EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000013285 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: PUS3
Alias: -
Full Name: pseudouridine synthase 3
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3249 bases
Position: chrKB743221.1:169034-172282
Accession: 101799678
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000013080	PseudoU_synth_1	PF01416.20	8.1e-33	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000013828	PUS3-201	1320	XM_005021091	ENSAPLP00000013080	440 (aa)	-	U3J0Q3

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000013285's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000013285's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	69.794	ENSG00000110060	PUS3	97	62.286	Homo_sapiens
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	53.986	ENSAPOG00000019483	pus3	93	53.986	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	71.462	ENSAMEG00000000144	PUS3	88	71.462	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000013285	PUS3	73	61.765	ENSACIG00000024479	pus3	98	56.563	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	52.632	ENSAOCG00000006589	pus3	90	51.844	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	52.070	ENSAPEG00000014617	pus3	90	52.070	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	53.531	ENSATEG00000022731	pus3	89	53.531	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000013285	PUS3	99	70.776	ENSACAG00000000186	PUS3	95	70.776	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000013285	PUS3	100	68.468	ENSANAG00000035614	PUS3	90	68.468	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000013285	PUS3	97	52.796	ENSACLG00000007356	pus3	91	52.796	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000013285	PUS3	99	53.452	ENSAMXG00000019534	pus3	90	53.452	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	71.101	ENSBTAG00000014339	PUS3	88	71.101	Bos_taurus
ENSAPLG00000013285	PUS3	75	37.015	WBGene00006473	tag-124	83	37.015	Caenorhabditis_elegans
ENSAPLG00000013285	PUS3	100	68.919	ENSCJAG00000046645	PUS3	90	68.919	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	70.362	ENSCAFG00000010534	PUS3	89	70.362	Canis_familiaris
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	70.362	ENSCAFG00020010659	PUS3	89	70.362	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	70.843	ENSCHIG00000012260	PUS3	89	70.843	Capra_hircus
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	69.495	ENSTSYG00000014744	PUS3	88	69.495	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	67.647	ENSCAPG00000012231	PUS3	90	67.647	Cavia_aperea
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	67.647	ENSCPOG00000032587	PUS3	90	67.647	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000013285	PUS3	100	68.254	ENSCCAG00000035999	PUS3	90	68.254	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000013285	PUS3	100	69.710	ENSCATG00000043123	PUS3	90	69.710	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	68.778	ENSCLAG00000014947	PUS3	89	68.778	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000013285	PUS3	100	69.820	ENSCSAG00000002281	PUS3	90	69.933	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000013285	PUS3	84	71.850	ENSCHOG00000008442	PUS3	97	71.850	Choloepus_hoffmanni
ENSAPLG00000013285	PUS3	52	81.938	ENSCPBG00000011173	PUS3	80	81.938	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000013285	PUS3	87	34.783	ENSCING00000009062	-	79	34.783	Ciona_intestinalis
ENSAPLG00000013285	PUS3	93	34.499	ENSCSAVG00000002211	-	97	34.732	Ciona_savignyi
ENSAPLG00000013285	PUS3	100	69.111	ENSCANG00000038729	PUS3	90	69.111	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000013285	PUS3	100	69.005	ENSCGRG00001019842	Pus3	90	69.005	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000013285	PUS3	100	68.552	ENSCGRG00000010155	Pus3	90	68.552	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000013285	PUS3	97	53.241	ENSCSEG00000007948	pus3	89	53.241	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000013285	PUS3	97	51.002	ENSCVAG00000022150	pus3	90	51.002	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	55.349	ENSDARG00000028976	pus3	89	55.349	Danio_rerio
