EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000015490 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ACO1
Alias: -
Full Name: aconitase 1
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 25083 bases
Position: chrKB751155.1:135952-161034
Accession: 101789751
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000015419	Aconitase	PF00330.20	4.7e-181	1	1
ENSAPLP00000015417	Aconitase	PF00330.20	2.3e-176	1	1
ENSAPLP00000015419	Aconitase_C	PF00694.19	6.8e-47	1	1
ENSAPLP00000015417	Aconitase_C	PF00694.19	7e-47	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000016214	ACO1-201	3340	-	ENSAPLP00000015417	897 (aa)	-	U3J7E0
ENSAPLT00000016216	ACO1-202	3316	XM_005031259	ENSAPLP00000015419	889 (aa)	XP_005031316	R0J775

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
apla00020	Citrate cycle (TCA cycle)	KEGG
apla00630	Glyoxylate and dicarboxylate metabolism	KEGG
apla01100	Metabolic pathways	KEGG
apla01200	Carbon metabolism	KEGG
apla01210	2-Oxocarboxylic acid metabolism	KEGG
apla01230	Biosynthesis of amino acids	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	62.583	ENSAPLG00000016388	IREB2	91	62.583

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.725	ENSG00000122729	ACO1	99	87.725	Homo_sapiens
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	81.869	ENSAPOG00000008670	aco1	99	81.869	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.177	ENSAMEG00000003746	ACO1	99	87.177	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	81.757	ENSACIG00000014377	aco1	99	81.757	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	81.869	ENSAOCG00000007699	aco1	99	81.869	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	81.757	ENSAPEG00000014370	aco1	99	81.757	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000015490	ACO1	100	82.115	ENSATEG00000000560	aco1	99	82.115	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000015490	ACO1	96	86.635	ENSACAG00000001541	ACO1	99	86.635	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000015490	ACO1	100	85.939	ENSANAG00000003359	ACO1	100	85.939	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	81.532	ENSACLG00000007755	aco1	99	81.532	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	82.187	ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.187	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	88.501	ENSBTAG00000000555	ACO1	99	88.501	Bos_taurus
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.050	ENSCJAG00000007687	ACO1	99	87.050	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.457	ENSCAFG00000001786	ACO1	99	87.402	Canis_familiaris
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.500	ENSCAFG00020014553	ACO1	99	87.500	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	88.613	ENSCHIG00000007667	ACO1	99	88.613	Capra_hircus
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.275	ENSTSYG00000004179	ACO1	99	87.275	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	70.833	ENSCAPG00000007254	ACO1	99	70.721	Cavia_aperea
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.950	ENSCPOG00000003768	ACO1	99	87.950	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	86.824	ENSCCAG00000022465	ACO1	99	86.824	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.162	ENSCATG00000045333	ACO1	99	87.162	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	86.937	ENSCLAG00000002487	ACO1	99	86.937	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.162	ENSCSAG00000009824	ACO1	99	87.162	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000015490	ACO1	90	69.565	ENSCHOG00000008996	ACO1	90	69.565	Choloepus_hoffmanni
ENSAPLG00000015490	ACO1	100	88.526	ENSCPBG00000008077	ACO1	100	88.526	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.050	ENSCANG00000014847	ACO1	99	87.050	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.725	ENSCGRG00001024337	Aco1	99	87.725	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	86.937	ENSCGRG00000004877	-	99	86.937	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	78.692	ENSCSEG00000018262	aco1	99	78.692	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	75.874	ENSCVAG00000020264	aco1	99	75.874	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	82.658	ENSDARG00000026376	aco1	99	82.658	Danio_rerio
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.613	ENSDNOG00000003951	ACO1	99	87.613	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.387	ENSDORG00000014246	Aco1	99	87.387	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000015490	ACO1	86	65.957	ENSETEG00000012415	-	85	65.957	Echinops_telfairi
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	57.052	ENSEBUG00000015441	aco1	97	57.052	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.838	ENSEASG00005004602	ACO1	99	87.838	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.725	ENSECAG00000014846	ACO1	99	87.725	Equus_caballus
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	75.563	ENSEEUG00000015174	ACO1	99	75.563	Erinaceus_europaeus
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	80.293	ENSELUG00000016812	aco1	97	80.293	Esox_lucius
