EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000015430 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: RTCA
Alias: -
Full Name: RNA 3'-terminal phosphate cyclase
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 8693 bases
Position: chrKB743021.1:1856741-1865433
Accession: 101791727
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000015323	RTC	PF01137.21	7e-77	1	1
ENSAPLP00000015323	RTC_insert	PF05189.13	6.3e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000016118	RTCA-201	1645	XM_005018756	ENSAPLP00000015323	353 (aa)	XP_021127495	U3J746

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	80.508	ENSG00000137996	RTCA	96	80.508	Homo_sapiens
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	67.422	ENSAPOG00000001345	rtca	95	67.422	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000015430	RTCA	76	82.528	ENSAMEG00000008855	RTCA	100	82.528	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	66.572	ENSACIG00000019643	rtca	96	66.572	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	67.422	ENSAOCG00000014979	rtca	95	67.422	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	67.422	ENSAPEG00000006945	rtca	95	67.422	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	66.856	ENSATEG00000006315	rtca	96	66.856	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	79.944	ENSANAG00000025446	RTCA	96	79.944	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	66.856	ENSACLG00000020770	rtca	95	66.856	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	69.688	ENSAMXG00000043271	rtca	96	69.688	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	81.356	ENSBTAG00000006321	RTCA	96	81.356	Bos_taurus
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	79.944	ENSCJAG00000003398	RTCA	96	79.944	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	79.944	ENSCAFG00000020010	RTCA	65	79.944	Canis_familiaris
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	79.944	ENSCAFG00020011528	RTCA	55	79.944	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	81.073	ENSCHIG00000018937	RTCA	96	81.073	Capra_hircus
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	79.379	ENSTSYG00000011305	RTCA	96	79.379	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	79.096	ENSCCAG00000021844	RTCA	96	79.096	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	77.384	ENSCATG00000019364	RTCA	100	81.877	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000015430	RTCA	90	81.329	ENSCLAG00000006125	RTCA	100	81.329	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	80.508	ENSCSAG00000001509	RTCA	96	80.508	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	79.944	ENSCHOG00000005211	RTCA	96	79.944	Choloepus_hoffmanni
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	86.402	ENSCPBG00000026658	RTCA	96	86.402	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	51.275	ENSCING00000007875	-	96	51.275	Ciona_intestinalis
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	50.992	ENSCSAVG00000007269	-	96	50.992	Ciona_savignyi
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	80.226	ENSCANG00000040106	RTCA	96	80.226	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000015430	RTCA	76	81.413	ENSCGRG00001013163	Rtca	85	81.413	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	64.873	ENSCSEG00000000530	rtca	94	64.873	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	54.775	ENSCVAG00000021809	rtca	96	54.775	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	69.688	ENSDARG00000002215	rtca	96	69.688	Danio_rerio
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	79.661	ENSDNOG00000000456	RTCA	96	79.661	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	80.791	ENSDORG00000005448	Rtca	96	80.791	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000015430	RTCA	99	36.286	FBgn0025630	Rtca	95	36.286	Drosophila_melanogaster
ENSAPLG00000015430	RTCA	94	54.925	ENSEBUG00000008556	rtca	91	54.925	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	80.791	ENSEASG00005015926	RTCA	96	80.791	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	80.791	ENSECAG00000019831	RTCA	96	80.791	Equus_caballus
ENSAPLG00000015430	RTCA	91	70.659	ENSEEUG00000001165	RTCA	96	70.659	Erinaceus_europaeus
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	65.722	ENSELUG00000003741	rtca	96	65.722	Esox_lucius
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	80.226	ENSFCAG00000024460	RTCA	96	80.226	Felis_catus
ENSAPLG00000015430	RTCA	91	91.589	ENSFALG00000002443	RTCA	85	91.589	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	79.379	ENSFDAG00000012070	-	96	79.379	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000015430	RTCA	98	64.000	ENSFDAG00000016084	-	95	64.000	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000015430	RTCA	58	67.980	ENSFHEG00000002868	rtca	93	64.840	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	64.589	ENSGMOG00000013264	rtca	96	64.589	Gadus_morhua
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	93.201	ENSGALG00000005277	RTCA	96	93.201	Gallus_gallus
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	67.139	ENSGAFG00000011853	rtca	95	67.139	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	66.006	ENSGACG00000013497	rtca	96	66.006	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000015430	RTCA	80	85.053	ENSGAGG00000023306	RTCA	95	85.053	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	80.226	ENSGGOG00000009546	-	100	81.877	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	79.379	ENSGGOG00000044018	-	96	79.379	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	66.856	ENSHBUG00000002114	rtca	95	66.856	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	79.096	ENSHGLG00000002617	RTCA	96	79.096	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	79.096	ENSHGLG00100006056	RTCA	96	79.096	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	61.473	ENSHCOG00000020628	rtca	86	61.473	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	69.688	ENSIPUG00000024803	rtca	96	69.688	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000015430	RTCA	90	82.390	ENSSTOG00000013528	-	93	82.390	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000015430	RTCA	99	69.972	ENSSTOG00000033099	-	95	69.972	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	57.062	ENSJJAG00000016178	Rtca	95	57.062	Jaculus_jaculus
