EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000011046 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: RAB11B%2C member RAS oncogene family
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 10429 bases
Position: chrKB744134.1:40401-50829
Accession: 101796061
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000010780	MMR_HSR1	PF01926.23	1.5e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000011498	-	2439	XM_005027204	ENSAPLP00000010780	218 (aa)	XP_005027261	U3IU57

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000011046's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
apla04144	Endocytosis	KEGG
apla05164	Influenza A	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000011046's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAPLG00000011046	-	73	34.545	ENSAPLG00000014490	GEM	58	33.898
ENSAPLG00000011046	-	71	41.509	ENSAPLG00000002371	RAB9A	79	41.509
ENSAPLG00000011046	-	94	32.381	ENSAPLG00000008936	RAB36	79	32.381
ENSAPLG00000011046	-	68	34.000	ENSAPLG00000015953	KRAS	85	35.404
ENSAPLG00000011046	-	75	50.920	ENSAPLG00000009597	RAB1A	80	50.920
ENSAPLG00000011046	-	70	44.231	ENSAPLG00000006592	-	89	44.231
ENSAPLG00000011046	-	73	47.170	ENSAPLG00000010775	RAB35	97	40.594
ENSAPLG00000011046	-	54	30.579	ENSAPLG00000001404	ARL4A	59	30.579
ENSAPLG00000011046	-	68	35.333	ENSAPLG00000012248	HRAS	97	36.646
ENSAPLG00000011046	-	94	89.268	ENSAPLG00000014962	RAB11A	94	89.268
ENSAPLG00000011046	-	76	40.936	ENSAPLG00000001949	RAB9B	85	40.936
ENSAPLG00000011046	-	94	42.927	ENSAPLG00000012817	RAB5A	90	42.927
ENSAPLG00000011046	-	70	36.842	ENSAPLG00000009164	-	92	36.842
ENSAPLG00000011046	-	69	38.562	ENSAPLG00000013647	-	87	38.562
ENSAPLG00000011046	-	72	32.911	ENSAPLG00000013435	MRAS	81	35.429
ENSAPLG00000011046	-	67	36.552	ENSAPLG00000003715	RAB23	89	37.342
ENSAPLG00000011046	-	60	30.534	ENSAPLG00000006871	RRAS2	77	30.534
ENSAPLG00000011046	-	94	71.359	ENSAPLG00000009395	-	100	71.359
ENSAPLG00000011046	-	72	40.123	ENSAPLG00000004323	RAB7A	91	40.123
ENSAPLG00000011046	-	83	38.624	ENSAPLG00000006894	RAB33B	81	38.624
ENSAPLG00000011046	-	93	39.409	ENSAPLG00000012821	RAB30	94	39.409
ENSAPLG00000011046	-	79	46.023	ENSAPLG00000014543	RAB39B	83	46.023
ENSAPLG00000011046	-	72	39.103	ENSAPLG00000013463	-	67	39.103
ENSAPLG00000011046	-	59	36.434	ENSAPLG00000011744	RAB20	54	36.434

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000011046	-	94	98.058	ENSAPOG00000023455	rab11bb	94	98.058	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000011046	-	94	98.544	ENSACIG00000024376	-	94	98.544	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000011046	-	94	84.951	ENSACIG00000019631	rab11bb	94	84.951	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000011046	-	94	98.544	ENSAOCG00000018849	-	94	98.544	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000011046	-	94	98.058	ENSAOCG00000018239	rab11bb	94	98.058	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000011046	-	94	98.058	ENSAPEG00000016590	rab11bb	94	98.058	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000011046	-	94	98.058	ENSATEG00000017696	rab11bb	94	98.058	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000011046	-	94	98.058	ENSATEG00000023725	-	94	98.058	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000011046	-	94	98.544	ENSACLG00000005446	-	94	98.544	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000011046	-	94	98.058	ENSACLG00000007076	rab11bb	94	98.058	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000011046	-	96	96.651	ENSAMXG00000037623	-	96	96.651	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000011046	-	94	99.515	ENSAMXG00000042655	rab11bb	94	99.515	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000011046	-	96	97.608	ENSBTAG00000002475	RAB11B	96	97.608	Bos_taurus
ENSAPLG00000011046	-	96	96.651	ENSCHIG00000022426	-	93	96.651	Capra_hircus
ENSAPLG00000011046	-	96	97.608	ENSCATG00000029188	-	96	97.608	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000011046	-	96	99.043	ENSCPBG00000017056	-	96	99.043	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000011046	-	94	98.058	ENSCSEG00000007239	-	94	98.058	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000011046	-	94	98.058	ENSCSEG00000012149	rab11bb	94	98.058	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000011046	-	94	97.573	ENSCVAG00000019718	-	94	97.573	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000011046	-	96	94.258	ENSCVAG00000019751	-	96	94.258	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000011046	-	94	98.058	ENSCVAG00000017021	-	94	98.058	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000011046	-	94	99.515	ENSDARG00000090086	rab11bb	94	99.515	Danio_rerio
ENSAPLG00000011046	-	96	96.651	ENSETEG00000000905	-	96	96.651	Echinops_telfairi
ENSAPLG00000011046	-	96	95.714	ENSEASG00005003708	-	97	95.714	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000011046	-	96	95.714	ENSECAG00000000716	RAB11B	97	95.714	Equus_caballus
ENSAPLG00000011046	-	94	97.573	ENSELUG00000020948	-	94	97.573	Esox_lucius
