EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000012113 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ESF1
Alias: -
Full Name: ESF1 nucleolar pre-rRNA processing protein homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 29203 bases
Position: chrKB743111.1:1247397-1276599
Accession: 101803375
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000011907	NUC153	PF08159.12	2e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000012639	ESF1-201	2493	XM_005019803	ENSAPLP00000011907	830 (aa)	XP_005019860	U3IXD1

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000012113's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000012113's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000012113	ESF1	100	59.725	ENSG00000089048	ESF1	80	77.322	Homo_sapiens
ENSAPLG00000012113	ESF1	60	54.943	ENSAPOG00000003004	esf1	99	55.916	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000012113	ESF1	70	70.164	ENSAMEG00000008830	ESF1	65	74.686	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000012113	ESF1	77	69.333	ENSACIG00000018305	esf1	99	62.172	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000012113	ESF1	76	64.935	ENSAOCG00000006033	esf1	99	60.118	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000012113	ESF1	76	64.935	ENSAPEG00000022385	esf1	90	60.000	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000012113	ESF1	77	68.919	ENSATEG00000016321	esf1	87	63.953	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000012113	ESF1	100	62.093	ENSACAG00000000963	ESF1	100	61.350	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000012113	ESF1	100	60.920	ENSANAG00000036778	ESF1	65	74.595	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000012113	ESF1	78	67.532	ENSACLG00000002972	esf1	89	66.250	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000012113	ESF1	76	60.601	ENSAMXG00000001172	esf1	91	61.484	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000012113	ESF1	66	74.460	ENSBTAG00000007130	ESF1	65	74.460	Bos_taurus
ENSAPLG00000012113	ESF1	100	60.438	ENSCJAG00000004640	ESF1	100	61.156	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000012113	ESF1	66	73.921	ENSCAFG00000005587	ESF1	65	73.968	Canis_familiaris
ENSAPLG00000012113	ESF1	66	73.921	ENSCAFG00020027530	ESF1	65	73.968	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000012113	ESF1	69	71.501	ENSCHIG00000021188	ESF1	100	61.085	Capra_hircus
ENSAPLG00000012113	ESF1	100	60.885	ENSTSYG00000009956	ESF1	100	61.871	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000012113	ESF1	75	70.833	ENSCAPG00000010466	-	80	65.934	Cavia_aperea
ENSAPLG00000012113	ESF1	75	70.833	ENSCAPG00000010333	-	92	65.946	Cavia_aperea
ENSAPLG00000012113	ESF1	100	59.815	ENSCPOG00000014027	-	67	73.694	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000012113	ESF1	100	60.784	ENSCCAG00000024521	ESF1	65	74.595	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000012113	ESF1	66	73.105	ENSCATG00000042792	ESF1	65	74.775	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000012113	ESF1	66	73.827	ENSCLAG00000013266	-	66	73.694	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000012113	ESF1	66	74.188	ENSCSAG00000011777	ESF1	65	74.955	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000012113	ESF1	71	42.424	ENSCING00000020446	-	88	55.224	Ciona_intestinalis
ENSAPLG00000012113	ESF1	74	59.091	ENSCSAVG00000009015	-	88	59.091	Ciona_savignyi
ENSAPLG00000012113	ESF1	66	74.234	ENSCANG00000030674	ESF1	65	74.955	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000012113	ESF1	66	73.333	ENSCGRG00001018257	Esf1	100	60.211	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000012113	ESF1	74	66.154	ENSCSEG00000001159	esf1	86	67.647	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000012113	ESF1	78	62.803	ENSCVAG00000007894	esf1	92	64.103	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000012113	ESF1	75	68.919	ENSDARG00000008740	esf1	87	67.059	Danio_rerio
ENSAPLG00000012113	ESF1	66	74.054	ENSDNOG00000019409	ESF1	100	59.930	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000012113	ESF1	100	61.170	ENSDORG00000016313	Esf1	100	60.588	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000012113	ESF1	81	50.617	FBgn0024364	CG11417	87	50.617	Drosophila_melanogaster
