUG00000022435	polr3f	86	78.182	Seriola_dumerili
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	89.455	ENSSLDG00000012761	polr3f	87	89.455	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	84.364	ENSSARG00000006039	POLR3F	87	84.364	Sorex_araneus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	96.000	ENSSPUG00000001873	POLR3F	88	96.000	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	79.636	ENSSPAG00000002092	polr3f	86	79.636	Stegastes_partitus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	94.545	ENSSSCG00000007095	POLR3F	100	95.690	Sus_scrofa
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	97.455	ENSTGUG00000005839	POLR3F	88	97.455	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	87.636	ENSTRUG00000012101	polr3f	87	87.636	Takifugu_rubripes
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	86.909	ENSTNIG00000006456	polr3f	87	86.909	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	76.364	ENSTBEG00000007921	POLR3F	87	76.364	Tupaia_belangeri
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	95.273	ENSTTRG00000002580	POLR3F	87	95.273	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	60	93.976	ENSUAMG00000024166	POLR3F	100	93.976	Ursus_americanus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	94.545	ENSUMAG00000024944	POLR3F	87	94.545	Ursus_maritimus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	94.182	ENSVPAG00000009063	POLR3F	87	94.182	Vicugna_pacos
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	94.909	ENSVVUG00000012925	POLR3F	87	94.909	Vulpes_vulpes
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	92.000	ENSXETG00000024898	polr3f	88	92.000	Xenopus_tropicalis
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	88.364	ENSXCOG00000010301	polr3f	100	88.364	Xiphophorus_couchianus
ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	88.364	ENSXMAG00000004604	polr3f	87	88.364	Xiphophorus_maculatus