EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000015475 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: CHD5
Alias: -
Full Name: chromodomain helicase DNA binding protein 5
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 28388 bases
Position: chrKB742522.1:51161-79548
Accession: 101790395
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000015426	ResIII	PF04851.15	2.7e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000016223	CHD5-201	5670	XM_005011076	ENSAPLP00000015426	1890 (aa)	-	U3J7E9

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000015475's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000015475's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAPLG00000015475	CHD5	92	68.952	ENSAPLG00000014146	-	90	68.927

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	81.141	ENSG00000116254	CHD5	95	88.027	Homo_sapiens
ENSAPLG00000015475	CHD5	99	79.468	ENSAMEG00000009880	CHD5	96	79.821	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000015475	CHD5	95	74.932	ENSACIG00000012582	chd5	82	92.857	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000015475	CHD5	95	75.691	ENSAOCG00000020356	chd5	88	75.332	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	77.433	ENSACAG00000002441	CHD5	91	79.067	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000015475	CHD5	90	81.964	ENSANAG00000001078	CHD5	91	81.907	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000015475	CHD5	95	68.470	ENSACLG00000003012	chd5	88	77.080	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000015475	CHD5	85	84.553	ENSAMXG00000008921	chd5	94	82.869	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000015475	CHD5	94	82.337	ENSBTAG00000040477	CHD5	98	82.227	Bos_taurus
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	81.194	ENSCJAG00000000101	CHD5	94	81.141	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000015475	CHD5	94	82.057	ENSCAFG00000019545	CHD5	98	81.783	Canis_familiaris
ENSAPLG00000015475	CHD5	99	81.582	ENSCAFG00020008689	CHD5	91	81.857	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000015475	CHD5	99	80.188	ENSCHIG00000015027	CHD5	95	79.202	Capra_hircus
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	76.166	ENSTSYG00000033991	CHD5	95	76.158	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	82.053	ENSCAPG00000009294	CHD5	96	82.141	Cavia_aperea
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	82.053	ENSCPOG00000025080	CHD5	96	82.141	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	81.108	ENSCCAG00000024756	CHD5	94	80.844	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	81.108	ENSCATG00000043011	CHD5	94	80.844	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	82.229	ENSCLAG00000010589	CHD5	96	82.087	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	81.214	ENSCSAG00000000733	CHD5	94	80.897	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000015475	CHD5	94	84.603	ENSCPBG00000019363	CHD5	98	85.082	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	81.108	ENSCANG00000032302	CHD5	95	81.108	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000015475	CHD5	57	80.574	ENSCGRG00001011042	Chd5	100	80.389	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	81.412	ENSCGRG00000011341	Chd5	96	81.324	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000015475	CHD5	95	74.560	ENSDARG00000105083	chd5	95	77.086	Danio_rerio
ENSAPLG00000015475	CHD5	97	64.441	ENSDARG00000025789	chd4b	93	65.667	Danio_rerio
ENSAPLG00000015475	CHD5	93	80.287	ENSDNOG00000046342	CHD5	94	76.834	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	82.293	ENSDORG00000005923	Chd5	96	82.258	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000015475	CHD5	90	93.671	ENSEASG00005021464	CHD5	96	93.671	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000015475	CHD5	90	92.917	ENSECAG00000025043	CHD5	96	92.917	Equus_caballus
ENSAPLG00000015475	CHD5	76	96.571	ENSEEUG00000002772	CHD5	72	96.571	Erinaceus_europaeus
ENSAPLG00000015475	CHD5	88	82.745	ENSELUG00000010742	chd5	91	92.593	Esox_lucius
ENSAPLG00000015475	CHD5	99	79.969	ENSFCAG00000006319	CHD5	94	80.432	Felis_catus
ENSAPLG00000015475	CHD5	99	83.781	ENSFALG00000009740	CHD5	95	84.632	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	81.458	ENSFDAG00000012881	CHD5	96	79.937	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000015475	CHD5	99	85.707	ENSGALG00000000747	CHD5	95	86.385	Gallus_gallus
ENSAPLG00000015475	CHD5	58	75.249	ENSGACG00000004389	chd5	93	75.045	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000015475	CHD5	92	94.466	ENSGAGG00000001590	CHD5	99	95.455	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	81.141	ENSGGOG00000000708	CHD5	96	81.088	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000015475	CHD5	95	69.472	ENSHBUG00000013453	chd5	88	92.857	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	81.852	ENSHGLG00000018184	CHD5	97	80.391	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	78.190	ENSHGLG00100013261	CHD5	95	77.790	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000015475	CHD5	95	74.162	ENSIPUG00000005446	chd5	91	91.549	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	82.616	ENSSTOG00000002778	CHD5	96	82.419	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	81.745	ENSJJAG00000019072	Chd5	94	81.657	Jaculus_jaculus
