EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000005827 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: PRPF38A
Alias: -
Full Name: pre-mRNA processing factor 38A
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3627 bases
Position: chrKB744139.1:310683-314309
Accession: 101803332
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000005440	PRP38	PF03371.15	4.9e-41	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000006071	PRPF38A-201	819	XM_005027242	ENSAPLP00000005440	248 (aa)	XP_005027299	U3IDW8

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000005827's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
apla03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000005827's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSG00000134748	PRPF38A	79	97.571	Homo_sapiens
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	63	86.538	ENSAPOG00000011652	prpf38a	79	78.629	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSAMEG00000009319	PRPF38A	79	97.571	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	63	83.333	ENSACIG00000012292	prpf38a	54	82.530	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	63	86.538	ENSAOCG00000018004	prpf38a	79	78.629	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	63	86.538	ENSAPEG00000021414	prpf38a	79	78.629	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	63	85.897	ENSATEG00000004608	prpf38a	79	77.823	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	96.356	ENSACAG00000008249	PRPF38A	79	96.356	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSANAG00000027839	PRPF38A	79	97.571	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	96	75.720	ENSANAG00000029204	-	83	69.136	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	63	83.974	ENSACLG00000021595	prpf38a	79	77.016	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	77.823	ENSAMXG00000029274	prpf38a	79	77.823	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSBTAG00000002720	PRPF38A	79	97.571	Bos_taurus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSCJAG00000021594	PRPF38A	79	97.571	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSCAFG00000003740	PRPF38A	79	97.571	Canis_familiaris
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSCAFG00020010939	PRPF38A	79	97.571	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSCHIG00000024730	PRPF38A	79	97.571	Capra_hircus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	96.761	ENSTSYG00000031994	-	88	96.761	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSTSYG00000009868	-	79	97.571	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSCPOG00000005079	PRPF38A	79	97.571	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.166	ENSCCAG00000026502	PRPF38A	79	97.166	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	67.611	ENSCATG00000044190	-	83	66.667	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSCATG00000032296	PRPF38A	79	97.571	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSCLAG00000005816	PRPF38A	79	97.571	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	71	93.548	ENSCHOG00000008388	PRPF38A	57	93.548	Choloepus_hoffmanni
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	98.785	ENSCPBG00000014791	PRPF38A	79	98.785	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	61	67.763	ENSCSAVG00000009580	-	57	61.988	Ciona_savignyi
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	94	97.436	ENSCANG00000032608	PRPF38A	78	97.436	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.976	ENSCGRG00001018502	-	79	97.976	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	67	84.337	ENSCGRG00001002557	-	56	84.337	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.976	ENSCGRG00000014868	Prpf38a	79	97.976	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	63	85.897	ENSCSEG00000001269	prpf38a	57	84.940	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	63	87.179	ENSCVAG00000012305	prpf38a	79	78.226	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	78.226	ENSDARG00000039213	prpf38a	79	78.226	Danio_rerio
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	54	69.925	ENSDNOG00000046061	-	99	69.925	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSDNOG00000042326	PRPF38A	79	97.571	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	90	75.446	ENSDORG00000023691	-	55	83.333	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	90	75.446	ENSDORG00000025371	-	55	83.333	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	81	100.000	ENSDORG00000023857	-	76	80.567	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	69	76.301	ENSEBUG00000012588	prpf38a	54	75.595	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSEASG00005014427	PRPF38A	79	97.571	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSECAG00000022628	PRPF38A	79	97.571	Equus_caballus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	63	82.051	ENSELUG00000021094	prpf38a	79	75.806	Esox_lucius
