EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000006878 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: BLM
Alias: -
Full Name: BLM RecQ like helicase
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 15935 bases
Position: chrKB742410.1:141667-157601
Accession: 101790058
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000006514	HRDC	PF00570.23	5.9e-13	1	1
ENSAPLP00000006514	BDHCT	PF08072.11	5.2e-22	1	1
ENSAPLP00000006514	DEAD	PF00270.29	1e-18	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000007160	BLM-201	3588	XM_005009250	ENSAPLP00000006514	1195 (aa)	XP_005009307	U3IGZ2

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000006878's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
apla03440	Homologous recombination	KEGG
apla03460	Fanconi anemia pathway	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000006878's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000006878	BLM	98	58.221	ENSG00000197299	BLM	81	58.583	Homo_sapiens
ENSAPLG00000006878	BLM	96	51.201	ENSAPOG00000017966	blm	82	51.583	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000006878	BLM	97	58.468	ENSAMEG00000013843	BLM	80	58.503	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000006878	BLM	83	60.748	ENSACIG00000023762	blm	79	50.876	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000006878	BLM	97	52.003	ENSAOCG00000003318	blm	81	52.632	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000006878	BLM	97	51.833	ENSAPEG00000018105	blm	80	52.336	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000006878	BLM	76	71.021	ENSACAG00000014275	BLM	79	59.250	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000006878	BLM	96	58.793	ENSANAG00000038415	BLM	81	58.292	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000006878	BLM	83	62.005	ENSACLG00000020354	blm	81	51.240	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000006878	BLM	89	59.547	ENSBTAG00000020301	BLM	80	59.283	Bos_taurus
ENSAPLG00000006878	BLM	53	41.272	WBGene00001865	him-6	66	41.272	Caenorhabditis_elegans
ENSAPLG00000006878	BLM	96	59.212	ENSCJAG00000009803	BLM	81	58.575	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000006878	BLM	83	68.230	ENSCAFG00000012385	BLM	81	58.194	Canis_familiaris
ENSAPLG00000006878	BLM	83	68.347	ENSCAFG00020016111	BLM	94	74.513	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000006878	BLM	98	57.060	ENSCHIG00000010329	BLM	81	57.452	Capra_hircus
ENSAPLG00000006878	BLM	99	57.048	ENSTSYG00000012368	BLM	82	57.369	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000006878	BLM	83	67.493	ENSCAPG00000017976	BLM	82	67.733	Cavia_aperea
ENSAPLG00000006878	BLM	98	56.904	ENSCPOG00000001761	BLM	81	57.251	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000006878	BLM	80	69.067	ENSCCAG00000023069	BLM	81	58.118	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000006878	BLM	98	58.354	ENSCATG00000040609	BLM	91	72.629	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000006878	BLM	98	56.500	ENSCLAG00000012111	BLM	81	56.846	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000006878	BLM	98	58.319	ENSCSAG00000017040	BLM	81	58.681	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000006878	BLM	91	60.124	ENSCHOG00000006255	BLM	77	60.331	Choloepus_hoffmanni
ENSAPLG00000006878	BLM	99	68.688	ENSCPBG00000025000	BLM	99	70.061	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000006878	BLM	79	70.556	ENSCANG00000034808	BLM	77	70.556	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000006878	BLM	96	57.374	ENSCGRG00001024897	Blm	80	58.171	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000006878	BLM	57	51.195	ENSCGRG00000016261	Blm	68	52.381	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000006878	BLM	72	63.014	ENSDARG00000077089	blm	83	53.110	Danio_rerio
ENSAPLG00000006878	BLM	83	67.364	ENSDNOG00000010159	BLM	81	58.083	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000006878	BLM	90	59.522	ENSDORG00000011033	Blm	99	60.074	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000006878	BLM	87	47.518	ENSETEG00000015019	BLM	72	47.518	Echinops_telfairi
ENSAPLG00000006878	BLM	52	56.640	ENSEBUG00000015743	-	89	56.361	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000006878	BLM	97	55.810	ENSEASG00005006727	BLM	82	55.739	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000006878	BLM	97	58.312	ENSECAG00000011405	BLM	82	58.134	Equus_caballus
ENSAPLG00000006878	BLM	97	57.095	ENSEEUG00000001434	BLM	82	57.107	Erinaceus_europaeus
ENSAPLG00000006878	BLM	69	63.270	ENSELUG00000019098	blm	78	52.733	Esox_lucius
ENSAPLG00000006878	BLM	97	57.276	ENSFCAG00000006087	BLM	80	57.868	Felis_catus
