EuRBPDB

Description

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000012606	MMR_HSR1	PF01926.23	4.8e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000013349	RAB5A-201	2086	XM_005030016	ENSAPLP00000012606	215 (aa)	XP_005030073	R0KLG8

Gene Model

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
apla04144	Endocytosis	KEGG
apla04145	Phagosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAPLG00000012817	RAB5A	89	37.824	ENSAPLG00000010775	RAB35	97	36.788
ENSAPLG00000012817	RAB5A	74	34.591	ENSAPLG00000009164	-	96	34.591
ENSAPLG00000012817	RAB5A	78	32.544	ENSAPLG00000015953	KRAS	90	32.164
ENSAPLG00000012817	RAB5A	90	34.848	ENSAPLG00000001949	RAB9B	97	34.848
ENSAPLG00000012817	RAB5A	90	42.927	ENSAPLG00000011046	-	94	42.927
ENSAPLG00000012817	RAB5A	90	34.343	ENSAPLG00000002371	RAB9A	97	34.343
ENSAPLG00000012817	RAB5A	98	30.837	ENSAPLG00000008936	RAB36	84	30.837
ENSAPLG00000012817	RAB5A	75	31.548	ENSAPLG00000014490	GEM	55	31.548
ENSAPLG00000012817	RAB5A	90	42.647	ENSAPLG00000009395	-	99	42.647
ENSAPLG00000012817	RAB5A	90	44.330	ENSAPLG00000009597	RAB1A	95	44.330
ENSAPLG00000012817	RAB5A	75	36.364	ENSAPLG00000014543	RAB39B	78	36.364
ENSAPLG00000012817	RAB5A	76	31.515	ENSAPLG00000012248	HRAS	99	31.515
ENSAPLG00000012817	RAB5A	74	34.969	ENSAPLG00000006592	-	93	34.969
ENSAPLG00000012817	RAB5A	81	39.444	ENSAPLG00000006894	RAB33B	77	39.444
ENSAPLG00000012817	RAB5A	78	34.132	ENSAPLG00000013463	-	72	34.132
ENSAPLG00000012817	RAB5A	55	30.159	ENSAPLG00000001404	ARL4A	60	30.159
ENSAPLG00000012817	RAB5A	81	44.253	ENSAPLG00000012821	RAB30	86	44.253
ENSAPLG00000012817	RAB5A	73	36.943	ENSAPLG00000003715	RAB23	95	37.870
ENSAPLG00000012817	RAB5A	75	36.810	ENSAPLG00000013647	-	93	36.810
ENSAPLG00000012817	RAB5A	90	41.584	ENSAPLG00000014962	RAB11A	94	41.584
ENSAPLG00000012817	RAB5A	74	42.424	ENSAPLG00000004323	RAB7A	93	42.424