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	68.555	ENSKMAG00000006651	rtca	95	68.555	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000015430	RTCA	91	66.562	ENSLBEG00000002448	-	99	66.562	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	66.006	ENSLBEG00000028971	rtca	96	66.006	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	73.371	ENSLACG00000013666	RTCA	96	73.371	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	67.705	ENSLOCG00000000093	rtca	95	67.705	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	79.096	ENSLAFG00000001473	RTCA	96	79.096	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	80.508	ENSMFAG00000034132	RTCA	96	80.508	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	80.508	ENSMMUG00000019105	RTCA	96	80.508	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000015430	RTCA	87	82.201	ENSMNEG00000037163	RTCA	100	82.201	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	64.972	ENSMLEG00000042151	RTCA	95	64.972	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	68.839	ENSMAMG00000016536	rtca	96	68.839	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	66.856	ENSMZEG00005017945	rtca	95	66.856	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000015430	RTCA	90	97.170	ENSMGAG00000006892	RTCA	99	97.170	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	79.379	ENSMAUG00000008488	Rtca	96	79.379	Mesocricetus_auratus
ENSAPLG00000015430	RTCA	87	81.877	ENSMICG00000008643	RTCA	100	81.877	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	79.944	ENSMOCG00000016660	Rtca	96	79.944	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000015430	RTCA	87	68.506	ENSMMOG00000007750	rtca	100	68.506	Mola_mola
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	79.661	ENSMODG00000003557	RTCA	96	79.661	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	68.272	ENSMALG00000020844	rtca	96	68.272	Monopterus_albus
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	79.661	MGP_CAROLIEiJ_G0025565	Rtca	100	82.394	Mus_caroli
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	79.096	ENSMUSG00000000339	Rtca	100	82.394	Mus_musculus
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	79.944	MGP_PahariEiJ_G0027011	Rtca	100	83.099	Mus_pahari
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	79.379	MGP_SPRETEiJ_G0026515	Rtca	100	81.690	Mus_spretus
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	80.508	ENSMPUG00000012119	RTCA	96	80.508	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	77.684	ENSMLUG00000009922	RTCA	96	77.684	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	79.379	ENSNGAG00000011540	Rtca	96	79.379	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	66.856	ENSNBRG00000003062	rtca	95	66.856	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	80.226	ENSNLEG00000031426	RTCA	96	80.226	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000015430	RTCA	56	80.000	ENSMEUG00000010030	-	73	72.727	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000015430	RTCA	76	77.695	ENSOPRG00000012092	RTCA	71	77.695	Ochotona_princeps
ENSAPLG00000015430	RTCA	99	78.632	ENSODEG00000006990	RTCA	96	78.814	Octodon_degus
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	66.572	ENSONIG00000007753	rtca	95	66.572	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000015430	RTCA	90	82.334	ENSOANG00000012055	RTCA	98	82.334	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	80.226	ENSOCUG00000014247	RTCA	96	80.226	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	67.139	ENSORLG00000013605	rtca	96	67.139	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	67.139	ENSORLG00020001904	rtca	96	67.139	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	67.139	ENSORLG00015021064	rtca	96	67.139	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	68.272	ENSOMEG00000000756	rtca	96	68.272	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	71.751	ENSOGAG00000005627	RTCA	96	71.751	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000015430	RTCA	90	82.704	ENSOARG00000018122	RTCA	100	82.704	Ovis_aries
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	77.657	ENSPPAG00000035119	RTCA	100	82.201	Pan_paniscus
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	80.226	ENSPPRG00000000350	RTCA	96	80.226	Panthera_pardus
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	79.944	ENSPTIG00000012816	RTCA	96	79.944	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	77.112	ENSPTRG00000001004	RTCA	100	81.553	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	80.791	ENSPANG00000000346	RTCA	96	80.791	Papio_anubis
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	70.255	ENSPKIG00000001653	rtca	96	70.255	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	85.836	ENSPSIG00000011408	RTCA	96	85.836	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	79.944	ENSPEMG00000018582	Rtca	96	79.944	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	54.237	ENSPMAG00000009110	rtca	96	54.237	Petromyzon_marinus
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	80.508	ENSPCIG00000007684	RTCA	96	80.508	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	67.514	ENSPFOG00000004824	rtca	96	67.514	Poecilia_formosa
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	67.705	ENSPLAG00000011753	rtca	95	67.705	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	67.705	ENSPMEG00000020469	rtca	95	67.705	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	68.555	ENSPREG00000001365	rtca	95	68.555	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	79.944	ENSPPYG00000001115	RTCA	96	79.944	Pongo_abelii
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	76.836	ENSPCAG00000005076	RTCA	96	76.836	Procavia_capensis
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	80.226	ENSPCOG00000005603	RTCA	96	80.226	Propithecus_coquereli
ENSAPLG00000015430	RTCA	100	76.294	ENSPVAG00000009478	RTCA	96	76.294	Pteropus_vampyrus
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ENSAPLG00000015430	RTCA	100	69.972	ENSPNAG00000022270	rtca	96	69.972	Pygocentrus_nattereri
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