EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000011147 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: EFL1
Alias: -
Full Name: elongation factor like GTPase 1
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 72141 bases
Position: chrKB744113.1:1107914-1180054
Accession: 101805415
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000010913	GTP_EFTU	PF00009.27	7.6e-52	1	1
ENSAPLP00000010913	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.3e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000011632	EFL1-201	3725	XM_005027171	ENSAPLP00000010913	1118 (aa)	-	U3IUJ0

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000011147's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
apla03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000011147's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAPLG00000011147	EFL1	90	35.068	ENSAPLG00000010503	EEF2	97	35.068

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	77.877	ENSG00000140598	EFL1	99	77.877	Homo_sapiens
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	70.344	ENSAPOG00000000188	efl1	99	70.344	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	77.357	ENSAMEG00000006031	EFL1	99	77.357	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	71.099	ENSACIG00000017802	efl1	99	71.277	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	70.027	ENSAOCG00000023933	efl1	99	70.292	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	70.697	ENSAPEG00000000262	efl1	99	70.697	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	70.599	ENSATEG00000012373	efl1	99	70.599	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	76.558	ENSACAG00000011040	EFL1	100	76.558	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	78.164	ENSANAG00000027459	EFL1	99	78.164	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	70.962	ENSACLG00000025780	efl1	99	71.150	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	71.878	ENSAMXG00000019529	efl1	100	72.694	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	76.991	ENSBTAG00000003410	EFL1	99	76.991	Bos_taurus
ENSAPLG00000011147	EFL1	93	35.437	WBGene00010732	K10C3.5	91	56.757	Caenorhabditis_elegans
ENSAPLG00000011147	EFL1	85	97.619	ENSCJAG00000015607	-	93	97.619	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	77.059	ENSCAFG00000013671	EFL1	99	77.059	Canis_familiaris
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	76.903	ENSCHIG00000001883	EFL1	99	76.903	Capra_hircus
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	78.055	ENSTSYG00000000348	EFL1	99	78.055	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	64.078	ENSCAPG00000017944	EFL1	99	64.078	Cavia_aperea
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	76.325	ENSCPOG00000001924	EFL1	99	76.413	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	78.164	ENSCCAG00000034450	EFL1	99	78.164	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	77.163	ENSCATG00000031678	-	99	77.163	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	76.794	ENSCLAG00000010155	EFL1	99	76.794	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	77.609	ENSCSAG00000015165	EFL1	99	77.609	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000011147	EFL1	72	78.318	ENSCHOG00000014029	EFL1	78	78.318	Choloepus_hoffmanni
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	84.947	ENSCPBG00000017638	EFL1	99	84.575	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	56.991	ENSCSAVG00000001787	-	99	60.739	Ciona_savignyi
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	77.520	ENSCANG00000038093	EFL1	99	77.520	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	72.453	ENSCGRG00001010826	Efl1	99	72.453	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	75.731	ENSCGRG00000003273	Efl1	99	75.731	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	67.940	ENSCSEG00000005856	efl1	98	68.206	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000011147	EFL1	93	69.619	ENSCVAG00000011863	efl1	95	69.619	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	73.375	ENSDARG00000079672	efl1	98	73.689	Danio_rerio
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	77.502	ENSDNOG00000006097	EFL1	99	77.502	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	75.221	ENSDORG00000000719	Efl1	99	75.221	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000011147	EFL1	98	45.766	FBgn0053158	CG33158	97	46.000	Drosophila_melanogaster
ENSAPLG00000011147	EFL1	92	70.431	ENSETEG00000004309	EFL1	99	70.431	Echinops_telfairi
ENSAPLG00000011147	EFL1	82	66.114	ENSEBUG00000010738	efl1	99	66.114	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	77.451	ENSEASG00005007108	EFL1	99	77.451	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000011147	EFL1	95	78.358	ENSECAG00000016354	EFL1	99	78.358	Equus_caballus
