EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000009977 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: PPARGC1B
Alias: -
Full Name: PPARG coactivator 1 beta
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 11993 bases
Position: chrKB742414.1:671872-683864
Accession: 101790707
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000009704	RRM_1	PF00076.22	7.1e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000010401	PPARGC1B-201	3193	XM_005009354	ENSAPLP00000009704	965 (aa)	-	U3IR31

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000009977's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000009977's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	52	50.365	ENSAPLG00000005303	PPARGC1A	61	50.365

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	48.954	ENSG00000155846	PPARGC1B	99	49.521	Homo_sapiens
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	49.568	ENSAMEG00000005287	PPARGC1B	99	50.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	58.710	ENSACAG00000015737	PPARGC1B	99	58.405	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	52	49.635	ENSACAG00000000741	PPARGC1A	60	49.635	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	49.185	ENSANAG00000021830	PPARGC1B	99	50.097	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	84	35.897	ENSAMXG00000010665	ppargc1b	75	46.667	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	49.084	ENSBTAG00000012943	PPARGC1B	99	48.662	Bos_taurus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	49.042	ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	97	49.598	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	54	49.635	ENSCHIG00000015991	PPARGC1A	62	49.635	Capra_hircus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	49.080	ENSCHIG00000004409	PPARGC1B	99	48.897	Capra_hircus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	98	47.689	ENSTSYG00000034354	PPARGC1B	99	47.122	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	66	49.635	ENSCAPG00000005150	PPARGC1A	58	51.163	Cavia_aperea
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	45.287	ENSCAPG00000008859	PPARGC1B	99	45.419	Cavia_aperea
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	46.935	ENSCPOG00000001958	PPARGC1B	99	46.449	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	49.183	ENSCCAG00000026909	PPARGC1B	99	50.098	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	48.372	ENSCATG00000030402	PPARGC1B	99	48.745	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	47.358	ENSCLAG00000015452	PPARGC1B	99	47.307	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	98	49.561	ENSCSAG00000011792	PPARGC1B	99	49.754	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	59	62.500	ENSCHOG00000005517	-	67	62.500	Choloepus_hoffmanni
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	66.961	ENSCPBG00000007891	PPARGC1B	99	66.863	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	49.093	ENSCANG00000037487	PPARGC1B	99	49.374	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	98	47.312	ENSCGRG00001017949	Ppargc1b	95	46.815	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	68	48.905	ENSCGRG00001015534	Ppargc1a	60	48.905	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	98	47.116	ENSCGRG00000008387	Ppargc1b	98	46.525	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	68	48.905	ENSCGRG00000000200	Ppargc1a	60	48.905	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	68	33.141	ENSDARG00000101569	ppargc1b	50	35.169	Danio_rerio
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	54	50.365	ENSDARG00000067829	ppargc1a	66	50.365	Danio_rerio
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	93	56.615	ENSDNOG00000005985	PPARGC1B	98	56.615	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	51	44.643	ENSDNOG00000041106	PPARGC1A	60	49.635	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	46.176	ENSDORG00000012605	Ppargc1b	99	45.533	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	56	48.905	ENSDORG00000016276	Ppargc1a	59	48.905	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	94	54.231	ENSEASG00005002826	PPARGC1B	99	48.851	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	94	53.979	ENSECAG00000019769	PPARGC1B	82	49.855	Equus_caballus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	74	57.838	ENSEEUG00000014903	PPARGC1B	77	51.542	Erinaceus_europaeus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	32.264	ENSELUG00000014929	ppargc1b	60	39.516	Esox_lucius
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	51	44.643	ENSFCAG00000000043	PPARGC1A	60	49.635	Felis_catus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	98	74.619	ENSFALG00000008858	PPARGC1B	99	73.909	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	51	49.635	ENSFALG00000009211	PPARGC1A	62	49.635	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	98	46.893	ENSFDAG00000008719	PPARGC1B	99	46.915	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	52	49.635	ENSGALG00000042851	PPARGC1A	61	49.635	Gallus_gallus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	53	46.602	ENSGAGG00000007043	PPARGC1A	62	49.635	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	91	84.058	ENSGAGG00000012870	PPARGC1B	98	82.192	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	98	48.594	ENSGGOG00000009505	PPARGC1B	99	49.413	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	47.343	ENSHGLG00000005967	PPARGC1B	99	47.490	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	45.015	ENSHGLG00100010588	PPARGC1B	99	44.412	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	66	41.667	ENSIPUG00000001584	Ppargc1b	76	41.667	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	47.409	ENSSTOG00000024758	PPARGC1B	99	48.077	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	47.318	ENSJJAG00000018633	Ppargc1b	99	47.679	Jaculus_jaculus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	69	51.095	ENSLACG00000014054	PPARGC1A	61	51.648	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	98	38.675	ENSLACG00000011232	PPARGC1B	100	38.767	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	86	43.429	ENSLOCG00000012195	ppargc1b	67	43.478	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	55	51.095	ENSLOCG00000012350	ppargc1a	65	51.095	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	50.800	ENSLAFG00000012339	PPARGC1B	99	49.951	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	49.425	ENSMFAG00000042269	PPARGC1B	99	49.614	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	49.521	ENSMMUG00000004749	PPARGC1B	99	49.710	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	49.425	ENSMNEG00000034121	PPARGC1B	99	49.614	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	98	49.659	ENSMLEG00000040973	PPARGC1B	99	49.853	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	52	50.365	ENSMGAG00000012485	PPARGC1A	61	50.365	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	86	83.051	ENSMGAG00000003134	PPARGC1B	88	84.181	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	68	48.905	ENSMAUG00000011811	Ppargc1a	60	48.905	Mesocricetus_auratus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	47.459	ENSMAUG00000014191	Ppargc1b	99	47.454	Mesocricetus_auratus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	48.932	ENSMICG00000002702	PPARGC1B	99	48.058	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	47.031	ENSMOCG00000014885	Ppargc1b	99	46.622	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	53.021	ENSMODG00000009891	PPARGC1B	99	52.266	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	68	48.905	MGP_CAROLIEiJ_G0027213	Ppargc1a	60	48.905	Mus_caroli
