EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000007014 (Gene tree)
Gene ID: 101795326
Gene Symbol: PNLDC1
Alias: -
Full Name: PARN like%2C ribonuclease domain containing 1
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 11846 bases
Position: chrKB742815.1:796919-808764
Accession: 101795326
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000006629	CAF1	PF04857.20	4.8e-77	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000007276	PNLDC1-201	1566	XM_005015910	ENSAPLP00000006629	522 (aa)	-	U3IHA7

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000007014's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
apla03018	RNA degradation	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000007014's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	99	58.046	ENSG00000146453	PNLDC1	99	58.046	Homo_sapiens
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	58.984	ENSAMEG00000015371	PNLDC1	95	58.984	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	59.566	ENSACAG00000013667	PNLDC1	95	59.566	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	57.843	ENSANAG00000034713	PNLDC1	95	57.843	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	58.627	ENSBTAG00000015166	PNLDC1	97	58.077	Bos_taurus
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	57.059	ENSCJAG00000011865	PNLDC1	99	56.863	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	98	59.649	ENSCAFG00000000740	PNLDC1	95	59.649	Canis_familiaris
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	98	57.505	ENSCAFG00020017742	PNLDC1	95	57.505	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	99	56.214	ENSCHIG00000003141	PNLDC1	98	56.214	Capra_hircus
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	57.451	ENSTSYG00000005606	PNLDC1	95	57.451	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	88	47.425	ENSCAPG00000011893	PNLDC1	88	47.425	Cavia_aperea
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	55.773	ENSCPOG00000019565	PNLDC1	95	55.773	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	57.451	ENSCCAG00000026232	PNLDC1	95	57.451	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	57.647	ENSCATG00000033196	PNLDC1	95	57.647	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	59.412	ENSCLAG00000003228	PNLDC1	95	59.412	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	99	56.489	ENSCSAG00000012478	PNLDC1	99	56.489	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	93	71.721	ENSCPBG00000004050	PNLDC1	95	71.721	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	98	57.752	ENSCANG00000043076	PNLDC1	98	57.752	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	46.184	ENSCGRG00001011981	-	93	46.184	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	57.647	ENSCGRG00001007470	-	95	57.647	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	46.771	ENSCGRG00000003103	-	94	46.771	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	57.647	ENSCGRG00000010221	-	95	57.647	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	59.883	ENSDNOG00000013709	PNLDC1	95	59.883	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	54.990	ENSDORG00000011517	Pnldc1	92	58.419	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	93	53.862	ENSETEG00000007587	PNLDC1	98	53.862	Echinops_telfairi
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	96	30.385	ENSEBUG00000008118	PNLDC1	94	30.385	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	98	54.789	ENSEASG00005019029	PNLDC1	95	54.789	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	98	60.234	ENSECAG00000012898	PNLDC1	95	60.234	Equus_caballus
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	69	56.250	ENSEEUG00000005717	-	85	56.250	Erinaceus_europaeus
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	98	60.429	ENSFCAG00000002848	PNLDC1	95	60.429	Felis_catus
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	78.543	ENSFALG00000012081	PNLDC1	100	78.543	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	58.708	ENSFDAG00000021334	PNLDC1	95	58.708	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	83	75.113	ENSGALG00000011624	PNLDC1	86	75.113	Gallus_gallus
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	71.203	ENSGAGG00000015276	PNLDC1	100	70.928	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	58.627	ENSGGOG00000014077	PNLDC1	95	58.627	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	59.608	ENSHGLG00000006889	PNLDC1	95	59.608	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	59.608	ENSHGLG00100018275	PNLDC1	95	59.608	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	60.196	ENSSTOG00000005595	PNLDC1	95	60.196	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	98	54.864	ENSJJAG00000009937	Pnldc1	95	54.864	Jaculus_jaculus
