EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000010340 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: POLR1E
Alias: -
Full Name: RNA polymerase I subunit E
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 12637 bases
Position: chrKB743341.1:26925-39561
Accession: 101790236
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000010063	RNA_pol_I_A49	PF06870.12	5.3e-82	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000010769	POLR1E-201	1320	XM_005031870	ENSAPLP00000010063	381 (aa)	-	U3IS40

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000010340's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
apla03020	RNA polymerase	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000010340's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	54.856	ENSG00000137054	POLR1E	80	55.000	Homo_sapiens
ENSAPLG00000010340	POLR1E	80	63.333	ENSAPOG00000012452	polr1e	78	67.857	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	57.623	ENSAMEG00000010193	POLR1E	80	57.623	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	38.058	ENSACIG00000009884	polr1e	76	44.097	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	38.875	ENSAOCG00000005665	polr1e	81	39.896	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	38.875	ENSAPEG00000020581	polr1e	81	39.896	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	41.146	ENSATEG00000020609	polr1e	81	41.146	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	55.789	ENSANAG00000038046	POLR1E	80	55.789	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	40.000	ENSACLG00000013685	polr1e	80	40.000	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	37.047	ENSAMXG00000018181	polr1e	81	37.047	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	57.105	ENSBTAG00000012243	POLR1E	80	57.105	Bos_taurus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	51.181	ENSCJAG00000010512	POLR1E	73	55.655	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	56.842	ENSCAFG00000002377	POLR1E	80	56.842	Canis_familiaris
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	57.105	ENSCAFG00020017851	POLR1E	80	57.105	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	56.316	ENSCHIG00000019479	POLR1E	80	56.316	Capra_hircus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	53.947	ENSTSYG00000002075	POLR1E	80	53.947	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000010340	POLR1E	76	64.828	ENSCAPG00000015653	POLR1E	99	64.828	Cavia_aperea
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	56.806	ENSCPOG00000009965	POLR1E	80	56.806	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	82	60.256	ENSCCAG00000029460	POLR1E	79	60.256	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	55.263	ENSCATG00000031732	POLR1E	75	77.419	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000010340	POLR1E	86	56.575	ENSCLAG00000012701	POLR1E	74	56.575	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	55.000	ENSCSAG00000010782	POLR1E	80	55.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	82	75.000	ENSCHOG00000013024	POLR1E	66	75.000	Choloepus_hoffmanni
ENSAPLG00000010340	POLR1E	84	85.185	ENSCPBG00000006923	POLR1E	81	65.789	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	55.118	ENSCANG00000036112	POLR1E	75	78.125	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	56.955	ENSCGRG00001006197	Polr1e	79	56.955	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	56.430	ENSCGRG00000006430	Polr1e	79	56.430	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	38.642	ENSCSEG00000005121	polr1e	81	38.642	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	39.175	ENSCVAG00000019759	polr1e	81	39.062	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	79	42.765	ENSDARG00000006434	polr1e	81	39.119	Danio_rerio
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	56.298	ENSDNOG00000010257	POLR1E	82	56.298	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	53.704	ENSETEG00000018204	POLR1E	93	53.704	Echinops_telfairi
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	55.526	ENSEASG00005000675	POLR1E	80	55.526	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	55.526	ENSECAG00000014669	POLR1E	80	55.526	Equus_caballus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	83	74.194	ENSEEUG00000011928	POLR1E	67	74.194	Erinaceus_europaeus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	38.243	ENSELUG00000008150	polr1e	80	38.642	Esox_lucius
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	57.105	ENSFCAG00000013081	POLR1E	80	57.105	Felis_catus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	72.703	ENSFALG00000012950	POLR1E	84	72.703	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	55.497	ENSFDAG00000016917	POLR1E	80	55.497	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	38.462	ENSFHEG00000009801	polr1e	81	38.182	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	91	35.897	ENSGMOG00000003336	POLR1E	76	35.897	Gadus_morhua
