EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000012686 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: exosome complex exonuclease RRP44
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 11872 bases
Position: chrKB743006.1:2503-14374
Accession: 101790143
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000012470	RNB	PF00773.19	1.7e-103	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000013211	-	1819	XM_005018574	ENSAPLP00000012470	470 (aa)	XP_021127352	U3IYZ4

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000012686's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
apla03018	RNA degradation	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000012686's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAPLG00000012686	-	99	38.031	ENSAPLG00000015294	DIS3L	50	38.031

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000012686	-	100	87.234	ENSG00000083520	DIS3	59	87.234	Homo_sapiens
ENSAPLG00000012686	-	88	37.327	ENSG00000144535	DIS3L2	93	40.845	Homo_sapiens
ENSAPLG00000012686	-	100	38.654	ENSG00000166938	DIS3L	53	38.654	Homo_sapiens
ENSAPLG00000012686	-	88	37.241	ENSAPOG00000020342	dis3l2	53	36.866	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000012686	-	100	38.004	ENSAMEG00000003166	DIS3L	51	38.004	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000012686	-	98	35.497	ENSACIG00000008363	dis3l2	66	35.497	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000012686	-	85	39.078	ENSAOCG00000023503	dis3l	89	39.078	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000012686	-	99	36.417	ENSACAG00000004194	-	55	36.863	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000012686	-	99	34.221	ENSACAG00000011987	DIS3L2	78	34.221	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000012686	-	88	36.636	ENSANAG00000020336	DIS3L2	52	36.636	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000012686	-	100	86.809	ENSANAG00000025580	DIS3	51	86.809	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000012686	-	100	38.654	ENSANAG00000024523	DIS3L	50	38.654	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000012686	-	79	66.310	ENSAMXG00000042551	-	88	66.310	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000012686	-	96	82.262	ENSAMXG00000000563	dis3	50	82.262	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000012686	-	92	34.056	WBGene00018612	disl-2	53	34.056	Caenorhabditis_elegans
ENSAPLG00000012686	-	100	87.447	ENSCJAG00000021117	DIS3	75	87.447	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000012686	-	100	38.580	ENSCAFG00000017271	DIS3L	50	38.580	Canis_familiaris
ENSAPLG00000012686	-	100	88.298	ENSCAFG00020025806	DIS3	75	88.298	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000012686	-	100	87.872	ENSTSYG00000007441	DIS3	51	87.872	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000012686	-	85	37.793	ENSTSYG00000011825	DIS3L2	77	37.793	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000012686	-	98	33.737	ENSCAPG00000000495	DIS3L2	58	33.737	Cavia_aperea
ENSAPLG00000012686	-	99	84.648	ENSCAPG00000005630	DIS3	56	84.648	Cavia_aperea
ENSAPLG00000012686	-	97	38.812	ENSCAPG00000016431	DIS3L	50	38.846	Cavia_aperea
ENSAPLG00000012686	-	98	35.830	ENSCPOG00000005205	DIS3L2	56	35.830	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000012686	-	99	87.846	ENSCPOG00000007178	DIS3	50	82.731	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000012686	-	100	87.447	ENSCCAG00000029240	DIS3	74	87.447	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000012686	-	100	87.234	ENSCATG00000037705	DIS3	59	87.234	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000012686	-	98	34.483	ENSCLAG00000010200	DIS3L2	55	34.483	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000012686	-	99	38.491	ENSCLAG00000005741	DIS3L	51	38.491	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000012686	-	100	38.846	ENSCSAG00000013140	DIS3L	53	38.846	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000012686	-	99	86.567	ENSCHOG00000008758	DIS3	53	86.567	Choloepus_hoffmanni
ENSAPLG00000012686	-	98	35.294	ENSCPBG00000016428	DIS3L2	57	35.294	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000012686	-	100	63.808	ENSCING00000024053	-	52	63.808	Ciona_intestinalis
