EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000010912 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: survival of motor neuron protein-like
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2914 bases
Position: chrKB743474.1:79683-82596
Accession: 101792326
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000010654	SMN	PF06003.12	2.3e-98	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000011371	-	597	XM_005023328	ENSAPLP00000010654	199 (aa)	XP_005023385	U3ITT1

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000010912's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000010912's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000010912	-	97	55.000	ENSG00000205571	SMN2	72	66.667	Homo_sapiens
ENSAPLG00000010912	-	97	55.000	ENSG00000172062	SMN1	68	56.995	Homo_sapiens
ENSAPLG00000010912	-	96	45.274	ENSAPOG00000011324	smn1	69	50.244	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000010912	-	97	58.081	ENSAMEG00000003316	-	66	59.091	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000010912	-	90	46.277	ENSACIG00000019772	-	70	46.809	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000010912	-	96	45.918	ENSAOCG00000024444	smn1	69	40.741	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000010912	-	96	46.429	ENSAPEG00000016504	smn1	71	50.746	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000010912	-	93	48.744	ENSATEG00000002182	smn1	58	43.350	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000010912	-	99	56.784	ENSACAG00000010017	-	68	62.500	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000010912	-	97	50.000	ENSANAG00000032133	-	74	53.960	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000010912	-	96	45.918	ENSACLG00000007308	smn1	66	48.259	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000010912	-	98	48.469	ENSAMXG00000013884	smn1	70	52.475	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000010912	-	96	58.376	ENSBTAG00000005743	SMN2	68	59.898	Bos_taurus
ENSAPLG00000010912	-	97	52.736	ENSCJAG00000016290	-	68	54.229	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000010912	-	97	58.586	ENSCAFG00000007812	SMN	69	59.091	Canis_familiaris
ENSAPLG00000010912	-	97	58.586	ENSCAFG00020019229	-	64	59.091	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000010912	-	96	60.302	ENSCHIG00000015559	-	67	60.302	Capra_hircus
ENSAPLG00000010912	-	100	56.522	ENSTSYG00000012058	-	71	57.971	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000010912	-	91	48.913	ENSCAPG00000011021	-	82	44.776	Cavia_aperea
ENSAPLG00000010912	-	96	54.822	ENSCPOG00000012328	-	67	56.345	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000010912	-	96	54.822	ENSCPOG00000036973	-	68	56.345	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000010912	-	97	55.224	ENSCCAG00000018127	-	68	55.276	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000010912	-	97	54.500	ENSCATG00000037002	-	68	56.477	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000010912	-	96	56.410	ENSCLAG00000000284	-	66	56.345	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000010912	-	97	54.500	ENSCSAG00000015688	-	68	56.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000010912	-	66	80.000	ENSCHOG00000007346	-	76	45.238	Choloepus_hoffmanni
ENSAPLG00000010912	-	99	70.352	ENSCPBG00000010968	-	73	71.859	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000010912	-	93	51.295	ENSCANG00000033324	-	65	53.368	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000010912	-	97	55.051	ENSCANG00000038242	-	68	57.672	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000010912	-	97	52.792	ENSCGRG00001017959	-	68	53.807	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000010912	-	97	47.692	ENSCGRG00001016998	-	77	48.731	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000010912	-	97	52.792	ENSCGRG00000007698	Smn1	68	53.807	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000010912	-	95	44.976	ENSCSEG00000015227	smn1	71	46.009	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000010912	-	99	50.251	ENSDARG00000018494	smn1	71	52.451	Danio_rerio
ENSAPLG00000010912	-	97	57.360	ENSDNOG00000007283	-	82	58.376	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000010912	-	51	45.098	ENSDNOG00000045949	-	59	42.857	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000010912	-	97	53.731	ENSDORG00000007082	Smn1	74	56.061	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000010912	-	94	39.806	ENSEBUG00000011902	smn1	65	38.974	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000010912	-	93	50.777	ENSEASG00005018000	-	67	51.020	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000010912	-	97	54.000	ENSECAG00000015215	-	69	54.187	Equus_caballus
ENSAPLG00000010912	-	92	54.497	ENSEEUG00000015777	-	75	54.497	Erinaceus_europaeus
ENSAPLG00000010912	-	99	50.971	ENSELUG00000018067	smn1	71	48.058	Esox_lucius
ENSAPLG00000010912	-	97	56.281	ENSFCAG00000028292	SMN	69	58.794	Felis_catus
ENSAPLG00000010912	-	100	79.899	ENSFALG00000012320	-	70	79.703	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000010912	-	97	54.315	ENSFDAG00000017683	-	67	54.000	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000010912	-	99	44.000	ENSGMOG00000017279	smn1	68	44.335	Gadus_morhua