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	79.790	ENSGALG00000005395	POLR1E	81	79.790	Gallus_gallus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	37.275	ENSGAFG00000004850	polr1e	81	37.143	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	38.402	ENSGACG00000016087	polr1e	81	38.402	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	84	75.000	ENSGAGG00000001659	POLR1E	81	75.000	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000010340	POLR1E	81	77.419	ENSGGOG00000001882	POLR1E	79	77.419	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	39.231	ENSHBUG00000002559	polr1e	80	40.260	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	56.283	ENSHGLG00000002036	POLR1E	80	56.283	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	56.545	ENSHGLG00100012784	POLR1E	80	56.545	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	37.403	ENSHCOG00000002774	polr1e	81	38.442	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	38.120	ENSIPUG00000003019	polr1e	80	37.598	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	56.053	ENSSTOG00000009810	POLR1E	80	56.053	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	54.474	ENSJJAG00000020731	Polr1e	77	54.474	Jaculus_jaculus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	39.740	ENSKMAG00000000046	polr1e	81	39.740	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	38.947	ENSLBEG00000003104	polr1e	80	39.474	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	50.392	ENSLACG00000003416	POLR1E	93	50.392	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	43.684	ENSLOCG00000012859	polr1e	80	43.684	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	56.777	ENSLAFG00000012831	POLR1E	82	56.777	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	55.263	ENSMFAG00000045465	POLR1E	75	77.419	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	55.263	ENSMMUG00000017892	POLR1E	75	77.419	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000010340	POLR1E	81	61.290	ENSMNEG00000040283	POLR1E	82	54.122	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000010340	POLR1E	81	77.419	ENSMLEG00000031135	POLR1E	78	77.419	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	38.802	ENSMAMG00000001260	polr1e	80	38.802	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	40.260	ENSMZEG00005021536	polr1e	80	40.260	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	53.947	ENSMAUG00000021044	Polr1e	77	53.947	Mesocricetus_auratus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	55.789	ENSMICG00000003673	POLR1E	80	55.789	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	56.693	ENSMOCG00000012920	Polr1e	79	56.693	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	40.155	ENSMMOG00000007391	polr1e	83	40.155	Mola_mola
ENSAPLG00000010340	POLR1E	96	56.131	ENSMODG00000002884	POLR1E	79	56.131	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	38.677	ENSMALG00000002665	polr1e	80	39.433	Monopterus_albus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	55.729	MGP_CAROLIEiJ_G0025967	Polr1e	80	55.729	Mus_caroli
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	55.729	ENSMUSG00000028318	Polr1e	83	52.756	Mus_musculus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	56.397	MGP_PahariEiJ_G0024114	Polr1e	83	54.474	Mus_pahari
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	55.729	MGP_SPRETEiJ_G0026930	Polr1e	83	52.756	Mus_spretus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	58.808	ENSMPUG00000006040	POLR1E	82	58.808	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	55.526	ENSMLUG00000012688	POLR1E	77	55.526	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	55.526	ENSNGAG00000002520	Polr1e	78	55.526	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	40.519	ENSNBRG00000016822	polr1e	80	40.519	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000010340	POLR1E	81	77.419	ENSNLEG00000003616	POLR1E	78	77.419	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000010340	POLR1E	60	74.194	ENSMEUG00000015372	-	60	74.194	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000010340	POLR1E	80	59.539	ENSOPRG00000014206	POLR1E	85	59.539	Ochotona_princeps
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	56.545	ENSODEG00000014565	POLR1E	78	56.545	Octodon_degus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	41.085	ENSONIG00000008921	polr1e	80	40.779	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	57.368	ENSOCUG00000024773	POLR1E	80	57.368	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	40.000	ENSORLG00000005143	polr1e	81	40.000	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	38.303	ENSORLG00020007271	polr1e	86	38.303	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	39.740	ENSORLG00015000137	polr1e	81	39.740	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	39.740	ENSOMEG00000013264	polr1e	79	39.740	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	56.579	ENSOGAG00000012981	POLR1E	78	56.579	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	56.842	ENSOARG00000011465	POLR1E	77	56.842	Ovis_aries
