EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000012401 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: HTATSF1
Alias: -
Full Name: HIV-1 Tat specific factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 9654 bases
Position: chrKB743532.1:767706-777359
Accession: 101795014
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000012195	RRM_1	PF00076.22	3.7e-16	1	2
ENSAPLP00000012195	RRM_1	PF00076.22	3.7e-16	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000012930	HTATSF1-201	1361	XM_005023807	ENSAPLP00000012195	413 (aa)	XP_005023864	U3IY69

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000012401's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000012401's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	92	68.783	ENSG00000102241	HTATSF1	79	71.196	Homo_sapiens
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	61.538	ENSAPOG00000009823	htatsf1	92	61.538	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	63.121	ENSACIG00000020459	htatsf1	92	63.121	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	60.613	ENSAOCG00000020994	htatsf1	92	61.085	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	61.520	ENSAPEG00000016432	htatsf1	92	61.758	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	87	66.845	ENSATEG00000008903	htatsf1	80	68.056	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	93	70.573	ENSACAG00000009346	HTATSF1	98	70.812	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	62.118	ENSACLG00000008096	htatsf1	92	62.118	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	61.628	ENSAMXG00000008387	htatsf1	92	61.737	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	76	37.273	WBGene00022025	Y65B4A.1	75	37.822	Caenorhabditis_elegans
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	100	82.082	ENSCPBG00000026092	HTATSF1	97	82.294	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	88	51.163	ENSCING00000005914	-	76	51.163	Ciona_intestinalis
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	82	43.597	ENSCSAVG00000000371	-	79	42.779	Ciona_savignyi
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	62.411	ENSCVAG00000014070	htatsf1	90	62.175	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	61.337	ENSDARG00000056649	htatsf1	92	61.520	Danio_rerio
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	86	43.631	FBgn0037081	barc	62	45.533	Drosophila_melanogaster
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	85	55.200	ENSEBUG00000001534	htatsf1	74	56.216	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	59.905	ENSELUG00000005486	htatsf1	68	68.421	Esox_lucius
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	100	92.252	ENSFALG00000003728	HTATSF1	91	92.252	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	63.443	ENSFHEG00000020286	htatsf1	91	63.208	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	77	68.012	ENSGMOG00000016444	htatsf1	90	68.012	Gadus_morhua
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	100	94.673	ENSGALG00000006410	HTATSF1	92	94.673	Gallus_gallus
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	63.095	ENSGAFG00000003041	htatsf1	90	62.233	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	62.500	ENSGACG00000020459	htatsf1	91	62.500	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	62.500	ENSHBUG00000004392	htatsf1	92	62.500	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	59.330	ENSHCOG00000009056	htatsf1	92	60.664	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	84	68.391	ENSIPUG00000017828	htatsf1	92	60.514	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	62.619	ENSKMAG00000007622	htatsf1	92	62.381	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	63.007	ENSLBEG00000001154	htatsf1	92	63.007	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	67.718	ENSLACG00000015989	HTATSF1	90	67.233	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	98	44.316	ENSLOCG00000015118	htatsf1	91	42.792	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	61.792	ENSMAMG00000021225	htatsf1	92	60.900	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	62.118	ENSMZEG00005000485	htatsf1	92	62.118	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	100	94.915	ENSMGAG00000003558	HTATSF1	96	94.915	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	60.377	ENSMMOG00000011013	htatsf1	91	60.613	Mola_mola
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	71.186	ENSMODG00000014087	-	88	71.186	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	51	77.033	ENSMODG00000000199	-	75	76.042	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	61.647	ENSMALG00000019977	htatsf1	92	61.190	Monopterus_albus
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	62.736	ENSNBRG00000003818	htatsf1	92	62.824	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	87	76.602	ENSMEUG00000004133	-	81	77.746	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	63.208	ENSONIG00000008638	htatsf1	92	63.208	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	77.561	ENSOANG00000011674	-	99	77.561	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	62.708	ENSORLG00000002356	htatsf1	92	62.708	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	62.500	ENSORLG00020017818	htatsf1	89	63.333	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	62.559	ENSORLG00015002268	htatsf1	92	61.848	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	63.744	ENSOMEG00000007564	htatsf1	92	63.981	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	63.017	ENSPKIG00000024852	htatsf1	91	63.017	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	85	84.527	ENSPSIG00000010192	HTATSF1	98	84.527	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	63.294	ENSPMGG00000006172	htatsf1	92	63.059	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	67.322	ENSPCIG00000018896	-	89	67.322	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	91	74.599	ENSPCIG00000030173	-	84	74.599	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	63.571	ENSPFOG00000007871	htatsf1	88	62.619	Poecilia_formosa
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	62.143	ENSPLAG00000007532	htatsf1	91	62.233	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	64.286	ENSPMEG00000000352	htatsf1	91	63.095	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	64.286	ENSPREG00000007811	htatsf1	91	63.183	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	62.118	ENSPNYG00000016693	htatsf1	92	62.118	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	61.557	ENSPNAG00000006166	htatsf1	91	62.774	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	55	32.099	YNL286W	-	80	31.799	Saccharomyces_cerevisiae
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	72.059	ENSSHAG00000018908	-	88	72.059	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	85	76.504	ENSSHAG00000006440	-	88	77.035	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	59.535	ENSSFOG00015012002	htatsf1	92	59.535	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	62.619	ENSSMAG00000002970	htatsf1	92	62.619	Scophthalmus_maximus
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	58.095	ENSSDUG00000020002	htatsf1	91	57.143	Seriola_dumerili
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	62.381	ENSSLDG00000016880	htatsf1	92	62.381	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	90	66.486	ENSSARG00000005193	HTATSF1	50	66.486	Sorex_araneus
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	100	76.271	ENSSPUG00000014767	HTATSF1	91	76.271	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	60.952	ENSSPAG00000000732	htatsf1	92	60.952	Stegastes_partitus
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	63.830	ENSSSCG00000023062	HTATSF1	60	63.934	Sus_scrofa
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	100	92.494	ENSTGUG00000002099	HTATSF1	92	92.494	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	62.945	ENSTRUG00000013383	htatsf1	91	63.095	Takifugu_rubripes
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	63.033	ENSTNIG00000016140	htatsf1	90	62.911	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	77	73.354	ENSTTRG00000002269	HTATSF1	52	73.651	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	65.865	ENSXETG00000019749	htatsf1	78	65.542	Xenopus_tropicalis
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	59.685	ENSXCOG00000006912	htatsf1	92	58.202	Xiphophorus_couchianus
ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	65.534	ENSXMAG00000000490	htatsf1	91	63.923	Xiphophorus_maculatus