EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000005821 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: UTP6
Alias: -
Full Name: UTP6%2C small subunit processome component
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 12507 bases
Position: chrKB742588.1:820200-832706
Accession: 101791972
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000005467	U3_assoc_6	PF08640.11	9.9e-18	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000006098	UTP6-201	1898	XM_005012327	ENSAPLP00000005467	597 (aa)	-	U3IDZ5

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000005821's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
apla03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000005821's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	65.365	ENSG00000108651	UTP6	99	65.365	Homo_sapiens
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	56.588	ENSAPOG00000000435	utp6	99	56.588	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000005821	UTP6	98	64.796	ENSAMEG00000005443	UTP6	98	64.796	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	55.068	ENSACIG00000004124	utp6	99	55.068	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	56.367	ENSAOCG00000016812	utp6	99	56.367	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	56.419	ENSAPEG00000023565	utp6	99	56.419	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	56.588	ENSATEG00000003401	utp6	99	56.588	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	72.326	ENSACAG00000009472	UTP6	99	72.326	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	65.195	ENSANAG00000034603	UTP6	99	65.195	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	57.770	ENSACLG00000006728	utp6	99	57.770	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	57.555	ENSAMXG00000009478	utp6	99	57.555	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	57.797	ENSBTAG00000003769	-	97	57.797	Bos_taurus
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	59.322	ENSBTAG00000015612	UTP6	99	59.322	Bos_taurus
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	65.365	ENSCJAG00000014115	UTP6	99	65.365	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	66.271	ENSCAFG00000018507	UTP6	99	66.271	Canis_familiaris
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	66.271	ENSCAFG00020014678	UTP6	99	66.271	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	59.661	ENSCHIG00000017954	-	99	59.661	Capra_hircus
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	59.661	ENSCHIG00000009726	-	99	59.661	Capra_hircus
ENSAPLG00000005821	UTP6	98	59.762	ENSTSYG00000002202	UTP6	98	59.762	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000005821	UTP6	88	61.059	ENSCAPG00000017595	UTP6	96	61.059	Cavia_aperea
ENSAPLG00000005821	UTP6	98	65.476	ENSCPOG00000014294	UTP6	99	65.476	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	61.290	ENSCCAG00000033318	-	99	61.290	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	64.915	ENSCATG00000034868	UTP6	99	64.915	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000005821	UTP6	98	65.646	ENSCLAG00000007274	UTP6	98	65.646	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	64.915	ENSCSAG00000006595	UTP6	99	64.915	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000005821	UTP6	84	52.941	ENSCHOG00000010940	-	85	52.941	Choloepus_hoffmanni
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	80.306	ENSCPBG00000004652	UTP6	99	80.306	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000005821	UTP6	96	30.964	ENSCING00000022947	-	97	30.667	Ciona_intestinalis
ENSAPLG00000005821	UTP6	52	36.741	ENSCSAVG00000011416	-	95	36.741	Ciona_savignyi
ENSAPLG00000005821	UTP6	87	46.360	ENSCANG00000031141	UTP6	89	46.360	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000005821	UTP6	98	65.365	ENSCGRG00001000046	Utp6	99	65.365	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000005821	UTP6	95	67.314	ENSCGRG00000011543	Utp6	100	67.314	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	52.881	ENSCSEG00000013422	utp6	91	72.222	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	56.027	ENSCVAG00000020322	utp6	99	56.027	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	55.857	ENSDARG00000098433	utp6	96	60.694	Danio_rerio
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	65.763	ENSDNOG00000037018	UTP6	99	65.763	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000005821	UTP6	90	66.108	ENSDORG00000003843	Utp6	99	66.108	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	66.271	ENSEASG00005010870	UTP6	99	66.271	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	66.102	ENSECAG00000022217	UTP6	99	66.102	Equus_caballus
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	57.725	ENSELUG00000006618	utp6	99	57.725	Esox_lucius
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	63.452	ENSFCAG00000015795	UTP6	99	63.452	Felis_catus
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	86.927	ENSFALG00000002282	UTP6	99	86.927	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000005821	UTP6	98	63.776	ENSFDAG00000019506	UTP6	99	63.776	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	55.574	ENSFHEG00000010373	utp6	99	55.574	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	54.499	ENSGMOG00000011958	utp6	99	54.499	Gadus_morhua
