EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000010177 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: KPNB1
Alias: -
Full Name: karyopherin subunit beta 1
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 18248 bases
Position: chrKB743461.1:285142-303389
Accession: 101795154
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000009979	IBN_N	PF03810.19	1e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000010681	KPNB1-201	2625	XM_005023260	ENSAPLP00000009979	875 (aa)	XP_005023317	U3IRV6

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000010177's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000010177's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	94.749	ENSG00000108424	KPNB1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	92.781	ENSAPOG00000020572	kpnb1	96	92.781	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	97.636	ENSAMEG00000004613	KPNB1	100	97.636	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	92.663	ENSACIG00000023130	kpnb1	98	92.663	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	92.781	ENSAOCG00000007048	kpnb1	96	92.781	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	92.781	ENSAPEG00000008270	kpnb1	96	92.781	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	92.189	ENSATEG00000015139	kpnb1	96	92.189	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	97.870	ENSACAG00000007097	KPNB1	96	97.870	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	92.009	ENSANAG00000024932	-	99	92.009	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	92.426	ENSACLG00000015070	kpnb1	96	92.426	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	92.663	ENSAMXG00000041903	kpnb1	96	92.663	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	95.091	ENSBTAG00000006586	KPNB1	99	95.091	Bos_taurus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	49.296	WBGene00002075	imb-1	95	49.180	Caenorhabditis_elegans
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	94.749	ENSCJAG00000007834	KPNB1	99	94.749	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	95.091	ENSCAFG00000016678	KPNB1	99	95.091	Canis_familiaris
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	95.091	ENSCAFG00020023205	KPNB1	99	95.091	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	95.091	ENSCHIG00000014896	KPNB1	99	95.091	Capra_hircus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	98	96.632	ENSTSYG00000014472	KPNB1	99	96.632	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	97.633	ENSCAPG00000014185	KPNB1	100	97.633	Cavia_aperea
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	94.863	ENSCPOG00000006566	KPNB1	99	94.863	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	87.699	ENSCCAG00000029263	-	99	87.699	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	94	82.243	ENSCCAG00000018551	-	96	82.243	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	94.749	ENSCATG00000037124	KPNB1	99	94.749	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	94.749	ENSCLAG00000017091	KPNB1	99	94.749	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	94.749	ENSCSAG00000002605	KPNB1	99	94.749	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	69	98.113	ENSCHOG00000010604	KPNB1	69	98.113	Choloepus_hoffmanni
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	98.817	ENSCPBG00000027423	KPNB1	92	98.817	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	64.929	ENSCING00000004639	-	95	64.929	Ciona_intestinalis
ENSAPLG00000010177	KPNB1	98	61.021	ENSCSAVG00000008624	-	98	61.021	Ciona_savignyi
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	95.507	ENSCANG00000013489	KPNB1	100	95.507	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	94.749	ENSCGRG00001016042	Kpnb1	99	94.749	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	97.515	ENSCGRG00000013910	Kpnb1	100	97.515	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	89.810	ENSCSEG00000007991	kpnb1	99	89.952	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	91.953	ENSDARG00000104889	kpnb1	96	91.953	Danio_rerio
ENSAPLG00000010177	KPNB1	99	59.703	FBgn0262743	Fs(2)Ket	99	59.703	Drosophila_melanogaster
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	81.635	ENSEBUG00000013869	kpnb1	96	81.635	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	95.091	ENSEASG00005000805	KPNB1	99	95.091	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	95.091	ENSECAG00000014560	KPNB1	99	95.091	Equus_caballus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	85	96.482	ENSEEUG00000005046	KPNB1	88	96.482	Erinaceus_europaeus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	92.544	ENSELUG00000015847	kpnb1	96	92.544	Esox_lucius
