EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000014051 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: POP4
Alias: -
Full Name: POP4 homolog%2C ribonuclease P/MRP subunit
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2432 bases
Position: chrKB743157.1:1739284-1741715
Accession: 101793838
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000013879	UPF0086	PF01868.16	1.7e-26	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000014646	POP4-201	867	XM_005020263	ENSAPLP00000013879	207 (aa)	XP_005020320	R0LK83

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000014051's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
apla03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG
apla03013	RNA transport	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000014051's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000014051	POP4	100	72.464	ENSG00000105171	POP4	100	85.417	Homo_sapiens
ENSAPLG00000014051	POP4	95	71.574	ENSAMEG00000018329	-	90	71.574	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000014051	POP4	95	63.317	ENSAMEG00000003172	-	89	63.317	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000014051	POP4	98	61.881	ENSACIG00000008358	pop4	96	61.386	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000014051	POP4	97	60.891	ENSAOCG00000010116	pop4	98	59.901	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000014051	POP4	98	60.294	ENSAPEG00000002829	pop4	86	59.314	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000014051	POP4	94	62.437	ENSATEG00000013028	pop4	89	61.421	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000014051	POP4	98	74.257	ENSANAG00000020295	POP4	92	74.257	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000014051	POP4	98	60.891	ENSACLG00000000526	pop4	91	60.891	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000014051	POP4	98	59.406	ENSAMXG00000002899	pop4	92	59.406	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000014051	POP4	98	74.752	ENSBTAG00000002223	POP4	92	74.752	Bos_taurus
ENSAPLG00000014051	POP4	98	75.369	ENSCJAG00000046750	POP4	100	77.778	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000014051	POP4	88	73.077	ENSCAFG00000007630	POP4	100	73.077	Canis_familiaris
ENSAPLG00000014051	POP4	98	74.752	ENSCHIG00000016743	POP4	90	76.142	Capra_hircus
ENSAPLG00000014051	POP4	95	71.939	ENSTSYG00000003488	POP4	89	71.939	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000014051	POP4	98	52.475	ENSCAPG00000011105	POP4	89	52.475	Cavia_aperea
ENSAPLG00000014051	POP4	98	71.782	ENSCPOG00000002992	POP4	92	71.782	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000014051	POP4	98	72.772	ENSCCAG00000020285	-	92	72.772	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000014051	POP4	98	65.347	ENSCCAG00000034244	-	90	65.347	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000014051	POP4	98	73.762	ENSCATG00000036022	POP4	100	85.417	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000014051	POP4	95	73.096	ENSCLAG00000013162	POP4	90	73.096	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000014051	POP4	98	74.257	ENSCSAG00000004868	POP4	93	74.257	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000014051	POP4	98	51.980	ENSCHOG00000002071	POP4	91	52.792	Choloepus_hoffmanni
ENSAPLG00000014051	POP4	98	84.653	ENSCPBG00000016132	POP4	92	84.653	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000014051	POP4	59	37.398	ENSCING00000023871	-	62	37.398	Ciona_intestinalis
ENSAPLG00000014051	POP4	98	73.762	ENSCANG00000005924	POP4	100	73.762	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000014051	POP4	98	71.287	ENSCGRG00001017185	Pop4	89	71.574	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000014051	POP4	98	71.287	ENSCGRG00000008155	Pop4	89	71.574	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000014051	POP4	98	53.695	ENSCSEG00000002946	pop4	92	53.695	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000014051	POP4	98	42.512	ENSCVAG00000018602	POP4	91	42.512	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000014051	POP4	98	62.871	ENSDARG00000101472	pop4	92	62.871	Danio_rerio
ENSAPLG00000014051	POP4	98	72.277	ENSDNOG00000047663	POP4	79	73.604	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000014051	POP4	73	65.789	ENSDORG00000008577	Pop4	88	65.789	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000014051	POP4	73	34.375	FBgn0035831	CG8038	66	34.815	Drosophila_melanogaster
ENSAPLG00000014051	POP4	97	58.500	ENSETEG00000003607	POP4	92	58.500	Echinops_telfairi
ENSAPLG00000014051	POP4	99	42.466	ENSEBUG00000004305	pop4	94	42.466	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000014051	POP4	95	47.619	ENSEBUG00000010447	pop4	82	47.619	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000014051	POP4	98	44.335	ENSEBUG00000008575	pop4	91	44.335	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000014051	POP4	95	78.846	ENSECAG00000020206	POP4	81	78.846	Equus_caballus
ENSAPLG00000014051	POP4	96	53.535	ENSEEUG00000013109	POP4	99	53.535	Erinaceus_europaeus