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	89.134	ENSGALG00000003260	UTP6	99	89.134	Gallus_gallus
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	56.027	ENSGAFG00000008505	utp6	99	56.027	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	55.857	ENSGACG00000019424	utp6	99	55.857	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	78.947	ENSGAGG00000004820	UTP6	99	78.947	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000005821	UTP6	98	52.811	ENSGGOG00000026003	-	98	52.811	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	65.365	ENSGGOG00000013569	UTP6	99	65.365	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	57.770	ENSHBUG00000018668	utp6	99	57.770	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000005821	UTP6	98	58.673	ENSHGLG00000008642	-	99	58.673	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000005821	UTP6	98	63.435	ENSHGLG00000010332	UTP6	99	63.435	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000005821	UTP6	94	60.213	ENSHGLG00100006047	-	99	60.213	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000005821	UTP6	98	60.374	ENSHGLG00100014271	-	99	60.374	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	55.236	ENSHCOG00000017277	utp6	99	55.236	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	57.046	ENSIPUG00000022587	Utp6	99	57.046	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000005821	UTP6	98	66.044	ENSSTOG00000015875	UTP6	99	66.044	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	57.264	ENSKMAG00000021631	utp6	99	57.264	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	57.770	ENSLBEG00000002115	utp6	99	57.770	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	69.100	ENSLACG00000017158	UTP6	99	69.100	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000005821	UTP6	90	58.955	ENSLOCG00000013797	utp6	89	58.955	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	64.746	ENSLAFG00000013008	UTP6	99	64.746	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000005821	UTP6	87	51.092	ENSMFAG00000041904	-	95	51.092	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	64.915	ENSMFAG00000038842	UTP6	99	64.915	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	64.915	ENSMMUG00000020403	UTP6	99	64.915	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	64.915	ENSMNEG00000039480	UTP6	99	64.915	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	55.798	ENSMLEG00000032174	UTP6	98	55.798	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000005821	UTP6	98	51.186	ENSMLEG00000039364	-	98	51.186	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	56.081	ENSMAMG00000002228	utp6	98	56.081	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	57.770	ENSMZEG00005023895	utp6	99	57.770	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000005821	UTP6	95	91.021	ENSMGAG00000008111	UTP6	100	91.021	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000005821	UTP6	98	65.535	ENSMAUG00000021895	Utp6	99	65.535	Mesocricetus_auratus
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	63.559	ENSMICG00000002632	UTP6	99	63.559	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000005821	UTP6	98	65.025	ENSMOCG00000014163	Utp6	99	65.025	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	55.912	ENSMMOG00000008653	utp6	91	75.000	Mola_mola
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	68.475	ENSMODG00000019206	UTP6	99	68.475	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	56.081	ENSMALG00000021112	utp6	99	57.895	Monopterus_albus
ENSAPLG00000005821	UTP6	98	65.025	MGP_CAROLIEiJ_G0016828	Utp6	99	65.025	Mus_caroli
ENSAPLG00000005821	UTP6	98	64.686	ENSMUSG00000035575	Utp6	99	64.686	Mus_musculus
ENSAPLG00000005821	UTP6	98	55.518	MGP_PahariEiJ_G0017965	Utp6	99	55.518	Mus_pahari
ENSAPLG00000005821	UTP6	98	65.025	MGP_SPRETEiJ_G0017672	Utp6	99	65.025	Mus_spretus
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	62.881	ENSMPUG00000014581	UTP6	99	62.881	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	64.576	ENSMLUG00000016422	UTP6	99	64.576	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000005821	UTP6	98	64.346	ENSNGAG00000015482	Utp6	99	64.346	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	57.770	ENSNBRG00000019714	utp6	99	57.770	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	64.346	ENSNLEG00000011009	UTP6	99	64.346	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000005821	UTP6	79	74.390	ENSOPRG00000008446	-	79	74.390	Ochotona_princeps
ENSAPLG00000005821	UTP6	68	65.066	ENSODEG00000011971	UTP6	98	65.066	Octodon_degus
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	57.432	ENSONIG00000018090	utp6	99	57.432	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000005821	UTP6	96	69.512	ENSOANG00000004279	UTP6	97	69.512	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPLG00000005821	UTP6	98	63.667	ENSOCUG00000016980	UTP6	98	63.667	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000005821	UTP6	98	56.853	ENSORLG00000003546	utp6	63	56.853	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000005821	UTP6	98	56.853	ENSORLG00020010377	utp6	98	56.853	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000005821	UTP6	98	56.176	ENSORLG00015008893	utp6	98	56.176	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	56.588	ENSOMEG00000017487	utp6	99	56.588	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000005821	UTP6	86	56.893	ENSOGAG00000004511	UTP6	98	56.893	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	59.831	ENSOARG00000013474	UTP6	99	59.831	Ovis_aries
