EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000011417 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: tudor domain containing 12
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 23710 bases
Position: chrKB743157.1:12166-35875
Accession: 101794133
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000011173	TUDOR	PF00567.24	5.4e-28	1	2
ENSAPLP00000011173	TUDOR	PF00567.24	5.4e-28	2	2
ENSAPLP00000011177	TUDOR	PF00567.24	1.9e-16	1	1
ENSAPLP00000011177	DEAD	PF00270.29	3.3e-07	1	1
ENSAPLP00000011173	DEAD	PF00270.29	4.7e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000011900	-	1509	-	ENSAPLP00000011177	503 (aa)	-	U3IVA4
ENSAPLT00000011896	-	3252	XM_005020264	ENSAPLP00000011173	1084 (aa)	-	U3IVA0

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000011417's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000011417's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000011417	-	97	32.347	ENSAPOG00000006421	tdrd12	90	40.323	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000011417	-	66	59.666	ENSAMEG00000015440	-	88	59.666	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000011417	-	97	34.420	ENSACIG00000021652	tdrd12	88	40.782	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000011417	-	97	30.116	ENSAOCG00000016463	tdrd12	76	40.648	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000011417	-	97	31.548	ENSAPEG00000015105	tdrd12	84	41.826	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000011417	-	97	31.250	ENSATEG00000011608	tdrd12	86	40.708	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000011417	-	66	56.685	ENSACAG00000029615	-	75	56.685	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000011417	-	97	55.556	ENSANAG00000023166	-	92	52.920	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000011417	-	97	38.076	ENSAMXG00000013811	tdrd12	85	46.696	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000011417	-	51	56.383	ENSBTAG00000019266	TDRD12	98	40.270	Bos_taurus
ENSAPLG00000011417	-	97	55.556	ENSCJAG00000000763	-	92	52.737	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000011417	-	97	57.018	ENSCAFG00000007505	TDRD12	82	58.730	Canis_familiaris
ENSAPLG00000011417	-	97	57.018	ENSCAFG00020019790	-	90	52.420	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000011417	-	97	56.579	ENSTSYG00000012034	-	92	52.709	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000011417	-	97	57.018	ENSCPOG00000002876	-	82	59.048	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000011417	-	97	56.838	ENSCCAG00000037592	-	92	50.821	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000011417	-	97	57.456	ENSCATG00000038627	-	92	49.128	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000011417	-	96	58.333	ENSCLAG00000012138	-	84	52.828	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000011417	-	99	56.579	ENSCSAG00000004794	-	92	53.242	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000011417	-	97	61.914	ENSCPBG00000000147	-	92	69.496	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000011417	-	97	56.579	ENSCANG00000040785	-	92	51.598	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000011417	-	92	59.365	ENSCGRG00001021407	-	81	59.365	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000011417	-	91	59.048	ENSCGRG00000007286	-	82	59.048	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000011417	-	84	37.983	ENSCSEG00000001744	-	72	37.983	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000011417	-	60	42.638	ENSCVAG00000004277	tdrd12	87	42.638	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000011417	-	99	38.070	ENSDARG00000075217	tdrd12	80	38.070	Danio_rerio
ENSAPLG00000011417	-	97	57.895	ENSDNOG00000017244	-	83	53.151	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000011417	-	97	46.886	ENSDORG00000012134	-	98	40.979	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000011417	-	57	54.947	ENSETEG00000015088	-	68	54.947	Echinops_telfairi
ENSAPLG00000011417	-	92	61.270	ENSEASG00005021053	-	81	61.270	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000011417	-	91	50.505	ENSEEUG00000008457	-	90	50.505	Erinaceus_europaeus
ENSAPLG00000011417	-	94	34.442	ENSELUG00000017494	tdrd12	76	43.253	Esox_lucius
ENSAPLG00000011417	-	99	57.103	ENSFALG00000000259	-	81	57.103	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000011417	-	92	58.730	ENSFDAG00000014797	-	81	58.730	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000011417	-	78	40.741	ENSFHEG00000002884	-	70	33.990	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000011417	-	97	70.994	ENSGALG00000004704	-	80	81.513	Gallus_gallus