ENSAPLG00000006878	BLM	97	71.969	ENSFALG00000010981	BLM	90	71.969	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000006878	BLM	99	50.824	ENSFDAG00000012658	BLM	81	51.236	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000006878	BLM	69	62.262	ENSFHEG00000002553	blm	81	51.351	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000006878	BLM	85	62.776	ENSGMOG00000016431	blm	99	57.610	Gadus_morhua
ENSAPLG00000006878	BLM	99	80.453	ENSGALG00000008256	BLM	85	80.537	Gallus_gallus
ENSAPLG00000006878	BLM	69	62.262	ENSGAFG00000001117	blm	84	51.956	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000006878	BLM	91	52.518	ENSGACG00000010863	blm	100	71.509	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000006878	BLM	85	69.700	ENSGAGG00000005383	BLM	99	67.113	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000006878	BLM	98	58.438	ENSGGOG00000007710	BLM	91	72.900	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000006878	BLM	71	62.369	ENSHBUG00000015943	blm	81	51.551	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000006878	BLM	98	58.278	ENSHGLG00000013231	BLM	82	57.455	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000006878	BLM	77	56.865	ENSHCOG00000011455	blm	91	56.210	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000006878	BLM	97	50.128	ENSIPUG00000000529	blm	94	50.297	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000006878	BLM	84	68.602	ENSSTOG00000005000	BLM	82	57.553	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000006878	BLM	80	59.791	ENSJJAG00000016322	Blm	94	60.268	Jaculus_jaculus
ENSAPLG00000006878	BLM	58	67.098	ENSLBEG00000018729	blm	93	61.501	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000006878	BLM	71	68.134	ENSLACG00000006490	BLM	79	57.395	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000006878	BLM	87	60.879	ENSLOCG00000014302	blm	74	61.394	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000006878	BLM	98	58.438	ENSMFAG00000042982	BLM	91	72.629	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000006878	BLM	98	58.270	ENSMMUG00000019526	BLM	91	72.629	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000006878	BLM	93	59.180	ENSMNEG00000031251	BLM	91	72.358	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000006878	BLM	98	55.929	ENSMLEG00000032934	BLM	81	56.307	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000006878	BLM	72	60.995	ENSMAMG00000008726	blm	82	51.048	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000006878	BLM	71	61.960	ENSMZEG00005022323	blm	75	53.465	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000006878	BLM	50	87.270	ENSMGAG00000010473	BLM	100	86.789	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000006878	BLM	71	68.452	ENSMAUG00000008953	Blm	79	58.615	Mesocricetus_auratus
ENSAPLG00000006878	BLM	98	58.692	ENSMICG00000034442	BLM	81	58.692	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000006878	BLM	84	68.881	ENSMOCG00000016367	Blm	82	58.444	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000006878	BLM	96	50.980	ENSMMOG00000006959	blm	80	51.358	Mola_mola
ENSAPLG00000006878	BLM	97	58.514	ENSMODG00000019449	BLM	80	59.782	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000006878	BLM	98	50.964	ENSMALG00000007323	blm	81	51.261	Monopterus_albus
ENSAPLG00000006878	BLM	98	56.750	MGP_CAROLIEiJ_G0029907	Blm	81	56.845	Mus_caroli
ENSAPLG00000006878	BLM	97	56.901	ENSMUSG00000030528	Blm	79	57.576	Mus_musculus
ENSAPLG00000006878	BLM	99	57.190	MGP_PahariEiJ_G0013129	Blm	81	57.427	Mus_pahari
ENSAPLG00000006878	BLM	97	56.419	MGP_SPRETEiJ_G0031009	Blm	79	57.275	Mus_spretus
ENSAPLG00000006878	BLM	79	58.091	ENSMPUG00000015657	BLM	76	58.549	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000006878	BLM	97	57.653	ENSMLUG00000014697	BLM	80	57.774	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000006878	BLM	98	57.488	ENSNGAG00000001275	Blm	81	57.724	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000006878	BLM	72	61.707	ENSNBRG00000019702	blm	61	60.630	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000006878	BLM	98	56.591	ENSNLEG00000012087	BLM	99	57.987	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000006878	BLM	97	55.993	ENSMEUG00000007253	BLM	79	56.570	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000006878	BLM	91	69.577	ENSOPRG00000011667	BLM	77	69.315	Ochotona_princeps
ENSAPLG00000006878	BLM	90	55.907	ENSODEG00000015373	BLM	99	56.140	Octodon_degus