ENSAPLG00000012113	ESF1	65	70.833	ENSETEG00000004471	ESF1	65	68.085	Echinops_telfairi
ENSAPLG00000012113	ESF1	66	50.086	ENSEBUG00000015161	esf1	99	43.569	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000012113	ESF1	100	59.789	ENSEASG00005001777	ESF1	100	60.023	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000012113	ESF1	100	59.859	ENSECAG00000019188	ESF1	100	59.906	Equus_caballus
ENSAPLG00000012113	ESF1	66	49.730	ENSEEUG00000015837	-	78	55.556	Erinaceus_europaeus
ENSAPLG00000012113	ESF1	66	74.506	ENSFCAG00000000919	ESF1	100	60.395	Felis_catus
ENSAPLG00000012113	ESF1	99	77.619	ENSFALG00000010914	ESF1	99	77.106	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000012113	ESF1	100	61.203	ENSFDAG00000014777	ESF1	67	72.875	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000012113	ESF1	60	59.881	ENSFHEG00000014984	esf1	99	60.870	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000012113	ESF1	100	81.893	ENSGALG00000034768	ESF1	100	81.420	Gallus_gallus
ENSAPLG00000012113	ESF1	76	63.514	ENSGAFG00000000540	esf1	92	58.621	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000012113	ESF1	100	59.153	ENSGGOG00000006692	ESF1	65	74.414	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000012113	ESF1	80	68.831	ENSHBUG00000001890	esf1	89	67.500	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000012113	ESF1	100	61.091	ENSHGLG00000011505	ESF1	100	60.165	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000012113	ESF1	100	61.091	ENSHGLG00100015045	ESF1	100	60.165	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000012113	ESF1	76	66.667	ENSIPUG00000006507	esf1	87	61.364	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000012113	ESF1	100	59.977	ENSSTOG00000009846	ESF1	100	60.331	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000012113	ESF1	100	60.990	ENSJJAG00000012570	Esf1	66	73.874	Jaculus_jaculus
ENSAPLG00000012113	ESF1	66	67.019	ENSLACG00000016439	ESF1	66	67.077	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000012113	ESF1	100	54.545	ENSLAFG00000005479	ESF1	100	60.329	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000012113	ESF1	66	73.466	ENSMFAG00000036841	ESF1	65	75.135	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000012113	ESF1	66	73.466	ENSMNEG00000044042	ESF1	65	75.135	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000012113	ESF1	66	73.466	ENSMLEG00000037121	ESF1	65	75.135	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000012113	ESF1	76	72.973	ENSMAMG00000018648	esf1	90	68.966	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000012113	ESF1	60	60.956	ENSMZEG00005013912	esf1	99	59.055	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000012113	ESF1	100	81.235	ENSMGAG00000004291	ESF1	100	80.737	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000012113	ESF1	100	59.719	ENSMAUG00000015975	Esf1	100	59.860	Mesocricetus_auratus
ENSAPLG00000012113	ESF1	66	75.812	ENSMICG00000010711	ESF1	65	75.812	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000012113	ESF1	100	58.422	ENSMOCG00000005902	Esf1	100	59.312	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000012113	ESF1	60	61.272	ENSMMOG00000018693	esf1	99	61.657	Mola_mola
ENSAPLG00000012113	ESF1	100	61.575	ENSMODG00000005066	ESF1	100	61.667	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000012113	ESF1	69	71.622	ENSMALG00000007338	esf1	80	67.442	Monopterus_albus
ENSAPLG00000012113	ESF1	100	60.727	MGP_CAROLIEiJ_G0024365	Esf1	100	61.170	Mus_caroli
ENSAPLG00000012113	ESF1	100	59.629	ENSMUSG00000045624	Esf1	100	60.839	Mus_musculus
ENSAPLG00000012113	ESF1	100	60.819	MGP_PahariEiJ_G0025810	Esf1	100	60.936	Mus_pahari
ENSAPLG00000012113	ESF1	92	70.748	MGP_SPRETEiJ_G0025285	Esf1	100	61.502	Mus_spretus
ENSAPLG00000012113	ESF1	66	75.000	ENSMPUG00000001450	ESF1	100	60.297	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000012113	ESF1	100	60.855	ENSMLUG00000013080	ESF1	66	73.968	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000012113	ESF1	100	56.453	ENSNLEG00000014563	ESF1	64	71.661	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000012113	ESF1	61	68.110	ENSOPRG00000004862	ESF1	100	68.110	Ochotona_princeps
