EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000013022 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: nucleolar RNA helicase 2
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 14014 bases
Position: chrKB742402.1:128395-142408
Accession: 101800344
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000012871	GUCT	PF08152.12	4.1e-32	1	1
ENSAPLP00000012871	ResIII	PF04851.15	1.1e-09	1	1
ENSAPLP00000012871	DEAD	PF00270.29	2.1e-46	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000013616	-	2085	XM_005009123	ENSAPLP00000012871	695 (aa)	-	U3J044

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000013022's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000013022's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAPLG00000013022	-	53	32.345	ENSAPLG00000006751	EIF4A2	87	32.345
ENSAPLG00000013022	-	51	35.376	ENSAPLG00000009071	DDX5	58	35.376
ENSAPLG00000013022	-	50	36.286	ENSAPLG00000011662	DDX4	78	36.000
ENSAPLG00000013022	-	53	34.127	ENSAPLG00000014334	-	63	33.850
ENSAPLG00000013022	-	52	33.514	ENSAPLG00000011648	DDX18	69	33.514
ENSAPLG00000013022	-	51	34.748	ENSAPLG00000014240	-	55	34.933
ENSAPLG00000013022	-	52	36.364	ENSAPLG00000010182	-	73	36.364
ENSAPLG00000013022	-	57	33.251	ENSAPLG00000011377	DDX27	54	32.446
ENSAPLG00000013022	-	56	31.500	ENSAPLG00000011942	DDX10	52	31.514
ENSAPLG00000013022	-	50	32.682	ENSAPLG00000015324	DDX47	73	32.682

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000013022	-	94	69.254	ENSG00000165732	DDX21	85	70.673	Homo_sapiens
ENSAPLG00000013022	-	55	81.053	ENSAPOG00000012269	ddx21	70	81.053	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000013022	-	82	77.003	ENSAMEG00000017978	DDX21	78	68.421	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000013022	-	79	76.051	ENSACIG00000006429	ddx21	72	76.909	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000013022	-	79	75.091	ENSAOCG00000023174	ddx21	80	68.530	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000013022	-	79	75.091	ENSAPEG00000007108	ddx21	80	68.530	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000013022	-	79	76.503	ENSATEG00000022194	ddx21	86	68.203	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000013022	-	83	79.487	ENSACAG00000009829	DDX21	77	75.200	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000013022	-	82	74.567	ENSANAG00000038109	DDX21	93	80.745	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000013022	-	79	76.138	ENSACLG00000008248	ddx21	75	69.537	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000013022	-	89	68.927	ENSAMXG00000009140	ddx21	87	69.219	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000013022	-	98	66.335	ENSBTAG00000014558	DDX21	78	70.607	Bos_taurus
ENSAPLG00000013022	-	97	67.452	ENSCJAG00000012876	DDX21	76	70.894	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000013022	-	82	74.874	ENSCAFG00000013791	DDX21	77	71.770	Canis_familiaris
ENSAPLG00000013022	-	82	56.655	ENSCHIG00000014104	-	83	51.852	Capra_hircus
ENSAPLG00000013022	-	82	54.237	ENSCHIG00000006053	-	65	56.530	Capra_hircus
ENSAPLG00000013022	-	95	67.394	ENSCHIG00000000248	-	90	69.099	Capra_hircus
ENSAPLG00000013022	-	95	68.571	ENSTSYG00000011231	DDX21	78	70.223	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000013022	-	81	58.761	ENSCAPG00000005945	DDX21	71	59.817	Cavia_aperea
ENSAPLG00000013022	-	98	65.864	ENSCPOG00000015479	DDX21	79	70.487	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000013022	-	82	74.567	ENSCCAG00000026288	DDX21	99	75.493	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000013022	-	83	74.355	ENSCATG00000043540	DDX21	80	67.802	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000013022	-	80	58.094	ENSCATG00000045019	-	87	51.376	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000013022	-	97	66.241	ENSCLAG00000012235	DDX21	79	70.927	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000013022	-	92	62.901	ENSCHOG00000000234	DDX21	79	64.274	Choloepus_hoffmanni
