EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000007830 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: CUGBP Elav-like family member 4
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 78332 bases
Position: chrKB743066.1:85774-164105
Accession: 101792253
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000007504	RRM_1	PF00076.22	6.5e-24	1	2
ENSAPLP00000007504	RRM_1	PF00076.22	6.5e-24	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000008167	-	1131	XM_005019193	ENSAPLP00000007504	376 (aa)	-	U3IJT2

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000007830's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000007830's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAPLG00000007830	-	100	34.656	ENSAPLG00000010064	CELF2	74	37.264
ENSAPLG00000007830	-	100	67.677	ENSAPLG00000016374	-	86	68.182
ENSAPLG00000007830	-	65	54.545	ENSAPLG00000008482	CELF1	74	37.237
ENSAPLG00000007830	-	100	51.651	ENSAPLG00000005174	CELF5	89	51.675

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000007830	-	100	86.207	ENSG00000101489	CELF4	99	96.947	Homo_sapiens
ENSAPLG00000007830	-	100	75.726	ENSAPOG00000002964	celf4	87	75.726	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000007830	-	90	81.711	ENSAMEG00000017059	CELF4	66	82.301	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000007830	-	100	68.170	ENSACIG00000018097	celf4	68	68.435	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000007830	-	76	59.233	ENSAOCG00000019919	-	71	59.140	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000007830	-	100	71.618	ENSAOCG00000020590	celf4	74	68.664	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000007830	-	100	71.618	ENSAPEG00000002940	celf4	68	71.618	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000007830	-	100	71.618	ENSATEG00000023731	celf4	69	71.618	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000007830	-	58	88.703	ENSACAG00000012428	CELF4	95	88.703	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000007830	-	100	85.979	ENSANAG00000029499	CELF4	69	85.979	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000007830	-	100	74.811	ENSACLG00000011828	celf4	72	75.063	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000007830	-	100	73.475	ENSAMXG00000007935	celf4	75	69.816	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000007830	-	100	85.979	ENSBTAG00000004940	CELF4	64	97.561	Bos_taurus
ENSAPLG00000007830	-	100	85.979	ENSCJAG00000021135	CELF4	78	85.979	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000007830	-	100	85.979	ENSCHIG00000007169	CELF4	65	97.561	Capra_hircus
ENSAPLG00000007830	-	100	85.979	ENSTSYG00000000816	CELF4	79	85.979	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000007830	-	100	81.612	ENSCPOG00000035956	CELF4	74	81.612	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000007830	-	100	85.979	ENSCCAG00000028373	CELF4	69	85.979	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000007830	-	100	85.979	ENSCATG00000045293	CELF4	69	85.979	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000007830	-	100	81.612	ENSCLAG00000008344	CELF4	70	81.612	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000007830	-	100	82.071	ENSCSAG00000017933	CELF4	99	82.071	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000007830	-	100	86.472	ENSCPBG00000005237	CELF4	92	86.472	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000007830	-	100	85.979	ENSCANG00000036735	CELF4	69	85.979	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000007830	-	78	90.096	ENSCGRG00001018085	Celf4	74	90.096	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000007830	-	100	68.664	ENSCSEG00000007074	celf4	66	95.238	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000007830	-	100	71.883	ENSCVAG00000017617	celf4	68	71.883	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000007830	-	100	68.433	ENSDARG00000070045	celf4	95	68.433	Danio_rerio
ENSAPLG00000007830	-	100	81.864	ENSDNOG00000032492	CELF4	95	81.864	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000007830	-	100	81.612	ENSDORG00000007169	Celf4	70	81.612	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000007830	-	80	67.727	ENSETEG00000007432	-	62	67.727	Echinops_telfairi
ENSAPLG00000007830	-	100	85.979	ENSEASG00005016534	CELF4	70	85.979	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000007830	-	100	85.979	ENSECAG00000008810	CELF4	69	85.979	Equus_caballus
ENSAPLG00000007830	-	70	100.000	ENSEEUG00000003763	CELF4	50	91.964	Erinaceus_europaeus