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	56	58.163	ENSLAFG00000030189	PNLDC1	85	58.163	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	57.647	ENSMFAG00000041296	PNLDC1	95	57.647	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	99	56.415	ENSMMUG00000004181	PNLDC1	99	56.415	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	57.647	ENSMNEG00000034271	PNLDC1	95	57.647	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	55.098	ENSMLEG00000044059	PNLDC1	95	55.098	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	99	79.423	ENSMGAG00000012470	PNLDC1	99	79.423	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	49.016	ENSMAUG00000012298	Pnldc1	95	49.016	Mesocricetus_auratus
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	58.235	ENSMICG00000008021	PNLDC1	95	58.235	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	57.843	ENSMOCG00000014287	Pnldc1	95	57.843	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	61.252	ENSMODG00000007420	PNLDC1	95	61.252	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	98	59.064	MGP_CAROLIEiJ_G0021045	Pnldc1	95	59.064	Mus_caroli
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	98	58.869	ENSMUSG00000073460	Pnldc1	95	58.869	Mus_musculus
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	98	59.144	MGP_PahariEiJ_G0023361	Pnldc1	96	59.144	Mus_pahari
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	98	59.454	MGP_SPRETEiJ_G0021975	Pnldc1	95	59.454	Mus_spretus
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	98	59.259	ENSMPUG00000004920	PNLDC1	95	59.259	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	60.861	ENSMLUG00000000747	PNLDC1	95	60.861	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	59.608	ENSNGAG00000017714	Pnldc1	95	59.608	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	99	58.046	ENSNLEG00000011282	PNLDC1	99	58.046	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	61	51.250	ENSMEUG00000011926	-	63	51.250	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	56	53.425	ENSMEUG00000014042	-	100	53.425	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	73	58.901	ENSOPRG00000003813	PNLDC1	71	58.901	Ochotona_princeps
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	98	59.339	ENSODEG00000008047	PNLDC1	96	59.339	Octodon_degus
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	50.198	ENSOANG00000012199	PNLDC1	95	50.394	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	98	59.064	ENSOCUG00000013867	PNLDC1	95	59.064	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	59.020	ENSOGAG00000007331	PNLDC1	95	59.020	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	57.143	ENSOARG00000004585	PNLDC1	95	57.143	Ovis_aries
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	58.039	ENSPPAG00000026651	PNLDC1	95	58.039	Pan_paniscus
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	98	60.039	ENSPPRG00000012854	PNLDC1	95	60.039	Panthera_pardus
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	58.039	ENSPTIG00000011501	PNLDC1	94	58.039	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	99	57.471	ENSPTRG00000018762	PNLDC1	99	57.471	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	57.647	ENSPANG00000022009	PNLDC1	95	57.647	Papio_anubis
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	59.216	ENSPEMG00000016301	Pnldc1	95	59.216	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	68	30.334	ENSPMAG00000003956	parn	71	30.334	Petromyzon_marinus
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	83	62.471	ENSPCIG00000023412	PNLDC1	98	62.471	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	55.058	ENSPPYG00000017148	PNLDC1	95	55.058	Pongo_abelii
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	98	53.216	ENSPCAG00000014169	PNLDC1	95	53.216	Procavia_capensis
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	58.627	ENSPCOG00000025722	PNLDC1	95	58.627	Propithecus_coquereli
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	69	61.644	ENSPVAG00000005325	PNLDC1	68	61.644	Pteropus_vampyrus
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	98	58.869	ENSRNOG00000023140	Pnldc1	100	54.601	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	98	58.090	ENSRBIG00000033806	PNLDC1	95	58.090	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	98	57.946	ENSRROG00000043919	PNLDC1	98	57.946	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	57.843	ENSSBOG00000019135	PNLDC1	95	57.843	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	61.133	ENSSHAG00000015192	PNLDC1	97	61.133	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	54	66.549	ENSSPUG00000004627	PNLDC1	99	62.667	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	58.008	ENSSSCG00000004046	PNLDC1	98	58.008	Sus_scrofa
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	93	78.645	ENSTGUG00000011418	PNLDC1	99	78.645	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	98	51.550	ENSTBEG00000009131	PNLDC1	98	51.550	Tupaia_belangeri
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	69	57.260	ENSTTRG00000010409	PNLDC1	68	57.260	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	98	50.288	ENSUAMG00000015783	PNLDC1	95	50.288	Ursus_americanus
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	97	54.669	ENSUMAG00000011903	PNLDC1	99	54.669	Ursus_maritimus
ENSAPLG00000007014	PNLDC1	94	59.514	ENSVVUG00000006586	PNLDC1	98	59.959	Vulpes_vulpes