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	95.091	ENSFCAG00000023994	KPNB1	99	95.091	Felis_catus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	97.633	ENSFDAG00000019923	KPNB1	100	97.633	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	92.071	ENSFHEG00000020199	kpnb1	96	92.071	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	87.574	ENSGMOG00000011607	kpnb1	96	87.574	Gadus_morhua
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	99.053	ENSGALG00000036962	KPNB1	96	99.053	Gallus_gallus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	91.953	ENSGAFG00000000783	kpnb1	96	91.953	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	88.056	ENSGACG00000014765	kpnb1	96	88.056	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	98.221	ENSGAGG00000023737	KPNB1	92	98.221	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	94.749	ENSGGOG00000008089	KPNB1	99	94.749	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	92.426	ENSHBUG00000016826	kpnb1	96	92.426	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	94.863	ENSHGLG00000014138	KPNB1	99	94.863	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000010177	KPNB1	97	97.406	ENSHGLG00100006572	KPNB1	100	97.633	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	90.651	ENSHCOG00000002084	kpnb1	96	90.651	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	88.402	ENSIPUG00000012402	kpnb1	93	88.402	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	95.091	ENSSTOG00000007896	KPNB1	99	95.091	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	94.749	ENSJJAG00000010909	Kpnb1	99	94.749	Jaculus_jaculus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	91.834	ENSKMAG00000001547	kpnb1	96	91.834	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	91.588	ENSLBEG00000025794	kpnb1	98	91.588	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000010177	KPNB1	86	94.024	ENSLACG00000017620	KPNB1	97	94.024	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	93.254	ENSLOCG00000013753	kpnb1	96	93.254	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	89.612	ENSLAFG00000001328	KPNB1	99	89.612	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000010177	KPNB1	99	95.397	ENSMFAG00000030197	KPNB1	100	97.515	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000010177	KPNB1	99	95.732	ENSMMUG00000019760	KPNB1	99	95.732	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	94.749	ENSMNEG00000040927	KPNB1	99	94.749	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	94.977	ENSMLEG00000038185	KPNB1	99	94.977	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	92.781	ENSMAMG00000011036	kpnb1	96	92.781	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	92.426	ENSMZEG00005004564	kpnb1	96	92.426	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000010177	KPNB1	55	98.758	ENSMGAG00000002770	-	100	98.758	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	94.749	ENSMAUG00000006211	Kpnb1	99	94.749	Mesocricetus_auratus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	97.870	ENSMICG00000012059	KPNB1	81	97.870	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	94.749	ENSMOCG00000003683	Kpnb1	99	94.749	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	95.091	ENSMODG00000012505	KPNB1	99	95.091	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	92.899	ENSMALG00000000863	kpnb1	96	92.899	Monopterus_albus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	94	94.647	MGP_CAROLIEiJ_G0017050	Kpnb1	99	94.647	Mus_caroli
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	94.863	ENSMUSG00000001440	Kpnb1	99	94.863	Mus_musculus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	94.071	ENSMPUG00000015220	KPNB1	99	94.071	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	89.647	ENSMLUG00000014522	KPNB1	99	89.647	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	97	97.754	ENSNGAG00000017610	Kpnb1	100	97.751	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	92.426	ENSNBRG00000019305	kpnb1	96	92.426	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	94.749	ENSNLEG00000001446	KPNB1	99	94.749	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	89.498	ENSMEUG00000014284	KPNB1	99	89.498	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	94.521	ENSODEG00000017287	KPNB1	99	94.521	Octodon_degus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	92.544	ENSONIG00000009269	kpnb1	96	92.544	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	94.977	ENSOCUG00000015425	KPNB1	99	94.977	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	92.308	ENSORLG00000019936	kpnb1	96	92.308	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	92.308	ENSORLG00020021181	kpnb1	96	92.308	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	92.189	ENSORLG00015012177	kpnb1	96	92.189	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	92.426	ENSOMEG00000021022	kpnb1	96	92.426	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	94.977	ENSOGAG00000006153	KPNB1	99	94.977	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000010177	KPNB1	97	97.524	ENSOARG00000008469	KPNB1	98	97.524	Ovis_aries