ENSAPLG00000010340	POLR1E	81	77.419	ENSPPAG00000034566	POLR1E	78	77.419	Pan_paniscus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	57.368	ENSPPRG00000005649	POLR1E	80	57.368	Panthera_pardus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	57.632	ENSPTIG00000009774	POLR1E	80	57.632	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000010340	POLR1E	81	77.419	ENSPTRG00000020944	POLR1E	78	77.419	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	55.263	ENSPANG00000025563	POLR1E	75	77.419	Papio_anubis
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	39.119	ENSPKIG00000003562	polr1e	80	39.119	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	59.103	ENSPSIG00000003274	POLR1E	78	59.103	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	39.018	ENSPMGG00000024169	polr1e	81	39.018	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	56.545	ENSPEMG00000019151	-	80	56.545	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	42.147	ENSPEMG00000022300	-	75	42.147	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000010340	POLR1E	96	56.131	ENSPCIG00000014798	POLR1E	79	56.131	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	40.674	ENSPFOG00000019627	polr1e	81	40.674	Poecilia_formosa
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	39.740	ENSPLAG00000022679	polr1e	81	39.740	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	39.740	ENSPMEG00000022123	polr1e	87	39.740	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	39.119	ENSPREG00000009470	polr1e	81	39.119	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	54.474	ENSPPYG00000019061	POLR1E	80	54.474	Pongo_abelii
ENSAPLG00000010340	POLR1E	62	59.746	ENSPCAG00000004891	POLR1E	77	59.746	Procavia_capensis
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	55.263	ENSPCOG00000027448	POLR1E	80	55.263	Propithecus_coquereli
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	56.053	ENSPVAG00000007940	POLR1E	71	55.789	Pteropus_vampyrus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	40.260	ENSPNYG00000001032	polr1e	80	40.260	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	37.270	ENSPNAG00000006987	polr1e	80	37.270	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	53.806	ENSRNOG00000012664	Polr1e	77	53.806	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	55.263	ENSRBIG00000034214	POLR1E	88	55.263	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	55.263	ENSRROG00000031986	POLR1E	75	77.419	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	55.526	ENSSBOG00000021415	POLR1E	80	55.526	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	55.526	ENSSHAG00000016084	POLR1E	93	55.526	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	40.052	ENSSFOG00015002293	polr1e	81	40.052	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	39.164	ENSSMAG00000011672	polr1e	75	39.426	Scophthalmus_maximus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	39.948	ENSSDUG00000022279	polr1e	80	39.948	Seriola_dumerili
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	39.637	ENSSLDG00000024918	polr1e	80	39.637	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPLG00000010340	POLR1E	61	56.277	ENSSARG00000009810	-	58	56.277	Sorex_araneus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	63.780	ENSSPUG00000009499	POLR1E	80	63.780	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	41.192	ENSSPAG00000021240	polr1e	81	41.192	Stegastes_partitus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	56.168	ENSSSCG00000005347	POLR1E	80	56.168	Sus_scrofa
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	68.020	ENSTGUG00000007169	POLR1E	87	68.020	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	39.119	ENSTRUG00000020779	polr1e	89	39.119	Takifugu_rubripes
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	38.701	ENSTNIG00000017812	polr1e	81	38.701	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	56.579	ENSTBEG00000013786	POLR1E	71	56.579	Tupaia_belangeri
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	55.614	ENSTTRG00000008294	POLR1E	72	55.614	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	56.316	ENSUAMG00000012474	POLR1E	80	56.316	Ursus_americanus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	56.316	ENSUMAG00000011496	POLR1E	80	56.316	Ursus_maritimus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	85	57.099	ENSVPAG00000009048	POLR1E	66	57.099	Vicugna_pacos
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	57.105	ENSVVUG00000019954	POLR1E	80	57.105	Vulpes_vulpes
ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	47.382	ENSXETG00000006533	polr1e	81	47.382	Xenopus_tropicalis
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	37.662	ENSXCOG00000013706	polr1e	80	37.403	Xiphophorus_couchianus
ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	39.481	ENSXMAG00000012484	polr1e	81	39.481	Xiphophorus_maculatus