EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000008519 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: AARS
Alias: -
Full Name: alanine--tRNA ligase%2C cytoplasmic-like
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 13640 bases
Position: chrKB742706.1:197235-210874
Accession: 101789828
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000008235	tRNA-synt_2c	PF01411.19	1.1e-214	1	1
ENSAPLP00000008235	DHHA1	PF02272.19	4.6e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000008909	AARS-201	2800	XM_005014295	ENSAPLP00000008235	916 (aa)	-	U3ILW3

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000008519's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
apla00970	Aminoacyl-tRNA biosynthesis	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000008519's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAPLG00000008519	AARS	82	53.539	ENSAPLG00000014835	AARS2	77	55.491

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000008519	AARS	84	89.964	ENSG00000090861	AARS	79	90.364	Homo_sapiens
ENSAPLG00000008519	AARS	83	83.154	ENSAPOG00000022413	aars	78	83.273	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000008519	AARS	84	88.530	ENSAMEG00000004815	AARS	79	89.273	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000008519	AARS	83	82.258	ENSACIG00000016586	aars	78	82.364	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000008519	AARS	83	83.333	ENSAOCG00000007036	aars	78	83.455	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000008519	AARS	83	83.154	ENSAPEG00000022892	aars	78	83.273	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000008519	AARS	83	82.975	ENSATEG00000013826	aars	78	83.273	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000008519	AARS	83	90.235	ENSACAG00000002808	AARS	79	90.545	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000008519	AARS	84	78.673	ENSANAG00000029082	AARS	98	89.732	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000008519	AARS	83	83.154	ENSACLG00000022314	aars	78	83.273	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000008519	AARS	83	83.871	ENSAMXG00000003368	aars	78	84.182	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000008519	AARS	84	89.427	ENSBTAG00000019810	AARS	79	89.818	Bos_taurus
ENSAPLG00000008519	AARS	83	64.261	WBGene00000197	aars-2	78	65.699	Caenorhabditis_elegans
ENSAPLG00000008519	AARS	84	89.606	ENSCJAG00000014562	AARS	100	90.323	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000008519	AARS	84	88.530	ENSCAFG00000020132	AARS	79	89.273	Canis_familiaris
ENSAPLG00000008519	AARS	84	88.530	ENSCAFG00020020967	AARS	79	89.273	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000008519	AARS	84	89.427	ENSCHIG00000015632	AARS	79	89.818	Capra_hircus
ENSAPLG00000008519	AARS	84	89.785	ENSTSYG00000010987	AARS	100	90.323	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000008519	AARS	74	89.447	ENSCAPG00000013564	AARS	76	90.000	Cavia_aperea
ENSAPLG00000008519	AARS	84	89.785	ENSCPOG00000002373	AARS	79	90.182	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000008519	AARS	84	89.427	ENSCCAG00000001818	AARS	96	90.179	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000008519	AARS	84	90.143	ENSCATG00000032821	AARS	100	90.726	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000008519	AARS	84	90.323	ENSCLAG00000004366	AARS	79	90.727	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000008519	AARS	84	90.323	ENSCSAG00000004476	AARS	79	90.727	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000008519	AARS	55	83.673	ENSCHOG00000000347	-	59	83.673	Choloepus_hoffmanni
ENSAPLG00000008519	AARS	83	89.964	ENSCPBG00000002995	AARS	78	90.364	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000008519	AARS	99	49.125	ENSCING00000024107	-	79	64.312	Ciona_intestinalis
ENSAPLG00000008519	AARS	99	49.426	ENSCSAVG00000000721	-	79	64.674	Ciona_savignyi