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	94.749	ENSPPAG00000028842	KPNB1	99	94.749	Pan_paniscus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	97	97.754	ENSPPRG00000022879	KPNB1	97	97.754	Panthera_pardus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	97	97.754	ENSPTIG00000006870	KPNB1	97	97.754	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	94.749	ENSPTRG00000009333	KPNB1	99	94.749	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	94.749	ENSPANG00000022099	KPNB1	99	94.749	Papio_anubis
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	92.899	ENSPKIG00000017563	kpnb1	96	92.899	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	98.698	ENSPSIG00000009775	KPNB1	100	98.698	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	87.825	ENSPMGG00000001041	kpnb1	89	87.825	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	94.749	ENSPEMG00000017783	Kpnb1	99	94.749	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	86.288	ENSPMAG00000007117	kpnb1	96	86.288	Petromyzon_marinus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	95.091	ENSPCIG00000001034	KPNB1	99	95.091	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	91.953	ENSPFOG00000009014	kpnb1	96	91.953	Poecilia_formosa
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	91.953	ENSPLAG00000010922	kpnb1	96	91.953	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	91.953	ENSPREG00000012268	kpnb1	96	91.953	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	94.749	ENSPPYG00000025935	KPNB1	99	94.749	Pongo_abelii
ENSAPLG00000010177	KPNB1	75	80.667	ENSPCAG00000002526	KPNB1	78	80.667	Procavia_capensis
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	95.091	ENSPCOG00000026259	KPNB1	99	95.091	Propithecus_coquereli
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	94.635	ENSPVAG00000004910	KPNB1	99	94.635	Pteropus_vampyrus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	88.136	ENSPNYG00000017703	kpnb1	92	92.961	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	84.912	ENSPNAG00000024047	kpnb1	96	84.912	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	94.863	ENSRNOG00000009275	Kpnb1	99	94.863	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	94.521	ENSRBIG00000002254	KPNB1	99	94.521	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	97.515	ENSRROG00000030419	KPNB1	97	97.515	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000010177	KPNB1	95	34.245	YLR347C	KAP95	94	34.245	Saccharomyces_cerevisiae
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	94.749	ENSSBOG00000030025	KPNB1	94	94.749	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000010177	KPNB1	97	97.642	ENSSHAG00000018214	KPNB1	99	97.642	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	93.491	ENSSFOG00015020000	kpnb1	98	92.189	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	93.018	ENSSDUG00000016218	kpnb1	96	93.018	Seriola_dumerili
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	93.018	ENSSLDG00000021549	kpnb1	95	93.018	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	98.225	ENSSPUG00000017799	KPNB1	96	98.225	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	92.899	ENSSPAG00000019346	kpnb1	96	92.899	Stegastes_partitus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	94.863	ENSSSCG00000017514	KPNB1	99	94.863	Sus_scrofa
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	93.609	ENSTGUG00000003387	KPNB1	100	93.609	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	89.822	ENSTRUG00000000542	kpnb1	96	89.822	Takifugu_rubripes
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	90.059	ENSTNIG00000006494	kpnb1	96	90.059	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	97.751	ENSTTRG00000004682	KPNB1	100	97.751	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	95.091	ENSUAMG00000025344	KPNB1	99	95.091	Ursus_americanus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	95.205	ENSUMAG00000016471	KPNB1	99	95.205	Ursus_maritimus
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	80.205	ENSVPAG00000003675	KPNB1	99	80.205	Vicugna_pacos
ENSAPLG00000010177	KPNB1	100	95.091	ENSVVUG00000003085	KPNB1	99	95.091	Vulpes_vulpes
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	94.675	ENSXETG00000014717	kpnb1	96	94.675	Xenopus_tropicalis
ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	92.071	ENSXMAG00000018792	kpnb1	96	92.071	Xiphophorus_maculatus