EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000006745 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: EEFSEC
Alias: -
Full Name: eukaryotic elongation factor%2C selenocysteine-tRNA specific
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 49479 bases
Position: chrKB742569.1:489824-539302
Accession: 101789705
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000006368	GTP_EFTU	PF00009.27	5.4e-08	1	1
ENSAPLP00000006368	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	6.6e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000007012	EEFSEC-201	1281	XM_005011867	ENSAPLP00000006368	427 (aa)	-	R0M2S4

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000006745's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000006745's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	78.704	ENSG00000132394	EEFSEC	72	78.704	Homo_sapiens
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	68.941	ENSAPOG00000015931	eefsec	72	68.941	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	79.206	ENSAMEG00000015165	EEFSEC	86	79.206	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	52	76.364	ENSACIG00000022407	eefsec	58	76.364	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	69.176	ENSAOCG00000008603	eefsec	72	69.176	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	67.277	ENSAPEG00000017090	eefsec	73	67.277	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	67.735	ENSATEG00000002753	eefsec	78	67.735	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	78.241	ENSANAG00000032691	EEFSEC	72	78.241	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	67.506	ENSACLG00000024565	eefsec	73	67.506	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	66.975	ENSAMXG00000002260	eefsec	72	66.975	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	75.463	ENSBTAG00000030962	EEFSEC	73	75.463	Bos_taurus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	74	30.031	WBGene00008133	efsc-1	61	30.031	Caenorhabditis_elegans
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	77.546	ENSCJAG00000005387	EEFSEC	72	77.546	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	79.302	ENSCAFG00000004135	EEFSEC	58	79.302	Canis_familiaris
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	79.302	ENSCAFG00020004811	EEFSEC	72	79.302	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	74.884	ENSCHIG00000021838	EEFSEC	75	74.884	Capra_hircus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	80.093	ENSTSYG00000012922	EEFSEC	72	80.093	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	72.622	ENSCAPG00000000084	EEFSEC	86	72.622	Cavia_aperea
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	78.009	ENSCPOG00000024352	EEFSEC	74	78.009	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	77.778	ENSCCAG00000031336	EEFSEC	72	77.778	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	78.472	ENSCATG00000019414	EEFSEC	88	78.118	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	77.958	ENSCLAG00000006973	EEFSEC	74	77.958	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	78.241	ENSCSAG00000008599	EEFSEC	72	78.241	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	93.144	ENSCPBG00000014356	EEFSEC	71	93.144	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	56.808	ENSCSAVG00000002208	-	79	56.808	Ciona_savignyi
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	78.241	ENSCANG00000031492	EEFSEC	72	78.241	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	79.446	ENSCGRG00001018089	Eefsec	74	79.446	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	79.446	ENSCGRG00000010063	Eefsec	74	79.446	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	66.515	ENSCSEG00000003008	eefsec	77	66.820	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	69.535	ENSCVAG00000005381	eefsec	72	69.535	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	67.667	ENSDARG00000004696	eefsec	73	67.667	Danio_rerio
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	74.126	ENSDNOG00000008925	EEFSEC	73	74.126	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	63.785	ENSDORG00000000264	Eefsec	80	85.185	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	98	43.230	FBgn0034627	eEFSec	76	43.230	Drosophila_melanogaster
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	87	77.005	ENSETEG00000007406	EEFSEC	63	77.005	Echinops_telfairi
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	75	57.812	ENSEBUG00000015029	eefsec	65	55.786	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	78.704	ENSEASG00005006786	EEFSEC	73	78.704	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	78.704	ENSECAG00000016565	EEFSEC	73	78.704	Equus_caballus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	64.612	ENSELUG00000016632	eefsec	73	64.612	Esox_lucius
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	78.935	ENSFCAG00000006153	EEFSEC	72	78.935	Felis_catus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	95.991	ENSFALG00000007901	EEFSEC	87	95.991	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	79.582	ENSFDAG00000010243	EEFSEC	85	85.430	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	69.302	ENSFHEG00000007155	eefsec	72	69.302	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	65.802	ENSGMOG00000007705	eefsec	72	66.353	Gadus_morhua
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	96.706	ENSGALG00000038684	EEFSEC	76	96.698	Gallus_gallus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	68.837	ENSGAFG00000021692	eefsec	73	68.837	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	69.484	ENSGACG00000000793	eefsec	74	69.484	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	92.671	ENSGAGG00000002059	EEFSEC	75	92.671	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	78.241	ENSGGOG00000001445	EEFSEC	83	78.241	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	69.647	ENSHBUG00000008917	eefsec	80	68.265	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	78.935	ENSHGLG00000000094	EEFSEC	78	86.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	78.935	ENSHGLG00100011393	EEFSEC	71	78.935	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	69.555	ENSHCOG00000004193	eefsec	72	69.555	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	67.209	ENSIPUG00000017291	eefsec	80	67.209	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	76.224	ENSSTOG00000019802	EEFSEC	85	82.781	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	68.224	ENSKMAG00000019907	eefsec	77	68.224	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	67.898	ENSLBEG00000017908	eefsec	73	67.898	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	77.518	ENSLACG00000013137	EEFSEC	82	77.518	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	70.396	ENSLOCG00000014535	eefsec	73	71.096	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	75.406	ENSLAFG00000001997	EEFSEC	74	75.406	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	78.472	ENSMFAG00000042128	EEFSEC	72	78.472	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	98	78.118	ENSMMUG00000018663	EEFSEC	88	78.118	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	78.472	ENSMNEG00000028574	EEFSEC	72	78.472	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	78.472	ENSMLEG00000041771	EEFSEC	81	78.472	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	66.819	ENSMAMG00000023964	eefsec	73	66.819	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	53	75.439	ENSMZEG00005009380	eefsec	57	75.439	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	90	93.540	ENSMGAG00000007243	EEFSEC	100	93.540	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	79.302	ENSMAUG00000011197	Eefsec	80	79.302	Mesocricetus_auratus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	79.677	ENSMOCG00000017748	Eefsec	74	79.677	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	51	78.000	ENSMMOG00000021820	eefsec	57	78.000	Mola_mola
