EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000009597 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: RAB1A
Alias: -
Full Name: RAB1A%2C member RAS oncogene family
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 7418 bases
Position: chrKB742970.1:725751-733168
Accession: 101790987
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000009308	MMR_HSR1	PF01926.23	8.5e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000009998	RAB1A-201	2505	XM_005018150	ENSAPLP00000009308	205 (aa)	XP_005018207	U3IPY5

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000009597's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000009597's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAPLG00000009597	RAB1A	88	30.000	ENSAPLG00000005823	RASL11A	86	30.000
ENSAPLG00000009597	RAB1A	94	38.571	ENSAPLG00000008936	RAB36	78	38.571
ENSAPLG00000009597	RAB1A	76	38.365	ENSAPLG00000002371	RAB9A	79	38.365
ENSAPLG00000009597	RAB1A	79	36.810	ENSAPLG00000012248	HRAS	98	36.810
ENSAPLG00000009597	RAB1A	80	45.783	ENSAPLG00000014543	RAB39B	78	45.783
ENSAPLG00000009597	RAB1A	62	32.857	ENSAPLG00000014398	ARFRP1	68	32.857
ENSAPLG00000009597	RAB1A	79	40.994	ENSAPLG00000009164	-	97	40.994
ENSAPLG00000009597	RAB1A	76	39.623	ENSAPLG00000001949	RAB9B	79	39.623
ENSAPLG00000009597	RAB1A	80	50.920	ENSAPLG00000011046	-	75	50.920
ENSAPLG00000009597	RAB1A	96	52.551	ENSAPLG00000010775	RAB35	99	52.551
ENSAPLG00000009597	RAB1A	57	31.933	ENSAPLG00000001404	ARL4A	59	31.933
ENSAPLG00000009597	RAB1A	78	39.024	ENSAPLG00000004323	RAB7A	93	39.024
ENSAPLG00000009597	RAB1A	95	44.330	ENSAPLG00000012817	RAB5A	90	44.330
ENSAPLG00000009597	RAB1A	81	36.527	ENSAPLG00000013463	-	72	36.527
ENSAPLG00000009597	RAB1A	59	33.884	ENSAPLG00000006871	RRAS2	71	33.884
ENSAPLG00000009597	RAB1A	56	30.172	ENSAPLG00000001749	ARL14	59	30.172
ENSAPLG00000009597	RAB1A	57	31.933	ENSAPLG00000015708	ARL4C	61	31.933
ENSAPLG00000009597	RAB1A	66	32.117	ENSAPLG00000016017	ARL3	70	32.117
ENSAPLG00000009597	RAB1A	94	39.320	ENSAPLG00000009395	-	99	39.320
ENSAPLG00000009597	RAB1A	100	43.662	ENSAPLG00000014962	RAB11A	99	43.662
ENSAPLG00000009597	RAB1A	80	37.576	ENSAPLG00000015953	KRAS	95	35.912
ENSAPLG00000009597	RAB1A	98	39.320	ENSAPLG00000006894	RAB33B	89	39.320
ENSAPLG00000009597	RAB1A	80	35.928	ENSAPLG00000013435	MRAS	80	35.928
ENSAPLG00000009597	RAB1A	80	40.237	ENSAPLG00000006592	-	95	40.476
ENSAPLG00000009597	RAB1A	80	51.220	ENSAPLG00000012821	RAB30	81	51.220
ENSAPLG00000009597	RAB1A	75	34.839	ENSAPLG00000003715	RAB23	93	34.545
ENSAPLG00000009597	RAB1A	82	36.257	ENSAPLG00000013647	-	98	36.257