ENSAPLG00000010912	-	100	82.412	ENSGALG00000002430	SMN	75	82.412	Gallus_gallus
ENSAPLG00000010912	-	96	48.187	ENSGAFG00000009501	smn1	69	41.743	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000010912	-	96	45.361	ENSGACG00000010584	smn1	66	51.795	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000010912	-	98	55.556	ENSGAGG00000013639	-	69	55.556	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000010912	-	99	68.342	ENSGAGG00000011374	-	69	70.352	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000010912	-	51	57.692	ENSGGOG00000026704	-	59	53.175	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000010912	-	92	50.000	ENSGGOG00000003872	-	64	48.936	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000010912	-	96	48.223	ENSHBUG00000013987	smn1	69	48.259	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000010912	-	97	54.872	ENSHGLG00000001018	-	66	54.872	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000010912	-	97	55.051	ENSHGLG00000001905	-	70	55.051	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000010912	-	97	54.872	ENSHGLG00100011252	-	66	54.872	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000010912	-	94	55.729	ENSHGLG00100018676	-	71	55.729	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000010912	-	97	43.541	ENSHCOG00000017136	smn1	62	43.077	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000010912	-	98	47.573	ENSIPUG00000012580	smn1	63	51.244	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000010912	-	92	57.219	ENSSTOG00000012288	-	68	52.941	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000010912	-	96	46.734	ENSKMAG00000007239	smn1	73	42.273	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000010912	-	96	45.274	ENSLBEG00000022550	smn1	69	46.411	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000010912	-	97	40.299	ENSLACG00000009808	-	66	38.049	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000010912	-	96	44.271	ENSLOCG00000011339	smn1	68	47.716	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000010912	-	97	56.436	ENSLAFG00000003425	-	99	45.238	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000010912	-	97	54.500	ENSMFAG00000031523	SMN1	72	55.500	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000010912	-	97	50.500	ENSMFAG00000008812	-	68	51.500	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000010912	-	97	54.500	ENSMMUG00000020214	SMN1	68	55.959	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000010912	-	97	50.500	ENSMMUG00000030594	-	68	51.500	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000010912	-	86	49.438	ENSMNEG00000036423	-	71	50.562	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000010912	-	99	53.922	ENSMNEG00000035094	-	68	55.959	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000010912	-	97	55.000	ENSMLEG00000041902	-	68	56.477	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000010912	-	96	50.990	ENSMAMG00000011034	smn1	69	46.117	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000010912	-	96	47.716	ENSMZEG00005013634	smn1	69	48.259	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000010912	-	100	77.387	ENSMGAG00000008889	-	98	77.387	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000010912	-	97	52.792	ENSMAUG00000010262	Smn1	68	53.807	Mesocricetus_auratus
ENSAPLG00000010912	-	74	51.282	ENSMICG00000034708	-	58	51.333	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000010912	-	97	54.315	ENSMOCG00000017833	Smn1	68	54.315	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000010912	-	95	41.919	ENSMMOG00000005504	smn1	69	41.627	Mola_mola
ENSAPLG00000010912	-	97	63.776	ENSMODG00000001436	-	67	63.000	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000010912	-	96	44.712	ENSMALG00000008025	smn1	69	45.455	Monopterus_albus
ENSAPLG00000010912	-	97	53.030	MGP_CAROLIEiJ_G0018836	Smn1	87	49.645	Mus_caroli
ENSAPLG00000010912	-	97	52.020	ENSMUSG00000021645	Smn1	87	48.936	Mus_musculus
ENSAPLG00000010912	-	97	49.038	MGP_PahariEiJ_G0015911	Smn1	87	47.857	Mus_pahari
ENSAPLG00000010912	-	97	52.239	MGP_SPRETEiJ_G0019718	Smn1	87	48.611	Mus_spretus
ENSAPLG00000010912	-	94	59.067	ENSMPUG00000014470	-	68	59.585	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000010912	-	97	53.883	ENSMLUG00000010603	-	66	55.825	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000010912	-	97	55.556	ENSNGAG00000019833	Smn1	69	57.000	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000010912	-	96	46.231	ENSNBRG00000023000	smn1	69	48.039	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000010912	-	97	55.500	ENSNLEG00000004454	-	68	57.513	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000010912	-	92	61.497	ENSMEUG00000011393	-	83	61.497	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000010912	-	92	56.771	ENSOPRG00000002015	-	76	57.216	Ochotona_princeps
ENSAPLG00000010912	-	91	57.143	ENSODEG00000015976	-	67	57.143	Octodon_degus