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	85.176	ENSMODG00000008034	EEFSEC	65	85.176	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	67.890	ENSMALG00000016211	eefsec	81	67.890	Monopterus_albus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	79.908	MGP_CAROLIEiJ_G0028627	Eefsec	98	84.739	Mus_caroli
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	79.908	ENSMUSG00000033216	Eefsec	98	84.739	Mus_musculus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	80.046	MGP_PahariEiJ_G0022366	Eefsec	98	84.739	Mus_pahari
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	79.677	MGP_SPRETEiJ_G0029640	Eefsec	98	84.739	Mus_spretus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	78.704	ENSMPUG00000017340	EEFSEC	70	78.704	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	78.140	ENSMLUG00000004261	EEFSEC	87	78.140	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	68.192	ENSNBRG00000002387	eefsec	73	68.192	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	78.241	ENSNLEG00000014303	EEFSEC	72	78.241	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	84.906	ENSMEUG00000005747	EEFSEC	88	84.906	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	78.472	ENSOPRG00000011276	EEFSEC	73	78.472	Ochotona_princeps
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	78.472	ENSODEG00000002928	EEFSEC	80	78.472	Octodon_degus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	98	68.372	ENSONIG00000019038	eefsec	88	68.372	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	98	84.048	ENSOANG00000009108	EEFSEC	88	84.048	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	79.398	ENSOCUG00000016517	EEFSEC	73	79.398	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	68.837	ENSORLG00000001377	eefsec	72	68.837	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	68.837	ENSORLG00020000729	eefsec	72	68.837	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	68.837	ENSORLG00015001986	eefsec	72	68.837	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	68.981	ENSOMEG00000010071	eefsec	79	68.981	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	79.254	ENSOGAG00000014084	EEFSEC	96	79.254	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	87	74.064	ENSOARG00000004600	EEFSEC	100	74.332	Ovis_aries
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	78.935	ENSPPAG00000030936	EEFSEC	74	87.619	Pan_paniscus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	78.935	ENSPPRG00000002846	EEFSEC	72	78.935	Panthera_pardus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	78.935	ENSPTIG00000013855	EEFSEC	78	78.935	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	78.935	ENSPTRG00000015353	EEFSEC	74	87.619	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	78.704	ENSPANG00000017041	EEFSEC	72	78.704	Papio_anubis
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	65.548	ENSPKIG00000005220	eefsec	73	66.591	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	92.908	ENSPSIG00000015135	EEFSEC	81	92.908	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	68.372	ENSPMGG00000020300	eefsec	73	68.372	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	79.446	ENSPEMG00000013677	Eefsec	74	79.446	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	66.197	ENSPMAG00000006779	eefsec	80	66.197	Petromyzon_marinus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	98	84.928	ENSPCIG00000020494	EEFSEC	87	84.928	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	69.070	ENSPFOG00000003748	eefsec	73	69.070	Poecilia_formosa
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	69.231	ENSPLAG00000018012	eefsec	77	69.231	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	69.070	ENSPMEG00000001202	eefsec	73	69.070	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	68.519	ENSPREG00000012235	eefsec	73	68.519	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	78.241	ENSPPYG00000013436	EEFSEC	72	78.241	Pongo_abelii
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	96	68.613	ENSPCAG00000005883	EEFSEC	78	68.613	Procavia_capensis
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	73.380	ENSPCOG00000023432	EEFSEC	76	83.810	Propithecus_coquereli
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	67.277	ENSPNYG00000005726	eefsec	73	67.277	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	66.513	ENSPNAG00000016724	eefsec	73	66.513	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	79.908	ENSRNOG00000012954	Eefsec	74	79.908	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	78.241	ENSRBIG00000032635	EEFSEC	72	78.241	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	98	77.647	ENSSBOG00000031478	EEFSEC	88	77.647	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	98	84.689	ENSSHAG00000014760	EEFSEC	87	84.689	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	68.779	ENSSFOG00015021109	eefsec	73	64.955	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	66.820	ENSSMAG00000001454	eefsec	78	66.743	Scophthalmus_maximus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	67.506	ENSSDUG00000007924	eefsec	73	67.506	Seriola_dumerili
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	67.277	ENSSLDG00000024985	eefsec	74	67.277	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	98	89.713	ENSSPUG00000004191	EEFSEC	88	89.713	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	67.048	ENSSPAG00000001320	eefsec	73	67.048	Stegastes_partitus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	78.161	ENSSSCG00000011619	EEFSEC	80	78.241	Sus_scrofa
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	95.059	ENSTGUG00000007895	EEFSEC	74	95.059	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	67.898	ENSTRUG00000010327	eefsec	77	67.898	Takifugu_rubripes
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	67.277	ENSTNIG00000003225	eefsec	73	67.277	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	77.315	ENSTTRG00000000994	EEFSEC	74	77.315	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	79.630	ENSUAMG00000017283	EEFSEC	72	79.630	Ursus_americanus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	78.935	ENSVVUG00000018372	EEFSEC	91	78.935	Vulpes_vulpes
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	87	81.989	ENSXETG00000002066	eefsec	80	81.989	Xenopus_tropicalis
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	69.070	ENSXCOG00000019916	eefsec	73	69.070	Xiphophorus_couchianus
ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	69.321	ENSXMAG00000001839	eefsec	77	69.231	Xiphophorus_maculatus