EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000015235 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: POLR2F
Alias: -
Full Name: RNA polymerase II subunit F
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4024 bases
Position: chrKB742823.1:298811-302834
Accession: 101804077
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000015095	RNA_pol_Rpb6	PF01192.22	4e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000015885	POLR2F-201	455	XM_005015955	ENSAPLP00000015095	125 (aa)	XP_005016012	U3J6G8

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000015235's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
apla03020	RNA polymerase	KEGG
apla04623	Cytosolic DNA-sensing pathway	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000015235's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000015235	POLR2F	96	97.500	ENSG00000100142	POLR2F	98	97.500	Homo_sapiens
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	88.679	ENSAPOG00000002902	polr2f	80	89.109	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	97.170	ENSAMEG00000010331	POLR2F	80	98.020	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	88.679	ENSACIG00000000923	polr2f	80	89.109	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	89.623	ENSAOCG00000003182	polr2f	80	90.099	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	89.623	ENSAPEG00000012999	polr2f	80	90.099	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	88.679	ENSATEG00000008929	polr2f	80	89.109	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	98.113	ENSACAG00000015288	POLR2F	80	99.010	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000015235	POLR2F	96	97.500	ENSANAG00000020840	POLR2F	98	97.500	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	89.623	ENSACLG00000016129	polr2f	80	90.099	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	88.679	ENSAMXG00000012812	polr2f	80	89.109	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	97.170	ENSBTAG00000004820	POLR2F	80	98.020	Bos_taurus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	67	73.810	WBGene00007355	rpb-6	68	70.213	Caenorhabditis_elegans
ENSAPLG00000015235	POLR2F	96	97.500	ENSCJAG00000048241	POLR2F	98	97.500	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	97.170	ENSCAFG00000001437	POLR2F	80	98.020	Canis_familiaris
ENSAPLG00000015235	POLR2F	96	97.500	ENSCHIG00000012907	POLR2F	94	97.500	Capra_hircus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	96.226	ENSTSYG00000008187	POLR2F	79	98.000	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000015235	POLR2F	96	97.500	ENSCAPG00000013419	POLR2F	94	97.500	Cavia_aperea
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	97.170	ENSCPOG00000034094	POLR2F	80	98.020	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	97.170	ENSCCAG00000036489	POLR2F	80	98.020	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	96	97.500	ENSCATG00000041014	POLR2F	98	97.500	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000015235	POLR2F	96	97.500	ENSCLAG00000017167	POLR2F	92	97.500	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	97.170	ENSCSAG00000006862	POLR2F	80	98.020	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	96	98.333	ENSCPBG00000023030	POLR2F	62	98.333	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000015235	POLR2F	82	76.699	ENSCING00000019359	-	69	79.592	Ciona_intestinalis
ENSAPLG00000015235	POLR2F	96	97.500	ENSCANG00000041884	POLR2F	98	97.500	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	97.170	ENSCGRG00001023541	POLR2F	80	98.020	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	97.170	ENSCGRG00000011921	POLR2F	80	98.020	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	89.623	ENSCSEG00000006848	polr2f	80	90.099	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000015235	POLR2F	100	84.000	ENSCVAG00000010437	polr2f	80	89.109	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	88.679	ENSDARG00000036625	polr2f	80	89.109	Danio_rerio
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	97.170	ENSDNOG00000005884	POLR2F	80	98.020	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	97.170	ENSDORG00000024789	Polr2f	80	98.020	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000015235	POLR2F	81	72.115	FBgn0003275	RpII18	79	72.115	Drosophila_melanogaster
ENSAPLG00000015235	POLR2F	57	78.873	ENSEBUG00000008509	polr2f	73	78.873	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000015235	POLR2F	73	71.429	ENSEBUG00000002842	-	87	65.000	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000015235	POLR2F	73	94.505	ENSEASG00005018802	-	82	94.505	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	94.340	ENSEEUG00000011014	POLR2F	79	95.050	Erinaceus_europaeus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	87.736	ENSELUG00000000319	polr2f	80	88.119	Esox_lucius
