EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000013873 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SMARCA2
Alias: -
Full Name: SWI/SNF related%2C matrix associated%2C actin dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C member 2
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 111164 bases
Position: chrKB742554.1:3161074-3272237
Accession: 101790842
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000013790	ResIII	PF04851.15	1.9e-07	1	1
ENSAPLP00000013790	BRK	PF07533.16	8.1e-18	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000014555	SMARCA2-201	5024	XM_005011612	ENSAPLP00000013790	1500 (aa)	XP_005011669	U3J2R3

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000013873's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000013873's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	68	82.313	ENSAPLG00000015503	SMARCA4	81	82.782

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	95	89.536	ENSG00000080503	SMARCA2	99	98.000	Homo_sapiens
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	77.747	ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	77.794	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	85.977	ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	85.947	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	77.507	ENSACIG00000015607	SMARCA2	87	77.921	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	77.847	ENSAOCG00000009647	-	87	78.091	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	77.871	ENSAPEG00000007646	SMARCA2	96	77.738	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	78.512	ENSATEG00000006916	SMARCA2	86	78.985	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	89.753	ENSACAG00000002423	SMARCA2	89	90.078	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	90.304	ENSANAG00000026498	SMARCA2	98	89.329	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	75	85.374	ENSACLG00000004248	SMARCA2	87	78.947	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	80.600	ENSAMXG00000012404	smarca2	87	80.689	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	90.092	ENSBTAG00000007494	SMARCA2	89	90.234	Bos_taurus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	94	90.021	ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	90.021	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	94	89.595	ENSCAFG00000002013	SMARCA2	89	90.375	Canis_familiaris
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	72	93.228	ENSCAFG00020026802	SMARCA2	87	93.228	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	90.092	ENSCHIG00000025863	SMARCA2	89	90.234	Capra_hircus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	86.309	ENSTSYG00000003858	SMARCA2	94	87.642	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	94	85.216	ENSCAPG00000002890	SMARCA2	89	85.826	Cavia_aperea
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	94	88.773	ENSCPOG00000005475	SMARCA2	89	89.936	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	94	89.735	ENSCCAG00000030636	SMARCA2	98	89.399	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	100	84.695	ENSCATG00000031470	SMARCA2	99	89.410	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	94	88.835	ENSCLAG00000014484	SMARCA2	89	89.250	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	90.304	ENSCSAG00000008650	SMARCA2	95	90.261	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	85	84.726	ENSCHOG00000004316	SMARCA2	80	84.438	Choloepus_hoffmanni
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	100	86.074	ENSCPBG00000025463	SMARCA2	98	86.074	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	98	88.204	ENSCANG00000039597	SMARCA2	98	90.409	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	94	83.474	ENSCGRG00001002323	Smarca2	89	84.413	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	74.066	ENSCSEG00000019311	SMARCA2	86	74.194	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	89	76.535	ENSCVAG00000016571	SMARCA2	95	77.217	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	80.856	ENSDARG00000008904	smarca2	87	80.808	Danio_rerio
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	90.197	ENSDNOG00000006402	SMARCA2	89	90.268	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	94	89.106	ENSDORG00000014832	Smarca2	90	88.920	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	92	70.763	ENSEBUG00000011442	-	90	70.410	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	68	69.738	ENSEBUG00000002449	-	88	61.946	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	90.304	ENSEASG00005010312	SMARCA2	89	90.517	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	61	87.500	ENSEEUG00000015540	-	61	84.722	Erinaceus_europaeus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	92	76.977	ENSELUG00000010318	smarca2	94	76.327	Esox_lucius