ENSAPLG00000008519	AARS	84	84.946	ENSCANG00000040257	AARS	100	90.323	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000008519	AARS	84	89.068	ENSCGRG00001014390	AARS	79	89.455	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000008519	AARS	84	89.068	ENSCGRG00000017420	AARS	79	89.455	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000008519	AARS	83	81.362	ENSCSEG00000014258	aars	78	81.636	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000008519	AARS	65	82.474	ENSCVAG00000000882	aars	74	82.632	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000008519	AARS	83	82.258	ENSDARG00000069142	aars	94	87.224	Danio_rerio
ENSAPLG00000008519	AARS	84	82.332	ENSDNOG00000004586	AARS	79	82.616	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000008519	AARS	84	88.530	ENSDORG00000004110	Aars	79	89.091	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000008519	AARS	85	65.352	FBgn0027094	AlaRS	81	65.352	Drosophila_melanogaster
ENSAPLG00000008519	AARS	84	80.824	ENSETEG00000002451	AARS	79	81.091	Echinops_telfairi
ENSAPLG00000008519	AARS	83	74.640	ENSEBUG00000004521	aars	77	76.541	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000008519	AARS	84	89.606	ENSEASG00005013408	AARS	71	90.000	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000008519	AARS	84	89.606	ENSECAG00000008561	AARS	75	90.000	Equus_caballus
ENSAPLG00000008519	AARS	77	90.000	ENSEEUG00000006335	AARS	72	90.000	Erinaceus_europaeus
ENSAPLG00000008519	AARS	83	81.720	ENSELUG00000015496	aars	78	82.364	Esox_lucius
ENSAPLG00000008519	AARS	84	89.427	ENSFCAG00000009482	AARS	79	90.000	Felis_catus
ENSAPLG00000008519	AARS	84	96.953	ENSFALG00000007196	AARS	79	96.953	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000008519	AARS	84	89.785	ENSFDAG00000011896	AARS	79	90.182	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000008519	AARS	83	72.760	ENSGMOG00000008147	aars	77	72.727	Gadus_morhua
ENSAPLG00000008519	AARS	84	98.208	ENSGALG00000001965	AARS	79	98.208	Gallus_gallus
ENSAPLG00000008519	AARS	83	82.079	ENSGAFG00000015182	aars	78	82.182	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000008519	AARS	83	72.321	ENSGACG00000002667	aars	78	72.383	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000008519	AARS	83	90.502	ENSGAGG00000014004	AARS	78	91.091	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000008519	AARS	74	91.892	ENSGGOG00000008737	AARS	100	90.323	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000008519	AARS	83	73.477	ENSHBUG00000011211	aars	77	73.455	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000008519	AARS	84	89.785	ENSHGLG00000011756	AARS	79	90.182	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000008519	AARS	84	89.785	ENSHGLG00100011337	AARS	79	90.182	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000008519	AARS	84	80.319	ENSHCOG00000012089	aars	80	81.091	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000008519	AARS	83	82.437	ENSIPUG00000020538	aars	78	82.727	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000008519	AARS	84	89.427	ENSSTOG00000006856	AARS	79	90.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000008519	AARS	84	88.889	ENSJJAG00000008731	Aars	79	89.273	Jaculus_jaculus
ENSAPLG00000008519	AARS	83	81.541	ENSKMAG00000009832	aars	78	81.818	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000008519	AARS	99	66.631	ENSLBEG00000018551	aars	99	66.311	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000008519	AARS	84	84.588	ENSLACG00000004892	AARS	78	85.246	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000008519	AARS	84	87.633	ENSLAFG00000006645	AARS	79	88.172	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000008519	AARS	84	89.785	ENSMFAG00000002309	AARS	100	86.076	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000008519	AARS	84	89.427	ENSMMUG00000021653	AARS	100	89.919	