EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000005865 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: REXO4
Alias: -
Full Name: REX4 homolog%2C 3'-5' exonuclease
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4533 bases
Position: chrKB742651.1:1789675-1794207
Accession: 12820
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000005444	RNase_T	PF00929.24	1.7e-22	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000006075	REXO4-201	1447	-	ENSAPLP00000005444	330 (aa)	-	U3IDX2

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	57.225	ENSG00000148300	REXO4	80	57.225	Homo_sapiens
ENSAPLG00000005865	REXO4	71	72.103	ENSAPOG00000019264	rexo4	55	72.103	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	57.714	ENSAMEG00000011649	REXO4	82	57.714	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000005865	REXO4	71	72.103	ENSAOCG00000004087	rexo4	54	72.103	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000005865	REXO4	71	71.674	ENSAPEG00000009106	rexo4	54	71.674	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	54.651	ENSATEG00000017662	rexo4	79	54.651	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	57.143	ENSANAG00000028404	REXO4	80	58.017	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	55.491	ENSACLG00000006007	rexo4	79	55.491	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000005865	REXO4	83	62.116	ENSAMXG00000013291	rexo4	55	71.250	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000005865	REXO4	98	55.689	ENSBTAG00000019721	REXO4	80	55.689	Bos_taurus
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	56.560	ENSCJAG00000009774	REXO4	80	58.309	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	54.294	ENSCAFG00000019767	REXO4	83	54.294	Canis_familiaris
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	55.056	ENSCAFG00020000983	-	80	55.056	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000005865	REXO4	98	56.587	ENSCHIG00000009517	REXO4	80	56.587	Capra_hircus
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	55.556	ENSTSYG00000027492	REXO4	80	55.556	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000005865	REXO4	74	66.532	ENSCAPG00000014583	REXO4	71	66.935	Cavia_aperea
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	54.444	ENSCPOG00000001386	REXO4	80	54.722	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	49.856	ENSCCAG00000027049	REXO4	79	50.144	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	58.261	ENSCATG00000028646	REXO4	80	58.261	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000005865	REXO4	74	65.323	ENSCLAG00000006919	REXO4	73	65.726	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	59.184	ENSCSAG00000015280	REXO4	80	59.184	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	67.052	ENSCPBG00000021152	REXO4	83	67.052	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000005865	REXO4	65	58.879	ENSCING00000010751	-	76	58.879	Ciona_intestinalis
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	58.092	ENSCANG00000029855	REXO4	80	58.092	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000005865	REXO4	98	54.706	ENSCGRG00001013126	Rexo4	78	54.706	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000005865	REXO4	98	54.706	ENSCGRG00000009819	Rexo4	80	54.706	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	53.757	ENSCSEG00000019343	rexo4	78	53.757	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000005865	REXO4	66	72.477	ENSCVAG00000014963	rexo4	58	72.477	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000005865	REXO4	89	57.325	ENSDARG00000088619	rexo4	80	70.642	Danio_rerio
ENSAPLG00000005865	REXO4	98	50.633	ENSDNOG00000002429	REXO4	76	56.811	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000005865	REXO4	73	67.073	ENSDORG00000006190	Rexo4	70	67.073	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000005865	REXO4	51	54.762	FBgn0036405	CG6833	58	54.762	Drosophila_melanogaster
ENSAPLG00000005865	REXO4	67	55.794	ENSEASG00005009915	-	75	56.223	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	56.176	ENSECAG00000007896	REXO4	74	56.471	Equus_caballus
ENSAPLG00000005865	REXO4	51	74.556	ENSEEUG00000012135	-	52	74.556	Erinaceus_europaeus
ENSAPLG00000005865	REXO4	67	70.721	ENSELUG00000003539	rexo4	62	61.888	Esox_lucius
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	54.913	ENSFCAG00000011652	REXO4	77	54.913	Felis_catus
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	72.965	ENSFALG00000001520	REXO4	83	72.911	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	54.467	ENSFDAG00000016050	REXO4	81	54.467	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	55.491	ENSFHEG00000002413	rexo4	81	57.227	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000005865	REXO4	66	61.187	ENSGMOG00000012876	rexo4	66	61.187	Gadus_morhua
ENSAPLG00000005865	REXO4	77	50.549	ENSGAFG00000015404	-	79	51.460	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	55.255	ENSGACG00000008065	rexo4	77	55.255	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	67.463	ENSGAGG00000010260	REXO4	83	67.463	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	57.803	ENSGGOG00000014508	REXO4	80	57.803	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	55.202	ENSHBUG00000000542	rexo4	79	55.202	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	53.056	ENSHGLG00000016901	REXO4	81	55.014	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	53.056	ENSHGLG00100017444	REXO4	81	55.014	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000005865	REXO4	66	64.840	ENSHCOG00000018196	rexo4	56	64.840	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000005865	REXO4	67	69.507	ENSIPUG00000021084	rexo4	57	67.797	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000005865	REXO4	98	56.105	ENSSTOG00000003754	REXO4	79	56.105	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000005865	REXO4	98	56.973	ENSJJAG00000013002	Rexo4	76	57.270	Jaculus_jaculus