ENSAPLG00000005821	UTP6	98	53.833	ENSPPAG00000016895	-	98	53.833	Pan_paniscus
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	65.535	ENSPPAG00000038089	UTP6	99	65.535	Pan_paniscus
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	65.593	ENSPPRG00000001010	UTP6	99	65.593	Panthera_pardus
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	65.763	ENSPTIG00000013913	UTP6	99	65.763	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000005821	UTP6	98	53.571	ENSPTRG00000044798	-	98	53.571	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	65.535	ENSPTRG00000008977	UTP6	99	65.535	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	62.775	ENSPANG00000023113	UTP6	99	62.775	Papio_anubis
ENSAPLG00000005821	UTP6	98	51.186	ENSPANG00000034274	-	99	51.186	Papio_anubis
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	58.545	ENSPKIG00000004653	utp6	100	60.317	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	76.231	ENSPSIG00000012435	UTP6	99	76.231	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	55.236	ENSPMGG00000009548	utp6	99	55.236	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPLG00000005821	UTP6	98	65.025	ENSPEMG00000014081	Utp6	99	65.025	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000005821	UTP6	93	48.404	ENSPMAG00000009561	utp6	100	48.404	Petromyzon_marinus
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	69.270	ENSPCIG00000029968	UTP6	85	69.270	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	55.008	ENSPFOG00000013918	utp6	99	55.008	Poecilia_formosa
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	54.839	ENSPLAG00000017825	utp6	99	54.839	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	55.178	ENSPMEG00000008133	utp6	99	55.178	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	54.160	ENSPREG00000013108	utp6	97	54.160	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	61.969	ENSPPYG00000008154	UTP6	99	61.969	Pongo_abelii
ENSAPLG00000005821	UTP6	53	50.000	ENSPCAG00000014878	-	58	50.000	Procavia_capensis
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	62.712	ENSPCOG00000010224	UTP6	99	62.712	Propithecus_coquereli
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	61.525	ENSPVAG00000015759	UTP6	99	61.525	Pteropus_vampyrus
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	57.432	ENSPNYG00000002290	utp6	99	57.432	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	56.537	ENSPNAG00000027370	utp6	99	56.537	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000005821	UTP6	98	63.328	ENSRNOG00000014209	Utp6	99	63.328	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	64.576	ENSRBIG00000020822	UTP6	99	64.576	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	64.576	ENSRROG00000036838	UTP6	99	64.576	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	58.376	ENSSFOG00015005978	utp6	99	58.376	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	57.264	ENSSMAG00000014772	utp6	99	57.264	Scophthalmus_maximus
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	57.601	ENSSDUG00000000329	utp6	99	57.601	Seriola_dumerili
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	57.601	ENSSLDG00000016724	utp6	99	57.601	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPLG00000005821	UTP6	98	57.483	ENSSARG00000010778	UTP6	98	57.483	Sorex_araneus
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	75.042	ENSSPUG00000005273	UTP6	99	75.042	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	56.367	ENSSPAG00000011871	utp6	98	56.367	Stegastes_partitus
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	66.271	ENSSSCG00000017745	UTP6	99	66.271	Sus_scrofa
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	86.757	ENSTGUG00000004999	UTP6	99	86.757	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000005821	UTP6	98	55.668	ENSTRUG00000012005	utp6	99	55.668	Takifugu_rubripes
ENSAPLG00000005821	UTP6	98	55.838	ENSTNIG00000003235	utp6	99	55.838	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPLG00000005821	UTP6	66	60.694	ENSTBEG00000005388	-	66	60.694	Tupaia_belangeri
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	64.915	ENSTTRG00000009911	UTP6	99	64.915	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000005821	UTP6	98	64.796	ENSUMAG00000015139	UTP6	98	64.796	Ursus_maritimus
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	64.576	ENSVPAG00000005782	UTP6	99	64.576	Vicugna_pacos
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	66.102	ENSVVUG00000012238	UTP6	99	66.102	Vulpes_vulpes
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	52.971	ENSXETG00000020057	utp6	99	52.971	Xenopus_tropicalis
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	55.330	ENSXCOG00000013626	utp6	92	75.862	Xiphophorus_couchianus
ENSAPLG00000005821	UTP6	99	55.348	ENSXMAG00000017414	utp6	99	55.348	Xiphophorus_maculatus