EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000007162 (Gene tree)
Gene ID: 101803516
Gene Symbol: CNOT1
Alias: -
Full Name: CCR4-NOT transcription complex subunit 1
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 51934 bases
Position: chrKB743822.1:119610-171543
Accession: 101803516
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000006862	Not1	PF04054.15	4.1e-153	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000007513	CNOT1-201	7143	XM_005025665	ENSAPLP00000006862	2380 (aa)	XP_005025722	U3IHZ0

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000007162's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
apla03018	RNA degradation	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000007162's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.647	ENSG00000125107	CNOT1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSAPLG00000007162	CNOT1	97	96.919	ENSAPOG00000005042	cnot1	100	95.938	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.479	ENSAMEG00000017298	CNOT1	100	97.479	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000007162	CNOT1	90	89.390	ENSACIG00000016003	cnot1	100	89.297	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	89.983	ENSAPEG00000022342	cnot1	100	89.648	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	87.018	ENSATEG00000012892	cnot1	100	87.055	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	91	96.991	ENSACAG00000001602	CNOT1	98	96.991	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	94.772	ENSANAG00000038198	CNOT1	100	94.772	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000007162	CNOT1	97	97.059	ENSACLG00000014234	cnot1	100	96.078	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	90.466	ENSAMXG00000013170	cnot1	100	90.638	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.731	ENSBTAG00000020782	CNOT1	100	98.406	Bos_taurus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	82	40.000	WBGene00002845	let-711	92	54.430	Caenorhabditis_elegans
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.605	ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	97.605	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.400	ENSCAFG00000008426	CNOT1	100	97.400	Canis_familiaris
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	96.651	ENSCAFG00020010156	CNOT1	100	96.699	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.731	ENSCHIG00000010452	CNOT1	100	97.731	Capra_hircus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.773	ENSTSYG00000006888	CNOT1	100	97.773	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	93.403	ENSCPOG00000013026	CNOT1	100	93.403	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	96.050	ENSCCAG00000026333	CNOT1	100	96.050	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.689	ENSCATG00000032625	CNOT1	100	97.689	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.689	ENSCLAG00000006289	CNOT1	100	97.689	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.689	ENSCSAG00000004731	CNOT1	100	97.689	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	80	100.000	ENSCHOG00000009712	CNOT1	82	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSAPLG00000007162	CNOT1	98	95.959	ENSCPBG00000026222	CNOT1	99	98.613	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	58.858	ENSCING00000009149	-	100	58.440	Ciona_intestinalis
ENSAPLG00000007162	CNOT1	89	63.020	ENSCSAVG00000002414	-	99	62.826	Ciona_savignyi
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	95.538	ENSCANG00000040534	CNOT1	100	95.538	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.353	ENSCGRG00001016365	Cnot1	100	97.353	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.353	ENSCGRG00000001714	Cnot1	100	97.353	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	82.764	ENSCVAG00000018930	cnot1	100	82.598	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	89.665	ENSDARG00000004174	cnot1	100	89.414	Danio_rerio
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	95.170	ENSDNOG00000013250	CNOT1	100	95.170	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	99	45.869	FBgn0085436	Not1	99	47.947	Drosophila_melanogaster
ENSAPLG00000007162	CNOT1	84	97.293	ENSETEG00000012806	CNOT1	84	97.293	Echinops_telfairi
ENSAPLG00000007162	CNOT1	81	76.866	ENSEBUG00000011534	cnot1	95	75.821	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000007162	CNOT1	97	98.134	ENSEASG00005005819	CNOT1	100	98.406	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.773	ENSECAG00000009889	CNOT1	100	97.773	Equus_caballus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	90	97.185	ENSEEUG00000006015	CNOT1	90	97.185	Erinaceus_europaeus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	89.380	ENSELUG00000014085	cnot1	100	89.137	Esox_lucius
