EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000006813 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: PAPOLG
Alias: -
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 15819 bases
Position: chrKB742875.1:1045337-1061155
Accession: 101804019
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000006501	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.9e-27	1	2
ENSAPLP00000006501	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.9e-27	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000007147	PAPOLG-201	2238	XM_013096954	ENSAPLP00000006501	745 (aa)	XP_012952408	U3IGX9

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000006813's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
apla03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000006813's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	59.704	ENSAPLG00000006645	PAPOLA	98	59.704

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.684	ENSG00000115421	PAPOLG	100	91.880	Homo_sapiens
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	66.756	ENSAPOG00000004798	papolg	98	65.989	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	100	73.440	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	100	73.440	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	64.682	ENSACIG00000010546	papolg	98	65.176	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	66.354	ENSAOCG00000010254	papolg	88	66.845	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	66.488	ENSAPEG00000006944	papolg	88	66.979	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	66.846	ENSATEG00000009007	papolg	78	82.661	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	81	61.426	ENSACAG00000015048	-	100	61.426	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	72.800	ENSANAG00000024627	PAPOLG	98	73.954	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	72	79.664	ENSACLG00000015592	papolg	88	65.921	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	66.799	ENSAMXG00000004611	papolg	99	66.799	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.901	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	99	73.901	Bos_taurus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.067	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	98	74.224	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.113	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	90	73.210	Canis_familiaris
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	72.973	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	99	72.944	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	74.764	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	98	74.764	Capra_hircus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.298	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	99	73.768	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	52	83.333	ENSCAPG00000014901	-	100	83.333	Cavia_aperea
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.502	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	99	73.901	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.279	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	98	74.359	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	90	86.283	ENSCATG00000044395	PAPOLG	99	86.283	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.768	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	99	73.768	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	74.089	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	98	74.494	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	90	70.963	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	70.963	Choloepus_hoffmanni
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	72	58.748	ENSCING00000024664	-	99	58.748	Ciona_intestinalis
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	65	63.244	ENSCSAVG00000009085	-	97	63.244	Ciona_savignyi
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.954	ENSCANG00000038120	PAPOLG	98	74.359	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.226	ENSCGRG00001014951	Papolg	100	73.628	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.226	ENSCGRG00000005552	-	100	73.628	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	65.583	ENSCSEG00000000771	papolg	98	66.125	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	72	78.545	ENSCVAG00000016602	papolg	88	81.727	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	66.533	ENSDARG00000012141	papolg	98	67.564	Danio_rerio
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	72.237	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	98	72.642	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	57	88.290	ENSDORG00000016228	Papolg	99	88.290	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	59.649	ENSETEG00000011815	PAPOLG	98	59.892	Echinops_telfairi
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	59	68.571	ENSEBUG00000004020	papolg	88	68.571	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	63	57.143	ENSEBUG00000005042	-	79	57.143	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.867	ENSEASG00005002038	PAPOLG	99	73.867	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	74.064	ENSECAG00000009859	PAPOLG	98	74.064	Equus_caballus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	65.246	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	99	65.246	Erinaceus_europaeus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	66.141	ENSELUG00000014497	papolg	94	66.428	Esox_lucius
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	72.884	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	99	72.884	Felis_catus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	72.252	ENSFALG00000011079	PAPOLG	96	72.252	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	74.301	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	96	74.301	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	67	56.556	ENSFHEG00000019080	papolg	90	56.870	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	86	78.165	ENSGMOG00000018772	papolg	92	78.716	Gadus_morhua
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	82.638	ENSGALG00000007853	PAPOLG	99	82.638	Gallus_gallus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	72	79.516	ENSGAFG00000003263	papolg	88	65.741	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	66.757	ENSGACG00000002718	papolg	98	67.206	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.144	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	98	74.359	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	72	79.664	ENSHBUG00000004882	papolg	88	65.921	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	100	74.138	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	100	74.138	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	74.335	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	99	74.335	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	65.772	ENSHCOG00000006782	papolg	87	65.779	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	67.116	ENSIPUG00000021642	papolg	99	66.935	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.236	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	99	73.635	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	57	87.588	ENSJJAG00000015601	Papolg	99	87.588	Jaculus_jaculus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	65.212	ENSKMAG00000016439	papolg	95	64.770	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	72	79.221	ENSLBEG00000023218	papolg	88	64.820	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	65.094	ENSLACG00000009543	PAPOLG	98	65.094	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	67.497	ENSLOCG00000016130	papolg	99	67.497	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	72.557	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	99	87.559	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.635	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	99	74.035	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.635	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	99	74.035	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	66.890	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	98	67.158	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.768	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	99	74.035	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	66.489	ENSMAMG00000010667	papolg	98	65.857	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	72	79.664	ENSMZEG00005018140	papolg	99	66.171	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	83.333	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	99	83.333	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	72.679	ENSMAUG00000009088	Papolg	99	73.077	Mesocricetus_auratus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.333	ENSMICG00000010042	PAPOLG	99	73.333	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	72.533	ENSMOCG00000006857	Papolg	99	72.933	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	66.220	ENSMMOG00000008020	papolg	98	66.889	Mola_mola