ENSAPLG00000014051	POP4	96	62.312	ENSELUG00000019812	pop4	90	62.312	Esox_lucius
ENSAPLG00000014051	POP4	95	73.604	ENSFCAG00000001619	POP4	90	73.604	Felis_catus
ENSAPLG00000014051	POP4	98	86.139	ENSFALG00000000206	POP4	90	86.139	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000014051	POP4	95	72.081	ENSFDAG00000017859	POP4	90	72.081	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000014051	POP4	96	53.960	ENSFHEG00000012745	pop4	91	52.970	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000014051	POP4	96	59.204	ENSGMOG00000000335	pop4	99	58.416	Gadus_morhua
ENSAPLG00000014051	POP4	98	87.624	ENSGALG00000041972	POP4	85	87.624	Gallus_gallus
ENSAPLG00000014051	POP4	76	51.250	ENSGAFG00000003571	pop4	88	50.000	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000014051	POP4	98	58.824	ENSGACG00000014510	pop4	91	58.824	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000014051	POP4	98	84.158	ENSGAGG00000024544	POP4	73	84.158	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000014051	POP4	100	72.464	ENSGGOG00000038346	POP4	94	72.464	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000014051	POP4	98	60.891	ENSHBUG00000021821	pop4	91	60.891	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000014051	POP4	95	73.096	ENSHGLG00000015798	POP4	90	73.096	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000014051	POP4	95	73.096	ENSHGLG00100009737	POP4	90	73.096	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000014051	POP4	98	60.488	ENSHCOG00000020937	pop4	91	60.488	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000014051	POP4	100	55.981	ENSIPUG00000013652	pop4	95	55.981	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000014051	POP4	98	71.287	ENSSTOG00000011016	POP4	92	71.287	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000014051	POP4	97	73.000	ENSJJAG00000013376	Pop4	90	73.000	Jaculus_jaculus
ENSAPLG00000014051	POP4	98	62.255	ENSKMAG00000012250	pop4	91	62.439	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000014051	POP4	94	56.122	ENSLBEG00000014139	pop4	88	54.822	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000014051	POP4	94	56.122	ENSLBEG00000018846	-	88	54.822	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000014051	POP4	98	68.812	ENSLACG00000008581	POP4	91	68.812	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000014051	POP4	98	70.792	ENSLOCG00000005597	pop4	92	70.792	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000014051	POP4	98	71.782	ENSLAFG00000000084	POP4	92	71.782	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000014051	POP4	98	74.257	ENSMFAG00000029606	POP4	92	74.257	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000014051	POP4	98	74.384	ENSMMUG00000017424	POP4	92	74.384	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000014051	POP4	98	74.384	ENSMNEG00000031374	POP4	92	74.384	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000014051	POP4	98	74.752	ENSMLEG00000043454	POP4	92	74.752	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000014051	POP4	90	62.766	ENSMAMG00000011716	pop4	91	59.804	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000014051	POP4	98	60.891	ENSMZEG00005002360	pop4	91	60.891	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000014051	POP4	98	87.624	ENSMGAG00000005337	POP4	90	87.624	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000014051	POP4	98	70.297	ENSMAUG00000020110	Pop4	90	71.574	Mesocricetus_auratus
ENSAPLG00000014051	POP4	98	68.317	ENSMICG00000035730	POP4	91	68.317	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000014051	POP4	98	60.891	ENSMMOG00000015321	pop4	91	60.891	Mola_mola
ENSAPLG00000014051	POP4	98	72.772	ENSMODG00000029406	POP4	87	72.772	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000014051	POP4	98	61.881	ENSMALG00000012571	pop4	92	61.576	Monopterus_albus
ENSAPLG00000014051	POP4	98	71.921	MGP_CAROLIEiJ_G0029600	Pop4	90	72.727	Mus_caroli
ENSAPLG00000014051	POP4	95	72.222	ENSMUSG00000030423	Pop4	90	71.717	Mus_musculus
ENSAPLG00000014051	POP4	98	71.287	MGP_SPRETEiJ_G0030699	Pop4	89	71.574	Mus_spretus
ENSAPLG00000014051	POP4	95	63.131	ENSMPUG00000008063	-	89	63.131	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000014051	POP4	95	72.081	ENSMPUG00000008041	-	90	72.081	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000014051	POP4	95	55.051	ENSMLUG00000010774	POP4	90	55.051	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000014051	POP4	60	76.000	ENSMEUG00000003636	-	100	76.000	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000014051	POP4	95	73.096	ENSOPRG00000004736	POP4	99	73.096	Ochotona_princeps
ENSAPLG00000014051	POP4	95	72.081	ENSODEG00000013025	POP4	93	72.081	Octodon_degus