ENSAPLG00000011147	EFL1	68	80.747	ENSEEUG00000006326	EFL1	79	80.747	Erinaceus_europaeus
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	65.544	ENSELUG00000002520	efl1	96	72.569	Esox_lucius
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	77.252	ENSFCAG00000007741	EFL1	99	77.252	Felis_catus
ENSAPLG00000011147	EFL1	100	89.123	ENSFALG00000011103	EFL1	100	89.123	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	75.752	ENSFDAG00000009023	EFL1	99	75.752	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	68.617	ENSFHEG00000017795	efl1	99	68.617	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	65.686	ENSGMOG00000005041	efl1	100	65.686	Gadus_morhua
ENSAPLG00000011147	EFL1	100	89.308	ENSGALG00000006225	EFL1	100	89.308	Gallus_gallus
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	68.113	ENSGACG00000012495	efl1	100	67.279	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000011147	EFL1	100	84.427	ENSGAGG00000022841	EFL1	100	84.427	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000011147	EFL1	97	73.766	ENSGGOG00000005017	EFL1	100	73.766	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	70.837	ENSHBUG00000022667	efl1	99	70.925	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	73.451	ENSHGLG00000011798	EFL1	99	73.451	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	76.637	ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	76.637	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	70.432	ENSHCOG00000007325	efl1	99	70.432	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	70.599	ENSIPUG00000023360	EFTUD1	99	70.599	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	73.959	ENSSTOG00000022945	EFL1	99	73.959	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	76.346	ENSJJAG00000018598	Efl1	99	76.346	Jaculus_jaculus
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	69.965	ENSLBEG00000015269	efl1	99	69.965	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	75.548	ENSLACG00000016121	EFL1	99	75.548	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	73.778	ENSLOCG00000012862	efl1	98	73.778	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	75.623	ENSLAFG00000012504	EFL1	99	75.623	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	77.520	ENSMFAG00000032657	-	99	77.520	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	75.238	ENSMMUG00000023353	EFL1	99	76.751	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	77.431	ENSMNEG00000041671	-	99	76.657	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	77.342	ENSMLEG00000033735	EFL1	99	77.342	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	71.278	ENSMAMG00000011336	efl1	99	71.278	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	70.811	ENSMZEG00005003012	efl1	99	70.988	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000011147	EFL1	100	90.265	ENSMGAG00000007991	EFL1	100	90.265	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	75.355	ENSMAUG00000010709	Efl1	99	75.355	Mesocricetus_auratus
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	77.059	ENSMICG00000027853	EFL1	99	77.059	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	75.688	ENSMOCG00000007470	Efl1	99	75.688	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000011147	EFL1	93	68.685	ENSMMOG00000015370	efl1	98	68.685	Mola_mola
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	78.584	ENSMODG00000019386	EFL1	99	78.584	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	69.851	ENSMALG00000018810	efl1	99	69.851	Monopterus_albus
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	75.465	MGP_CAROLIEiJ_G0029936	Efl1	98	79.668	Mus_caroli
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	75.554	ENSMUSG00000038563	Efl1	98	79.654	Mus_musculus
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	75.133	MGP_PahariEiJ_G0013157	Efl1	98	79.221	Mus_pahari
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	78.657	MGP_SPRETEiJ_G0031038	Efl1	99	78.657	Mus_spretus
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	75.066	ENSMPUG00000015494	EFL1	99	75.066	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	76.507	ENSNGAG00000017740	Efl1	99	76.507	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000011147	EFL1	93	78.215	ENSNLEG00000010679	EFL1	100	78.215	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000011147	EFL1	61	70.968	ENSMEUG00000012049	-	68	70.968	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000011147	EFL1	55	93.182	ENSOPRG00000012488	-	56	93.182	Ochotona_princeps
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	75.819	ENSODEG00000016193	EFL1	99	75.819	Octodon_degus