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000008519	AARS	100	70.285	ENSMNEG00000014902	AARS	100	86.076	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000008519	AARS	78	83.529	ENSMLEG00000035037	AARS	77	83.865	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000008519	AARS	83	82.079	ENSMAMG00000016945	aars	78	82.364	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000008519	AARS	83	82.975	ENSMZEG00005010733	aars	78	83.091	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000008519	AARS	84	98.029	ENSMGAG00000002038	AARS	79	98.029	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000008519	AARS	84	88.889	ENSMAUG00000021342	Aars	79	89.273	Mesocricetus_auratus
ENSAPLG00000008519	AARS	84	90.161	ENSMICG00000000255	AARS	100	91.093	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000008519	AARS	84	89.427	ENSMOCG00000005336	Aars	79	89.818	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000008519	AARS	83	81.362	ENSMMOG00000002584	aars	78	81.818	Mola_mola
ENSAPLG00000008519	AARS	84	89.247	ENSMODG00000014518	AARS	79	89.636	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000008519	AARS	83	81.541	ENSMALG00000007912	aars	78	81.818	Monopterus_albus
ENSAPLG00000008519	AARS	84	88.351	ENSMUSG00000031960	Aars	79	88.727	Mus_musculus
ENSAPLG00000008519	AARS	84	89.068	ENSMPUG00000010060	AARS	79	89.818	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000008519	AARS	84	89.606	ENSMLUG00000007431	AARS	79	90.000	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000008519	AARS	84	88.710	ENSNGAG00000003676	Aars	79	89.091	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000008519	AARS	83	82.975	ENSNBRG00000007321	aars	78	83.091	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000008519	AARS	77	76.344	ENSMEUG00000016034	-	77	76.545	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000008519	AARS	84	85.663	ENSOPRG00000003373	AARS	79	86.000	Ochotona_princeps
ENSAPLG00000008519	AARS	65	88.387	ENSODEG00000014606	-	50	88.387	Octodon_degus
ENSAPLG00000008519	AARS	80	85.413	ENSODEG00000014435	-	80	85.413	Octodon_degus
ENSAPLG00000008519	AARS	83	83.333	ENSONIG00000011185	aars	78	83.455	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000008519	AARS	84	89.785	ENSOANG00000001157	AARS	79	90.182	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPLG00000008519	AARS	84	86.042	ENSOCUG00000008872	AARS	79	86.380	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000008519	AARS	83	82.258	ENSORLG00000013398	aars	78	82.909	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000008519	AARS	83	82.437	ENSORLG00020017581	aars	78	83.091	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000008519	AARS	83	82.437	ENSORLG00015007783	aars	78	83.091	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000008519	AARS	83	83.333	ENSOMEG00000014361	aars	78	84.000	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000008519	AARS	84	89.785	ENSOGAG00000011601	AARS	79	90.182	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000008519	AARS	84	89.606	ENSOARG00000005286	AARS	79	90.000	Ovis_aries
ENSAPLG00000008519	AARS	84	89.964	ENSPPAG00000040404	AARS	100	90.323	Pan_paniscus
ENSAPLG00000008519	AARS	84	89.247	ENSPPRG00000013214	AARS	79	89.818	Panthera_pardus
ENSAPLG00000008519	AARS	84	89.247	ENSPTIG00000021477	AARS	79	89.818	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000008519	AARS	84	89.964	ENSPTRG00000008297	AARS	100	90.323	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000008519	AARS	84	89.964	ENSPANG00000020452	AARS	100	86.498	Papio_anubis
ENSAPLG00000008519	AARS	84	82.437	ENSPKIG00000002593	aars	79	82.727	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000008519	AARS	83	87.679	ENSPSIG00000012820	AARS	78	87.862	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000008519	AARS	83	82.437	ENSPMGG00000016971	aars	78	82.909	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPLG00000008519	AARS	84	88.351	ENSPEMG00000010864	Aars	79	88.727	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000008519	AARS	83	72.014	ENSPMAG00000001946	aars	78	72.252	Petromyzon_marinus