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSFCAG00000002518	PRPF38A	79	97.571	Felis_catus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	84.959	ENSFALG00000003612	-	55	92.169	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	99.190	ENSFALG00000005598	-	91	99.190	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.166	ENSFDAG00000011287	PRPF38A	79	97.166	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	79	74.874	ENSFHEG00000014317	prpf38a	56	85.542	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	99.190	ENSGALG00000010627	PRPF38A	79	99.190	Gallus_gallus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	63	88.462	ENSGAFG00000012422	prpf38a	79	79.032	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	63	83.544	ENSGACG00000005423	prpf38a	79	76.000	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	98.381	ENSGAGG00000020547	PRPF38A	79	98.381	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSGGOG00000003940	PRPF38A	79	97.571	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	50	89.516	ENSHBUG00000020572	prpf38a	52	89.431	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	80.567	ENSHGLG00000007918	-	78	80.162	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSHGLG00000000475	PRPF38A	79	97.571	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	80.567	ENSHGLG00100003928	-	78	80.162	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSHGLG00100008935	PRPF38A	79	97.571	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	67	83.234	ENSIPUG00000005757	prpf38a	54	82.635	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSSTOG00000015610	PRPF38A	79	97.571	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSJJAG00000015811	Prpf38a	79	97.571	Jaculus_jaculus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	63	87.179	ENSKMAG00000006588	prpf38a	79	78.226	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	94	72.103	ENSLBEG00000020585	prpf38a	79	75.000	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	92.713	ENSLACG00000011495	PRPF38A	79	92.713	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	75.403	ENSLOCG00000006262	prpf38a	79	76.613	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSLAFG00000025862	PRPF38A	79	97.571	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSMFAG00000039449	PRPF38A	79	97.571	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSMMUG00000014333	PRPF38A	89	97.571	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSMNEG00000031221	PRPF38A	79	97.571	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	67.206	ENSMNEG00000040242	-	83	66.667	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSMLEG00000041105	PRPF38A	79	97.571	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	63	85.897	ENSMAMG00000015431	prpf38a	79	78.226	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	63	83.974	ENSMZEG00005017838	prpf38a	79	77.016	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	94	99.145	ENSMGAG00000011176	PRPF38A	78	99.145	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	80	93.467	ENSMAUG00000018029	-	63	93.373	Mesocricetus_auratus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSMICG00000014193	PRPF38A	79	97.571	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.976	ENSMOCG00000013080	Prpf38a	79	97.976	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	78	76.166	ENSMMOG00000016972	prpf38a	58	83.133	Mola_mola
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.177	ENSMODG00000000644	PRPF38A	79	97.177	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	63	85.256	ENSMALG00000019363	prpf38a	77	77.823	Monopterus_albus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.166	MGP_CAROLIEiJ_G0026269	Prpf38a	79	97.166	Mus_caroli
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.166	ENSMUSG00000063800	Prpf38a	79	97.166	Mus_musculus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.166	MGP_PahariEiJ_G0028602	Prpf38a	79	97.166	Mus_pahari
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	96.761	MGP_SPRETEiJ_G0027238	Prpf38a	79	96.761	Mus_spretus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSMPUG00000006896	PRPF38A	79	97.571	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.976	ENSNGAG00000011884	Prpf38a	79	97.976	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	63	82.692	ENSNBRG00000004013	prpf38a	53	81.928	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSNLEG00000017999	PRPF38A	79	97.571	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	98	65.289	ENSNLEG00000033398	-	75	65.289	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	96	70.042	ENSNLEG00000012592	-	76	70.042	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	93.522	ENSMEUG00000003860	PRPF38A	79	93.522	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	71	97.714	ENSOPRG00000008985	PRPF38A	73	97.714	Ochotona_princeps
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSODEG00000005869	PRPF38A	79	97.571	Octodon_degus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	63	83.333	ENSONIG00000007816	prpf38a	79	76.613	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSOCUG00000000963	PRPF38A	79	97.571	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	95	77.872	ENSORLG00000013485	prpf38a	79	78.138	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	95	77.872	ENSORLG00020002130	prpf38a	79	78.138	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	95	77.447	ENSORLG00015021393	prpf38a	79	77.733	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	94	77.682	ENSOMEG00000016333	prpf38a	79	77.823	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSOGAG00000005423	PRPF38A	79	97.571	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSOARG00000005373	PRPF38A	79	97.571	Ovis_aries
