EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000012316 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: RPUSD1
Alias: -
Full Name: RNA pseudouridine synthase domain containing 1
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1982 bases
Position: chrKB744307.1:54872-56853
Accession: 14173
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000012083	PseudoU_synth_2	PF00849.22	1.8e-14	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000012816	RPUSD1-201	726	-	ENSAPLP00000012083	242 (aa)	-	U3IXV7

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000012316's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000012316's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	58.300	ENSG00000007376	RPUSD1	100	52.000	Homo_sapiens
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	58.403	ENSAPOG00000022221	rpusd1	77	58.750	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	60.905	ENSAMEG00000007461	RPUSD1	78	60.905	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	57.438	ENSACIG00000015863	rpusd1	77	58.848	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	58.091	ENSAOCG00000021975	rpusd1	75	58.921	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	58.506	ENSAPEG00000001316	rpusd1	75	59.336	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	58.091	ENSATEG00000002984	rpusd1	77	58.848	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	71.008	ENSACAG00000008953	RPUSD1	77	71.008	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	59.919	ENSANAG00000024709	RPUSD1	79	59.919	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	59.259	ENSACLG00000013692	rpusd1	77	59.259	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	59.664	ENSAMXG00000019802	rpusd1	77	59.664	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	100	61.943	ENSBTAG00000000179	RPUSD1	79	62.500	Bos_taurus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	58.704	ENSCJAG00000012253	RPUSD1	79	58.704	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	60.905	ENSCAFG00000019614	RPUSD1	78	60.905	Canis_familiaris
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	60.905	ENSCAFG00020008891	RPUSD1	78	60.905	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	100	61.538	ENSCHIG00000012872	RPUSD1	79	62.097	Capra_hircus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	100	57.661	ENSTSYG00000036934	RPUSD1	78	57.661	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	100	58.065	ENSCAPG00000014219	RPUSD1	78	58.065	Cavia_aperea
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	100	58.065	ENSCPOG00000034604	RPUSD1	78	58.065	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	59.514	ENSCCAG00000034385	RPUSD1	79	59.514	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	58.704	ENSCATG00000042983	RPUSD1	79	58.704	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	100	57.490	ENSCLAG00000013966	RPUSD1	78	58.065	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	58.300	ENSCSAG00000012121	RPUSD1	79	58.300	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	80.672	ENSCPBG00000021101	RPUSD1	78	80.672	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	87	61.111	ENSCANG00000028576	RPUSD1	76	61.111	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	60.905	ENSCGRG00001014253	Rpusd1	78	60.905	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	60.905	ENSCGRG00000017995	Rpusd1	78	60.905	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	57.438	ENSCSEG00000018512	rpusd1	77	57.438	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	59.833	ENSCVAG00000022746	rpusd1	77	59.833	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	62.185	ENSDARG00000060192	rpusd1	77	62.185	Danio_rerio
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	100	59.426	ENSDNOG00000003721	RPUSD1	78	59.671	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	100	57.787	ENSDORG00000026656	Rpusd1	78	59.426	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	46.667	ENSEBUG00000008767	rpusd1	70	46.667	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	58.566	ENSEASG00005018421	RPUSD1	60	59.363	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	54.167	ENSELUG00000014307	rpusd1	69	56.846	Esox_lucius
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	61.317	ENSFCAG00000010359	RPUSD1	78	61.317	Felis_catus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	81.092	ENSFALG00000003211	RPUSD1	78	81.092	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	100	58.065	ENSFDAG00000013398	RPUSD1	78	58.065	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	57.741	ENSFHEG00000004736	rpusd1	77	59.336	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	55.417	ENSGMOG00000010756	rpusd1	77	55.417	Gadus_morhua