ENSAPLG00000012113	ESF1	100	61.657	ENSODEG00000006824	ESF1	68	74.281	Octodon_degus
ENSAPLG00000012113	ESF1	79	68.831	ENSONIG00000006804	esf1	89	61.538	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000012113	ESF1	66	74.327	ENSOANG00000008432	-	100	63.015	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPLG00000012113	ESF1	100	60.950	ENSOCUG00000005414	ESF1	100	59.450	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000012113	ESF1	59	57.088	ENSORLG00000018625	esf1	99	55.364	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000012113	ESF1	76	67.949	ENSORLG00015022826	esf1	92	67.500	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000012113	ESF1	59	56.214	ENSOMEG00000009311	esf1	99	55.344	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000012113	ESF1	100	61.039	ENSOGAG00000016912	ESF1	100	61.039	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000012113	ESF1	66	74.460	ENSOARG00000011158	ESF1	63	74.460	Ovis_aries
ENSAPLG00000012113	ESF1	100	58.305	ENSPPAG00000024379	ESF1	65	74.775	Pan_paniscus
ENSAPLG00000012113	ESF1	66	74.506	ENSPPRG00000012007	ESF1	65	74.506	Panthera_pardus
ENSAPLG00000012113	ESF1	66	74.686	ENSPTIG00000020063	ESF1	100	60.905	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000012113	ESF1	100	57.223	ENSPTRG00000013258	ESF1	65	74.775	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000012113	ESF1	78	71.429	ENSPMGG00000016911	esf1	83	65.517	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPLG00000012113	ESF1	100	61.196	ENSPCIG00000019331	ESF1	100	61.899	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000012113	ESF1	80	57.143	ENSPFOG00000010101	esf1	90	57.143	Poecilia_formosa
ENSAPLG00000012113	ESF1	60	58.300	ENSPLAG00000006452	esf1	99	56.445	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000012113	ESF1	76	63.514	ENSPMEG00000000713	esf1	89	63.158	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000012113	ESF1	76	63.514	ENSPREG00000004431	esf1	88	59.770	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000012113	ESF1	100	58.014	ENSPPYG00000010715	ESF1	65	74.368	Pongo_abelii
ENSAPLG00000012113	ESF1	100	57.643	ENSPCAG00000006881	ESF1	66	68.525	Procavia_capensis
ENSAPLG00000012113	ESF1	75	75.000	ENSPVAG00000001295	ESF1	75	70.930	Pteropus_vampyrus
ENSAPLG00000012113	ESF1	82	66.234	ENSPNYG00000015735	esf1	89	65.000	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000012113	ESF1	75	62.162	ENSPNAG00000014721	esf1	86	62.069	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000012113	ESF1	66	73.381	ENSRNOG00000004777	Esf1	100	60.347	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000012113	ESF1	66	74.595	ENSRBIG00000035763	ESF1	65	75.360	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000012113	ESF1	66	74.775	ENSRROG00000032022	ESF1	65	75.540	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000012113	ESF1	66	74.414	ENSSBOG00000030387	ESF1	65	74.414	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000012113	ESF1	100	61.922	ENSSHAG00000000449	ESF1	100	60.824	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000012113	ESF1	77	71.622	ENSSDUG00000019460	esf1	94	68.966	Seriola_dumerili
ENSAPLG00000012113	ESF1	100	65.599	ENSSPUG00000012635	ESF1	100	65.238	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000012113	ESF1	77	66.250	ENSSPAG00000019077	esf1	89	65.882	Stegastes_partitus
ENSAPLG00000012113	ESF1	66	74.101	ENSSSCG00000007077	ESF1	65	74.147	Sus_scrofa
ENSAPLG00000012113	ESF1	100	73.140	ENSTGUG00000002450	ESF1	83	87.184	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000012113	ESF1	81	58.803	ENSTRUG00000009445	esf1	89	65.000	Takifugu_rubripes
ENSAPLG00000012113	ESF1	50	75.510	ENSTBEG00000008552	ESF1	67	75.510	Tupaia_belangeri
ENSAPLG00000012113	ESF1	100	58.419	ENSTTRG00000005335	ESF1	100	60.093	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000012113	ESF1	66	74.506	ENSUMAG00000008579	ESF1	100	61.001	Ursus_maritimus
ENSAPLG00000012113	ESF1	58	79.339	ENSVPAG00000005291	ESF1	58	79.424	Vicugna_pacos
ENSAPLG00000012113	ESF1	66	73.741	ENSVVUG00000014318	ESF1	61	73.788	Vulpes_vulpes
ENSAPLG00000012113	ESF1	66	66.961	ENSXETG00000008079	esf1	100	56.140	Xenopus_tropicalis
ENSAPLG00000012113	ESF1	76	64.865	ENSXMAG00000017651	esf1	88	64.474	Xiphophorus_maculatus