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	70.106	ENSONIG00000003394	efl1	99	70.485	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	77.067	ENSOCUG00000012163	EFL1	99	77.067	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000011147	EFL1	63	65.352	ENSORLG00000020390	efl1	100	65.678	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000011147	EFL1	95	77.350	ENSORLG00015012031	efl1	98	77.350	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	69.313	ENSOMEG00000022784	efl1	99	69.313	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	76.746	ENSOARG00000014452	EFL1	99	76.746	Ovis_aries
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	72.881	ENSPPAG00000039672	EFL1	99	72.881	Pan_paniscus
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	77.788	ENSPPRG00000002193	EFL1	99	77.916	Panthera_pardus
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	77.609	ENSPTIG00000007053	EFL1	99	77.738	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	78.075	ENSPTRG00000007374	EFL1	99	78.075	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	77.431	ENSPANG00000015635	-	99	76.657	Papio_anubis
ENSAPLG00000011147	EFL1	100	70.062	ENSPKIG00000018456	efl1	99	70.062	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000011147	EFL1	97	85.405	ENSPSIG00000007790	EFL1	97	85.405	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000011147	EFL1	93	63.001	ENSPMAG00000002026	efl1	100	63.001	Petromyzon_marinus
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	78.546	ENSPCIG00000004372	EFL1	99	78.546	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	69.176	ENSPFOG00000018687	efl1	99	69.176	Poecilia_formosa
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	69.176	ENSPLAG00000001988	efl1	99	69.176	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	69.210	ENSPMEG00000000402	efl1	99	69.210	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	69.823	ENSPREG00000022085	efl1	99	69.823	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	77.877	ENSPPYG00000006724	EFL1	99	77.877	Pongo_abelii
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	77.074	ENSPVAG00000003189	EFL1	99	77.074	Pteropus_vampyrus
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	64.431	ENSPNYG00000019406	efl1	99	64.695	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	73.158	ENSPNAG00000012104	efl1	99	73.158	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	75.798	ENSRNOG00000032723	Efl1	99	75.798	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	77.698	ENSRBIG00000040576	EFL1	99	77.698	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	75.825	ENSRROG00000031475	EFL1	99	75.825	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000011147	EFL1	97	43.863	YNL163C	RIA1	90	43.863	Saccharomyces_cerevisiae
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	77.342	ENSSBOG00000018280	EFL1	99	77.342	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	74.228	ENSSHAG00000018863	EFL1	99	74.228	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	72.664	ENSSFOG00015016244	efl1	99	72.664	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	69.592	ENSSMAG00000016928	efl1	99	70.124	Scophthalmus_maximus
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	70.976	ENSSDUG00000013271	efl1	99	70.976	Seriola_dumerili
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	71.290	ENSSLDG00000014655	efl1	99	71.466	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	83.494	ENSSPUG00000000941	EFL1	99	83.494	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	71.403	ENSSPAG00000011885	efl1	99	71.403	Stegastes_partitus
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	77.414	ENSSSCG00000001792	EFL1	99	77.414	Sus_scrofa
ENSAPLG00000011147	EFL1	100	88.791	ENSTGUG00000007850	EFL1	100	88.791	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	61.736	ENSTNIG00000003399	efl1	99	61.736	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPLG00000011147	EFL1	72	85.802	ENSTBEG00000011804	EFL1	78	85.802	Tupaia_belangeri
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	77.094	ENSTTRG00000011243	EFL1	99	77.094	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	77.004	ENSUAMG00000022106	EFL1	99	77.004	Ursus_americanus
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	77.357	ENSUMAG00000010303	EFL1	99	77.357	Ursus_maritimus
ENSAPLG00000011147	EFL1	94	81.743	ENSVPAG00000005735	EFL1	94	81.743	Vicugna_pacos
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	77.493	ENSVVUG00000004967	EFL1	99	77.493	Vulpes_vulpes
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	76.637	ENSXETG00000015701	EFL1	99	76.637	Xenopus_tropicalis
ENSAPLG00000011147	EFL1	99	69.770	ENSXMAG00000023705	efl1	99	69.770	Xiphophorus_maculatus