EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000013871 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: POLR1A
Alias: -
Full Name: RNA polymerase I subunit A
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 27133 bases
Position: chrKB742833.1:482-27614
Accession: 101804624
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000013783	RNA_pol_Rpb1_5	PF04998.17	2.4e-102	1	1
ENSAPLP00000013783	RNA_pol_Rpb1_4	PF05000.17	3.8e-24	1	1
ENSAPLP00000013783	RNA_pol_Rpb1_2	PF00623.20	7.3e-70	1	1
ENSAPLP00000013783	RNA_pol_Rpb1_3	PF04983.18	3.1e-39	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000014548	POLR1A-201	4398	XM_005016218	ENSAPLP00000013783	1465 (aa)	XP_005016275	U3J2Q6

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000013871's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
apla03020	RNA polymerase	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000013871's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAPLG00000013871	POLR1A	74	32.678	ENSAPLG00000015878	POLR3A	68	33.333

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	72.967	ENSG00000068654	POLR1A	86	72.967	Homo_sapiens
ENSAPLG00000013871	POLR1A	64	70.899	ENSAPOG00000017945	polr1a	89	70.899	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	73.098	ENSAMEG00000005807	POLR1A	86	73.098	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000013871	POLR1A	98	68.053	ENSACIG00000022147	polr1a	88	67.152	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	67.226	ENSAOCG00000017336	polr1a	88	68.458	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	67.226	ENSAPEG00000016105	polr1a	88	67.122	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	67.391	ENSATEG00000016773	polr1a	86	66.510	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	73.265	ENSACAG00000012141	POLR1A	85	72.046	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	72.230	ENSANAG00000033927	POLR1A	86	72.900	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000013871	POLR1A	98	65.406	ENSACLG00000020541	polr1a	86	65.155	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	72.598	ENSBTAG00000006481	POLR1A	86	72.887	Bos_taurus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	98	41.281	WBGene00012999	rpoa-1	77	59.783	Caenorhabditis_elegans
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	71.911	ENSCJAG00000019547	POLR1A	86	72.764	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	73.048	ENSCAFG00000007613	POLR1A	86	73.090	Canis_familiaris
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	73.012	ENSCAFG00020014752	POLR1A	87	71.866	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	72.041	ENSCHIG00000018204	POLR1A	85	71.739	Capra_hircus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	72.049	ENSTSYG00000002761	POLR1A	86	71.496	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	68.566	ENSCAPG00000010132	POLR1A	88	68.222	Cavia_aperea
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	71.777	ENSCPOG00000012350	POLR1A	86	71.922	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	72.189	ENSCCAG00000019839	POLR1A	86	72.696	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	73.035	ENSCATG00000029786	POLR1A	86	73.035	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	72.196	ENSCLAG00000005187	POLR1A	85	71.814	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	72.874	ENSCSAG00000016251	POLR1A	86	73.103	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	100	81.046	ENSCPBG00000001115	POLR1A	86	81.046	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000013871	POLR1A	51	43.110	ENSCING00000007684	-	99	42.930	Ciona_intestinalis
ENSAPLG00000013871	POLR1A	95	54.875	ENSCSAVG00000007184	-	83	54.342	Ciona_savignyi
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	69.871	ENSCANG00000031785	POLR1A	86	70.007	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	96	77.573	ENSCGRG00001006651	Polr1a	85	77.573	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000013871	POLR1A	70	69.238	ENSCGRG00000010834	Polr1a	99	70.943	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	63.425	ENSCSEG00000020190	polr1a	86	63.014	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	64.453	ENSCVAG00000020941	polr1a	86	65.353	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	68.182	ENSDARG00000098375	polr1a	86	68.182	Danio_rerio
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	69.278	ENSDNOG00000010829	POLR1A	86	68.227	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	72.352	ENSDORG00000008298	Polr1a	84	72.082	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000013871	POLR1A	75	48.831	FBgn0019938	RpI1	84	46.617	Drosophila_melanogaster
ENSAPLG00000013871	POLR1A	67	87.097	ENSETEG00000000412	-	57	87.097	Echinops_telfairi
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	47.954	ENSEBUG00000005667	-	95	48.161	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	72.900	ENSEASG00005001625	POLR1A	86	73.103	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	94	79.387	ENSECAG00000036306	-	85	79.387	Equus_caballus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	94	79.387	ENSECAG00000030510	-	85	79.387	Equus_caballus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	94	79.387	ENSECAG00000010092	POLR1A	85	79.387	Equus_caballus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	82	85.714	ENSEEUG00000000676	POLR1A	70	85.714	Erinaceus_europaeus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	68.703	ENSELUG00000012769	polr1a	85	68.703	Esox_lucius