ENSAPLG00000011417	-	79	41.753	ENSGAFG00000003729	tdrd12	63	41.753	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000011417	-	97	63.747	ENSGAGG00000000247	-	92	69.784	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000011417	-	97	57.895	ENSGGOG00000011938	-	92	53.333	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000011417	-	78	42.770	ENSHBUG00000020426	tdrd12	85	42.770	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000011417	-	97	49.254	ENSHGLG00000015608	-	97	40.139	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000011417	-	98	53.082	ENSHGLG00100008227	-	97	53.082	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000011417	-	62	41.875	ENSHCOG00000016160	-	79	41.875	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000011417	-	99	36.563	ENSIPUG00000016825	tdrd12	81	36.563	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000011417	-	92	60.952	ENSSTOG00000013638	-	82	60.952	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000011417	-	64	42.308	ENSKMAG00000008031	tdrd12	81	42.308	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000011417	-	97	33.400	ENSLBEG00000005601	tdrd12	87	39.589	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000011417	-	97	51.598	ENSLACG00000010650	-	98	48.263	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000011417	-	97	39.946	ENSLOCG00000001690	tdrd12	80	39.946	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000011417	-	94	59.649	ENSLAFG00000008698	-	99	53.455	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000011417	-	97	57.456	ENSMFAG00000044756	-	92	53.412	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000011417	-	97	57.456	ENSMMUG00000015608	-	92	53.333	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000011417	-	97	57.456	ENSMNEG00000043067	-	92	53.394	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000011417	-	97	58.333	ENSMLEG00000042036	-	96	58.957	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000011417	-	80	41.460	ENSMAMG00000013867	tdrd12	82	41.460	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000011417	-	80	42.183	ENSMZEG00005024214	tdrd12	86	42.183	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000011417	-	63	77.025	ENSMGAG00000005627	-	99	77.025	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000011417	-	91	60.396	ENSMAUG00000013767	-	81	60.396	Mesocricetus_auratus
ENSAPLG00000011417	-	100	52.055	ENSMICG00000003623	-	94	52.055	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000011417	-	92	59.048	ENSMOCG00000002366	-	98	51.465	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000011417	-	92	33.605	ENSMMOG00000018662	tdrd12	86	39.971	Mola_mola
ENSAPLG00000011417	-	97	58.068	ENSMODG00000012286	-	79	58.068	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000011417	-	85	37.198	ENSMALG00000006918	tdrd12	75	39.394	Monopterus_albus
ENSAPLG00000011417	-	92	60.000	MGP_CAROLIEiJ_G0029587	-	94	56.186	Mus_caroli
ENSAPLG00000011417	-	99	52.941	MGP_PahariEiJ_G0012821	-	94	58.031	Mus_pahari
ENSAPLG00000011417	-	92	60.000	MGP_SPRETEiJ_G0030686	-	94	57.513	Mus_spretus
ENSAPLG00000011417	-	97	55.702	ENSMPUG00000007791	-	83	53.467	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000011417	-	97	59.211	ENSMLUG00000010694	-	98	60.317	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000011417	-	92	58.730	ENSNGAG00000000793	-	81	58.730	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000011417	-	60	42.593	ENSNBRG00000017878	-	91	42.593	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000011417	-	97	56.579	ENSNLEG00000007635	-	91	49.587	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000011417	-	58	77.778	ENSMEUG00000014059	-	57	77.778	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000011417	-	91	58.257	ENSOPRG00000015809	-	80	59.596	Ochotona_princeps
ENSAPLG00000011417	-	92	57.460	ENSODEG00000014443	-	83	57.460	Octodon_degus
