EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000009619 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 55116 bases
Position: chrKB742554.1:1864640-1919755
Accession: 101790265
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000009385	IBN_N	PF03810.19	1e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000010077	-	2697	XM_005011610	ENSAPLP00000009385	898 (aa)	XP_005011667	U3IQ62

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000009619	-	97	93.678	ENSG00000083312	TNPO1	100	95.918	Homo_sapiens
ENSAPLG00000009619	-	97	90.711	ENSAPOG00000003453	tnpo1	99	89.741	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000009619	-	97	92.711	ENSAMEG00000007147	TNPO1	98	91.844	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000009619	-	84	89.774	ENSACIG00000003711	tnpo1	98	88.932	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000009619	-	97	90.826	ENSAOCG00000008154	tnpo1	99	89.853	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000009619	-	97	90.826	ENSAPEG00000001112	tnpo1	99	89.853	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000009619	-	97	90.482	ENSATEG00000010408	tnpo1	99	89.515	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000009619	-	99	93.348	ENSACAG00000009599	TNPO1	99	93.348	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000009619	-	96	87.587	ENSANAG00000025351	-	95	87.587	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000009619	-	86	70.000	ENSANAG00000027118	-	97	62.644	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000009619	-	97	93.333	ENSANAG00000022453	-	98	92.334	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000009619	-	97	88.417	ENSACLG00000027223	tnpo1	99	87.711	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000009619	-	96	90.603	ENSAMXG00000009842	tnpo1	99	88.839	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000009619	-	97	93.678	ENSBTAG00000007979	TNPO1	98	92.559	Bos_taurus
ENSAPLG00000009619	-	97	93.333	ENSCJAG00000016409	TNPO1	98	92.334	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000009619	-	96	94.322	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	94.322	Canis_familiaris
ENSAPLG00000009619	-	97	90.920	ENSCAFG00020017397	TNPO1	99	89.966	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000009619	-	97	93.678	ENSCHIG00000023462	TNPO1	98	92.559	Capra_hircus
ENSAPLG00000009619	-	97	92.157	ENSTSYG00000001871	TNPO1	98	92.503	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000009619	-	97	93.218	ENSCCAG00000026472	TNPO1	99	92.221	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000009619	-	97	93.678	ENSCATG00000043792	TNPO1	99	92.672	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000009619	-	97	93.448	ENSCLAG00000016191	TNPO1	99	92.446	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000009619	-	97	93.678	ENSCSAG00000015616	TNPO1	98	92.672	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000009619	-	91	80.586	ENSCHOG00000001746	TNPO1	98	79.785	Choloepus_hoffmanni
ENSAPLG00000009619	-	99	94.025	ENSCPBG00000000260	TNPO1	93	94.025	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000009619	-	99	72.534	ENSCSAVG00000010981	-	99	72.758	Ciona_savignyi
ENSAPLG00000009619	-	97	93.678	ENSCANG00000004353	TNPO1	98	92.672	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000009619	-	97	93.448	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	98	92.446	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000009619	-	96	94.309	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	94.309	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000009619	-	99	89.064	ENSCSEG00000012674	tnpo1	99	89.290	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000009619	-	97	89.908	ENSCVAG00000001010	tnpo1	99	89.064	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000009619	-	97	89.220	ENSDARG00000035390	tnpo1	99	88.388	Danio_rerio
ENSAPLG00000009619	-	97	87.400	ENSDNOG00000006647	TNPO1	98	86.517	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000009619	-	93	94.258	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	94.251	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000009619	-	93	58.403	FBgn0035693	CG8219	96	58.403	Drosophila_melanogaster
ENSAPLG00000009619	-	85	97.407	ENSETEG00000017805	TNPO1	88	97.407	Echinops_telfairi
ENSAPLG00000009619	-	94	83.215	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	83.215	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000009619	-	97	93.678	ENSEASG00005018055	TNPO1	99	92.672	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000009619	-	97	93.563	ENSECAG00000024424	TNPO1	98	92.559	Equus_caballus
ENSAPLG00000009619	-	99	82.443	ENSELUG00000002821	tnpo1	99	82.804	Esox_lucius
ENSAPLG00000009619	-	97	93.678	ENSFCAG00000013181	TNPO1	99	92.672	Felis_catus
ENSAPLG00000009619	-	99	93.799	ENSFALG00000010292	TNPO1	99	93.799	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000009619	-	97	93.563	ENSFDAG00000013345	TNPO1	98	92.559	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000009619	-	97	90.940	ENSFHEG00000019234	tnpo1	99	89.853	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000009619	-	99	87.050	ENSGMOG00000000347	tnpo1	98	87.064	Gadus_morhua
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ENSAPLG00000009619	-	97	89.908	ENSGAFG00000000943	tnpo1	99	88.839	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000009619	-	97	90.023	ENSGACG00000015841	tnpo1	98	89.290	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000009619	-	99	93.799	ENSGAGG00000013419	TNPO1	99	93.799	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000009619	-	97	93.678	ENSGGOG00000026800	TNPO1	99	92.672	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000009619	-	96	78.630	ENSGGOG00000022535	-	97	76.914	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000009619	-	97	90.138	ENSHBUG00000008068	tnpo1	99	89.402	Haplochromis_burtoni
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ENSAPLG00000009619	-	97	93.448	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	99	92.509	Mus_pahari
ENSAPLG00000009619	-	97	93.218	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	99	92.385	Mus_spretus
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ENSAPLG00000009619	-	92	95.157	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	95.157	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPLG00000009619	-	96	88.631	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	88.631	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000009619	-	84	89.376	ENSORLG00000003182	tnpo1	98	88.542	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000009619	-	97	89.679	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	88.952	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000009619	-	97	89.908	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	89.177	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000009619	-	97	89.564	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	88.839	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000009619	-	97	93.678	ENSOGAG00000000808	TNPO1	98	92.672	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000009619	-	97	93.678	ENSOARG00000005038	TNPO1	83	92.559	Ovis_aries
ENSAPLG00000009619	-	97	93.678	ENSPPAG00000042518	TNPO1	98	92.672	Pan_paniscus
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ENSAPLG00000009619	-	97	93.678	ENSPTIG00000018839	TNPO1	99	92.672	Panthera_tigris_altaica
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ENSAPLG00000009619	-	90	82.923	ENSPTRG00000047731	-	99	80.641	Pan_troglodytes
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ENSAPLG00000009619	-	97	87.041	ENSPKIG00000019795	tnpo1	99	86.246	Paramormyrops_kingsleyae
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ENSAPLG00000009619	-	96	94.309	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	94.309	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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