ENSAPLG00000007830	-	100	85.979	ENSFCAG00000045234	CELF4	70	85.979	Felis_catus
ENSAPLG00000007830	-	100	82.828	ENSFALG00000009188	CELF4	98	82.828	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000007830	-	100	81.612	ENSFDAG00000010287	CELF4	74	81.612	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000007830	-	100	75.726	ENSFHEG00000003431	celf4	88	75.726	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000007830	-	89	95.122	ENSGMOG00000011747	-	73	95.122	Gadus_morhua
ENSAPLG00000007830	-	100	60.000	ENSGMOG00000008703	celf4	74	58.161	Gadus_morhua
ENSAPLG00000007830	-	100	75.989	ENSGAFG00000021515	celf4	87	75.989	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000007830	-	100	64.286	ENSGACG00000008752	celf4	74	62.358	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000007830	-	78	97.945	ENSGAGG00000023014	-	98	97.945	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000007830	-	100	54.660	ENSGAGG00000017672	-	82	54.912	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000007830	-	100	85.979	ENSGGOG00000013920	CELF4	69	85.979	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000007830	-	100	74.559	ENSHBUG00000021618	celf4	71	74.559	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000007830	-	100	85.942	ENSHGLG00000003130	CELF4	69	85.942	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000007830	-	100	81.108	ENSHGLG00100006394	CELF4	70	81.108	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000007830	-	100	70.712	ENSHCOG00000012195	celf4	69	70.185	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000007830	-	100	73.740	ENSIPUG00000010810	celf4	69	73.210	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000007830	-	100	81.360	ENSJJAG00000016892	Celf4	70	81.360	Jaculus_jaculus
ENSAPLG00000007830	-	100	68.433	ENSKMAG00000019602	celf4	79	68.664	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000007830	-	100	71.618	ENSLBEG00000000940	celf4	68	71.618	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000007830	-	100	64.384	ENSLOCG00000004792	celf4	95	64.384	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000007830	-	100	81.360	ENSLAFG00000021352	CELF4	99	75.819	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000007830	-	100	85.979	ENSMFAG00000042983	CELF4	69	85.979	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000007830	-	100	85.979	ENSMMUG00000006866	CELF4	84	78.836	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000007830	-	100	85.979	ENSMNEG00000033449	CELF4	70	85.979	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000007830	-	90	84.320	ENSMLEG00000028543	CELF4	69	84.320	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000007830	-	100	71.618	ENSMAMG00000018573	celf4	68	71.618	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000007830	-	100	71.883	ENSMZEG00005026879	celf4	68	72.149	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000007830	-	90	60.472	ENSMGAG00000017029	CELF4	99	60.831	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000007830	-	100	85.714	ENSMICG00000006984	CELF4	69	85.714	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000007830	-	100	81.108	ENSMOCG00000011985	Celf4	70	80.605	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000007830	-	100	71.088	ENSMMOG00000012281	celf4	69	71.088	Mola_mola
ENSAPLG00000007830	-	89	83.881	ENSMODG00000000306	CELF4	77	84.776	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000007830	-	100	75.726	ENSMALG00000001696	celf4	88	75.726	Monopterus_albus
ENSAPLG00000007830	-	100	85.714	MGP_CAROLIEiJ_G0022058	Celf4	74	85.714	Mus_caroli
ENSAPLG00000007830	-	100	85.676	ENSMUSG00000024268	Celf4	69	85.676	Mus_musculus
ENSAPLG00000007830	-	100	85.714	MGP_PahariEiJ_G0018792	Celf4	74	85.714	Mus_pahari
ENSAPLG00000007830	-	100	85.676	MGP_SPRETEiJ_G0022969	Celf4	92	85.676	Mus_spretus
ENSAPLG00000007830	-	100	64.651	ENSMPUG00000001027	CELF4	93	66.667	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000007830	-	100	80.856	ENSMLUG00000001755	CELF4	95	80.605	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000007830	-	100	81.360	ENSNGAG00000000761	Celf4	70	81.360	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000007830	-	100	71.883	ENSNBRG00000018194	celf4	68	72.149	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000007830	-	89	81.845	ENSMEUG00000007202	-	84	81.845	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000007830	-	100	70.106	ENSOPRG00000014415	CELF4	69	70.635	Ochotona_princeps