ENSAPLG00000011417	-	97	32.207	ENSONIG00000010630	tdrd12	97	32.207	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000011417	-	97	49.183	ENSOANG00000029442	-	96	49.183	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPLG00000011417	-	93	57.143	ENSOCUG00000016911	-	82	57.143	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000011417	-	78	40.501	ENSORLG00000027859	tdrd12	71	40.501	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000011417	-	87	37.379	ENSORLG00015020835	tdrd12	64	39.572	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000011417	-	97	33.871	ENSOMEG00000021862	tdrd12	87	38.835	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000011417	-	97	56.579	ENSOGAG00000001571	-	98	52.516	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000011417	-	97	56.410	ENSOARG00000004254	-	83	52.632	Ovis_aries
ENSAPLG00000011417	-	96	59.292	ENSPPAG00000042284	-	92	51.369	Pan_paniscus
ENSAPLG00000011417	-	99	52.091	ENSPPRG00000002389	-	94	52.091	Panthera_pardus
ENSAPLG00000011417	-	97	57.895	ENSPTRG00000010795	TDRD12	92	51.273	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000011417	-	97	57.018	ENSPANG00000001203	-	92	53.516	Papio_anubis
ENSAPLG00000011417	-	99	36.435	ENSPKIG00000006407	tdrd12	80	36.435	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000011417	-	97	54.049	ENSPSIG00000012970	-	100	58.621	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000011417	-	97	32.383	ENSPMGG00000022691	tdrd12	89	41.003	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPLG00000011417	-	99	52.704	ENSPEMG00000009233	-	95	52.704	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000011417	-	99	56.841	ENSPCIG00000020993	-	82	56.841	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000011417	-	97	35.638	ENSPFOG00000008184	tdrd12	79	35.638	Poecilia_formosa
ENSAPLG00000011417	-	97	32.794	ENSPMEG00000006420	tdrd12	81	41.403	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000011417	-	73	41.964	ENSPREG00000004916	tdrd12	71	41.964	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000011417	-	97	57.895	ENSPPYG00000009821	-	90	53.059	Pongo_abelii
ENSAPLG00000011417	-	69	52.673	ENSPCAG00000013510	-	68	52.673	Procavia_capensis
ENSAPLG00000011417	-	97	57.018	ENSPCOG00000023600	-	93	50.183	Propithecus_coquereli
ENSAPLG00000011417	-	82	61.749	ENSPVAG00000014599	-	82	59.375	Pteropus_vampyrus
ENSAPLG00000011417	-	78	42.770	ENSPNYG00000022866	tdrd12	83	42.770	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000011417	-	79	44.428	ENSPNAG00000003413	tdrd12	82	44.428	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000011417	-	95	58.904	ENSRNOG00000012719	Tdrd12	83	52.877	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000011417	-	92	57.456	ENSRBIG00000019899	-	90	51.685	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000011417	-	97	57.456	ENSRROG00000036351	-	92	53.503	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000011417	-	97	55.983	ENSSBOG00000034916	-	92	53.145	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000011417	-	94	64.035	ENSSHAG00000002599	-	98	57.066	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000011417	-	82	41.096	ENSSFOG00015000297	tdrd12	79	43.472	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000011417	-	97	31.179	ENSSMAG00000002870	tdrd12	87	39.724	Scophthalmus_maximus
ENSAPLG00000011417	-	93	31.612	ENSSDUG00000017304	tdrd12	86	42.183	Seriola_dumerili
ENSAPLG00000011417	-	94	30.533	ENSSLDG00000004415	tdrd12	85	41.298	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPLG00000011417	-	99	48.349	ENSSARG00000005357	-	99	48.387	Sorex_araneus
ENSAPLG00000011417	-	88	61.838	ENSSPUG00000013174	-	90	61.838	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000011417	-	93	32.334	ENSSPAG00000005706	tdrd12	79	38.735	Stegastes_partitus
ENSAPLG00000011417	-	85	52.581	ENSSSCG00000002857	-	91	52.581	Sus_scrofa
ENSAPLG00000011417	-	60	65.250	ENSTGUG00000009121	-	100	67.442	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000011417	-	94	30.105	ENSTRUG00000021888	tdrd12	87	35.052	Takifugu_rubripes
ENSAPLG00000011417	-	66	42.537	ENSTNIG00000000465	-	98	30.952	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPLG00000011417	-	75	64.085	ENSTBEG00000007609	-	74	64.085	Tupaia_belangeri
ENSAPLG00000011417	-	96	56.444	ENSTTRG00000012206	-	98	51.426	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000011417	-	97	54.825	ENSUAMG00000007298	-	91	52.390	Ursus_americanus
ENSAPLG00000011417	-	97	54.825	ENSUMAG00000014314	-	91	52.390	Ursus_maritimus
ENSAPLG00000011417	-	96	60.914	ENSVPAG00000012051	-	93	55.108	Vicugna_pacos
ENSAPLG00000011417	-	97	55.702	ENSVVUG00000016637	-	86	52.752	Vulpes_vulpes
ENSAPLG00000011417	-	59	43.516	ENSXETG00000031945	-	74	43.516	Xenopus_tropicalis
ENSAPLG00000011417	-	97	32.665	ENSXMAG00000020908	tdrd12	86	42.074	Xiphophorus_maculatus