EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000012791 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: URB1
Alias: -
Full Name: URB1 ribosome biogenesis homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 45000 bases
Position: chrKB742682.1:1173787-1218786
Accession: 101791517
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000012608	Npa1	PF11707.8	1.5e-91	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000013351	URB1-201	6591	XM_005013850	ENSAPLP00000012608	2197 (aa)	-	U3IZD2

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000012791	URB1	100	56.428	ENSG00000142207	URB1	97	56.428	Homo_sapiens
ENSAPLG00000012791	URB1	97	50.916	ENSAPOG00000020308	urb1	96	50.599	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000012791	URB1	100	56.137	ENSAMEG00000011998	URB1	97	56.182	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000012791	URB1	98	45.730	ENSACIG00000003248	urb1	97	45.801	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000012791	URB1	97	55.568	ENSAOCG00000010364	urb1	96	55.568	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000012791	URB1	97	56.326	ENSAPEG00000010758	urb1	96	55.776	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000012791	URB1	99	46.469	ENSATEG00000011790	urb1	95	46.334	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000012791	URB1	99	64.386	ENSACAG00000002817	URB1	96	64.386	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000012791	URB1	100	56.647	ENSANAG00000024617	URB1	97	56.737	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000012791	URB1	99	46.649	ENSACLG00000024865	urb1	97	46.604	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000012791	URB1	99	42.275	ENSAMXG00000012306	urb1	96	42.275	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000012791	URB1	100	55.036	ENSBTAG00000012412	URB1	97	55.121	Bos_taurus
ENSAPLG00000012791	URB1	100	55.915	ENSCJAG00000009118	URB1	97	56.005	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000012791	URB1	100	57.291	ENSCAFG00000008892	URB1	97	57.201	Canis_familiaris
ENSAPLG00000012791	URB1	100	56.498	ENSCAFG00020025994	-	97	56.408	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000012791	URB1	100	57.175	ENSCAFG00020025987	-	97	57.020	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000012791	URB1	99	55.095	ENSCHIG00000015645	URB1	97	55.140	Capra_hircus
ENSAPLG00000012791	URB1	99	57.381	ENSTSYG00000013286	URB1	97	57.336	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000012791	URB1	100	54.948	ENSCAPG00000015589	URB1	98	54.812	Cavia_aperea
ENSAPLG00000012791	URB1	100	55.696	ENSCPOG00000006748	URB1	97	55.561	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000012791	URB1	100	56.628	ENSCCAG00000021299	URB1	97	56.537	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000012791	URB1	100	56.453	ENSCATG00000042630	URB1	97	56.588	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000012791	URB1	100	55.581	ENSCLAG00000005262	URB1	97	55.446	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000012791	URB1	100	55.546	ENSCSAG00000009584	URB1	97	55.680	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000012791	URB1	99	75.857	ENSCPBG00000006454	URB1	97	75.857	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000012791	URB1	100	56.628	ENSCANG00000031088	URB1	97	56.763	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000012791	URB1	100	54.725	ENSCGRG00001010616	Urb1	97	54.635	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000012791	URB1	100	54.550	ENSCGRG00000015840	Urb1	99	54.459	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000012791	URB1	99	45.173	ENSCSEG00000012616	urb1	97	44.838	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000012791	URB1	98	54.693	ENSCVAG00000009076	urb1	97	55.298	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000012791	URB1	99	46.202	ENSDARG00000060308	urb1	97	46.226	Danio_rerio
ENSAPLG00000012791	URB1	86	60.011	ENSDNOG00000015586	URB1	97	59.852	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000012791	URB1	100	55.666	ENSDORG00000006735	Urb1	97	55.756	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000012791	URB1	91	65.010	ENSETEG00000009080	URB1	88	66.465	Echinops_telfairi
ENSAPLG00000012791	URB1	98	61.209	ENSEASG00005007711	URB1	95	61.099	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000012791	URB1	96	67.470	ENSECAG00000013206	URB1	97	67.108	Equus_caballus