ENSAPLG00000015235	POLR2F	97	96.694	ENSFCAG00000002806	POLR2F	99	96.694	Felis_catus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	97.170	ENSFDAG00000009926	POLR2F	80	98.020	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000015235	POLR2F	90	87.500	ENSFHEG00000005448	polr2f	80	88.119	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	100	80.000	ENSGMOG00000009967	polr2f	79	84.158	Gadus_morhua
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	98.113	ENSGALG00000012291	POLR2F	80	99.010	Gallus_gallus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	100	83.200	ENSGAFG00000017573	polr2f	80	88.119	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000015235	POLR2F	100	80.800	ENSGACG00000007322	polr2f	80	87.129	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	98	96.721	ENSGAGG00000021757	POLR2F	80	99.010	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000015235	POLR2F	96	97.500	ENSGGOG00000005213	POLR2F	98	97.500	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	89.623	ENSHBUG00000022089	polr2f	80	90.099	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	97.170	ENSHGLG00000018942	POLR2F	80	98.020	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000015235	POLR2F	96	97.500	ENSHGLG00100012851	POLR2F	91	97.500	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	85.849	ENSHCOG00000006149	polr2f	80	86.139	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000015235	POLR2F	78	91.753	ENSIPUG00000000814	polr2f	100	91.753	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	97.170	ENSSTOG00000025722	POLR2F	80	98.020	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	97.170	ENSJJAG00000008097	Polr2f	80	98.020	Jaculus_jaculus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	89.623	ENSKMAG00000014230	polr2f	80	90.099	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	87.736	ENSLBEG00000008383	polr2f	84	88.119	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	92.453	ENSLACG00000003931	POLR2F	80	94.059	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	87.156	ENSLOCG00000011827	polr2f	78	88.119	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	97.170	ENSLAFG00000012632	POLR2F	80	98.020	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000015235	POLR2F	96	97.500	ENSMFAG00000033687	POLR2F	98	97.500	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000015235	POLR2F	96	97.500	ENSMMUG00000038231	POLR2F	98	97.500	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000015235	POLR2F	96	97.500	ENSMNEG00000044365	POLR2F	98	97.500	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000015235	POLR2F	96	97.500	ENSMLEG00000033077	POLR2F	98	97.500	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	89.623	ENSMAMG00000008056	polr2f	80	90.099	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	89.623	ENSMZEG00005005705	polr2f	80	90.099	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	98.113	ENSMGAG00000012504	POLR2F	80	99.010	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	97.170	ENSMAUG00000018586	Polr2f	80	98.020	Mesocricetus_auratus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	96	97.500	ENSMICG00000013128	POLR2F	98	97.500	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	97.170	ENSMOCG00000000237	Polr2f	80	98.020	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	89.623	ENSMMOG00000005106	polr2f	80	90.099	Mola_mola
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	97.170	ENSMODG00000019063	POLR2F	80	98.020	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	88.679	ENSMALG00000001444	polr2f	80	89.109	Monopterus_albus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	96.226	MGP_CAROLIEiJ_G0020006	Polr2f	80	97.030	Mus_caroli
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	96.226	ENSMUSG00000033020	Polr2f	87	96.471	Mus_musculus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	96.226	MGP_PahariEiJ_G0020008	Polr2f	80	97.030	Mus_pahari
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	96.226	MGP_SPRETEiJ_G0020904	Polr2f	80	97.030	Mus_spretus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	97.170	ENSMPUG00000012997	POLR2F	80	98.020	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000015235	POLR2F	98	86.885	ENSMLUG00000029612	-	78	91.837	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	91	94.828	ENSMLUG00000014315	-	90	94.828	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	97.170	ENSNGAG00000020682	Polr2f	80	98.020	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	88.679	ENSNBRG00000002492	polr2f	80	89.109	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000015235	POLR2F	96	97.500	ENSNLEG00000014987	-	98	97.500	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	97.170	ENSODEG00000014123	POLR2F	80	98.020	Octodon_degus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	88.679	ENSONIG00000008394	polr2f	80	89.109	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	98.113	ENSOANG00000014684	POLR2F	80	99.010	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	97.170	ENSOCUG00000012064	POLR2F	80	98.020	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	100	83.200	ENSORLG00000014580	polr2f	80	89.109	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000015235	POLR2F	100	84.000	ENSORLG00020006910	polr2f	80	90.099	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000015235	POLR2F	81	83.168	ENSORLG00015015332	polr2f	59	87.500	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000015235	POLR2F	65	83.951	ENSOMEG00000006530	polr2f	50	77.381	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	97.170	ENSOGAG00000025463	POLR2F	80	98.020	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	97.170	ENSOARG00000014692	POLR2F	80	98.020	Ovis_aries