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	76.490	ENSLOCG00000004944	chd5	94	75.825	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	81.650	ENSLAFG00000006348	CHD5	98	81.395	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	81.161	ENSMFAG00000033993	CHD5	98	82.102	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	82.616	ENSMMUG00000016838	CHD5	96	80.812	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	81.161	ENSMNEG00000040044	CHD5	94	80.844	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	78.288	ENSMLEG00000039166	CHD5	96	78.039	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000015475	CHD5	90	75.997	ENSMZEG00005000841	chd5	88	76.030	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	86.196	ENSMGAG00000001055	CHD5	95	86.407	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	78.534	ENSMICG00000017862	CHD5	94	83.986	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	81.368	ENSMOCG00000011049	Chd5	94	81.226	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000015475	CHD5	86	70.038	ENSMODG00000006294	CHD5	74	82.074	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000015475	CHD5	95	74.601	ENSMALG00000002831	chd5	94	73.041	Monopterus_albus
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	80.254	MGP_CAROLIEiJ_G0026857	Chd5	95	80.137	Mus_caroli
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	81.495	ENSMUSG00000005045	Chd5	94	81.354	Mus_musculus
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	81.466	MGP_PahariEiJ_G0029205	Chd5	94	81.378	Mus_pahari
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	81.627	MGP_SPRETEiJ_G0027850	Chd5	94	81.539	Mus_spretus
ENSAPLG00000015475	CHD5	99	78.059	ENSMPUG00000007122	CHD5	95	78.774	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	79.979	ENSNGAG00000019812	Chd5	92	79.926	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	79.103	ENSNLEG00000010320	CHD5	96	78.839	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000015475	CHD5	85	78.678	ENSOPRG00000004304	CHD5	82	78.323	Ochotona_princeps
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	82.078	ENSODEG00000010262	CHD5	96	81.872	Octodon_degus
ENSAPLG00000015475	CHD5	95	74.779	ENSONIG00000000619	chd5	91	74.393	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000015475	CHD5	87	82.358	ENSOANG00000001819	CHD5	84	81.570	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPLG00000015475	CHD5	95	81.937	ENSOGAG00000005703	CHD5	92	81.828	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000015475	CHD5	99	79.426	ENSOARG00000013425	CHD5	96	79.884	Ovis_aries
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	81.141	ENSPPAG00000034048	CHD5	96	81.141	Pan_paniscus
ENSAPLG00000015475	CHD5	99	79.343	ENSPPRG00000009453	CHD5	94	79.800	Panthera_pardus
ENSAPLG00000015475	CHD5	99	73.422	ENSPTIG00000013926	CHD5	96	74.015	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	81.141	ENSPTRG00000000075	CHD5	94	81.141	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	81.214	ENSPANG00000006765	CHD5	94	80.897	Papio_anubis
ENSAPLG00000015475	CHD5	91	82.812	ENSPKIG00000004282	chd5	89	92.627	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000015475	CHD5	95	77.137	ENSPSIG00000006414	CHD5	95	78.013	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000015475	CHD5	67	82.850	ENSPEMG00000014799	Chd5	97	82.799	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000015475	CHD5	99	83.059	ENSPCIG00000028310	CHD5	93	81.680	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000015475	CHD5	90	85.714	ENSPLAG00000005343	chd5	82	92.488	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000015475	CHD5	93	83.275	ENSPPYG00000001952	CHD5	96	83.275	Pongo_abelii
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	81.098	ENSPCOG00000022930	CHD5	94	81.013	Propithecus_coquereli
ENSAPLG00000015475	CHD5	95	73.202	ENSPNYG00000003183	chd5	95	73.068	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	80.000	ENSRNOG00000011268	Chd5	95	79.915	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	79.489	ENSRBIG00000032140	CHD5	97	80.327	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	81.161	ENSRROG00000041146	CHD5	94	81.108	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	77.603	ENSSBOG00000001955	CHD5	98	81.609	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	76.486	ENSSHAG00000018641	CHD5	98	76.223	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000015475	CHD5	90	87.554	ENSSFOG00015006296	chd5	87	92.991	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000015475	CHD5	88	81.467	ENSSDUG00000017526	chd5	92	92.523	Seriola_dumerili
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	75.940	ENSSPUG00000010622	CHD5	96	75.478	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	81.035	ENSSSCG00000003366	CHD5	98	82.082	Sus_scrofa
ENSAPLG00000015475	CHD5	94	84.337	ENSTGUG00000002634	-	100	83.289	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000015475	CHD5	55	73.359	ENSTNIG00000004346	chd5	100	73.720	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	81.170	ENSTTRG00000010468	CHD5	95	81.062	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000015475	CHD5	89	92.453	ENSUAMG00000024509	CHD5	95	92.453	Ursus_americanus
ENSAPLG00000015475	CHD5	97	79.514	ENSUMAG00000024173	CHD5	96	79.781	Ursus_maritimus
ENSAPLG00000015475	CHD5	91	92.308	ENSVVUG00000026480	CHD5	91	97.333	Vulpes_vulpes
ENSAPLG00000015475	CHD5	98	76.101	ENSXETG00000002904	chd5	98	75.897	Xenopus_tropicalis
ENSAPLG00000015475	CHD5	59	82.857	ENSXCOG00000014202	chd5	95	82.857	Xiphophorus_couchianus