ENSAPLG00000013285	PUS3	100	68.243	ENSDNOG00000040719	PUS3	91	68.243	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	70.481	ENSDORG00000001819	Pus3	89	70.481	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000013285	PUS3	93	40.402	FBgn0034703	CG3045	84	40.402	Drosophila_melanogaster
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	65.429	ENSETEG00000013067	PUS3	88	65.429	Echinops_telfairi
ENSAPLG00000013285	PUS3	94	52.653	ENSEBUG00000002154	pus3	61	57.477	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	70.302	ENSEASG00005023003	PUS3	88	70.302	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	70.642	ENSECAG00000007581	PUS3	88	70.642	Equus_caballus
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	71.926	ENSEEUG00000010543	PUS3	88	71.926	Erinaceus_europaeus
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	57.143	ENSELUG00000004425	pus3	91	57.143	Esox_lucius
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	70.968	ENSFCAG00000005340	PUS3	89	70.968	Felis_catus
ENSAPLG00000013285	PUS3	100	77.955	ENSFALG00000005159	PUS3	92	77.955	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	69.336	ENSFDAG00000020745	PUS3	89	69.336	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000013285	PUS3	97	52.027	ENSFHEG00000010984	pus3	83	52.027	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	54.147	ENSGMOG00000004534	pus3	94	54.147	Gadus_morhua
ENSAPLG00000013285	PUS3	100	89.545	ENSGALG00000000962	PUS3	96	89.545	Gallus_gallus
ENSAPLG00000013285	PUS3	97	50.787	ENSGAFG00000005615	pus3	90	51.685	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	51.236	ENSGACG00000002125	pus3	89	52.466	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000013285	PUS3	100	80.499	ENSGAGG00000000160	PUS3	89	80.499	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000013285	PUS3	100	69.710	ENSGGOG00000015047	PUS3	90	69.710	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000013285	PUS3	97	52.455	ENSHBUG00000016532	pus3	91	52.455	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	69.794	ENSHGLG00000000565	PUS3	89	69.794	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	62.615	ENSHGLG00000006599	-	86	62.615	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000013285	PUS3	63	72.662	ENSHGLG00000015753	-	77	72.662	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	62.673	ENSHGLG00000018861	-	91	62.673	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000013285	PUS3	66	63.574	ENSHGLG00100002435	-	98	63.574	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	67.202	ENSHGLG00100014825	-	89	67.202	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	59.908	ENSHGLG00100011339	-	90	59.908	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	53.899	ENSHGLG00100007519	-	84	53.899	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000013285	PUS3	71	69.206	ENSHGLG00100008656	-	98	69.206	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000013285	PUS3	50	62.443	ENSHGLG00100002139	-	84	62.443	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	52.874	ENSHCOG00000015705	pus3	91	52.874	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	54.505	ENSIPUG00000000105	pus3	89	54.505	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000013285	PUS3	57	30.634	ENSIPUG00000010387	pus1	63	30.634	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	68.778	ENSSTOG00000003721	PUS3	90	68.778	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	69.794	ENSJJAG00000011306	Pus3	90	69.794	Jaculus_jaculus
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	51.214	ENSKMAG00000016715	pus3	90	52.318	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	51.628	ENSLBEG00000004143	pus3	90	51.628	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	65.904	ENSLACG00000011161	PUS3	87	65.904	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	53.319	ENSLOCG00000011922	pus3	94	53.319	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	71.230	ENSLAFG00000000535	PUS3	88	71.230	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000013285	PUS3	100	69.507	ENSMFAG00000041002	PUS3	90	69.507	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000013285	PUS3	100	69.507	ENSMMUG00000041875	PUS3	90	69.507	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000013285	PUS3	100	69.507	ENSMNEG00000045347	PUS3	90	69.507	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000013285	PUS3	100	69.710	ENSMLEG00000029053	PUS3	90	69.710	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000013285	PUS3	97	53.795	ENSMAMG00000016741	pus3	90	54.464	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000013285	PUS3	97	52.796	ENSMZEG00005015950	pus3	91	52.796	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000013285	PUS3	87	90.339	ENSMGAG00000000851	PUS3	97	90.339	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000013285	PUS3	100	69.231	ENSMAUG00000015873	Pus3	90	69.231	Mesocricetus_auratus