ENSAPLG00000013022	-	95	74.811	ENSCPBG00000019937	-	76	77.120	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000013022	-	96	78.507	ENSCPBG00000019934	-	88	80.671	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000013022	-	83	56.174	ENSCANG00000036110	-	77	52.846	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000013022	-	97	67.452	ENSCANG00000039926	DDX21	78	70.353	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000013022	-	94	69.572	ENSCGRG00001016264	-	79	71.246	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000013022	-	81	66.901	ENSCGRG00001017824	-	79	62.520	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000013022	-	94	69.572	ENSCGRG00000015134	-	79	71.246	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000013022	-	81	67.077	ENSCGRG00000008450	-	79	62.679	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000013022	-	78	76.252	ENSCSEG00000013939	ddx21	85	66.052	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000013022	-	78	77.079	ENSCVAG00000018333	ddx21	86	67.385	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000013022	-	81	74.423	ENSDARG00000063626	ddx21	68	76.164	Danio_rerio
ENSAPLG00000013022	-	83	73.684	ENSDNOG00000001680	DDX21	78	72.476	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000013022	-	81	69.735	ENSDORG00000002202	Ddx21	78	63.608	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000013022	-	82	74.869	ENSETEG00000014073	DDX21	77	69.697	Echinops_telfairi
ENSAPLG00000013022	-	83	75.559	ENSEASG00005015598	DDX21	76	70.927	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000013022	-	83	73.411	ENSECAG00000010810	DDX21	77	70.927	Equus_caballus
ENSAPLG00000013022	-	84	67.350	ENSEEUG00000005959	DDX21	84	65.947	Erinaceus_europaeus
ENSAPLG00000013022	-	78	74.630	ENSELUG00000018856	ddx21	88	63.328	Esox_lucius
ENSAPLG00000013022	-	82	75.000	ENSFCAG00000002109	DDX21	77	72.364	Felis_catus
ENSAPLG00000013022	-	79	73.723	ENSFALG00000013043	-	93	65.954	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000013022	-	78	91.667	ENSFALG00000013022	-	91	84.591	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000013022	-	92	69.457	ENSFDAG00000007401	DDX21	78	70.767	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000013022	-	88	67.360	ENSFHEG00000019089	ddx21	86	67.610	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000013022	-	77	69.074	ENSGMOG00000012354	ddx21	88	69.074	Gadus_morhua
ENSAPLG00000013022	-	91	85.962	ENSGALG00000004144	-	89	85.965	Gallus_gallus
ENSAPLG00000013022	-	96	66.220	ENSGALG00000042254	-	90	70.540	Gallus_gallus
ENSAPLG00000013022	-	78	77.551	ENSGAFG00000003427	ddx21	87	68.510	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000013022	-	78	75.370	ENSGACG00000016060	ddx21	81	75.465	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000013022	-	96	77.761	ENSGAGG00000022163	-	81	79.777	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000013022	-	96	71.343	ENSGAGG00000022169	-	88	74.641	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000013022	-	83	74.871	ENSGGOG00000005065	DDX21	77	70.513	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000013022	-	79	76.138	ENSHBUG00000017638	ddx21	75	69.537	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000013022	-	92	69.479	ENSHGLG00000013902	DDX21	78	71.406	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000013022	-	92	69.479	ENSHGLG00100015956	DDX21	79	71.406	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000013022	-	78	74.307	ENSHCOG00000014503	ddx21	74	74.307	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000013022	-	78	75.691	ENSIPUG00000006972	ddx21	70	75.978	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000013022	-	95	69.896	ENSSTOG00000011572	DDX21	78	71.975	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000013022	-	90	70.860	ENSJJAG00000014035	Ddx21	77	71.591	Jaculus_jaculus
