EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000009642 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: AGO3
Alias: -
Full Name: argonaute 3%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 20867 bases
Position: chrKB743745.1:614775-635641
Accession: 101790103
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000009447	PAZ	PF02170.22	7.4e-29	1	1
ENSAPLP00000009447	Piwi	PF02171.17	1e-113	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000010139	AGO3-201	2951	XM_005025334	ENSAPLP00000009447	860 (aa)	XP_005025391	U3IQC4

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAPLG00000009642	AGO3	98	80.687	ENSAPLG00000010465	AGO2	97	80.687
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	79.391	ENSAPLG00000010440	AGO1	97	79.391
ENSAPLG00000009642	AGO3	98	81.659	ENSAPLG00000010882	AGO4	99	81.659

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	99.416	ENSG00000126070	AGO3	100	99.362	Homo_sapiens
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	94.664	ENSAPOG00000014494	-	99	94.664	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	97.427	ENSAPOG00000024260	ago3a	99	97.427	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	99.533	ENSAMEG00000000497	AGO3	99	99.533	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000009642	AGO3	92	96.086	ENSACIG00000019272	AGO3	100	96.086	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000009642	AGO3	92	97.854	ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.854	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	97.427	ENSAOCG00000017642	ago3a	99	97.427	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000009642	AGO3	53	90.295	ENSAOCG00000022538	-	90	90.295	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000009642	AGO3	93	88.221	ENSAOCG00000017051	-	100	88.221	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	96.636	ENSAPEG00000004375	ago3a	99	96.636	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	94.432	ENSAPEG00000020249	-	99	94.432	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	94.432	ENSATEG00000005160	-	99	94.432	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	96.636	ENSATEG00000008458	ago3a	99	96.636	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	99.766	ENSACAG00000003385	AGO3	99	99.766	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	99.416	ENSANAG00000037735	AGO3	99	99.416	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	97.427	ENSACLG00000000963	ago3a	100	96.608	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	94.548	ENSACLG00000001965	-	99	94.548	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000009642	AGO3	92	94.571	ENSAMXG00000009571	ago3b	100	94.571	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000009642	AGO3	92	95.707	ENSAMXG00000002198	ago3a	100	95.707	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	99.533	ENSBTAG00000018324	AGO3	100	99.069	Bos_taurus
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	99.416	ENSCJAG00000031580	AGO3	99	99.416	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	99.416	ENSCAFG00000024682	AGO3	99	99.416	Canis_familiaris
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	99.533	ENSCAFG00020009051	AGO3	99	99.683	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	99.533	ENSCHIG00000011536	AGO3	100	99.069	Capra_hircus
ENSAPLG00000009642	AGO3	84	99.444	ENSTSYG00000011897	AGO3	99	99.444	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000009642	AGO3	89	89.147	ENSCAPG00000011589	AGO3	99	89.147	Cavia_aperea
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	95.911	ENSCPOG00000030524	AGO3	100	95.911	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	99.416	ENSCCAG00000034189	AGO3	100	99.362	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	99.416	ENSCATG00000029748	AGO3	100	99.362	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	99.533	ENSCLAG00000013184	AGO3	99	99.533	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	99.416	ENSCSAG00000001092	AGO3	99	99.416	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000009642	AGO3	92	100.000	ENSCHOG00000011621	AGO3	91	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	99.883	ENSCPBG00000018583	AGO3	99	99.883	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	99.416	ENSCANG00000033258	AGO3	100	99.362	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	99.182	ENSCGRG00001024614	Ago3	99	99.182	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	99.182	ENSCGRG00000010670	Ago3	99	99.182	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000009642	AGO3	92	90.150	ENSCSEG00000009788	-	100	90.150	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000009642	AGO3	92	97.222	ENSCSEG00000001040	ago3a	100	97.222	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	97.076	ENSCVAG00000018224	ago3a	99	97.076	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000009642	AGO3	52	86.813	ENSCVAG00000011229	-	98	86.813	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	96.520	ENSDARG00000059888	ago3a	99	96.520	Danio_rerio
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	95.439	ENSDARG00000063079	ago3b	99	95.439	Danio_rerio
ENSAPLG00000009642	AGO3	88	99.469	ENSDNOG00000008106	AGO3	99	99.469	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	99.182	ENSDORG00000009414	Ago3	99	99.182	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000009642	AGO3	85	98.315	ENSETEG00000007639	AGO3	89	98.315	Echinops_telfairi
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	99.533	ENSEASG00005012089	AGO3	99	99.533	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	99.533	ENSECAG00000023972	AGO3	99	99.533	Equus_caballus
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	82.477	ENSEEUG00000007058	AGO3	99	82.477	Erinaceus_europaeus
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	93.822	ENSELUG00000001774	-	99	93.822	Esox_lucius
ENSAPLG00000009642	AGO3	92	94.823	ENSELUG00000016755	ago3a	100	94.823	Esox_lucius
ENSAPLG00000009642	AGO3	73	99.362	ENSFCAG00000000747	-	100	99.362	Felis_catus
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	99.884	ENSFALG00000000802	AGO3	100	99.884	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	99.532	ENSFDAG00000012874	AGO3	100	99.532	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	93.271	ENSFHEG00000016205	-	99	93.271	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000009642	AGO3	83	78.455	ENSGMOG00000019418	-	89	78.455	Gadus_morhua