ENSAPLG00000011046	-	96	96.172	ENSELUG00000000916	-	96	96.172	Esox_lucius
ENSAPLG00000011046	-	94	98.058	ENSELUG00000021148	rab11bb	94	98.058	Esox_lucius
ENSAPLG00000011046	-	96	99.043	ENSFALG00000011828	-	96	99.043	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000011046	-	94	98.058	ENSFHEG00000022676	-	94	98.058	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000011046	-	94	98.058	ENSFHEG00000018353	rab11bb	94	98.058	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000011046	-	94	98.058	ENSGMOG00000009211	rab11bb	94	98.058	Gadus_morhua
ENSAPLG00000011046	-	94	94.118	ENSGMOG00000009668	-	94	94.118	Gadus_morhua
ENSAPLG00000011046	-	96	99.043	ENSGALG00000000613	RAB11B	96	99.043	Gallus_gallus
ENSAPLG00000011046	-	94	98.058	ENSGAFG00000007102	rab11bb	94	98.058	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000011046	-	96	94.258	ENSGACG00000013297	-	95	94.258	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000011046	-	94	97.573	ENSGACG00000015479	rab11bb	94	97.573	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000011046	-	96	97.608	ENSGGOG00000014516	RAB11B	96	97.608	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000011046	-	94	98.544	ENSHBUG00000009947	-	94	98.544	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000011046	-	94	98.058	ENSHBUG00000014777	rab11bb	94	98.058	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000011046	-	96	94.737	ENSHCOG00000000954	-	99	93.750	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000011046	-	94	98.544	ENSHCOG00000002423	rab11bb	94	98.544	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000011046	-	94	93.204	ENSHCOG00000000985	-	94	93.204	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000011046	-	96	97.129	ENSIPUG00000025100	rab11b	96	97.129	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000011046	-	94	99.029	ENSIPUG00000019927	rab11bb	94	99.029	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000011046	-	94	98.058	ENSKMAG00000009033	rab11bb	94	98.058	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000011046	-	94	98.544	ENSKMAG00000006170	-	94	98.544	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000011046	-	94	97.573	ENSLBEG00000015248	rab11bb	94	97.573	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000011046	-	94	90.291	ENSLBEG00000005981	-	94	90.291	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000011046	-	94	98.058	ENSLBEG00000004172	-	94	98.058	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000011046	-	96	99.043	ENSLACG00000016857	-	96	99.043	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000011046	-	96	97.608	ENSMFAG00000003654	RAB11B	96	97.608	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000011046	-	96	97.608	ENSMLEG00000030601	-	96	97.608	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000011046	-	94	97.087	ENSMAMG00000018533	-	94	97.087	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000011046	-	94	97.573	ENSMAMG00000006378	rab11bb	94	97.573	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000011046	-	94	98.544	ENSMZEG00005010975	-	94	98.544	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000011046	-	94	98.058	ENSMZEG00005003352	rab11bb	94	98.058	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000011046	-	96	97.608	ENSMICG00000034065	-	96	97.608	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000011046	-	95	95.192	ENSMMOG00000001238	-	95	95.192	Mola_mola
ENSAPLG00000011046	-	94	98.544	ENSMMOG00000001250	-	94	98.544	Mola_mola
ENSAPLG00000011046	-	94	98.049	ENSMMOG00000007917	rab11bb	100	98.049	Mola_mola
ENSAPLG00000011046	-	96	99.043	ENSMODG00000003841	-	96	99.043	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000011046	-	94	98.058	ENSMALG00000022187	rab11bb	94	98.058	Monopterus_albus
ENSAPLG00000011046	-	94	89.372	ENSMLUG00000006677	-	100	89.372	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000011046	-	94	98.544	ENSNBRG00000023885	-	94	98.544	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000011046	-	94	98.058	ENSNBRG00000000372	rab11bb	94	98.058	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000011046	-	96	99.043	ENSMEUG00000003686	-	96	99.043	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000011046	-	94	98.058	ENSONIG00000010435	rab11bb	94	98.058	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000011046	-	94	98.544	ENSONIG00000002544	-	94	98.544	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000011046	-	94	96.585	ENSORLG00000015284	-	68	96.585	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000011046	-	98	94.836	ENSORLG00000013938	rab11bb	94	97.573	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000011046	-	94	96.585	ENSORLG00020020844	RAB11B	94	96.585	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000011046	-	98	94.836	ENSORLG00020019393	rab11bb	95	96.618	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000011046	-	98	94.836	ENSORLG00015020173	rab11bb	94	97.573	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000011046	-	94	96.585	ENSORLG00015016999	RAB11B	94	96.585	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000011046	-	94	97.573	ENSOMEG00000002562	-	94	97.573	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000011046	-	94	98.058	ENSOMEG00000017806	-	94	98.058	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000011046	-	96	97.608	ENSPPAG00000028589	-	96	97.608	Pan_paniscus