ENSAPLG00000014051	POP4	98	61.881	ENSONIG00000003458	pop4	90	61.881	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000014051	POP4	95	73.604	ENSOCUG00000015974	POP4	90	73.604	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000014051	POP4	99	58.738	ENSORLG00000020317	pop4	93	57.971	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000014051	POP4	98	58.333	ENSORLG00015011624	pop4	91	57.561	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000014051	POP4	98	60.294	ENSOMEG00000002538	pop4	91	60.294	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000014051	POP4	98	70.792	ENSOGAG00000011168	POP4	92	70.792	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000014051	POP4	95	76.142	ENSOARG00000004041	POP4	89	76.142	Ovis_aries
ENSAPLG00000014051	POP4	100	72.464	ENSPPAG00000040372	POP4	94	72.464	Pan_paniscus
ENSAPLG00000014051	POP4	95	73.604	ENSPPRG00000010502	POP4	90	73.604	Panthera_pardus
ENSAPLG00000014051	POP4	95	73.604	ENSPTIG00000016598	POP4	90	73.604	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000014051	POP4	100	72.464	ENSPTRG00000010779	POP4	94	72.464	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000014051	POP4	98	74.257	ENSPANG00000008546	POP4	92	74.257	Papio_anubis
ENSAPLG00000014051	POP4	99	63.592	ENSPKIG00000004468	pop4	90	63.592	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000014051	POP4	98	84.653	ENSPSIG00000015690	POP4	100	84.158	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000014051	POP4	97	54.634	ENSPMGG00000008608	pop4	98	54.634	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPLG00000014051	POP4	98	57.426	ENSPEMG00000019982	-	92	57.426	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000014051	POP4	99	70.388	ENSPEMG00000014034	-	94	70.388	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000014051	POP4	88	49.495	ENSPMAG00000006265	pop4	100	49.495	Petromyzon_marinus
ENSAPLG00000014051	POP4	98	73.762	ENSPCIG00000024738	POP4	87	73.762	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000014051	POP4	98	57.143	ENSPFOG00000000925	pop4	91	56.650	Poecilia_formosa
ENSAPLG00000014051	POP4	98	57.143	ENSPLAG00000003161	pop4	91	56.650	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000014051	POP4	98	57.143	ENSPMEG00000002475	pop4	91	56.650	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000014051	POP4	95	57.360	ENSPREG00000022403	pop4	85	56.853	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000014051	POP4	100	72.947	ENSPPYG00000009805	POP4	94	72.947	Pongo_abelii
ENSAPLG00000014051	POP4	97	67.662	ENSPCAG00000007737	POP4	91	67.662	Procavia_capensis
ENSAPLG00000014051	POP4	96	72.362	ENSPCOG00000018055	POP4	89	72.362	Propithecus_coquereli
ENSAPLG00000014051	POP4	95	70.051	ENSPVAG00000006069	POP4	90	70.051	Pteropus_vampyrus
ENSAPLG00000014051	POP4	98	61.881	ENSPNYG00000020038	pop4	91	61.881	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000014051	POP4	94	60.309	ENSPNAG00000005591	pop4	92	57.921	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000014051	POP4	98	70.936	ENSRNOG00000027646	Pop4	90	71.717	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000014051	POP4	77	69.182	ENSRBIG00000044769	POP4	89	71.739	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000014051	POP4	98	73.762	ENSRROG00000028903	POP4	92	73.762	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000014051	POP4	61	33.094	YBR257W	-	50	33.094	Saccharomyces_cerevisiae
ENSAPLG00000014051	POP4	98	73.267	ENSSBOG00000032445	POP4	92	73.267	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000014051	POP4	98	74.752	ENSSHAG00000016888	POP4	92	74.752	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000014051	POP4	98	62.376	ENSSFOG00015014556	pop4	90	62.376	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000014051	POP4	97	61.084	ENSSMAG00000016611	pop4	95	61.084	Scophthalmus_maximus
ENSAPLG00000014051	POP4	98	58.824	ENSSDUG00000019865	pop4	82	57.843	Seriola_dumerili
ENSAPLG00000014051	POP4	98	58.824	ENSSLDG00000001763	pop4	91	57.843	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPLG00000014051	POP4	95	73.604	ENSSARG00000004748	POP4	91	73.604	Sorex_araneus
ENSAPLG00000014051	POP4	98	62.255	ENSSPAG00000014364	pop4	91	61.275	Stegastes_partitus
ENSAPLG00000014051	POP4	98	73.267	ENSSSCG00000002854	POP4	92	73.267	Sus_scrofa
ENSAPLG00000014051	POP4	97	91.500	ENSTGUG00000008953	POP4	100	91.500	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000014051	POP4	98	59.606	ENSTNIG00000006401	pop4	100	59.606	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPLG00000014051	POP4	94	73.846	ENSTBEG00000002194	POP4	88	74.872	Tupaia_belangeri
ENSAPLG00000014051	POP4	98	75.248	ENSTTRG00000005882	POP4	92	75.248	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000014051	POP4	95	72.081	ENSUAMG00000003049	-	90	72.081	Ursus_americanus
ENSAPLG00000014051	POP4	95	72.081	ENSUMAG00000007522	-	90	72.081	Ursus_maritimus
ENSAPLG00000014051	POP4	95	72.081	ENSVVUG00000016876	-	69	72.081	Vulpes_vulpes
ENSAPLG00000014051	POP4	98	72.772	ENSXETG00000017598	pop4	92	72.772	Xenopus_tropicalis
ENSAPLG00000014051	POP4	95	57.789	ENSXCOG00000017695	pop4	85	56.784	Xiphophorus_couchianus
ENSAPLG00000014051	POP4	95	57.789	ENSXMAG00000013862	pop4	85	56.784	Xiphophorus_maculatus