ENSAPLG00000012791	URB1	54	66.250	ENSEEUG00000003626	-	52	66.250	Erinaceus_europaeus
ENSAPLG00000012791	URB1	97	65.000	ENSELUG00000020516	urb1	96	65.000	Esox_lucius
ENSAPLG00000012791	URB1	100	56.208	ENSFCAG00000002177	URB1	97	56.072	Felis_catus
ENSAPLG00000012791	URB1	99	69.497	ENSFALG00000004636	URB1	98	69.317	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000012791	URB1	100	55.685	ENSFDAG00000007288	URB1	92	55.700	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000012791	URB1	96	53.125	ENSFHEG00000000202	urb1	94	53.125	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000012791	URB1	94	47.887	ENSGMOG00000001838	urb1	92	47.623	Gadus_morhua
ENSAPLG00000012791	URB1	100	88.123	ENSGALG00000015887	URB1	97	88.123	Gallus_gallus
ENSAPLG00000012791	URB1	95	54.576	ENSGAFG00000020694	urb1	96	54.245	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000012791	URB1	99	46.496	ENSGACG00000011703	urb1	97	46.316	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000012791	URB1	99	75.372	ENSGAGG00000022544	URB1	97	75.372	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000012791	URB1	100	56.382	ENSGGOG00000000285	URB1	97	56.382	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000012791	URB1	99	46.515	ENSHBUG00000001904	urb1	97	46.470	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000012791	URB1	100	54.945	ENSHGLG00000004907	URB1	97	54.856	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000012791	URB1	100	55.326	ENSHGLG00100010749	URB1	97	55.236	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000012791	URB1	69	57.411	ENSHCOG00000018683	urb1	94	57.620	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000012791	URB1	99	41.805	ENSIPUG00000014721	urb1	97	42.171	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000012791	URB1	100	56.428	ENSSTOG00000004539	URB1	97	56.337	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000012791	URB1	97	48.336	ENSKMAG00000006001	urb1	96	50.874	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000012791	URB1	98	43.776	ENSLBEG00000027208	urb1	97	54.436	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000012791	URB1	99	54.655	ENSLACG00000017059	URB1	96	54.790	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000012791	URB1	99	48.908	ENSLOCG00000009190	urb1	96	48.863	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000012791	URB1	99	57.233	ENSLAFG00000010407	URB1	96	57.407	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000012791	URB1	100	56.518	ENSMFAG00000034391	URB1	94	56.543	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000012791	URB1	100	56.382	ENSMMUG00000010295	URB1	97	56.473	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000012791	URB1	100	55.601	ENSMNEG00000032981	URB1	97	55.691	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000012791	URB1	100	56.453	ENSMLEG00000041435	URB1	97	56.634	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000012791	URB1	99	45.061	ENSMAMG00000011238	urb1	96	44.921	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000012791	URB1	99	42.614	ENSMZEG00005011862	urb1	97	42.435	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000012791	URB1	99	88.214	ENSMGAG00000014512	URB1	98	88.214	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000012791	URB1	92	60.836	ENSMAUG00000010516	Urb1	97	60.526	Mesocricetus_auratus
ENSAPLG00000012791	URB1	100	56.236	ENSMICG00000016424	URB1	97	56.146	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000012791	URB1	99	53.995	ENSMOCG00000012613	Urb1	97	53.950	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000012791	URB1	99	59.150	ENSMODG00000021076	URB1	97	58.879	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000012791	URB1	97	45.665	ENSMALG00000017411	urb1	94	56.733	Monopterus_albus
ENSAPLG00000012791	URB1	100	54.881	MGP_CAROLIEiJ_G0020948	Urb1	97	54.836	Mus_caroli
ENSAPLG00000012791	URB1	100	54.615	ENSMUSG00000039929	Urb1	97	54.570	Mus_musculus
ENSAPLG00000012791	URB1	100	54.500	MGP_PahariEiJ_G0016653	Urb1	97	54.635	Mus_pahari
ENSAPLG00000012791	URB1	100	54.770	MGP_SPRETEiJ_G0021854	Urb1	97	54.725	Mus_spretus