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.486	ENSFCAG00000025155	CNOT1	100	97.486	Felis_catus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	99.370	ENSFALG00000007285	CNOT1	100	99.370	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.605	ENSFDAG00000013399	CNOT1	100	97.605	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	89.937	ENSFHEG00000020574	cnot1	100	89.602	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	91	88.868	ENSGMOG00000012864	cnot1	100	89.192	Gadus_morhua
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	99.412	ENSGALG00000002301	CNOT1	100	99.412	Gallus_gallus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	88.600	ENSGAFG00000015005	cnot1	100	88.307	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000007162	CNOT1	91	89.705	ENSGACG00000002606	cnot1	100	94.667	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	98.740	ENSGAGG00000022646	CNOT1	100	99.065	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.605	ENSGGOG00000009547	CNOT1	100	97.605	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000007162	CNOT1	97	97.059	ENSHBUG00000001729	cnot1	100	96.078	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.605	ENSHGLG00000014322	CNOT1	100	97.605	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	89.065	ENSHCOG00000006501	cnot1	100	89.357	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	88.349	ENSIPUG00000011915	cnot1	100	88.810	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.689	ENSSTOG00000005490	CNOT1	100	97.689	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.059	ENSJJAG00000000633	Cnot1	100	97.059	Jaculus_jaculus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	89.808	ENSKMAG00000006149	cnot1	100	89.599	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	95	96.414	ENSLBEG00000004740	cnot1	100	95.020	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	94.874	ENSLACG00000010869	CNOT1	100	94.874	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	92.588	ENSLOCG00000006324	cnot1	100	92.588	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.523	ENSLAFG00000000098	CNOT1	100	97.523	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.437	ENSMFAG00000035888	CNOT1	100	97.437	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.647	ENSMMUG00000014625	CNOT1	100	97.647	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	94.889	ENSMNEG00000031820	CNOT1	100	97.668	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	96.261	ENSMLEG00000040933	CNOT1	100	96.261	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	88.773	ENSMAMG00000016524	cnot1	100	88.558	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	97	97.059	ENSMZEG00005016210	cnot1	100	96.078	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	99.244	ENSMGAG00000001908	CNOT1	100	99.244	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.563	ENSMICG00000007071	CNOT1	100	97.563	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.395	ENSMOCG00000017969	Cnot1	100	97.395	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000007162	CNOT1	97	93.697	ENSMMOG00000019134	cnot1	100	92.717	Mola_mola
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.605	ENSMODG00000014199	CNOT1	100	97.605	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	89.895	ENSMALG00000008645	cnot1	100	89.937	Monopterus_albus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	95	99.048	MGP_CAROLIEiJ_G0031430	Cnot1	92	99.048	Mus_caroli
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.437	ENSMUSG00000036550	Cnot1	100	97.437	Mus_musculus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.395	MGP_PahariEiJ_G0023028	Cnot1	100	97.395	Mus_pahari
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.437	MGP_SPRETEiJ_G0032549	Cnot1	100	97.437	Mus_spretus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.773	ENSMPUG00000004830	CNOT1	100	97.773	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.185	ENSMLUG00000003728	CNOT1	100	97.185	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.689	ENSNGAG00000018628	Cnot1	100	97.689	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000007162	CNOT1	94	97.059	ENSNBRG00000019358	cnot1	100	96.078	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.647	ENSNLEG00000003566	CNOT1	100	97.647	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000007162	CNOT1	86	96.214	ENSMEUG00000006145	CNOT1	88	96.214	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000007162	CNOT1	86	100.000	ENSOPRG00000005604	CNOT1	86	100.000	Ochotona_princeps
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.563	ENSODEG00000016337	CNOT1	100	97.563	Octodon_degus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	90.176	ENSONIG00000007358	cnot1	100	89.799	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	91	97.541	ENSOANG00000012109	CNOT1	100	97.934	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.689	ENSOCUG00000006911	CNOT1	100	97.689	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	89.912	ENSORLG00000013734	cnot1	100	89.703	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	88.386	ENSORLG00020017012	cnot1	100	88.260	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	88.302	ENSORLG00015007091	cnot1	100	88.008	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	87.306	ENSOMEG00000015124	cnot1	100	87.977	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.605	ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	97.605	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.731	ENSOARG00000001567	CNOT1	100	97.731	Ovis_aries