ENSAPLG00000013022	-	79	74.681	ENSKMAG00000020766	ddx21	87	65.749	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000013022	-	78	76.155	ENSLBEG00000001244	ddx21	79	68.690	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000013022	-	78	78.493	ENSLACG00000000658	DDX21	92	78.850	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000013022	-	78	75.231	ENSLOCG00000009123	ddx21	86	64.392	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000013022	-	83	72.093	ENSLAFG00000007962	DDX21	77	70.128	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000013022	-	80	58.244	ENSMFAG00000033536	-	87	51.687	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000013022	-	83	74.527	ENSMFAG00000044838	DDX21	94	79.264	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000013022	-	80	62.186	ENSMMUG00000032331	-	85	55.061	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000013022	-	83	74.527	ENSMMUG00000001005	DDX21	77	70.080	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000013022	-	83	74.527	ENSMNEG00000032825	DDX21	80	67.957	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000013022	-	80	58.453	ENSMLEG00000028215	-	87	51.682	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000013022	-	83	70.740	ENSMLEG00000028940	DDX21	90	80.317	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000013022	-	94	64.672	ENSMAMG00000019683	ddx21	89	65.948	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000013022	-	79	76.138	ENSMZEG00005011618	ddx21	79	69.537	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000013022	-	90	90.112	ENSMGAG00000004298	DDX21	91	90.080	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000013022	-	94	68.939	ENSMAUG00000011153	Ddx21	80	71.111	Mesocricetus_auratus
ENSAPLG00000013022	-	92	62.848	ENSMICG00000033371	-	87	69.091	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000013022	-	92	70.249	ENSMICG00000015112	-	78	71.406	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000013022	-	83	76.950	ENSMOCG00000020855	Ddx21	78	71.815	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000013022	-	69	76.141	ENSMMOG00000015938	ddx21	91	76.141	Mola_mola
ENSAPLG00000013022	-	78	76.243	ENSMODG00000010727	DDX21	84	69.316	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000013022	-	75	73.295	ENSMALG00000010489	ddx21	78	74.269	Monopterus_albus
ENSAPLG00000013022	-	82	77.098	MGP_CAROLIEiJ_G0015388	Ddx21	77	72.520	Mus_caroli
ENSAPLG00000013022	-	96	70.721	ENSMUSG00000020075	Ddx21	70	72.890	Mus_musculus
ENSAPLG00000013022	-	82	77.273	MGP_SPRETEiJ_G0016199	Ddx21	70	72.890	Mus_spretus
ENSAPLG00000013022	-	95	70.544	ENSMPUG00000004603	DDX21	77	72.293	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000013022	-	83	72.788	ENSMLUG00000023298	DDX21	73	70.989	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000013022	-	80	76.523	ENSNGAG00000022273	Ddx21	81	67.708	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000013022	-	79	76.321	ENSNBRG00000006198	ddx21	85	66.018	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000013022	-	83	74.527	ENSNLEG00000011591	DDX21	85	70.032	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000013022	-	74	73.888	ENSOPRG00000001640	DDX21	67	74.414	Ochotona_princeps
ENSAPLG00000013022	-	91	55.743	ENSODEG00000012879	-	82	57.348	Octodon_degus
ENSAPLG00000013022	-	79	76.503	ENSONIG00000005499	ddx21	78	67.683	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000013022	-	93	66.516	ENSOANG00000004777	DDX21	81	68.521	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPLG00000013022	-	83	74.161	ENSOCUG00000002888	DDX21	63	79.221	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000013022	-	79	75.458	ENSORLG00000010122	ddx21	83	75.881	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000013022	-	79	75.275	ENSORLG00020004409	ddx21	82	75.696	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000013022	-	78	75.786	ENSORLG00015000051	ddx21	83	75.881	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000013022	-	79	75.824	ENSOMEG00000004523	ddx21	80	67.868	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000013022	-	81	74.306	ENSOGAG00000001846	-	63	78.409	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000013022	-	80	69.300	ENSOGAG00000031242	-	97	64.000	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000013022	-	95	67.394	ENSOARG00000005307	DDX21	86	69.099	Ovis_aries