ENSAPLG00000012791	URB1	100	56.557	ENSMPUG00000001123	URB1	97	56.467	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000012791	URB1	100	54.320	ENSNGAG00000001905	Urb1	97	54.320	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000012791	URB1	81	46.917	ENSNBRG00000001049	urb1	96	46.917	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000012791	URB1	100	55.165	ENSNLEG00000026872	URB1	97	55.165	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000012791	URB1	90	72.727	ENSMEUG00000010828	URB1	91	63.244	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000012791	URB1	99	52.572	ENSOPRG00000013482	URB1	97	52.525	Ochotona_princeps
ENSAPLG00000012791	URB1	100	55.536	ENSODEG00000002587	URB1	97	55.356	Octodon_degus
ENSAPLG00000012791	URB1	99	47.017	ENSONIG00000005599	urb1	97	46.869	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000012791	URB1	99	55.666	ENSOCUG00000009381	URB1	97	55.641	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000012791	URB1	99	45.401	ENSORLG00000003429	urb1	97	45.286	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000012791	URB1	99	45.205	ENSORLG00020013785	urb1	99	44.593	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000012791	URB1	97	58.571	ENSORLG00015019421	urb1	96	58.571	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000012791	URB1	81	50.846	ENSOMEG00000002094	urb1	96	59.062	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000012791	URB1	100	56.377	ENSOGAG00000017140	URB1	97	56.377	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000012791	URB1	96	58.019	ENSOARG00000013679	URB1	96	57.341	Ovis_aries
ENSAPLG00000012791	URB1	100	56.518	ENSPPAG00000003423	URB1	97	56.518	Pan_paniscus
ENSAPLG00000012791	URB1	100	56.704	ENSPPRG00000023131	URB1	97	56.524	Panthera_pardus
ENSAPLG00000012791	URB1	92	57.314	ENSPTIG00000016125	URB1	96	57.114	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000012791	URB1	100	56.428	ENSPTRG00000013852	URB1	97	56.428	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000012791	URB1	100	56.318	ENSPANG00000021964	URB1	97	56.453	Papio_anubis
ENSAPLG00000012791	URB1	99	46.971	ENSPKIG00000003683	urb1	96	46.859	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000012791	URB1	100	54.860	ENSPEMG00000021205	Urb1	96	54.860	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000012791	URB1	82	32.137	ENSPMAG00000009733	URB1	99	33.407	Petromyzon_marinus
ENSAPLG00000012791	URB1	99	58.951	ENSPCIG00000016350	URB1	98	58.980	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000012791	URB1	98	45.036	ENSPLAG00000004371	urb1	99	44.945	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000012791	URB1	99	45.299	ENSPMEG00000006634	urb1	97	45.209	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000012791	URB1	99	45.361	ENSPREG00000013453	urb1	97	45.271	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000012791	URB1	100	56.318	ENSPPYG00000011359	URB1	97	56.318	Pongo_abelii
ENSAPLG00000012791	URB1	99	49.254	ENSPCAG00000007430	URB1	96	49.163	Procavia_capensis
ENSAPLG00000012791	URB1	100	56.616	ENSPCOG00000022695	URB1	97	56.655	Propithecus_coquereli
ENSAPLG00000012791	URB1	100	54.599	ENSPVAG00000000889	URB1	97	54.554	Pteropus_vampyrus
ENSAPLG00000012791	URB1	99	45.995	ENSPNYG00000010589	urb1	97	46.026	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000012791	URB1	99	43.126	ENSPNAG00000019324	urb1	97	43.299	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000012791	URB1	100	54.362	ENSRNOG00000002080	Urb1	97	54.496	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000012791	URB1	100	56.428	ENSRBIG00000033122	URB1	97	56.608	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000012791	URB1	100	56.428	ENSRROG00000040237	URB1	97	56.608	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000012791	URB1	100	56.467	ENSSBOG00000027672	URB1	97	56.557	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000012791	URB1	99	59.072	ENSSHAG00000005140	URB1	97	58.847	Sarcophilus_harrisii
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ENSAPLG00000012791	URB1	99	46.762	ENSSMAG00000003782	urb1	97	46.807	Scophthalmus_maximus
ENSAPLG00000012791	URB1	99	47.439	ENSSDUG00000012313	urb1	97	47.260	Seriola_dumerili
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ENSAPLG00000012791	URB1	99	68.866	ENSSPUG00000012447	URB1	96	68.866	Sphenodon_punctatus
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