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	47.490	MGP_CAROLIEiJ_G0022323	Ppargc1b	99	47.318	Mus_caroli
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	68	48.905	ENSMUSG00000029167	Ppargc1a	60	48.905	Mus_musculus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	47.172	ENSMUSG00000033871	Ppargc1b	99	47.217	Mus_musculus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	57	48.905	MGP_PahariEiJ_G0016995	Ppargc1a	60	48.905	Mus_pahari
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	46.908	MGP_PahariEiJ_G0019053	Ppargc1b	99	46.330	Mus_pahari
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	47.628	MGP_SPRETEiJ_G0023235	Ppargc1b	99	47.308	Mus_spretus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	68	48.905	MGP_SPRETEiJ_G0028208	Ppargc1a	60	48.905	Mus_spretus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	52	44.643	ENSMLUG00000016307	PPARGC1A	60	49.635	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	89	46.696	ENSMLUG00000013169	PPARGC1B	97	47.614	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	47.767	ENSNGAG00000016998	Ppargc1b	99	46.500	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	48.599	ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	98	49.125	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	98	46.154	ENSOPRG00000010017	PPARGC1B	99	46.752	Ochotona_princeps
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	45.969	ENSODEG00000004901	PPARGC1B	99	45.180	Octodon_degus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	61	50.365	ENSOANG00000006680	PPARGC1A	59	50.365	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	51.759	ENSOANG00000009368	PPARGC1B	100	50.610	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	98	48.502	ENSOCUG00000013833	PPARGC1B	99	48.792	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	53	44.643	ENSOGAG00000014559	PPARGC1A	60	48.905	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	49.205	ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	98	48.126	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	48.685	ENSOARG00000005658	PPARGC1B	98	48.685	Ovis_aries
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	98	48.880	ENSPPAG00000035226	PPARGC1B	99	49.558	Pan_paniscus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	49.620	ENSPPRG00000004608	PPARGC1B	99	50.192	Panthera_pardus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	52	49.635	ENSPPRG00000001711	PPARGC1A	61	49.635	Panthera_pardus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	52	49.635	ENSPTIG00000007378	PPARGC1A	61	49.635	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	49.618	ENSPTIG00000007391	PPARGC1B	98	50.096	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	48.659	ENSPTRG00000017403	PPARGC1B	99	49.324	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	49.521	ENSPANG00000009512	PPARGC1B	99	49.710	Papio_anubis
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	66.036	ENSPSIG00000008358	PPARGC1B	99	65.438	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	54	44.248	ENSPSIG00000011790	PPARGC1A	61	49.635	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	47.697	ENSPEMG00000018822	Ppargc1b	99	47.826	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	68	48.905	ENSPEMG00000010892	Ppargc1a	60	48.905	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	90	52.114	ENSPCIG00000020102	PPARGC1B	99	51.572	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	52	46.018	ENSPCIG00000015835	PPARGC1A	61	49.635	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	49.808	ENSPPYG00000015938	PPARGC1B	99	49.759	Pongo_abelii
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	70	54.280	ENSPCAG00000012171	PPARGC1B	65	56.000	Procavia_capensis
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	49.277	ENSPCOG00000024059	PPARGC1B	99	49.177	Propithecus_coquereli
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	48.932	ENSPVAG00000001308	PPARGC1B	99	49.563	Pteropus_vampyrus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	98	31.443	ENSPNAG00000023871	ppargc1b	90	35.802	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	47.161	ENSRNOG00000017503	Ppargc1b	99	46.915	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	68	48.905	ENSRNOG00000004473	Ppargc1a	60	48.905	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	49.474	ENSRBIG00000036724	PPARGC1B	99	49.610	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	98	49.220	ENSRROG00000029594	PPARGC1B	97	49.608	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	48.415	ENSSBOG00000028738	PPARGC1B	99	49.219	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	52	49.635	ENSSBOG00000006423	PPARGC1A	68	49.635	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	54.294	ENSSHAG00000016400	PPARGC1B	98	53.189	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	52	46.018	ENSSHAG00000010033	PPARGC1A	58	49.635	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	52	51.095	ENSSPUG00000013556	PPARGC1A	61	51.095	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	62.500	ENSSPUG00000019271	PPARGC1B	99	62.066	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	47.610	ENSSSCG00000014437	PPARGC1B	99	48.213	Sus_scrofa
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	98	70.352	ENSTGUG00000000232	PPARGC1B	100	69.950	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	52	50.365	ENSTGUG00000009487	PPARGC1A	61	50.365	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	50.245	ENSTTRG00000008430	PPARGC1B	100	49.464	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	52	49.635	ENSTTRG00000005327	PPARGC1A	60	49.635	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	49.807	ENSUMAG00000005361	PPARGC1B	99	49.759	Ursus_maritimus
ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	98	45.582	ENSXETG00000012711	ppargc1b	99	44.637	Xenopus_tropicalis