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	72.346	ENSFCAG00000008966	POLR1A	86	73.288	Felis_catus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	100	88.737	ENSFALG00000010082	POLR1A	87	88.881	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	71.992	ENSFDAG00000013726	POLR1A	86	71.486	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000013871	POLR1A	98	64.865	ENSFHEG00000005996	polr1a	85	64.924	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	62.203	ENSGMOG00000002230	polr1a	87	62.331	Gadus_morhua
ENSAPLG00000013871	POLR1A	88	91.789	ENSGALG00000038160	-	83	92.146	Gallus_gallus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	66.780	ENSGAFG00000015266	polr1a	87	66.508	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	65.676	ENSGACG00000018791	polr1a	86	65.946	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	100	81.305	ENSGAGG00000004984	-	95	81.305	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	73.035	ENSGGOG00000001788	POLR1A	86	73.035	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000013871	POLR1A	88	69.565	ENSHBUG00000020021	polr1a	85	69.857	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	72.173	ENSHGLG00000006334	POLR1A	86	71.978	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	71.930	ENSHGLG00100006614	POLR1A	86	71.736	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000013871	POLR1A	96	66.221	ENSHCOG00000003345	polr1a	86	66.879	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	68.360	ENSIPUG00000013174	polr1a	86	68.389	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	71.818	ENSSTOG00000012580	POLR1A	86	72.090	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	72.777	ENSJJAG00000013113	Polr1a	86	72.777	Jaculus_jaculus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	67.579	ENSKMAG00000007399	polr1a	85	66.463	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	96	69.041	ENSLBEG00000015401	polr1a	87	68.820	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	70.904	ENSLOCG00000010881	polr1a	86	71.128	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	73.148	ENSLAFG00000014948	POLR1A	85	73.283	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	73.171	ENSMFAG00000046097	POLR1A	86	73.171	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	73.171	ENSMMUG00000015815	POLR1A	86	73.171	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	73.171	ENSMNEG00000043313	POLR1A	86	73.171	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	72.629	ENSMLEG00000042428	POLR1A	86	72.629	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	67.735	ENSMAMG00000016565	polr1a	86	66.870	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	67.573	ENSMZEG00005004915	polr1a	85	67.323	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000013871	POLR1A	100	88.503	ENSMGAG00000013111	POLR1A	85	88.587	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	72.136	ENSMAUG00000008497	Polr1a	93	73.383	Mesocricetus_auratus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	72.241	ENSMICG00000000757	POLR1A	86	72.309	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	72.388	ENSMOCG00000000122	Polr1a	85	72.653	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	65.531	ENSMMOG00000010216	polr1a	86	64.929	Mola_mola
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	68.460	ENSMODG00000009335	POLR1A	86	68.510	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	67.418	ENSMALG00000013363	polr1a	91	66.893	Monopterus_albus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	72.079	MGP_CAROLIEiJ_G0028494	Polr1a	99	65.390	Mus_caroli
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	72.283	ENSMUSG00000049553	Polr1a	99	65.563	Mus_musculus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	72.622	MGP_PahariEiJ_G0022230	Polr1a	99	66.133	Mus_pahari
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	70.761	MGP_SPRETEiJ_G0029499	Polr1a	99	66.445	Mus_spretus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	73.406	ENSMPUG00000009135	POLR1A	86	73.207	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	71.922	ENSMLUG00000015723	POLR1A	85	72.297	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	72.196	ENSNGAG00000017907	Polr1a	85	71.727	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	67.573	ENSNBRG00000000519	polr1a	85	67.391	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	70.671	ENSNLEG00000002264	POLR1A	86	70.889	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000013871	POLR1A	71	89.683	ENSMEUG00000011665	-	61	89.683	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000013871	POLR1A	98	69.448	ENSOPRG00000008269	POLR1A	85	69.634	Ochotona_princeps