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	85.714	ENSGALG00000005315	RPUSD1	78	85.714	Gallus_gallus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	58.333	ENSGAFG00000009886	rpusd1	77	58.333	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	58.091	ENSGACG00000014276	rpusd1	77	58.506	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	78.992	ENSGAGG00000004181	RPUSD1	78	78.992	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	59.514	ENSGGOG00000013997	RPUSD1	98	52.273	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	59.259	ENSHBUG00000023728	rpusd1	77	59.259	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	100	57.787	ENSHGLG00000002595	RPUSD1	78	58.468	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	100	57.787	ENSHGLG00100014303	RPUSD1	78	58.468	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	56.540	ENSHCOG00000002390	rpusd1	77	56.540	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	61.134	ENSIPUG00000001570	rpusd1	78	62.762	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	59.919	ENSSTOG00000004276	RPUSD1	78	59.919	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	58.025	ENSJJAG00000015696	Rpusd1	78	58.537	Jaculus_jaculus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	59.072	ENSKMAG00000017287	rpusd1	77	59.916	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	57.261	ENSLBEG00000022502	rpusd1	77	57.676	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	57.261	ENSLBEG00000013354	RPUSD1	77	57.676	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	71.849	ENSLACG00000008869	RPUSD1	77	71.849	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	62	75.333	ENSLOCG00000005682	rpusd1	68	75.333	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	58.436	ENSLAFG00000002115	RPUSD1	78	58.436	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	58.704	ENSMFAG00000003961	RPUSD1	79	58.704	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	58.704	ENSMMUG00000000842	RPUSD1	79	58.704	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	58.704	ENSMNEG00000042712	RPUSD1	79	58.704	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	58.704	ENSMLEG00000030591	RPUSD1	79	58.704	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	57.895	ENSMAMG00000004735	rpusd1	77	58.678	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	59.259	ENSMZEG00005003214	rpusd1	77	59.259	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	86.555	ENSMGAG00000005447	RPUSD1	79	86.555	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	78	58.639	ENSMAUG00000019998	Rpusd1	71	58.639	Mesocricetus_auratus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	100	59.836	ENSMICG00000017561	RPUSD1	79	59.836	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	100	59.836	ENSMOCG00000014082	Rpusd1	78	60.081	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	53.279	ENSMMOG00000012569	rpusd1	78	56.017	Mola_mola
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	65.560	ENSMODG00000016882	RPUSD1	78	65.560	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	57.025	ENSMALG00000017818	rpusd1	77	57.438	Monopterus_albus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	59.350	MGP_CAROLIEiJ_G0021244	Rpusd1	78	59.756	Mus_caroli
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	59.350	ENSMUSG00000041199	Rpusd1	78	59.756	Mus_musculus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	59.583	MGP_PahariEiJ_G0023562	Rpusd1	77	59.583	Mus_pahari
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	59.350	MGP_SPRETEiJ_G0022155	Rpusd1	78	59.756	Mus_spretus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	60.494	ENSMPUG00000015897	RPUSD1	78	60.494	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	100	60.324	ENSMLUG00000001089	RPUSD1	79	60.324	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	58.436	ENSNGAG00000003595	Rpusd1	78	58.704	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	59.494	ENSNBRG00000006457	rpusd1	77	59.494	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	70	51.705	ENSNLEG00000008424	-	99	51.705	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	65.833	ENSMEUG00000016049	RPUSD1	77	65.833	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	51.852	ENSOPRG00000008340	RPUSD1	78	51.852	Ochotona_princeps
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	59.091	ENSODEG00000016945	RPUSD1	78	59.091	Octodon_degus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	58.264	ENSONIG00000015672	rpusd1	78	58.264	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	60.000	ENSORLG00000013009	rpusd1	77	60.000	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	59.414	ENSORLG00020010382	rpusd1	77	59.414	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	59.583	ENSORLG00015021354	rpusd1	77	59.583	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	58.228	ENSOMEG00000021426	rpusd1	76	58.228	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	100	60.081	ENSOGAG00000003795	RPUSD1	79	60.081	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	100	61.538	ENSOARG00000014254	RPUSD1	79	62.097	Ovis_aries