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	69.374	ENSMICG00000032941	PUS3	88	69.374	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000013285	PUS3	100	68.778	ENSMOCG00000004901	Pus3	90	68.778	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	54.167	ENSMMOG00000013909	pus3	89	54.167	Mola_mola
ENSAPLG00000013285	PUS3	100	70.156	ENSMODG00000004222	PUS3	98	70.156	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	54.398	ENSMALG00000022420	pus3	90	54.398	Monopterus_albus
ENSAPLG00000013285	PUS3	100	67.929	MGP_CAROLIEiJ_G0031957	Pus3	99	68.196	Mus_caroli
ENSAPLG00000013285	PUS3	100	67.483	ENSMUSG00000032103	Pus3	99	67.890	Mus_musculus
ENSAPLG00000013285	PUS3	100	67.929	MGP_PahariEiJ_G0014822	Pus3	99	67.890	Mus_pahari
ENSAPLG00000013285	PUS3	100	67.929	MGP_SPRETEiJ_G0033081	Pus3	99	68.196	Mus_spretus
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	71.429	ENSMPUG00000006568	PUS3	89	71.429	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	69.910	ENSMLUG00000030636	PUS3	89	69.910	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	68.326	ENSNGAG00000013868	Pus3	90	68.326	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000013285	PUS3	97	52.796	ENSNBRG00000015864	pus3	92	52.796	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000013285	PUS3	100	68.919	ENSNLEG00000007460	PUS3	90	69.042	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000013285	PUS3	55	30.337	ENSMEUG00000011649	-	86	30.337	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000013285	PUS3	82	72.549	ENSMEUG00000014040	PUS3	74	72.549	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000013285	PUS3	99	69.021	ENSOPRG00000007888	-	90	69.021	Ochotona_princeps
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	68.265	ENSODEG00000004280	PUS3	89	68.265	Octodon_degus
ENSAPLG00000013285	PUS3	97	54.503	ENSONIG00000016224	pus3	97	53.034	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000013285	PUS3	99	70.975	ENSOANG00000000406	PUS3	90	70.068	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	68.879	ENSOCUG00000004468	PUS3	84	68.879	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	52.106	ENSORLG00000008445	pus3	91	52.106	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	52.328	ENSORLG00020008847	pus3	91	52.328	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	51.663	ENSORLG00015007438	pus3	91	51.663	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000013285	PUS3	57	30.035	ENSOMEG00000022655	pus1	59	30.035	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	53.288	ENSOMEG00000014321	pus3	90	53.288	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	69.142	ENSOGAG00000008913	PUS3	88	69.142	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	71.101	ENSOARG00000011870	PUS3	88	71.101	Ovis_aries
ENSAPLG00000013285	PUS3	100	69.595	ENSPPAG00000025809	PUS3	90	69.710	Pan_paniscus
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	70.737	ENSPPRG00000005662	PUS3	89	70.737	Panthera_pardus
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	70.737	ENSPTIG00000001192	PUS3	89	70.737	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000013285	PUS3	100	69.595	ENSPTRG00000004449	PUS3	90	69.710	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000013285	PUS3	100	69.488	ENSPANG00000013782	PUS3	90	69.488	Papio_anubis
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	54.505	ENSPKIG00000000646	pus3	92	54.505	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000013285	PUS3	100	78.685	ENSPSIG00000013961	PUS3	89	78.685	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000013285	PUS3	91	54.926	ENSPMGG00000000911	pus3	89	54.926	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPLG00000013285	PUS3	100	68.527	ENSPEMG00000009602	Pus3	90	68.527	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	72.055	ENSPCIG00000010225	PUS3	94	72.055	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000013285	PUS3	97	53.256	ENSPFOG00000009447	pus3	94	53.256	Poecilia_formosa