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	72.079	ENSODEG00000003542	POLR1A	86	72.279	Octodon_degus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	67.459	ENSONIG00000015895	polr1a	86	67.344	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	73.202	ENSOCUG00000010138	POLR1A	86	73.202	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	66.667	ENSORLG00000008753	polr1a	85	66.531	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	65.068	ENSORLG00020020726	polr1a	86	64.874	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000013871	POLR1A	98	65.813	ENSORLG00015016071	polr1a	89	65.677	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	72.290	ENSOGAG00000004031	POLR1A	86	72.260	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	72.151	ENSOARG00000020601	POLR1A	86	72.807	Ovis_aries
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	72.967	ENSPPAG00000042450	POLR1A	86	72.967	Pan_paniscus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	73.153	ENSPPRG00000006702	POLR1A	86	72.807	Panthera_pardus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	72.654	ENSPTIG00000018783	POLR1A	86	72.312	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	72.200	ENSPTRG00000012147	POLR1A	86	73.103	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	72.967	ENSPANG00000025908	POLR1A	86	72.967	Papio_anubis
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	67.637	ENSPKIG00000005468	polr1a	90	66.957	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000013871	POLR1A	73	77.839	ENSPSIG00000009321	-	100	77.839	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	72.117	ENSPEMG00000022224	Polr1a	85	72.999	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000013871	POLR1A	94	72.538	ENSPCIG00000004222	POLR1A	84	72.434	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	66.893	ENSPFOG00000005025	polr1a	86	66.577	Poecilia_formosa
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	66.329	ENSPLAG00000021389	polr1a	86	66.644	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000013871	POLR1A	97	66.597	ENSPMEG00000006463	polr1a	86	66.141	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	67.459	ENSPREG00000002389	polr1a	88	66.014	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	72.222	ENSPPYG00000012217	POLR1A	86	72.222	Pongo_abelii
ENSAPLG00000013871	POLR1A	89	77.586	ENSPCAG00000011582	POLR1A	76	77.586	Procavia_capensis
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	72.200	ENSPCOG00000026987	POLR1A	86	72.402	Propithecus_coquereli
ENSAPLG00000013871	POLR1A	92	69.735	ENSPVAG00000012674	POLR1A	81	70.830	Pteropus_vampyrus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	67.505	ENSPNYG00000000026	polr1a	85	67.255	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	69.090	ENSPNAG00000019223	polr1a	89	69.194	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	72.907	ENSRNOG00000009545	Polr1a	85	73.043	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	73.035	ENSRBIG00000028335	POLR1A	86	73.035	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	73.035	ENSRROG00000031473	POLR1A	97	71.391	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	38.525	YOR341W	RPA190	81	38.305	Saccharomyces_cerevisiae
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	71.630	ENSSBOG00000030262	POLR1A	86	72.764	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	67.995	ENSSHAG00000014739	POLR1A	85	68.065	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	69.319	ENSSFOG00015019716	polr1a	86	68.784	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	67.547	ENSSMAG00000014342	polr1a	88	68.094	Scophthalmus_maximus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	68.614	ENSSDUG00000014631	polr1a	86	68.581	Seriola_dumerili
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	67.577	ENSSLDG00000024095	polr1a	87	68.119	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPLG00000013871	POLR1A	71	92.683	ENSSARG00000003136	-	62	92.683	Sorex_araneus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	75.528	ENSSPUG00000004215	POLR1A	83	81.443	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	63	69.817	ENSSPAG00000016341	polr1a	81	70.197	Stegastes_partitus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	80	75.127	ENSSSCG00000008226	POLR1A	82	75.042	Sus_scrofa
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	87.798	ENSTGUG00000010704	POLR1A	87	87.798	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	63.795	ENSTRUG00000002210	polr1a	86	64.315	Takifugu_rubripes
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	59.854	ENSTNIG00000010116	polr1a	85	59.907	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPLG00000013871	POLR1A	64	86.283	ENSTBEG00000008646	POLR1A	55	86.283	Tupaia_belangeri
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	69.633	ENSTTRG00000008597	POLR1A	86	69.633	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	80	72.666	ENSUAMG00000012158	-	94	72.673	Ursus_americanus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	72.283	ENSUMAG00000006700	POLR1A	86	72.358	Ursus_maritimus
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	72.931	ENSVVUG00000001245	POLR1A	86	72.955	Vulpes_vulpes
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	68.268	ENSXETG00000001952	polr1a	85	68.400	Xenopus_tropicalis
ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	66.712	ENSXMAG00000004032	polr1a	85	66.824	Xiphophorus_maculatus