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	57.738	ENSKMAG00000015039	rexo4	80	57.738	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	55.491	ENSLBEG00000025570	rexo4	78	55.491	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	58.974	ENSLACG00000012399	REXO4	81	58.974	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	60.000	ENSLOCG00000003577	rexo4	77	61.159	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	53.541	ENSLAFG00000011274	REXO4	83	53.541	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	58.551	ENSMFAG00000042425	REXO4	80	58.551	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	58.551	ENSMMUG00000000935	REXO4	80	58.551	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	58.551	ENSMNEG00000031604	REXO4	80	58.551	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	58.621	ENSMLEG00000037716	REXO4	80	58.621	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000005865	REXO4	71	68.240	ENSMAMG00000011251	rexo4	80	53.372	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000005865	REXO4	71	70.339	ENSMZEG00005012336	rexo4	62	71.946	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	72.521	ENSMGAG00000006521	REXO4	96	72.521	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000005865	REXO4	98	56.213	ENSMAUG00000015137	Rexo4	78	56.213	Mesocricetus_auratus
ENSAPLG00000005865	REXO4	98	55.102	ENSMICG00000008422	REXO4	79	55.102	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000005865	REXO4	98	54.142	ENSMOCG00000020607	Rexo4	76	54.142	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	57.910	ENSMODG00000012817	REXO4	80	57.627	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	56.034	ENSMALG00000019705	rexo4	78	56.034	Monopterus_albus
ENSAPLG00000005865	REXO4	98	54.896	MGP_CAROLIEiJ_G0023332	-	80	54.896	Mus_caroli
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	53.644	ENSMUSG00000052406	Rexo4	82	53.644	Mus_musculus
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	53.353	MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	80	54.303	Mus_pahari
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	53.936	MGP_SPRETEiJ_G0024249	-	82	53.936	Mus_spretus
ENSAPLG00000005865	REXO4	74	67.068	ENSMPUG00000012315	REXO4	69	67.068	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000005865	REXO4	98	57.751	ENSNGAG00000010700	Rexo4	80	57.751	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000005865	REXO4	71	70.339	ENSNBRG00000011712	rexo4	56	70.339	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	56.686	ENSNLEG00000007556	-	84	56.686	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000005865	REXO4	98	58.824	ENSNLEG00000013130	-	79	58.824	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	44.509	ENSMEUG00000006513	-	57	52.301	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000005865	REXO4	73	66.531	ENSODEG00000015721	REXO4	69	66.531	Octodon_degus
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	56.305	ENSONIG00000020052	rexo4	80	56.305	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	58.739	ENSOANG00000002453	REXO4	90	58.739	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	58.507	ENSORLG00000006904	rexo4	79	58.507	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	58.754	ENSORLG00020013768	rexo4	79	58.754	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	58.160	ENSORLG00015012070	rexo4	79	58.160	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	58.841	ENSOMEG00000018327	rexo4	77	58.841	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	52.890	ENSOGAG00000014040	REXO4	81	56.268	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	57.681	ENSPPAG00000027911	REXO4	80	57.681	Pan_paniscus
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	57.227	ENSPPRG00000002894	REXO4	82	57.227	Panthera_pardus
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	49.401	ENSPTIG00000012007	REXO4	79	49.401	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	57.803	ENSPTRG00000023363	REXO4	80	57.803	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	58.551	ENSPANG00000026040	REXO4	80	58.551	Papio_anubis
ENSAPLG00000005865	REXO4	70	71.674	ENSPKIG00000024761	rexo4	54	71.674	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	65.217	ENSPSIG00000016908	REXO4	82	65.217	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000005865	REXO4	71	68.240	ENSPMGG00000005312	rexo4	59	66.524	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPLG00000005865	REXO4	98	55.357	ENSPEMG00000017982	Rexo4	80	55.357	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	56.571	ENSPCIG00000017379	REXO4	81	56.571	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	56.232	ENSPFOG00000017751	rexo4	80	56.725	Poecilia_formosa
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	56.358	ENSPLAG00000010487	rexo4	79	57.726	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	56.725	ENSPMEG00000020767	rexo4	80	57.941	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000005865	REXO4	69	70.485	ENSPREG00000021841	rexo4	79	57.143	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	57.514	ENSPPYG00000019735	REXO4	80	57.514	Pongo_abelii
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	55.000	ENSPCAG00000010581	REXO4	81	55.000	Procavia_capensis
ENSAPLG00000005865	REXO4	98	54.094	ENSPCOG00000025466	REXO4	79	54.094	Propithecus_coquereli
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	53.448	ENSPVAG00000001429	REXO4	81	53.736	Pteropus_vampyrus
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	55.202	ENSPNYG00000013712	rexo4	79	55.202	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000005865	REXO4	68	69.507	ENSPNAG00000019227	rexo4	67	58.746	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000005865	REXO4	98	54.734	ENSRNOG00000027867	Rexo4	80	54.734	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	58.671	ENSRBIG00000037515	REXO4	80	58.671	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	58.382	ENSRROG00000028864	REXO4	80	58.382	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000005865	REXO4	52	52.326	YOL080C	-	60	52.326	Saccharomyces_cerevisiae
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	46.087	ENSSBOG00000032587	REXO4	78	46.667	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	56.772	ENSSHAG00000005827	REXO4	87	56.772	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000005865	REXO4	66	73.394	ENSSFOG00015017394	rexo4	60	73.394	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000005865	REXO4	99	55.457	ENSSMAG00000015441	rexo4	78	55.457	Scophthalmus_maximus
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ENSAPLG00000005865	REXO4	99	55.143	ENSSSCG00000023173	REXO4	81	55.143	Sus_scrofa
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ENSAPLG00000005865	REXO4	99	59.050	ENSTNIG00000005873	rexo4	93	59.050	Tetraodon_nigroviridis
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