ENSAPLG00000008519	AARS	84	87.634	ENSPCIG00000010681	AARS	79	88.000	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000008519	AARS	83	82.437	ENSPFOG00000015763	aars	78	82.545	Poecilia_formosa
ENSAPLG00000008519	AARS	83	82.437	ENSPLAG00000014226	aars	78	82.545	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000008519	AARS	83	82.616	ENSPMEG00000019736	aars	78	82.727	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000008519	AARS	83	82.079	ENSPREG00000019562	aars	78	82.182	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000008519	AARS	62	86.226	ENSPPYG00000007544	-	60	86.226	Pongo_abelii
ENSAPLG00000008519	AARS	64	85.417	ENSPCAG00000012883	AARS	60	85.417	Procavia_capensis
ENSAPLG00000008519	AARS	87	87.415	ENSPCOG00000016630	AARS	100	90.726	Propithecus_coquereli
ENSAPLG00000008519	AARS	83	89.531	ENSPVAG00000000669	AARS	79	89.636	Pteropus_vampyrus
ENSAPLG00000008519	AARS	83	82.975	ENSPNYG00000010796	aars	78	83.091	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000008519	AARS	83	82.616	ENSPNAG00000015269	aars	72	82.909	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000008519	AARS	84	88.172	ENSRNOG00000018404	Aars	79	88.545	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000008519	AARS	84	89.606	ENSRBIG00000032650	AARS	100	84.848	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000008519	AARS	84	89.785	ENSRROG00000027324	AARS	100	90.323	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000008519	AARS	81	55.060	YOR335C	ALA1	76	57.195	Saccharomyces_cerevisiae
ENSAPLG00000008519	AARS	84	89.427	ENSSBOG00000022141	AARS	100	90.323	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000008519	AARS	84	88.889	ENSSHAG00000007347	AARS	79	89.273	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000008519	AARS	83	81.183	ENSSFOG00015011897	AARS	78	81.818	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000008519	AARS	82	80.824	ENSSFOG00015013147	aars	77	81.273	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000008519	AARS	83	80.287	ENSSMAG00000014488	aars	78	80.545	Scophthalmus_maximus
ENSAPLG00000008519	AARS	83	81.900	ENSSDUG00000021127	aars	78	82.000	Seriola_dumerili
ENSAPLG00000008519	AARS	83	81.900	ENSSLDG00000017716	aars	78	82.000	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPLG00000008519	AARS	83	89.606	ENSSPUG00000001911	AARS	78	90.182	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000008519	AARS	83	82.616	ENSSPAG00000001290	aars	78	82.727	Stegastes_partitus
ENSAPLG00000008519	AARS	84	89.427	ENSSSCG00000002723	-	79	89.818	Sus_scrofa
ENSAPLG00000008519	AARS	82	53.333	ENSSSCG00000040225	-	79	53.333	Sus_scrofa
ENSAPLG00000008519	AARS	84	96.953	ENSTGUG00000005683	AARS	79	96.953	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000008519	AARS	73	81.720	ENSTRUG00000000907	aars	99	85.185	Takifugu_rubripes
ENSAPLG00000008519	AARS	83	80.322	ENSTNIG00000004016	aars	78	80.581	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPLG00000008519	AARS	79	65.511	ENSTBEG00000017122	-	77	66.270	Tupaia_belangeri
ENSAPLG00000008519	AARS	84	88.530	ENSUAMG00000007008	AARS	79	89.273	Ursus_americanus
ENSAPLG00000008519	AARS	84	88.530	ENSUMAG00000016975	AARS	79	89.273	Ursus_maritimus
ENSAPLG00000008519	AARS	69	80.943	ENSVPAG00000003189	AARS	68	81.076	Vicugna_pacos
ENSAPLG00000008519	AARS	84	88.530	ENSVVUG00000018036	AARS	79	89.273	Vulpes_vulpes
ENSAPLG00000008519	AARS	84	87.276	ENSXETG00000007668	aars	79	88.000	Xenopus_tropicalis
ENSAPLG00000008519	AARS	83	82.258	ENSXCOG00000013625	aars	79	82.364	Xiphophorus_couchianus
ENSAPLG00000008519	AARS	83	82.258	ENSXMAG00000006282	aars	78	82.364	Xiphophorus_maculatus