ENSAPLG00000013022	-	83	74.871	ENSPPAG00000036670	DDX21	77	70.513	Pan_paniscus
ENSAPLG00000013022	-	82	74.831	ENSPPRG00000012523	DDX21	77	72.364	Panthera_pardus
ENSAPLG00000013022	-	82	74.831	ENSPTIG00000007268	DDX21	77	72.364	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000013022	-	83	74.871	ENSPTRG00000002563	DDX21	77	70.513	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000013022	-	83	74.527	ENSPANG00000022140	DDX21	77	70.080	Papio_anubis
ENSAPLG00000013022	-	97	51.704	ENSPANG00000031334	-	87	51.529	Papio_anubis
ENSAPLG00000013022	-	81	74.028	ENSPKIG00000014660	ddx21	77	71.848	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000013022	-	97	73.412	ENSPSIG00000004724	DDX21	91	76.282	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000013022	-	94	67.941	ENSPEMG00000018513	Ddx21	76	72.520	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000013022	-	79	79.167	ENSPCIG00000015505	DDX21	81	74.545	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000013022	-	78	77.264	ENSPFOG00000016196	ddx21	82	68.000	Poecilia_formosa
ENSAPLG00000013022	-	77	75.741	ENSPLAG00000017849	ddx21	92	68.095	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000013022	-	78	77.449	ENSPMEG00000014571	ddx21	82	68.154	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000013022	-	83	74.699	ENSPPYG00000002389	DDX21	77	70.192	Pongo_abelii
ENSAPLG00000013022	-	87	68.966	ENSPCAG00000016697	DDX21	83	70.707	Procavia_capensis
ENSAPLG00000013022	-	92	67.284	ENSPCOG00000019284	DDX21	75	68.618	Propithecus_coquereli
ENSAPLG00000013022	-	82	76.632	ENSPVAG00000009521	DDX21	78	71.725	Pteropus_vampyrus
ENSAPLG00000013022	-	75	76.527	ENSPNYG00000015566	ddx21	83	77.432	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000013022	-	75	77.143	ENSPNAG00000004814	ddx21	75	76.850	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000013022	-	95	70.015	ENSRNOG00000048990	AABR07037356.1	78	71.224	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000013022	-	95	70.465	ENSRNOG00000043099	Ddx21	78	71.701	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000013022	-	98	61.207	ENSRBIG00000035862	-	79	64.904	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000013022	-	83	74.355	ENSRBIG00000043721	-	95	75.410	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000013022	-	98	66.000	ENSRROG00000033387	DDX21	77	69.683	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000013022	-	83	54.778	ENSSBOG00000025801	-	80	52.564	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000013022	-	87	70.473	ENSSFOG00015014610	ddx21	90	72.300	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000013022	-	78	75.601	ENSSMAG00000003932	ddx21	87	65.601	Scophthalmus_maximus
ENSAPLG00000013022	-	79	75.271	ENSSDUG00000021420	ddx21	86	66.362	Seriola_dumerili
ENSAPLG00000013022	-	80	74.101	ENSSLDG00000025665	ddx21	87	74.188	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPLG00000013022	-	79	81.455	ENSSPUG00000004088	DDX21	75	82.037	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000013022	-	78	76.937	ENSSPAG00000013142	ddx21	87	66.869	Stegastes_partitus
ENSAPLG00000013022	-	83	74.372	ENSSSCG00000010247	DDX21	86	69.811	Sus_scrofa
ENSAPLG00000013022	-	90	84.345	ENSTGUG00000003810	-	90	84.591	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000013022	-	89	69.378	ENSTRUG00000017570	ddx21	91	66.921	Takifugu_rubripes
ENSAPLG00000013022	-	77	76.493	ENSTNIG00000013798	ddx21	89	76.493	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPLG00000013022	-	95	61.424	ENSTBEG00000002310	DDX21	78	63.419	Tupaia_belangeri
ENSAPLG00000013022	-	97	67.634	ENSTTRG00000016398	DDX21	77	69.968	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000013022	-	97	69.559	ENSUMAG00000007735	DDX21	77	72.524	Ursus_maritimus
ENSAPLG00000013022	-	87	69.294	ENSVPAG00000000627	DDX21	84	70.628	Vicugna_pacos
ENSAPLG00000013022	-	83	76.389	ENSVVUG00000020486	DDX21	77	71.885	Vulpes_vulpes
ENSAPLG00000013022	-	75	76.686	ENSXCOG00000009654	ddx21	86	67.247	Xiphophorus_couchianus
ENSAPLG00000013022	-	78	76.525	ENSXMAG00000008199	ddx21	87	67.385	Xiphophorus_maculatus