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	94	89.246	ENSFCAG00000001568	SMARCA2	89	90.092	Felis_catus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	100	87.476	ENSFALG00000010416	SMARCA2	98	87.476	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	88.347	ENSFDAG00000010502	SMARCA2	89	88.881	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	77.978	ENSFHEG00000021250	SMARCA2	87	78.658	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	92	75.777	ENSGMOG00000014229	SMARCA2	87	76.828	Gadus_morhua
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	93.967	ENSGALG00000010164	SMARCA2	89	94.180	Gallus_gallus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	71	82.013	ENSGAFG00000001164	SMARCA2	83	76.064	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	77.330	ENSGACG00000014488	SMARCA2	88	77.233	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	100	86.138	ENSGAGG00000024412	SMARCA2	98	86.138	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	72	95.163	ENSGGOG00000000513	SMARCA2	73	94.312	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	78.606	ENSHBUG00000006691	SMARCA2	87	77.983	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	88.347	ENSHGLG00000005215	SMARCA2	89	88.539	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	94	88.039	ENSHGLG00100010496	SMARCA2	89	89.530	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	73.042	ENSHCOG00000015348	-	97	72.820	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	80.167	ENSIPUG00000011060	smarca2	94	79.403	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	94	88.727	ENSSTOG00000006812	SMARCA2	89	89.958	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	94	88.440	ENSJJAG00000010867	Smarca2	89	89.880	Jaculus_jaculus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	77.701	ENSKMAG00000015844	-	87	78.344	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	51	73.058	ENSLACG00000000270	SMARCA2	87	84.073	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	96	79.728	ENSLOCG00000011499	smarca2	91	81.212	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	89.422	ENSLAFG00000014061	SMARCA2	89	89.704	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	94	89.381	ENSMFAG00000003814	SMARCA2	98	90.199	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	98	88.472	ENSMMUG00000015279	SMARCA2	99	87.393	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	98	87.684	ENSMNEG00000041069	SMARCA2	99	89.816	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	74	95.063	ENSMLEG00000027418	SMARCA2	99	89.694	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	79.075	ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	78.107	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	77.640	ENSMZEG00005020709	SMARCA2	87	78.348	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	80	78.336	ENSMGAG00000005160	-	100	78.468	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	90.234	ENSMICG00000005162	SMARCA2	99	89.268	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	94	88.657	ENSMOCG00000001611	Smarca2	89	89.958	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	100	74.254	ENSMMOG00000014196	SMARCA2	89	77.834	Mola_mola
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	90.658	ENSMODG00000003578	SMARCA2	89	91.366	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	77.919	ENSMALG00000009611	SMARCA2	86	78.020	Monopterus_albus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	89	97.904	MGP_CAROLIEiJ_G0022841	Smarca2	98	87.517	Mus_caroli
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	98	88.132	ENSMUSG00000024921	Smarca2	99	98.000	Mus_musculus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	89	97.904	MGP_PahariEiJ_G0014334	Smarca2	98	87.643	Mus_pahari
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	98	87.736	MGP_SPRETEiJ_G0023759	Smarca2	90	100.000	Mus_spretus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	74	94.614	ENSMPUG00000005171	SMARCA2	81	94.869	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	84.280	ENSMLUG00000002342	SMARCA2	89	84.423	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	99	82.896	ENSNGAG00000000108	Smarca2	89	88.059	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	95	66.437	ENSNBRG00000017998	SMARCA2	94	81.463	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	79	92.119	ENSNLEG00000008575	SMARCA2	98	88.675	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	85.269	ENSMEUG00000009812	SMARCA2	88	85.977	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	73	90.228	ENSOPRG00000013474	SMARCA2	89	84.653	Ochotona_princeps
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	94	88.338	ENSODEG00000005452	SMARCA2	89	89.044	Octodon_degus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	78.315	ENSONIG00000014163	SMARCA2	87	77.918	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	51	93.229	ENSOANG00000008299	-	95	95.984	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	73	96.347	ENSOCUG00000006320	SMARCA2	89	90.007	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	95	76.330	ENSORLG00000020820	SMARCA2	99	76.446	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	95	77.055	ENSORLG00015006289	SMARCA2	99	76.297	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	78.925	ENSOMEG00000009736	-	92	78.814	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	89.758	ENSOARG00000013265	SMARCA2	89	89.815	Ovis_aries
