EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000006592 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1033 bases
Position: chrKB743161.1:82789-83821
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000006187	MMR_HSR1	PF01926.23	2.1e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000006828	-	522	-	ENSAPLP00000006187	174 (aa)	-	U3IG15

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000006592's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000006592's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAPLG00000006592	-	93	36.810	ENSAPLG00000015953	KRAS	84	36.810
ENSAPLG00000006592	-	95	41.916	ENSAPLG00000013463	-	70	41.916
ENSAPLG00000006592	-	95	40.476	ENSAPLG00000009597	RAB1A	80	40.237
ENSAPLG00000006592	-	97	42.442	ENSAPLG00000013647	-	97	42.442
ENSAPLG00000006592	-	94	32.941	ENSAPLG00000004323	RAB7A	93	32.941
ENSAPLG00000006592	-	93	36.527	ENSAPLG00000001949	RAB9B	81	36.527
ENSAPLG00000006592	-	89	44.231	ENSAPLG00000011046	-	70	44.231
ENSAPLG00000006592	-	91	42.767	ENSAPLG00000010775	RAB35	78	42.767
ENSAPLG00000006592	-	97	35.632	ENSAPLG00000002371	RAB9A	84	35.632
ENSAPLG00000006592	-	93	37.423	ENSAPLG00000012248	HRAS	96	37.423
ENSAPLG00000006592	-	93	34.969	ENSAPLG00000012817	RAB5A	74	34.969
ENSAPLG00000006592	-	89	31.677	ENSAPLG00000014490	GEM	54	31.361
ENSAPLG00000006592	-	90	31.646	ENSAPLG00000013435	MRAS	74	32.500
ENSAPLG00000006592	-	90	34.591	ENSAPLG00000008936	RAB36	58	34.591
ENSAPLG00000006592	-	91	39.877	ENSAPLG00000006894	RAB33B	69	39.877
ENSAPLG00000006592	-	68	33.898	ENSAPLG00000011744	RAB20	50	33.898
ENSAPLG00000006592	-	68	33.613	ENSAPLG00000006871	RRAS2	67	33.884
ENSAPLG00000006592	-	87	43.421	ENSAPLG00000014962	RAB11A	69	43.421
ENSAPLG00000006592	-	87	41.176	ENSAPLG00000009395	-	73	41.176
ENSAPLG00000006592	-	83	34.247	ENSAPLG00000003715	RAB23	85	33.758
ENSAPLG00000006592	-	93	38.554	ENSAPLG00000014543	RAB39B	76	38.554
ENSAPLG00000006592	-	93	39.877	ENSAPLG00000012821	RAB30	78	39.877
ENSAPLG00000006592	-	95	41.317	ENSAPLG00000009164	-	98	41.317

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000006592	-	56	74.490	ENSPKIG00000021308	-	78	74.490	Paramormyrops_kingsleyae