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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000013149 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SMARCA1
Alias: -
Full Name: SWI/SNF related%2C matrix associated%2C actin dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C member 1
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 26421 bases
Position: chrKB743323.1:2333278-2359698
Accession: 101800953
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000013008	ResIII	PF04851.15	7.3e-12	1	1
ENSAPLP00000013008	DEAD	PF00270.29	4.1e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000013756	SMARCA1-201	3623	XM_005022155	ENSAPLP00000013008	982 (aa)	-	U3J0I1

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	54	44.681	ENSAPLG00000002649	HELLS	70	44.681
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	58	41.930	ENSAPLG00000009976	CHD1L	61	41.930
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	98	87.642	ENSAPLG00000009206	SMARCA5	99	87.642

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	93.279	ENSG00000102038	SMARCA1	93	93.279	Homo_sapiens
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	84.426	ENSAPOG00000016035	smarca5	98	84.683	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	91.851	ENSAMEG00000015218	SMARCA1	93	91.851	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	92	84.939	ENSACIG00000016982	smarca5	99	85.045	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	84.426	ENSAOCG00000015578	smarca5	94	84.426	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	84.426	ENSAPEG00000011117	smarca5	99	84.670	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	83.910	ENSATEG00000012894	smarca5	95	83.910	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	95.825	ENSACAG00000011376	SMARCA1	94	95.825	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	88.086	ENSANAG00000023098	SMARCA1	93	88.086	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	84.521	ENSACLG00000025356	smarca5	94	84.521	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	94	91.935	ENSAMXG00000011227	smarca1	97	93.958	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	85.128	ENSAMXG00000005709	smarca5	94	85.128	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	92.449	ENSBTAG00000002292	SMARCA1	91	92.138	Bos_taurus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	63.545	WBGene00002169	isw-1	97	63.545	Caenorhabditis_elegans
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	93.279	ENSCJAG00000002868	SMARCA1	93	93.279	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	82.983	ENSCAFG00000018673	SMARCA1	99	83.647	Canis_familiaris
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	93.177	ENSCAFG00020001751	SMARCA1	93	93.177	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	92.668	ENSCHIG00000009837	SMARCA1	93	92.668	Capra_hircus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	93.177	ENSTSYG00000004240	SMARCA1	94	93.446	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	91.397	ENSCPOG00000013601	SMARCA1	94	91.397	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	90.224	ENSCCAG00000030817	SMARCA1	93	90.224	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	92.153	ENSCATG00000015921	SMARCA1	93	92.153	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	92.057	ENSCLAG00000002171	SMARCA1	93	92.057	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	93.279	ENSCSAG00000008460	SMARCA1	93	93.279	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	97.862	ENSCPBG00000001146	SMARCA1	93	97.862	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	74.002	ENSCING00000004110	swi/snf	97	74.002	Ciona_intestinalis
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	73.900	ENSCSAVG00000004620	-	100	74.499	Ciona_savignyi
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	93.177	ENSCANG00000007183	SMARCA1	93	93.177	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	91.548	ENSCGRG00001010776	Smarca1	93	91.548	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	97	91.268	ENSCGRG00000015301	Smarca1	94	91.552	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	84.324	ENSCSEG00000000328	smarca5	95	84.012	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	83.605	ENSCVAG00000008668	smarca5	99	84.217	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	84.103	ENSDARG00000052348	smarca5	94	84.103	Danio_rerio
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	88.855	ENSDARG00000012776	smarca1	96	88.855	Danio_rerio
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	97	93.103	ENSDNOG00000004315	SMARCA1	91	93.418	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	97	91.954	ENSDORG00000009270	Smarca1	90	92.251	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	96	75.476	FBgn0011604	Iswi	97	73.134	Drosophila_melanogaster
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	83	88.393	ENSETEG00000017426	SMARCA1	83	88.393	Echinops_telfairi