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	58.704	ENSPPAG00000034797	RPUSD1	94	46.009	Pan_paniscus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	61.317	ENSPPRG00000012389	RPUSD1	78	61.317	Panthera_pardus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	100	60.656	ENSPTIG00000008545	RPUSD1	72	60.656	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	58.704	ENSPTRG00000007565	RPUSD1	94	46.009	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	58.300	ENSPANG00000024401	RPUSD1	79	58.300	Papio_anubis
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	64.286	ENSPKIG00000018890	rpusd1	71	64.286	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	80.672	ENSPSIG00000013945	RPUSD1	78	80.672	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	58.228	ENSPMGG00000014950	rpusd1	77	57.741	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	60.324	ENSPEMG00000000497	Rpusd1	78	61.134	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	80	56.477	ENSPMAG00000001563	rpusd1	77	50.000	Petromyzon_marinus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	68.050	ENSPCIG00000021216	-	73	68.050	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	59.916	ENSPFOG00000007946	rpusd1	77	59.916	Poecilia_formosa
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	59.916	ENSPLAG00000011925	rpusd1	77	59.916	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	59.916	ENSPMEG00000002910	rpusd1	77	59.916	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	59.494	ENSPREG00000019851	rpusd1	77	59.494	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	84	53.398	ENSPCAG00000002258	RPUSD1	66	53.398	Procavia_capensis
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	100	59.677	ENSPCOG00000022582	RPUSD1	79	59.677	Propithecus_coquereli
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	57.085	ENSPVAG00000013104	RPUSD1	78	57.085	Pteropus_vampyrus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	59.259	ENSPNYG00000024076	rpusd1	77	59.259	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	57.983	ENSPNAG00000013806	rpusd1	77	57.983	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	100	59.677	ENSRNOG00000023639	Rpusd1	78	60.081	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	58.704	ENSRBIG00000030238	RPUSD1	79	58.704	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	58.704	ENSRROG00000036663	RPUSD1	79	58.704	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	58.436	ENSSBOG00000033063	RPUSD1	78	58.848	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	67.635	ENSSHAG00000013500	RPUSD1	78	67.635	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	64.583	ENSSFOG00015014394	rpusd1	78	64.583	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	56.098	ENSSMAG00000008045	rpusd1	72	57.676	Scophthalmus_maximus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	81	64.103	ENSSDUG00000001829	rpusd1	75	58.921	Seriola_dumerili
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	81	64.103	ENSSLDG00000020853	rpusd1	75	58.921	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	62	71.053	ENSSARG00000011187	-	90	71.053	Sorex_araneus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	80	72.165	ENSSPUG00000005119	-	99	72.165	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	58.921	ENSSPAG00000012708	rpusd1	77	60.166	Stegastes_partitus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	100	62.903	ENSSSCG00000008000	RPUSD1	72	70.526	Sus_scrofa
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	78	88.889	ENSTGUG00000015375	RPUSD1	74	88.889	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	56.846	ENSTRUG00000003041	rpusd1	77	58.091	Takifugu_rubripes
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	83	61.000	ENSTNIG00000002660	rpusd1	73	61.000	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	100	62.500	ENSTTRG00000010167	RPUSD1	79	62.500	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	61.317	ENSUAMG00000012736	RPUSD1	78	61.066	Ursus_americanus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	61.728	ENSUMAG00000021174	RPUSD1	78	61.728	Ursus_maritimus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	61.382	ENSVVUG00000012357	RPUSD1	78	61.382	Vulpes_vulpes
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	99	65.000	ENSXETG00000007184	rpusd1	77	65.000	Xenopus_tropicalis
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	57.551	ENSXCOG00000017930	rpusd1	77	57.551	Xiphophorus_couchianus
ENSAPLG00000012316	RPUSD1	98	57.551	ENSXMAG00000024084	rpusd1	77	57.551	Xiphophorus_maculatus