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	100	83.020	ENSPPAG00000038717	SMARCA2	98	89.329	Pan_paniscus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	94	89.316	ENSPPRG00000001879	SMARCA2	89	90.163	Panthera_pardus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	100	84.610	ENSPTRG00000051168	SMARCA2	98	90.638	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	94	83.264	ENSPANG00000025121	SMARCA2	89	84.266	Papio_anubis
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	81.728	ENSPKIG00000018469	-	89	81.637	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	100	85.834	ENSPSIG00000006284	SMARCA2	98	85.834	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	99	70.344	ENSPMGG00000013696	-	89	75.615	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	94	88.162	ENSPEMG00000019821	Smarca2	89	88.606	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	70.861	ENSPMAG00000005337	-	89	71.053	Petromyzon_marinus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	90.375	ENSPCIG00000015658	SMARCA2	89	91.083	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	78.086	ENSPFOG00000001856	SMARCA2	87	78.623	Poecilia_formosa
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	77.970	ENSPLAG00000017829	SMARCA2	85	78.267	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	77.762	ENSPMEG00000001815	-	87	78.245	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	100	74.308	ENSPREG00000013800	SMARCA2	89	78.521	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	100	85.071	ENSPPYG00000019258	SMARCA2	98	85.071	Pongo_abelii
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	71	79.298	ENSPCAG00000016969	SMARCA2	67	79.298	Procavia_capensis
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	98	85.198	ENSPCOG00000025709	SMARCA2	99	87.846	Propithecus_coquereli
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	83	89.179	ENSPVAG00000000901	SMARCA2	82	89.810	Pteropus_vampyrus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	75.192	ENSPNYG00000004533	SMARCA2	87	75.267	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	81.207	ENSPNAG00000014635	smarca2	86	81.375	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	98	87.238	ENSRNOG00000011931	Smarca2	98	87.114	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	98	87.693	ENSRBIG00000038618	SMARCA2	99	89.653	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	98	86.954	ENSRROG00000019271	SMARCA2	99	90.496	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	100	83.871	ENSSBOG00000034827	SMARCA2	98	83.871	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	90.870	ENSSHAG00000007884	SMARCA2	98	85.171	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	97	81.756	ENSSFOG00015014870	SMARCA2	99	81.212	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	77.786	ENSSMAG00000013707	SMARCA2	89	77.693	Scophthalmus_maximus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	77.336	ENSSDUG00000008852	-	86	78.396	Seriola_dumerili
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	77.260	ENSSLDG00000025449	SMARCA2	86	77.378	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	88	74.981	ENSSARG00000007888	SMARCA2	83	75.056	Sorex_araneus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	98	82.533	ENSSPUG00000001629	SMARCA2	95	84.997	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	77.593	ENSSPAG00000020091	-	89	77.263	Stegastes_partitus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	90.163	ENSSSCG00000005232	SMARCA2	89	90.375	Sus_scrofa
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	100	87.282	ENSTGUG00000005460	SMARCA2	98	87.282	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	77.141	ENSTRUG00000015619	SMARCA2	87	77.354	Takifugu_rubripes
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	65	100.000	ENSTBEG00000008767	SMARCA2	66	100.000	Tupaia_belangeri
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	94	88.571	ENSTTRG00000002033	SMARCA2	89	89.099	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	96	87.908	ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	89.787	Ursus_americanus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	84	87.050	ENSVPAG00000001204	SMARCA2	86	86.897	Vicugna_pacos
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	72	93.142	ENSVVUG00000004598	SMARCA2	89	93.142	Vulpes_vulpes
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	82.076	ENSXETG00000015299	smarca2	89	81.730	Xenopus_tropicalis
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	75	82.548	ENSXCOG00000011073	SMARCA2	97	76.823	Xiphophorus_couchianus
ENSAPLG00000013873	SMARCA2	74	84.996	ENSXMAG00000015611	SMARCA2	89	78.870	Xiphophorus_maculatus