ENSAPLG00000006878	BLM	80	62.428	ENSONIG00000015193	blm	78	52.078	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000006878	BLM	64	71.520	ENSOANG00000009316	-	100	71.520	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPLG00000006878	BLM	97	58.100	ENSOCUG00000013969	BLM	80	58.425	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000006878	BLM	97	52.876	ENSORLG00000008110	blm	81	53.035	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000006878	BLM	97	52.946	ENSORLG00020004812	blm	81	52.936	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000006878	BLM	97	52.775	ENSORLG00015018640	blm	88	59.215	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000006878	BLM	99	51.410	ENSOMEG00000023545	blm	82	51.570	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000006878	BLM	99	55.345	ENSOGAG00000005708	BLM	82	55.474	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000006878	BLM	98	57.226	ENSOARG00000012875	BLM	81	57.641	Ovis_aries
ENSAPLG00000006878	BLM	93	59.127	ENSPPAG00000032173	BLM	81	58.333	Pan_paniscus
ENSAPLG00000006878	BLM	97	57.420	ENSPPRG00000002471	BLM	80	57.961	Panthera_pardus
ENSAPLG00000006878	BLM	97	57.179	ENSPTIG00000016168	BLM	80	57.806	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000006878	BLM	93	59.216	ENSPTRG00000007460	BLM	81	58.417	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000006878	BLM	98	58.354	ENSPANG00000018572	BLM	91	72.629	Papio_anubis
ENSAPLG00000006878	BLM	98	51.400	ENSPKIG00000008954	blm	82	51.855	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000006878	BLM	60	66.852	ENSPMGG00000006629	blm	88	60.237	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPLG00000006878	BLM	96	57.962	ENSPEMG00000017348	Blm	81	57.510	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000006878	BLM	61	57.085	ENSPMAG00000000445	blm	99	57.276	Petromyzon_marinus
ENSAPLG00000006878	BLM	98	59.482	ENSPCIG00000006609	BLM	81	59.950	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000006878	BLM	82	60.161	ENSPFOG00000005059	blm	80	51.583	Poecilia_formosa
ENSAPLG00000006878	BLM	72	60.323	ENSPLAG00000017344	blm	80	50.900	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000006878	BLM	72	60.417	ENSPMEG00000000321	blm	80	51.497	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000006878	BLM	72	60.809	ENSPREG00000007715	blm	79	51.286	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000006878	BLM	96	58.304	ENSPPYG00000006784	BLM	81	58.145	Pongo_abelii
ENSAPLG00000006878	BLM	82	65.273	ENSPCAG00000008960	BLM	70	64.806	Procavia_capensis
ENSAPLG00000006878	BLM	98	50.417	ENSPCOG00000000439	BLM	80	50.417	Propithecus_coquereli
ENSAPLG00000006878	BLM	72	82.392	ENSPVAG00000011642	BLM	61	82.392	Pteropus_vampyrus
ENSAPLG00000006878	BLM	71	51.217	ENSPNYG00000010956	blm	78	43.745	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000006878	BLM	99	52.362	ENSPNAG00000011714	blm	83	53.051	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000006878	BLM	99	55.921	ENSRNOG00000011213	Blm	82	56.404	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000006878	BLM	97	58.376	ENSRBIG00000029656	BLM	91	71.816	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000006878	BLM	98	58.522	ENSRROG00000037871	BLM	91	71.816	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000006878	BLM	85	57.968	ENSSBOG00000030957	BLM	79	57.663	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000006878	BLM	98	58.877	ENSSHAG00000007988	BLM	83	59.468	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000006878	BLM	71	61.137	ENSSFOG00015015462	blm	72	59.480	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000006878	BLM	82	60.829	ENSSMAG00000001120	blm	81	51.224	Scophthalmus_maximus
ENSAPLG00000006878	BLM	72	61.476	ENSSDUG00000010955	blm	80	52.312	Seriola_dumerili
ENSAPLG00000006878	BLM	72	61.636	ENSSLDG00000000634	blm	80	52.438	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPLG00000006878	BLM	90	54.777	ENSSARG00000006398	BLM	79	54.809	Sorex_araneus
ENSAPLG00000006878	BLM	90	65.082	ENSSPUG00000000013	BLM	98	61.577	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000006878	BLM	72	61.253	ENSSPAG00000013999	blm	79	52.159	Stegastes_partitus
ENSAPLG00000006878	BLM	99	57.842	ENSSSCG00000001816	BLM	81	58.478	Sus_scrofa
ENSAPLG00000006878	BLM	97	66.695	ENSTGUG00000009959	-	100	67.382	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000006878	BLM	79	62.655	ENSTRUG00000019860	blm	73	58.739	Takifugu_rubripes
ENSAPLG00000006878	BLM	82	60.599	ENSTNIG00000019246	blm	81	51.494	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPLG00000006878	BLM	99	57.664	ENSTTRG00000016386	BLM	82	58.285	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000006878	BLM	97	58.177	ENSUMAG00000009105	BLM	94	74.059	Ursus_maritimus
ENSAPLG00000006878	BLM	99	54.847	ENSVPAG00000000085	BLM	82	55.033	Vicugna_pacos
ENSAPLG00000006878	BLM	98	57.750	ENSVVUG00000006402	BLM	81	57.952	Vulpes_vulpes
ENSAPLG00000006878	BLM	97	56.698	ENSXETG00000007847	blm	80	56.723	Xenopus_tropicalis
ENSAPLG00000006878	BLM	69	59.069	ENSXCOG00000020227	blm	73	51.101	Xiphophorus_couchianus
ENSAPLG00000006878	BLM	71	60.422	ENSXMAG00000002951	blm	80	51.451	Xiphophorus_maculatus