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.647	ENSPPAG00000022013	CNOT1	100	97.647	Pan_paniscus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.773	ENSPPRG00000004867	CNOT1	100	97.773	Panthera_pardus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.773	ENSPTIG00000012589	CNOT1	100	97.773	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.361	ENSPTRG00000008183	CNOT1	100	97.361	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	94.600	ENSPANG00000020901	CNOT1	100	94.600	Papio_anubis
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	91.831	ENSPKIG00000023538	CNOT1	100	91.831	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000007162	CNOT1	97	93.128	ENSPKIG00000002914	CNOT1	99	92.146	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	98.613	ENSPSIG00000005499	CNOT1	100	98.613	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	80.695	ENSPMAG00000009381	cnot1	100	80.637	Petromyzon_marinus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	96.293	ENSPCIG00000007343	CNOT1	100	98.613	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	99	89.236	ENSPFOG00000003497	cnot1	100	89.025	Poecilia_formosa
ENSAPLG00000007162	CNOT1	95	96.016	ENSPLAG00000014018	cnot1	100	94.622	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000007162	CNOT1	95	96.016	ENSPMEG00000005868	cnot1	100	94.622	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000007162	CNOT1	95	96.016	ENSPREG00000018793	cnot1	100	94.622	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.605	ENSPPYG00000007410	CNOT1	100	97.605	Pongo_abelii
ENSAPLG00000007162	CNOT1	90	95.157	ENSPCAG00000003241	CNOT1	90	95.157	Procavia_capensis
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.319	ENSPCOG00000027139	CNOT1	100	97.319	Propithecus_coquereli
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	95.126	ENSPVAG00000004243	CNOT1	100	95.126	Pteropus_vampyrus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	97	97.059	ENSPNYG00000012919	cnot1	100	96.078	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	89.458	ENSPNAG00000000246	cnot1	100	89.500	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.353	ENSRNOG00000012271	Cnot1	100	97.353	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	95.475	ENSRBIG00000044598	CNOT1	100	95.475	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.689	ENSRROG00000000906	CNOT1	100	97.689	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000007162	CNOT1	56	30.544	YCR093W	CDC39	68	34.074	Saccharomyces_cerevisiae
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	93.272	ENSSBOG00000029155	CNOT1	100	93.272	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.565	ENSSHAG00000012187	CNOT1	100	97.565	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	90.038	ENSSFOG00015017614	cnot1	100	90.038	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	97	97.059	ENSSMAG00000013844	cnot1	100	96.078	Scophthalmus_maximus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	97	96.919	ENSSDUG00000021491	cnot1	100	95.938	Seriola_dumerili
ENSAPLG00000007162	CNOT1	97	96.919	ENSSLDG00000014816	cnot1	100	95.938	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPLG00000007162	CNOT1	84	100.000	ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	Sorex_araneus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	90.071	ENSSPAG00000018802	cnot1	100	89.527	Stegastes_partitus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.647	ENSSSCG00000002799	CNOT1	100	98.406	Sus_scrofa
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	99.119	ENSTGUG00000005919	CNOT1	100	99.119	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	88.255	ENSTNIG00000018706	cnot1	100	88.047	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPLG00000007162	CNOT1	80	97.887	ENSTBEG00000000720	CNOT1	80	97.887	Tupaia_belangeri
ENSAPLG00000007162	CNOT1	95	97.612	ENSTTRG00000008460	CNOT1	95	97.612	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.773	ENSUAMG00000009251	CNOT1	100	97.773	Ursus_americanus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.773	ENSUMAG00000021291	CNOT1	100	97.773	Ursus_maritimus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	97	95.341	ENSVPAG00000008846	CNOT1	97	95.007	Vicugna_pacos
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	96.651	ENSVVUG00000024037	CNOT1	100	96.699	Vulpes_vulpes
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	90.067	ENSXETG00000015900	cnot1	100	89.690	Xenopus_tropicalis
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	88.768	ENSXCOG00000013552	cnot1	100	88.474	Xiphophorus_couchianus
ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	88.810	ENSXMAG00000006031	cnot1	100	88.516	Xiphophorus_maculatus