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	74.800	ENSMODG00000002160	PAPOLG	99	74.800	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	65.748	ENSMALG00000007012	papolg	88	65.658	Monopterus_albus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.431	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	99	88.263	Mus_caroli
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	72.715	ENSMUSG00000020273	Papolg	99	88.263	Mus_musculus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.727	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	73.727	Mus_pahari
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.431	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	88.263	Mus_spretus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.502	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	90	73.502	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	100	72.464	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	100	72.464	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	72.377	ENSNGAG00000001120	Papolg	99	72.776	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	58.824	ENSNBRG00000011943	papolg	99	59.868	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	57	87.793	ENSNLEG00000009507	-	99	87.793	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	81	70.000	ENSMEUG00000013605	-	87	70.000	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.502	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	99	73.502	Ochotona_princeps
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	57	84.507	ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	84.507	Octodon_degus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	60.345	ENSONIG00000002985	papolg	98	61.074	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	74.400	ENSOANG00000012403	PAPOLG	99	74.400	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	74.301	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	99	74.301	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	65.328	ENSORLG00000001577	papolg	87	65.282	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	64.793	ENSORLG00020002482	papolg	87	65.147	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	65.060	ENSORLG00015008836	papolg	87	65.013	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	65.200	ENSOMEG00000001406	papolg	88	65.821	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	59	61.348	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	61.348	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	74.000	ENSOARG00000001563	PAPOLG	90	74.000	Ovis_aries
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.684	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	98	74.089	Pan_paniscus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	72.884	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	99	72.884	Panthera_pardus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	72.751	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	99	72.751	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.684	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	98	74.089	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	70.390	ENSPANG00000014543	PAPOLG	98	70.794	Papio_anubis
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	92	66.957	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	96	66.957	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	66.358	ENSPKIG00000003313	papolg	99	66.358	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	100	74.766	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	74.766	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.360	ENSPEMG00000008960	-	100	73.762	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	51.184	ENSPMAG00000002961	papolg	99	51.252	Petromyzon_marinus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	66	62.450	ENSPMAG00000004864	-	98	62.450	Petromyzon_marinus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	75.233	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	99	75.233	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	64.191	ENSPFOG00000012909	papolg	98	66.050	Poecilia_formosa
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	72	79.143	ENSPLAG00000018445	papolg	88	65.695	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	65.642	ENSPMEG00000003961	papolg	88	66.043	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	72	79.143	ENSPREG00000010358	papolg	88	65.695	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.819	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	98	74.224	Pongo_abelii
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	65.583	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	99	65.583	Procavia_capensis
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	66.800	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	99	66.800	Propithecus_coquereli
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	86	82.537	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	86	82.537	Pteropus_vampyrus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	65.176	ENSPNYG00000006729	papolg	98	65.583	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	66.313	ENSPNAG00000015521	papolg	99	66.313	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.510	ENSRNOG00000006261	Papolg	99	73.510	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	69.189	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	98	69.459	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	74.054	ENSRROG00000035954	PAPOLG	98	74.459	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.200	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	98	74.359	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	95	75.316	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	75.316	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	59.489	ENSSFOG00015011874	papolg	98	59.489	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	65.182	ENSSFOG00015002383	papolg	98	65.182	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	72	78.839	ENSSMAG00000015598	papolg	93	63.452	Scophthalmus_maximus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	65.765	ENSSDUG00000000912	papolg	98	65.447	Seriola_dumerili
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	65.600	ENSSLDG00000001217	papolg	98	62.299	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.289	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	99	73.289	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	65.744	ENSSPAG00000009004	papolg	98	65.041	Stegastes_partitus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.727	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	98	73.727	Sus_scrofa
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	73	79.190	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	99	79.190	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	64.430	ENSTRUG00000006410	papolg	99	64.832	Takifugu_rubripes
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	60.211	ENSTNIG00000017106	papolg	99	60.343	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	67.290	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	99	67.290	Tupaia_belangeri
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	69.947	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	99	69.947	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.404	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	73.404	Ursus_americanus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.404	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	90	73.404	Ursus_maritimus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	71.162	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	99	71.028	Vicugna_pacos
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.635	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	73.635	Vulpes_vulpes
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	70.306	ENSXETG00000002208	papolg	99	70.306	Xenopus_tropicalis
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	67	81.489	ENSXCOG00000006611	papolg	73	81.489	Xiphophorus_couchianus
ENSAPLG00000006813	PAPOLG	72	79.074	ENSXMAG00000007383	papolg	89	79.074	Xiphophorus_maculatus