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	82.329	ENSEBUG00000001239	smarca5	96	82.329	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	88.259	ENSEASG00005008218	SMARCA1	99	88.664	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	92.974	ENSECAG00000012106	SMARCA1	93	92.974	Equus_caballus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	81	92.715	ENSEEUG00000014927	SMARCA1	80	92.715	Erinaceus_europaeus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	90.408	ENSELUG00000010515	smarca1	96	90.856	Esox_lucius
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	92.872	ENSFCAG00000018496	SMARCA1	93	92.872	Felis_catus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	93	99.123	ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	99.123	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	97	91.641	ENSFDAG00000009818	SMARCA1	94	91.929	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	83.910	ENSFHEG00000007687	smarca5	94	83.910	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	98	99.374	ENSGALG00000008431	SMARCA1	95	99.374	Gallus_gallus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	84.114	ENSGAFG00000017731	smarca5	95	84.114	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	97.840	ENSGAGG00000023575	SMARCA1	100	97.840	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	73	88.261	ENSGGOG00000012841	-	93	88.261	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	91.548	ENSHGLG00000003080	SMARCA1	93	91.548	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	90.992	ENSHGLG00100001102	SMARCA1	99	90.992	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	84.151	ENSHCOG00000005458	smarca5	95	84.012	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	84.923	ENSIPUG00000005229	SMARCA5	96	84.923	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	90.266	ENSIPUG00000016905	Smarca1	99	90.266	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	93.075	ENSSTOG00000014524	SMARCA1	94	93.100	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	91.692	ENSJJAG00000002593	Smarca1	93	91.692	Jaculus_jaculus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	83.845	ENSKMAG00000003777	smarca5	95	83.707	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	94	85.049	ENSLBEG00000013295	SMARCA1	100	85.588	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	83.605	ENSLBEG00000018112	smarca5	95	83.605	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	93.788	ENSLACG00000016697	SMARCA1	97	93.788	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	92.355	ENSLOCG00000014591	smarca1	96	92.355	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	92.206	ENSLAFG00000000896	SMARCA1	98	92.206	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	93.279	ENSMFAG00000002117	SMARCA1	94	93.856	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	92.153	ENSMMUG00000008818	SMARCA1	97	93.497	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	92.153	ENSMNEG00000041768	SMARCA1	94	93.856	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	93.177	ENSMLEG00000043198	SMARCA1	93	93.177	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	84.114	ENSMAMG00000014294	smarca5	94	84.114	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	84.521	ENSMZEG00005009369	smarca5	94	84.521	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	98.189	ENSMGAG00000007042	SMARCA1	98	98.189	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	97	91.268	ENSMAUG00000008133	Smarca1	91	90.881	Mesocricetus_auratus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	93.075	ENSMICG00000015768	SMARCA1	93	93.075	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	90.983	ENSMOCG00000009464	Smarca1	93	90.983	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	82.587	ENSMMOG00000005547	smarca5	99	82.587	Mola_mola
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	95.621	ENSMODG00000013187	-	95	95.621	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	84.151	ENSMALG00000002081	smarca5	96	84.511	Monopterus_albus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	90.983	MGP_CAROLIEiJ_G0033034	Smarca1	93	90.983	Mus_caroli
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	91.084	ENSMUSG00000031099	Smarca1	93	91.084	Mus_musculus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	90.881	MGP_PahariEiJ_G0031579	Smarca1	93	90.881	Mus_pahari
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	91.084	MGP_SPRETEiJ_G0034192	Smarca1	93	91.084	Mus_spretus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	91.851	ENSMPUG00000017423	SMARCA1	88	91.851	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	90.261	ENSMLUG00000029614	SMARCA1	93	90.261	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	97	92.100	ENSNGAG00000006492	Smarca1	91	91.719	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	84.521	ENSNBRG00000004463	smarca5	98	84.521	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	91.549	ENSNLEG00000015179	SMARCA1	94	93.122	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	94	86.081	ENSMEUG00000008819	SMARCA1	98	86.081	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	97	91.228	ENSODEG00000012163	SMARCA1	91	91.509	Octodon_degus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	84.521	ENSONIG00000009993	smarca5	94	84.521	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	96.811	ENSOANG00000002862	SMARCA1	100	96.811	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	92.261	ENSOCUG00000001047	SMARCA1	93	92.261	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	84.765	ENSORLG00000021998	smarca5	94	84.623	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	84.867	ENSORLG00020017679	smarca5	94	84.725	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	84.765	ENSORLG00015017210	smarca5	94	84.521	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	84.867	ENSOMEG00000000086	smarca5	94	84.623	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	97	92.776	ENSOGAG00000004399	SMARCA1	91	93.082	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	92.653	ENSOARG00000014638	SMARCA1	100	92.653	Ovis_aries