ENSAPLG00000012686	-	87	37.978	ENSCING00000003927	-	60	37.978	Ciona_intestinalis
ENSAPLG00000012686	-	72	32.520	ENSCSAVG00000006664	-	80	33.787	Ciona_savignyi
ENSAPLG00000012686	-	100	87.234	ENSCANG00000010365	DIS3	51	87.234	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000012686	-	100	38.654	ENSCANG00000041576	DIS3L	50	38.654	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000012686	-	99	88.699	ENSCGRG00000012184	Dis3	53	88.699	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000012686	-	99	82.942	ENSCVAG00000019095	dis3	53	82.942	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000012686	-	87	36.682	ENSDNOG00000018938	DIS3L2	57	36.682	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000012686	-	100	38.846	ENSDORG00000014909	Dis3l	54	38.846	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000012686	-	99	88.273	ENSETEG00000016363	DIS3	57	88.273	Echinops_telfairi
ENSAPLG00000012686	-	88	36.842	ENSEBUG00000008467	-	50	36.842	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000012686	-	100	70.851	ENSEBUG00000010372	dis3	95	71.065	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000012686	-	96	35.503	ENSEBUG00000016190	dis3l	50	35.503	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000012686	-	100	39.615	ENSEASG00005006407	DIS3L	50	39.615	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000012686	-	100	38.846	ENSFCAG00000029869	DIS3L	50	38.846	Felis_catus
ENSAPLG00000012686	-	100	88.298	ENSFCAG00000028493	DIS3	51	88.298	Felis_catus
ENSAPLG00000012686	-	100	94.468	ENSFALG00000001001	DIS3	52	94.468	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000012686	-	88	37.413	ENSFALG00000007642	DIS3L2	50	37.413	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000012686	-	99	88.486	ENSFDAG00000016444	DIS3	52	88.486	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000012686	-	100	38.462	ENSFDAG00000008259	DIS3L	51	38.462	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000012686	-	88	35.484	ENSGMOG00000006607	dis3l2	59	35.484	Gadus_morhua
ENSAPLG00000012686	-	100	94.681	ENSGALG00000016930	DIS3	53	94.681	Gallus_gallus
ENSAPLG00000012686	-	88	36.952	ENSGALG00000007767	DIS3L2	50	36.952	Gallus_gallus
ENSAPLG00000012686	-	99	82.942	ENSGAFG00000012015	dis3	50	82.942	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000012686	-	88	35.797	ENSGAFG00000011865	dis3l2	53	35.797	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000012686	-	99	79.957	ENSGACG00000009812	dis3	59	79.957	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000012686	-	88	36.552	ENSGACG00000016435	dis3l2	53	36.552	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000012686	-	98	38.716	ENSGAGG00000004493	DIS3L	52	38.716	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000012686	-	98	35.020	ENSGAGG00000009026	DIS3L2	57	35.020	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000012686	-	100	87.705	ENSGAGG00000000602	DIS3	50	87.705	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000012686	-	100	87.234	ENSGGOG00000006630	DIS3	51	87.234	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000012686	-	100	38.654	ENSGGOG00000001549	DIS3L	50	38.654	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000012686	-	100	37.885	ENSHGLG00100011280	DIS3L	51	37.885	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000012686	-	88	37.558	ENSHCOG00000002371	dis3l2	61	37.558	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000012686	-	100	38.654	ENSSTOG00000009158	DIS3L	51	38.654	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000012686	-	98	33.737	ENSKMAG00000007743	dis3l2	51	33.737	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000012686	-	99	81.663	ENSKMAG00000000313	dis3	50	81.663	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000012686	-	95	35.802	ENSLACG00000012787	DIS3L2	69	35.802	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000012686	-	100	87.234	ENSMFAG00000027055	DIS3	51	87.234	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000012686	-	100	87.447	ENSMMUG00000000787	DIS3	51	87.447	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000012686	-	88	37.273	ENSMMUG00000015167	DIS3L2	88	40.974	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000012686	