ENSAPLG00000011046	-	96	97.608	ENSPTRG00000010422	RAB11B	96	97.608	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000011046	-	96	97.608	ENSPANG00000007765	-	96	97.608	Papio_anubis
ENSAPLG00000011046	-	94	97.073	ENSPKIG00000001389	-	66	97.073	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000011046	-	94	98.058	ENSPKIG00000011640	rab11bb	94	98.058	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000011046	-	96	97.608	ENSPKIG00000011703	-	96	97.608	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000011046	-	94	97.156	ENSPSIG00000010242	-	82	97.156	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000011046	-	95	92.788	ENSPMGG00000014336	-	95	92.788	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPLG00000011046	-	94	96.602	ENSPMGG00000014333	-	94	96.602	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPLG00000011046	-	94	98.058	ENSPMGG00000009435	rab11bb	94	98.058	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPLG00000011046	-	96	98.095	ENSPCIG00000020371	-	97	98.095	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000011046	-	94	98.544	ENSPFOG00000006224	-	94	98.544	Poecilia_formosa
ENSAPLG00000011046	-	94	98.058	ENSPFOG00000024114	-	94	98.058	Poecilia_formosa
ENSAPLG00000011046	-	94	98.544	ENSPLAG00000014207	-	94	98.544	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000011046	-	94	98.058	ENSPLAG00000001598	rab11bb	94	98.058	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000011046	-	94	98.544	ENSPMEG00000007842	-	94	98.544	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000011046	-	94	98.058	ENSPMEG00000012389	rab11bb	94	98.058	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000011046	-	96	96.651	ENSPREG00000014269	rab11bb	94	98.058	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000011046	-	94	98.058	ENSPREG00000006336	-	94	98.058	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000011046	-	94	98.544	ENSPNYG00000019611	-	94	98.544	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000011046	-	94	98.058	ENSPNYG00000004098	rab11bb	94	98.058	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000011046	-	96	97.608	ENSRROG00000037812	-	96	97.608	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000011046	-	96	98.571	ENSSHAG00000006816	-	95	98.571	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000011046	-	94	72.816	ENSSFOG00015006245	-	94	72.816	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000011046	-	96	97.608	ENSSFOG00015009042	rab11bb	96	97.608	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000011046	-	94	97.573	ENSSMAG00000004922	rab11bb	94	97.573	Scophthalmus_maximus
ENSAPLG00000011046	-	94	94.660	ENSSMAG00000018613	-	94	94.660	Scophthalmus_maximus
ENSAPLG00000011046	-	94	98.544	ENSSDUG00000002934	-	94	98.544	Seriola_dumerili
ENSAPLG00000011046	-	94	98.058	ENSSDUG00000013558	rab11bb	94	98.058	Seriola_dumerili
ENSAPLG00000011046	-	94	98.544	ENSSLDG00000005275	-	94	98.544	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPLG00000011046	-	94	98.058	ENSSLDG00000020676	rab11bb	94	98.058	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPLG00000011046	-	96	98.565	ENSSPUG00000002243	-	96	98.565	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000011046	-	94	98.058	ENSSPAG00000011419	rab11bb	94	98.058	Stegastes_partitus
ENSAPLG00000011046	-	94	98.544	ENSSPAG00000014559	-	94	98.544	Stegastes_partitus
ENSAPLG00000011046	-	96	99.043	ENSTGUG00000000084	-	96	99.043	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000011046	-	94	98.058	ENSTRUG00000022029	rab11bb	94	98.058	Takifugu_rubripes
ENSAPLG00000011046	-	94	98.529	ENSTRUG00000021619	-	94	98.529	Takifugu_rubripes
ENSAPLG00000011046	-	95	94.231	ENSTRUG00000021614	-	95	94.231	Takifugu_rubripes
ENSAPLG00000011046	-	94	98.529	ENSTNIG00000013182	-	94	98.529	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPLG00000011046	-	95	93.750	ENSTNIG00000013184	-	95	93.750	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPLG00000011046	-	93	96.059	ENSTNIG00000002003	-	100	96.059	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPLG00000011046	-	94	97.087	ENSTNIG00000011081	rab11bb	94	97.087	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPLG00000011046	-	94	98.537	ENSUAMG00000006639	-	99	98.537	Ursus_americanus
ENSAPLG00000011046	-	94	99.512	ENSXETG00000025484	rab11b.1	93	99.512	Xenopus_tropicalis
ENSAPLG00000011046	-	94	98.058	ENSXCOG00000008042	-	94	98.058	Xiphophorus_couchianus
ENSAPLG00000011046	-	94	98.544	ENSXCOG00000009190	-	94	98.544	Xiphophorus_couchianus
ENSAPLG00000011046	-	94	98.058	ENSXMAG00000011926	rab11bb	94	98.058	Xiphophorus_maculatus
ENSAPLG00000011046	-	94	98.058	ENSXMAG00000024840	-	94	98.058	Xiphophorus_maculatus