ENSAPLG00000007830	-	100	81.612	ENSODEG00000018464	CELF4	70	81.612	Octodon_degus
ENSAPLG00000007830	-	100	78.215	ENSONIG00000019463	celf4	69	77.165	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000007830	-	89	84.570	ENSOCUG00000024790	CELF4	55	84.570	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000007830	-	100	71.883	ENSORLG00000008913	celf4	73	68.203	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000007830	-	100	76.253	ENSORLG00020008454	celf4	88	76.253	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000007830	-	100	68.514	ENSORLG00015004115	celf4	73	68.203	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000007830	-	100	71.883	ENSOMEG00000002391	celf4	74	68.664	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000007830	-	100	73.349	ENSOGAG00000010018	CELF4	93	73.349	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000007830	-	78	89.137	ENSOARG00000005276	CELF4	99	88.818	Ovis_aries
ENSAPLG00000007830	-	90	84.320	ENSPPAG00000020644	CELF4	66	84.320	Pan_paniscus
ENSAPLG00000007830	-	100	85.979	ENSPPRG00000007683	CELF4	69	85.979	Panthera_pardus
ENSAPLG00000007830	-	100	85.979	ENSPTRG00000009982	CELF4	69	85.979	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000007830	-	100	85.979	ENSPANG00000006365	CELF4	69	85.979	Papio_anubis
ENSAPLG00000007830	-	100	70.773	ENSPKIG00000017421	celf4	73	69.807	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000007830	-	100	82.828	ENSPSIG00000015538	CELF4	98	82.828	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000007830	-	100	81.360	ENSPEMG00000019299	Celf4	70	81.360	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000007830	-	70	71.483	ENSPLAG00000012151	celf4	54	71.483	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000007830	-	80	95.238	ENSPMEG00000015313	celf4	62	95.238	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000007830	-	100	74.811	ENSPREG00000021231	celf4	72	75.063	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000007830	-	76	100.000	ENSPCAG00000000126	CELF4	68	100.000	Procavia_capensis
ENSAPLG00000007830	-	100	85.979	ENSPVAG00000009204	CELF4	69	85.979	Pteropus_vampyrus
ENSAPLG00000007830	-	100	71.883	ENSPNYG00000004131	celf4	68	72.149	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000007830	-	100	76.322	ENSPNAG00000006426	celf4	73	76.322	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000007830	-	99	83.646	ENSRNOG00000014503	Celf4	100	84.182	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000007830	-	100	85.979	ENSRBIG00000035924	CELF4	70	85.979	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000007830	-	100	85.979	ENSRROG00000014839	CELF4	69	85.979	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000007830	-	100	85.979	ENSSBOG00000030001	CELF4	69	85.979	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000007830	-	90	83.776	ENSSHAG00000009193	CELF4	87	83.776	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000007830	-	100	71.357	ENSSFOG00015010874	celf4	72	71.357	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000007830	-	100	73.399	ENSSMAG00000009331	celf4	66	95.238	Scophthalmus_maximus
ENSAPLG00000007830	-	100	75.328	ENSSLDG00000018548	celf4	88	75.328	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPLG00000007830	-	100	75.726	ENSSPAG00000018307	celf4	88	75.726	Stegastes_partitus
ENSAPLG00000007830	-	100	85.979	ENSSSCG00000003748	CELF4	70	85.979	Sus_scrofa
ENSAPLG00000007830	-	100	82.828	ENSTGUG00000001649	CELF4	98	82.828	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000007830	-	100	66.578	ENSTRUG00000015481	celf4	68	69.496	Takifugu_rubripes
ENSAPLG00000007830	-	99	76.253	ENSTNIG00000010679	celf4	67	75.198	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPLG00000007830	-	100	85.714	ENSTBEG00000010647	CELF4	80	85.714	Tupaia_belangeri
ENSAPLG00000007830	-	100	85.714	ENSTTRG00000016826	CELF4	69	85.714	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000007830	-	90	84.366	ENSUAMG00000005506	CELF4	71	84.366	Ursus_americanus
ENSAPLG00000007830	-	69	58.527	ENSVPAG00000009042	-	70	58.527	Vicugna_pacos
ENSAPLG00000007830	-	100	85.979	ENSVVUG00000027721	CELF4	70	85.979	Vulpes_vulpes
ENSAPLG00000007830	-	100	81.864	ENSXETG00000020486	celf4	94	81.864	Xenopus_tropicalis
ENSAPLG00000007830	-	100	70.025	ENSXCOG00000017592	celf4	81	70.025	Xiphophorus_couchianus
ENSAPLG00000007830	-	100	74.811	ENSXMAG00000018178	celf4	72	75.063	Xiphophorus_maculatus