-	100	38.846	ENSMMUG00000003693	DIS3L	53	38.846	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000012686	-	100	87.234	ENSMNEG00000030275	DIS3	51	87.234	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000012686	-	100	87.234	ENSMLEG00000030670	DIS3	75	87.234	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000012686	-	100	38.846	ENSMLEG00000034558	DIS3L	51	38.846	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000012686	-	88	38.914	ENSMZEG00005025145	-	69	38.914	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000012686	-	88	38.914	ENSMZEG00005011908	DIS3L	69	38.914	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000012686	-	88	35.904	ENSMGAG00000017114	-	50	35.904	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000012686	-	53	96.371	ENSMGAG00000014951	-	98	96.371	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000012686	-	88	36.952	ENSMGAG00000008209	DIS3L2	50	36.952	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000012686	-	100	88.936	ENSMICG00000004703	DIS3	51	88.936	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000012686	-	98	34.576	ENSMALG00000004604	dis3l2	58	34.576	Monopterus_albus
ENSAPLG00000012686	-	99	39.535	MGP_CAROLIEiJ_G0032344	Dis3l	53	39.535	Mus_caroli
ENSAPLG00000012686	-	99	39.105	ENSMUSG00000032396	Dis3l	53	39.105	Mus_musculus
ENSAPLG00000012686	-	99	39.535	MGP_PahariEiJ_G0015209	Dis3l	53	39.535	Mus_pahari
ENSAPLG00000012686	-	99	39.535	MGP_SPRETEiJ_G0033483	Dis3l	53	39.535	Mus_spretus
ENSAPLG00000012686	-	100	88.085	MGP_SPRETEiJ_G0020456	Dis3	73	93.750	Mus_spretus
ENSAPLG00000012686	-	87	38.140	MGP_SPRETEiJ_G0015171	Dis3l2	75	39.095	Mus_spretus
ENSAPLG00000012686	-	99	39.530	ENSMLUG00000008589	-	54	39.189	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000012686	-	99	82.516	ENSNBRG00000015801	dis3	50	82.516	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000012686	-	86	37.237	ENSNLEG00000014226	DIS3L2	50	37.204	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000012686	-	100	87.021	ENSNLEG00000016050	DIS3	51	87.021	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000012686	-	90	34.716	ENSOPRG00000015911	DIS3L2	51	34.716	Ochotona_princeps
ENSAPLG00000012686	-	85	36.512	ENSOPRG00000004753	-	54	36.512	Ochotona_princeps
ENSAPLG00000012686	-	99	38.402	ENSODEG00000015811	DIS3L	51	38.402	Octodon_degus
ENSAPLG00000012686	-	99	35.130	ENSODEG00000007857	DIS3L2	57	35.130	Octodon_degus
ENSAPLG00000012686	-	98	34.879	ENSONIG00000018681	dis3l2	58	34.879	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000012686	-	99	37.800	ENSOANG00000009753	DIS3L	50	37.800	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPLG00000012686	-	99	82.516	ENSORLG00000005460	dis3	50	82.516	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000012686	-	88	36.952	ENSORLG00000009374	dis3l2	53	36.952	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000012686	-	99	82.729	ENSORLG00020010040	dis3	52	82.729	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000012686	-	99	82.942	ENSORLG00015014931	dis3	50	82.942	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000012686	-	100	38.654	ENSOARG00000018151	DIS3L	51	38.654	Ovis_aries
ENSAPLG00000012686	-	100	87.234	ENSPPAG00000041783	DIS3	51	87.234	Pan_paniscus
ENSAPLG00000012686	-	100	38.846	ENSPPAG00000019888	DIS3L	51	38.846	Pan_paniscus
ENSAPLG00000012686	-	100	88.298	ENSPPRG00000008400	DIS3	51	88.298	Panthera_pardus
ENSAPLG00000012686	-	100	38.654	ENSPTIG00000009042	DIS3L	53	38.654	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000012686	-	100	88.298	ENSPTIG00000017886	DIS3	59	88.298	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000012686	-	100	38.846	ENSPTRG00000007191	DIS3L	53	38.846	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000012686	-	100	87.234	ENSPTRG00000005926	DIS3	59	87.234	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000012686	-	100	87.234	ENSPANG00000010053	DIS3	51	87.234	Papio_anubis