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	93.279	ENSPPAG00000034647	SMARCA1	93	93.279	Pan_paniscus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	93.075	ENSPPRG00000008929	SMARCA1	93	93.075	Panthera_pardus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	91.091	ENSPTIG00000000915	SMARCA1	96	91.091	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	93.279	ENSPTRG00000049876	SMARCA1	93	92.153	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	93.279	ENSPANG00000003871	SMARCA1	93	93.279	Papio_anubis
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	95	90.763	ENSPKIG00000013411	smarca1	94	90.782	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	97.942	ENSPSIG00000010101	SMARCA1	100	97.942	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	97	91.684	ENSPEMG00000017503	Smarca1	91	91.300	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	96.334	ENSPCIG00000015460	SMARCA1	96	96.334	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	84.151	ENSPFOG00000007649	smarca5	95	83.910	Poecilia_formosa
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	84.151	ENSPLAG00000003363	smarca5	95	83.910	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	84.254	ENSPMEG00000019849	smarca5	95	84.012	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	84.254	ENSPREG00000023250	smarca5	95	84.012	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	90.428	ENSPPYG00000020703	SMARCA1	93	90.428	Pongo_abelii
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	79	84.626	ENSPCOG00000020722	SMARCA1	94	88.693	Propithecus_coquereli
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	91	91.355	ENSPVAG00000003805	SMARCA1	92	85.243	Pteropus_vampyrus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	60	86.849	ENSPNYG00000012299	smarca5	90	86.849	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	91.548	ENSRNOG00000003762	Smarca1	93	91.548	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	93.177	ENSRROG00000034167	SMARCA1	93	93.177	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	93.163	ENSSBOG00000020641	SMARCA1	100	93.163	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	88.284	ENSSHAG00000013518	SMARCA1	99	88.284	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	85.155	ENSSFOG00015016794	smarca5	100	85.155	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	90.964	ENSSFOG00015009043	smarca1	96	90.964	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	83.605	ENSSMAG00000004801	smarca5	95	83.605	Scophthalmus_maximus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	83.809	ENSSDUG00000020690	smarca5	95	83.809	Seriola_dumerili
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	83.809	ENSSLDG00000025190	smarca5	95	83.809	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	83	92.199	ENSSARG00000000842	SMARCA1	81	92.199	Sorex_araneus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	98	97.185	ENSSPUG00000000590	SMARCA1	93	97.185	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	84.114	ENSSPAG00000002894	smarca5	97	84.182	Stegastes_partitus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	92.887	ENSSSCG00000012649	SMARCA1	94	92.806	Sus_scrofa
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	98.574	ENSTGUG00000003899	-	100	98.574	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	84.012	ENSTRUG00000014094	smarca5	95	84.012	Takifugu_rubripes
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	83.197	ENSTNIG00000017717	smarca5	94	82.892	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	91	90.687	ENSTBEG00000014973	SMARCA1	89	90.981	Tupaia_belangeri
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	97	89.038	ENSTTRG00000006168	SMARCA1	96	89.286	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	92.770	ENSUAMG00000020201	SMARCA1	93	92.770	Ursus_americanus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	87.726	ENSUMAG00000004073	SMARCA1	96	92.910	Ursus_maritimus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	78	93.137	ENSVPAG00000010492	-	77	94.158	Vicugna_pacos
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	93.177	ENSVVUG00000008878	SMARCA1	98	93.936	Vulpes_vulpes
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	92.872	ENSXETG00000001526	smarca1	98	92.872	Xenopus_tropicalis
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	84.012	ENSXCOG00000011170	smarca5	97	84.012	Xiphophorus_couchianus
ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	84.012	ENSXMAG00000009678	smarca5	98	85.016	Xiphophorus_maculatus