ENSAPLG00000010912	-	96	46.231	ENSONIG00000011799	smn1	69	48.039	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000010912	-	97	63.590	ENSOANG00000001626	-	69	63.636	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPLG00000010912	-	97	56.410	ENSOCUG00000017097	-	67	56.923	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000010912	-	97	55.897	ENSOCUG00000026649	-	66	56.410	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000010912	-	97	53.431	ENSOCUG00000025183	-	75	54.854	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000010912	-	96	46.231	ENSORLG00020007936	smn1	66	44.162	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000010912	-	96	46.269	ENSOMEG00000007824	smn1	69	50.990	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000010912	-	92	55.330	ENSOGAG00000031414	-	67	55.838	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000010912	-	96	58.883	ENSOARG00000005425	-	72	60.406	Ovis_aries
ENSAPLG00000010912	-	97	55.446	ENSPPAG00000036640	-	68	57.436	Pan_paniscus
ENSAPLG00000010912	-	97	56.784	ENSPPRG00000005575	-	69	57.921	Panthera_pardus
ENSAPLG00000010912	-	97	57.500	ENSPTIG00000007745	-	69	57.635	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000010912	-	97	52.451	ENSPTRG00000016955	-	68	56.186	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000010912	-	97	54.000	ENSPANG00000013601	-	68	55.500	Papio_anubis
ENSAPLG00000010912	-	99	51.220	ENSPANG00000000253	-	69	52.683	Papio_anubis
ENSAPLG00000010912	-	98	45.000	ENSPKIG00000011096	smn1	70	38.356	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000010912	-	99	69.000	ENSPSIG00000014787	-	64	69.000	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000010912	-	96	44.330	ENSPMGG00000012285	smn1	66	44.211	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPLG00000010912	-	98	40.284	ENSPMAG00000005004	smn1	69	42.574	Petromyzon_marinus
ENSAPLG00000010912	-	97	62.755	ENSPCIG00000025764	-	68	63.000	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000010912	-	96	46.231	ENSPFOG00000007786	smn1	69	40.826	Poecilia_formosa
ENSAPLG00000010912	-	96	48.969	ENSPLAG00000012071	smn1	66	44.898	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000010912	-	96	48.454	ENSPMEG00000017085	smn1	66	44.388	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000010912	-	96	49.261	ENSPREG00000005824	smn1	69	42.202	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000010912	-	92	39.785	ENSPPYG00000019189	-	68	35.789	Pongo_abelii
ENSAPLG00000010912	-	97	55.000	ENSPPYG00000015533	-	72	56.500	Pongo_abelii
ENSAPLG00000010912	-	97	56.931	ENSPCAG00000004187	-	75	59.113	Procavia_capensis
ENSAPLG00000010912	-	69	51.064	ENSPCOG00000022307	-	65	49.677	Propithecus_coquereli
ENSAPLG00000010912	-	97	58.500	ENSPVAG00000005977	-	68	59.500	Pteropus_vampyrus
ENSAPLG00000010912	-	96	46.231	ENSPNYG00000014148	smn1	69	48.039	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000010912	-	98	50.739	ENSPNAG00000014007	smn1	61	52.261	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000010912	-	97	53.299	ENSRNOG00000018067	Smn1	68	53.807	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000010912	-	97	54.500	ENSRBIG00000037052	-	68	56.000	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000010912	-	93	44.792	ENSRBIG00000036775	-	62	48.421	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000010912	-	97	46.701	ENSRROG00000031088	-	65	45.050	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000010912	-	97	54.500	ENSRROG00000039399	-	68	56.477	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000010912	-	53	52.336	ENSSBOG00000020112	-	66	49.206	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000010912	-	97	54.315	ENSSBOG00000011665	-	67	55.330	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000010912	-	97	62.755	ENSSHAG00000001499	-	72	62.000	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000010912	-	99	49.000	ENSSFOG00015015507	smn1	70	49.038	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000010912	-	96	41.294	ENSSMAG00000007922	smn1	69	51.232	Scophthalmus_maximus
ENSAPLG00000010912	-	96	44.444	ENSSDUG00000018533	smn1	69	51.707	Seriola_dumerili
ENSAPLG00000010912	-	96	44.928	ENSSLDG00000021135	smn1	69	52.195	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPLG00000010912	-	99	67.337	ENSSPUG00000000373	-	69	69.347	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000010912	-	96	46.392	ENSSPAG00000004345	smn1	69	48.756	Stegastes_partitus
ENSAPLG00000010912	-	97	55.779	ENSSSCG00000016970	-	74	57.789	Sus_scrofa
ENSAPLG00000010912	-	92	75.000	ENSTGUG00000001548	-	69	75.000	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000010912	-	97	41.500	ENSTRUG00000000736	smn	69	42.211	Takifugu_rubripes
ENSAPLG00000010912	-	51	59.615	ENSTBEG00000002399	-	57	57.265	Tupaia_belangeri
ENSAPLG00000010912	-	96	59.278	ENSTTRG00000005080	-	67	60.204	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000010912	-	97	58.586	ENSUMAG00000007842	-	51	59.596	Ursus_maritimus
ENSAPLG00000010912	-	92	49.468	ENSVPAG00000009887	-	68	45.854	Vicugna_pacos
ENSAPLG00000010912	-	97	58.586	ENSVVUG00000006934	-	69	59.091	Vulpes_vulpes
ENSAPLG00000010912	-	92	35.323	ENSXETG00000004912	-	66	34.272	Xenopus_tropicalis
ENSAPLG00000010912	-	98	54.822	ENSXETG00000018189	smn2	67	56.716	Xenopus_tropicalis
ENSAPLG00000010912	-	96	48.768	ENSXMAG00000001521	smn1	69	42.661	Xiphophorus_maculatus