ENSAPLG00000012686	-	81	79.528	ENSPKIG00000013775	dis3	53	79.528	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000012686	-	97	35.378	ENSPSIG00000007443	DIS3L2	56	35.378	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000012686	-	98	39.844	ENSPSIG00000011629	DIS3L	50	39.844	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000012686	-	98	34.979	ENSPMGG00000020250	dis3l2	66	34.979	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPLG00000012686	-	99	82.553	ENSPMGG00000023439	dis3	50	82.553	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPLG00000012686	-	63	72.973	ENSPMAG00000009074	-	100	72.973	Petromyzon_marinus
ENSAPLG00000012686	-	53	66.270	ENSPMAG00000002342	-	83	66.270	Petromyzon_marinus
ENSAPLG00000012686	-	68	64.955	ENSPMAG00000004031	-	89	64.955	Petromyzon_marinus
ENSAPLG00000012686	-	88	36.028	ENSPLAG00000021123	dis3l2	54	36.028	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000012686	-	99	82.729	ENSPLAG00000007305	dis3	50	82.729	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000012686	-	88	36.028	ENSPMEG00000001083	dis3l2	51	36.028	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000012686	-	88	35.797	ENSPREG00000002432	dis3l2	51	35.797	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000012686	-	100	38.803	ENSPCAG00000003114	DIS3L	53	38.803	Procavia_capensis
ENSAPLG00000012686	-	100	39.038	ENSPCOG00000015776	DIS3L	51	39.038	Propithecus_coquereli
ENSAPLG00000012686	-	100	80.213	ENSPCOG00000026058	DIS3	50	80.851	Propithecus_coquereli
ENSAPLG00000012686	-	99	78.138	ENSPNYG00000003418	dis3	51	78.138	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000012686	-	100	86.383	ENSRBIG00000034236	DIS3	51	86.383	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000012686	-	100	38.846	ENSRBIG00000029360	DIS3L	54	38.846	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000012686	-	100	86.383	ENSRROG00000012179	DIS3	51	86.383	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000012686	-	100	87.447	ENSSBOG00000028346	DIS3	74	87.447	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000012686	-	100	38.077	ENSSHAG00000010970	DIS3L	50	38.077	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000012686	-	88	37.471	ENSSFOG00015013209	dis3l2	50	37.471	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000012686	-	88	37.558	ENSSMAG00000012119	dis3l2	54	37.558	Scophthalmus_maximus
ENSAPLG00000012686	-	99	36.047	ENSSARG00000001350	DIS3L	53	36.047	Sorex_araneus
ENSAPLG00000012686	-	99	81.607	ENSSPUG00000011738	DIS3	50	81.607	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000012686	-	99	38.596	ENSSPUG00000013652	DIS3L	53	38.596	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000012686	-	88	37.011	ENSSPAG00000021224	dis3l2	52	36.866	Stegastes_partitus
ENSAPLG00000012686	-	100	39.038	ENSSSCG00000004941	DIS3L	52	39.038	Sus_scrofa
ENSAPLG00000012686	-	88	36.986	ENSSSCG00000022177	DIS3L2	51	37.089	Sus_scrofa
ENSAPLG00000012686	-	99	37.331	ENSTGUG00000009315	DIS3L	50	37.331	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000012686	-	99	79.531	ENSTRUG00000010021	dis3	50	79.531	Takifugu_rubripes
ENSAPLG00000012686	-	88	36.259	ENSTNIG00000007891	dis3l2	53	36.259	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPLG00000012686	-	100	79.787	ENSTNIG00000017037	dis3	50	79.787	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPLG00000012686	-	100	79.149	ENSTBEG00000006813	DIS3	57	79.149	Tupaia_belangeri
ENSAPLG00000012686	-	85	36.170	ENSTTRG00000009186	DIS3L2	52	36.170	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000012686	-	100	38.846	ENSTTRG00000010174	DIS3L	53	38.846	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000012686	-	100	39.038	ENSUAMG00000004022	-	71	39.038	Ursus_americanus
ENSAPLG00000012686	-	88	33.793	ENSUAMG00000020532	DIS3L2	55	34.677	Ursus_americanus
ENSAPLG00000012686	-	100	87.872	ENSUAMG00000027931	DIS3	51	87.872	Ursus_americanus
ENSAPLG00000012686	-	100	88.085	ENSUMAG00000009496	DIS3	52	88.085	Ursus_maritimus
ENSAPLG00000012686	-	100	39.231	ENSUMAG00000012227	DIS3L	54	39.231	Ursus_maritimus
ENSAPLG00000012686	-	99	38.132	ENSVPAG00000006742	DIS3L	53	38.132	Vicugna_pacos
ENSAPLG00000012686	-	100	39.231	ENSVVUG00000014492	DIS3L	52	39.231	Vulpes_vulpes
ENSAPLG00000012686	-	88	37.011	ENSXETG00000033647	DIS3L2	56	37.011	Xenopus_tropicalis
ENSAPLG00000012686	-	88	39.062	ENSXMAG00000013661	dis3l	50	39.062	Xiphophorus_maculatus
ENSAPLG00000012686	-	88	35.797	ENSXMAG00000011688	dis3l2	55	35.797	Xiphophorus_maculatus