ENSAPLG00000013285	PUS3	97	51.236	ENSPLAG00000023343	pus3	90	51.236	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000013285	PUS3	97	51.236	ENSPMEG00000009870	pus3	90	51.236	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000013285	PUS3	72	55.988	ENSPREG00000003179	pus3	64	55.988	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000013285	PUS3	100	69.595	ENSPPYG00000004039	PUS3	90	69.595	Pongo_abelii
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	70.998	ENSPCAG00000000441	PUS3	88	70.998	Procavia_capensis
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	69.838	ENSPCOG00000019330	PUS3	88	69.838	Propithecus_coquereli
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	70.070	ENSPVAG00000002606	PUS3	88	70.070	Pteropus_vampyrus
ENSAPLG00000013285	PUS3	97	52.796	ENSPNYG00000019615	pus3	91	52.796	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	55.955	ENSPNAG00000014541	pus3	89	55.955	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000013285	PUS3	100	67.706	ENSRNOG00000012994	Pus3	91	67.706	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000013285	PUS3	100	69.388	ENSRBIG00000044456	PUS3	90	69.507	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000013285	PUS3	100	69.683	ENSRROG00000035245	PUS3	90	69.799	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000013285	PUS3	83	40.054	YFL001W	DEG1	78	40.054	Saccharomyces_cerevisiae
ENSAPLG00000013285	PUS3	100	68.468	ENSSBOG00000022433	PUS3	90	68.468	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	70.805	ENSSHAG00000001382	PUS3	89	70.805	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000013285	PUS3	97	56.977	ENSSFOG00015004850	pus3	91	56.977	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	52.527	ENSSMAG00000020340	pus3	91	53.407	Scophthalmus_maximus
ENSAPLG00000013285	PUS3	97	52.212	ENSSDUG00000020825	pus3	89	53.229	Seriola_dumerili
ENSAPLG00000013285	PUS3	97	52.193	ENSSLDG00000019932	pus3	89	52.193	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPLG00000013285	PUS3	71	68.139	ENSSARG00000013826	PUS3	97	68.139	Sorex_araneus
ENSAPLG00000013285	PUS3	99	78.490	ENSSPUG00000001412	PUS3	89	78.490	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	53.061	ENSSPAG00000019221	pus3	91	52.834	Stegastes_partitus
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	70.642	ENSSSCG00000015222	PUS3	88	70.642	Sus_scrofa
ENSAPLG00000013285	PUS3	100	76.818	ENSTGUG00000000778	-	99	76.818	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000013285	PUS3	97	50.787	ENSTRUG00000013050	pus3	94	50.787	Takifugu_rubripes
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	50.577	ENSTNIG00000004929	PUS3	90	50.577	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPLG00000013285	PUS3	83	50.000	ENSTNIG00000010307	pus3	92	50.000	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPLG00000013285	PUS3	100	67.191	ENSTBEG00000004382	PUS3	95	67.191	Tupaia_belangeri
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	71.789	ENSTTRG00000012167	PUS3	88	71.789	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	71.230	ENSUAMG00000009297	PUS3	88	71.230	Ursus_americanus
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	71.462	ENSUMAG00000001795	PUS3	88	71.462	Ursus_maritimus
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	70.136	ENSVPAG00000001495	PUS3	89	70.136	Vicugna_pacos
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	70.362	ENSVVUG00000020152	PUS3	89	70.362	Vulpes_vulpes
ENSAPLG00000013285	PUS3	98	56.410	ENSXETG00000024532	pus3	80	56.410	Xenopus_tropicalis
ENSAPLG00000013285	PUS3	57	62.055	ENSXMAG00000028945	pus3	84	62.055	Xiphophorus_maculatus
ENSAPLG00000013285	PUS3	97	53.256	ENSXMAG00000028016	pus3	90	53.256	Xiphophorus_maculatus
ENSAPLG00000013285	PUS3	72	58.176	ENSXMAG00000029934	pus3	74	58.176	Xiphophorus_maculatus
ENSAPLG00000013285	PUS3	72	58.360	ENSXMAG00000025659	PUS3	52	59.223	Xiphophorus_maculatus
ENSAPLG00000013285	PUS3	57	62.055	ENSXMAG00000025146	pus3	78	62.055	Xiphophorus_maculatus
ENSAPLG00000013285	PUS3	72	58.360	ENSXMAG00000025077	pus3	73	58.360	Xiphophorus_maculatus