ENSAPLG00000015235	POLR2F	96	97.500	ENSPPAG00000024276	POLR2F	98	97.500	Pan_paniscus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	97	96.694	ENSPPRG00000013030	POLR2F	99	96.694	Panthera_pardus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	97	94.215	ENSPTIG00000000632	POLR2F	99	94.215	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000015235	POLR2F	96	97.500	ENSPTRG00000014356	POLR2F	98	97.500	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000015235	POLR2F	96	97.500	ENSPANG00000023979	POLR2F	98	97.500	Papio_anubis
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	88.679	ENSPKIG00000002464	polr2f	80	89.109	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000015235	POLR2F	57	100.000	ENSPSIG00000013913	POLR2F	100	100.000	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	89.623	ENSPMGG00000009619	polr2f	80	90.099	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	97.170	ENSPEMG00000008322	Polr2f	80	98.020	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	97.170	ENSPCIG00000012000	-	80	98.020	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	100	84.000	ENSPFOG00000000139	polr2f	80	89.109	Poecilia_formosa
ENSAPLG00000015235	POLR2F	100	84.000	ENSPLAG00000000988	polr2f	80	89.109	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000015235	POLR2F	100	84.000	ENSPMEG00000019063	polr2f	80	89.109	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000015235	POLR2F	77	82.292	ENSPREG00000016749	polr2f	73	88.889	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	97.170	ENSPPYG00000011809	POLR2F	80	98.020	Pongo_abelii
ENSAPLG00000015235	POLR2F	96	97.500	ENSPCOG00000025716	POLR2F	98	97.500	Propithecus_coquereli
ENSAPLG00000015235	POLR2F	70	95.402	ENSPVAG00000010107	POLR2F	55	95.402	Pteropus_vampyrus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	89.623	ENSPNYG00000019790	polr2f	80	90.099	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	89.623	ENSPNAG00000009017	polr2f	80	90.099	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	96.226	ENSRNOG00000011214	Polr2f	80	97.030	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	96	97.500	ENSRBIG00000044878	POLR2F	98	97.500	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000015235	POLR2F	96	97.500	ENSRROG00000019586	POLR2F	98	97.500	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000015235	POLR2F	66	72.289	YPR187W	RPO26	54	72.289	Saccharomyces_cerevisiae
ENSAPLG00000015235	POLR2F	96	97.500	ENSSBOG00000023340	POLR2F	98	97.500	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	97.170	ENSSHAG00000008502	POLR2F	80	98.020	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	89.623	ENSSFOG00015012810	polr2f	80	90.099	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	88.679	ENSSMAG00000005354	polr2f	80	89.109	Scophthalmus_maximus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	89.623	ENSSDUG00000016273	polr2f	80	90.099	Seriola_dumerili
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	89.623	ENSSLDG00000024895	polr2f	80	90.099	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	98.113	ENSSPUG00000011343	POLR2F	80	99.010	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	89.623	ENSSPAG00000019646	polr2f	80	90.099	Stegastes_partitus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	96.226	ENSSSCG00000000116	POLR2F	80	97.030	Sus_scrofa
ENSAPLG00000015235	POLR2F	81	99.010	ENSTGUG00000010476	POLR2F	74	99.010	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000015235	POLR2F	70	98.864	ENSTGUG00000016504	-	100	98.864	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	88.679	ENSTRUG00000021130	polr2f	57	89.109	Takifugu_rubripes
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	89.623	ENSTNIG00000010827	polr2f	80	90.099	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPLG00000015235	POLR2F	70	95.402	ENSTTRG00000004817	POLR2F	55	95.402	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	97.170	ENSUAMG00000020504	POLR2F	80	98.020	Ursus_americanus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	97.170	ENSUMAG00000015052	POLR2F	80	98.020	Ursus_maritimus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	96	97.500	ENSVVUG00000024021	POLR2F	91	97.500	Vulpes_vulpes
ENSAPLG00000015235	POLR2F	85	92.453	ENSXETG00000006346	polr2f	80	94.059	Xenopus_tropicalis
ENSAPLG00000015235	POLR2F	100	84.000	ENSXCOG00000015983	polr2f	80	89.109	Xiphophorus_couchianus
ENSAPLG00000015235	POLR2F	100	84.000	ENSXMAG00000001559	polr2f	80	89.109	Xiphophorus_maculatus