ENSAPLG00000009642	AGO3	97	96.890	ENSGMOG00000013069	-	100	96.890	Gadus_morhua
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	99.651	ENSGALG00000043711	AGO3	100	99.882	Gallus_gallus
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	93.155	ENSGAFG00000015911	-	99	93.155	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	97.310	ENSGAFG00000009808	ago3a	99	97.310	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000009642	AGO3	97	95.455	ENSGACG00000002455	AGO3	100	95.455	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000009642	AGO3	92	97.243	ENSGACG00000012453	ago3a	100	97.243	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	99.766	ENSGAGG00000012887	AGO3	99	99.766	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	99.416	ENSGGOG00000036711	AGO3	99	99.416	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	94.548	ENSHBUG00000017794	-	99	94.548	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000009642	AGO3	88	95.714	ENSHBUG00000010542	ago3a	96	95.714	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	99.533	ENSHGLG00000012538	AGO3	99	99.533	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	99.060	ENSHGLG00100006043	AGO3	100	99.060	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000009642	AGO3	87	96.247	ENSHCOG00000005674	ago3a	97	96.247	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	93.503	ENSHCOG00000011851	AGO3	99	93.503	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	92.164	ENSIPUG00000023241	ago3a	99	92.164	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	95.128	ENSIPUG00000008548	ago3b	99	95.128	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	94.743	ENSSTOG00000025904	AGO3	99	94.743	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	99.416	ENSJJAG00000017436	Ago3	99	99.416	Jaculus_jaculus
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	96.636	ENSKMAG00000019534	ago3a	99	96.636	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	93.814	ENSLBEG00000016073	-	99	93.814	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000009642	AGO3	92	97.854	ENSLBEG00000007592	ago3a	100	97.854	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000009642	AGO3	100	99.072	ENSLAFG00000002744	AGO3	99	99.533	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	99.416	ENSMFAG00000035610	AGO3	100	99.362	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	99.416	ENSMMUG00000006252	AGO3	99	99.679	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	99.416	ENSMNEG00000039518	AGO3	100	99.362	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	99.416	ENSMLEG00000027912	AGO3	100	99.362	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	91.731	ENSMAMG00000008440	ago3a	100	96.843	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	94.084	ENSMAMG00000005697	-	99	94.084	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	97.427	ENSMZEG00005007949	ago3a	100	96.608	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	94.664	ENSMZEG00005026243	-	99	94.664	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	99.767	ENSMGAG00000003773	AGO3	99	99.767	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000009642	AGO3	93	86.575	ENSMAUG00000010128	Ago3	96	86.700	Mesocricetus_auratus
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	99.533	ENSMICG00000016158	AGO3	99	99.533	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	96.370	ENSMOCG00000020568	Ago3	99	96.370	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000009642	AGO3	92	92.689	ENSMMOG00000018446	ago3a	100	92.689	Mola_mola
ENSAPLG00000009642	AGO3	92	93.561	ENSMMOG00000014065	-	100	93.561	Mola_mola
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	99.650	ENSMODG00000017869	AGO3	99	99.650	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	93.042	ENSMALG00000014658	-	99	93.042	Monopterus_albus
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	94.575	ENSMALG00000010895	ago3a	99	94.575	Monopterus_albus
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	98.715	MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	99	98.715	Mus_caroli
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	98.481	ENSMUSG00000028842	Ago3	99	98.481	Mus_musculus
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	98.598	MGP_PahariEiJ_G0028808	Ago3	99	98.598	Mus_pahari
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	98.832	MGP_SPRETEiJ_G0027456	Ago3	99	98.832	Mus_spretus
ENSAPLG00000009642	AGO3	73	99.203	ENSMLUG00000009668	AGO3	100	99.203	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	99.182	ENSNGAG00000012607	Ago3	99	99.182	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000009642	AGO3	92	88.819	ENSNBRG00000010936	ago3a	100	88.819	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000009642	AGO3	92	95.960	ENSNBRG00000015687	AGO3	100	95.960	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	94.529	ENSNLEG00000027092	AGO3	100	94.529	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000009642	AGO3	87	86.636	ENSMEUG00000009200	AGO3	91	86.636	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000009642	AGO3	81	100.000	ENSOPRG00000012344	AGO3	81	100.000	Ochotona_princeps
ENSAPLG00000009642	AGO3	100	99.302	ENSODEG00000005161	AGO3	100	99.532	Octodon_degus
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	97.310	ENSONIG00000016349	ago3a	99	97.310	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	95.227	ENSONIG00000013760	AGO3	99	95.227	Oreochromis_niloticus
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ENSAPLG00000009642	AGO3	99	99.533	ENSOCUG00000006255	AGO3	99	99.533	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	92.982	ENSORLG00000009091	-	99	92.982	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000009642	AGO3	92	97.980	ENSORLG00000015016	ago3a	100	97.980	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	92.982	ENSORLG00020015386	AGO3	99	92.982	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000009642	AGO3	99	92.865	ENSORLG00015006205	-	99	92.865	Oryzias_latipes_hsok
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