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSPPAG00000030905	PRPF38A	79	97.571	Pan_paniscus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	72.874	ENSPPAG00000033867	-	77	72.874	Pan_paniscus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSPPRG00000013268	PRPF38A	79	97.571	Panthera_pardus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSPTIG00000015419	PRPF38A	79	97.571	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSPTRG00000000739	PRPF38A	79	97.571	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSPANG00000015483	PRPF38A	79	97.571	Papio_anubis
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	73.684	ENSPKIG00000011439	prpf38a	79	75.304	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	98.381	ENSPSIG00000017487	PRPF38A	79	98.381	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	76	78.836	ENSPMGG00000021352	prpf38a	77	76.639	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	89.600	ENSPEMG00000011212	-	79	88.400	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.976	ENSPEMG00000023277	-	79	97.976	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	96.774	ENSPCIG00000022369	-	79	96.774	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	78	76.804	ENSPFOG00000004248	prpf38a	79	79.032	Poecilia_formosa
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	90	71.179	ENSPLAG00000010328	prpf38a	79	79.032	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	79	73.762	ENSPMEG00000011804	prpf38a	80	79.032	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	98	96.721	ENSPPYG00000001348	PRPF38A	77	96.721	Pongo_abelii
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.166	ENSPCAG00000013328	PRPF38A	79	97.166	Procavia_capensis
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSPCOG00000016387	-	79	97.571	Propithecus_coquereli
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	73.684	ENSPCOG00000020709	-	54	78.916	Propithecus_coquereli
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSPVAG00000009803	PRPF38A	79	97.571	Pteropus_vampyrus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	63	83.974	ENSPNYG00000005571	prpf38a	79	77.016	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	78.226	ENSPNAG00000010399	prpf38a	79	78.226	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.976	ENSRNOG00000009451	Prpf38a	79	97.976	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSRBIG00000036442	PRPF38A	79	97.571	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	56.275	ENSRBIG00000034053	-	57	75.524	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	57.085	ENSRROG00000034606	-	74	55.061	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSRROG00000032788	PRPF38A	79	97.571	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	97	80.498	ENSRROG00000040003	-	57	83.735	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSSBOG00000019515	PRPF38A	79	97.571	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.177	ENSSHAG00000006906	-	92	97.177	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	95	65.401	ENSSHAG00000006029	-	52	77.564	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	74.597	ENSSFOG00015013572	prpf38a	79	75.000	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	63	83.974	ENSSMAG00000015379	prpf38a	54	83.133	Scophthalmus_maximus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	63	85.256	ENSSDUG00000001324	prpf38a	79	77.823	Seriola_dumerili
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	63	85.256	ENSSLDG00000014803	prpf38a	79	77.823	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	87	97.209	ENSSARG00000014458	PRPF38A	69	97.209	Sorex_araneus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	96.356	ENSSPUG00000013259	PRPF38A	79	96.356	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSSSCG00000028288	PRPF38A	79	97.571	Sus_scrofa
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	99.190	ENSTGUG00000008995	PRPF38A	79	99.190	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	63	83.333	ENSTRUG00000003374	prpf38a	51	82.530	Takifugu_rubripes
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	63	81.646	ENSTNIG00000005533	prpf38a	79	75.200	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	96.761	ENSTBEG00000000725	PRPF38A	79	96.761	Tupaia_belangeri
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSTTRG00000016139	PRPF38A	79	97.571	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSUAMG00000000625	PRPF38A	79	97.571	Ursus_americanus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSUMAG00000022674	PRPF38A	79	97.571	Ursus_maritimus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	67	96.386	ENSVPAG00000000907	PRPF38A	79	90.283	Vicugna_pacos
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	ENSVVUG00000004475	PRPF38A	79	97.571	Vulpes_vulpes
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	82.258	ENSXETG00000008060	prpf38a	79	87.097	Xenopus_tropicalis
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	63	86.076	ENSXCOG00000007393	prpf38a	56	85.119	Xiphophorus_couchianus
ENSAPLG00000005827	PRPF38A	63	88.462	ENSXMAG00000026143	prpf38a	79	79.032	Xiphophorus_maculatus