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.275	ENSFCAG00000001293	ACO1	99	87.275	Felis_catus
ENSAPLG00000015490	ACO1	100	96.288	ENSFALG00000001167	ACO1	100	96.288	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	86.937	ENSFDAG00000016058	ACO1	99	86.937	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	82.074	ENSFHEG00000005619	aco1	99	82.074	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	77.452	ENSGMOG00000005514	aco1	99	77.452	Gadus_morhua
ENSAPLG00000015490	ACO1	100	97.638	ENSGALG00000002162	ACO1	100	97.638	Gallus_gallus
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	81.828	ENSGACG00000001637	aco1	99	81.828	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000015490	ACO1	100	88.189	ENSGAGG00000023315	ACO1	100	88.189	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.838	ENSGGOG00000016306	ACO1	99	87.838	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	81.419	ENSHBUG00000008952	aco1	99	81.419	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.613	ENSHGLG00000018922	Aco1	99	87.613	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.613	ENSHGLG00100000149	Aco1	99	87.613	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	78.467	ENSHCOG00000015881	aco1	99	78.467	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	81.849	ENSIPUG00000020088	ACO1	99	81.849	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	88.176	ENSSTOG00000006942	ACO1	99	88.176	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.050	ENSJJAG00000013824	Aco1	99	87.050	Jaculus_jaculus
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	82.054	ENSKMAG00000015759	aco1	99	82.054	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	77.503	ENSLBEG00000013866	aco1	99	77.503	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000015490	ACO1	75	72.889	ENSLACG00000000936	ACO1	99	72.849	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	82.864	ENSLOCG00000011082	aco1	99	82.864	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	85.923	ENSLAFG00000013470	ACO1	99	85.923	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.275	ENSMFAG00000001702	ACO1	99	87.275	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.387	ENSMMUG00000008196	ACO1	99	87.387	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.275	ENSMNEG00000045040	ACO1	99	87.275	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.387	ENSMLEG00000005636	ACO1	99	87.387	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	82.658	ENSMAMG00000002915	aco1	99	82.658	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	77.828	ENSMZEG00005012733	aco1	99	77.492	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000015490	ACO1	100	79.487	ENSMGAG00000008851	ACO1	100	79.487	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.050	ENSMAUG00000021408	Aco1	99	87.050	Mesocricetus_auratus
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	86.712	ENSMICG00000006540	ACO1	99	86.712	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.613	ENSMOCG00000015393	Aco1	99	87.613	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	80.405	ENSMMOG00000020282	aco1	99	80.405	Mola_mola
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	86.599	ENSMODG00000004463	ACO1	99	86.599	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	82.658	ENSMALG00000019764	aco1	99	82.658	Monopterus_albus
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.500	MGP_CAROLIEiJ_G0025892	Aco1	99	87.500	Mus_caroli
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.387	ENSMUSG00000028405	Aco1	99	87.387	Mus_musculus
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.387	MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	99	87.387	Mus_pahari
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.387	MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	99	87.387	Mus_spretus
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	88.176	ENSMPUG00000004340	ACO1	99	88.176	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	85.473	ENSMLUG00000003029	ACO1	99	85.473	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.500	ENSNGAG00000005703	Aco1	99	87.500	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	64.206	ENSNBRG00000008973	aco1	99	64.094	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.387	ENSNLEG00000003409	ACO1	99	87.387	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000015490	ACO1	89	81.007	ENSMEUG00000014756	ACO1	89	81.007	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	83.446	ENSOPRG00000016791	ACO1	99	83.446	Ochotona_princeps
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	82.545	ENSODEG00000015432	-	99	82.095	Octodon_degus
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	85.360	ENSODEG00000001240	-	99	85.360	Octodon_degus
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	81.306	ENSONIG00000019869	aco1	99	81.306	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000015490	ACO1	81	87.673	ENSOANG00000012132	ACO1	99	87.673	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	85.412	ENSOCUG00000015960	ACO1	99	85.239	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000015490	ACO1	100	80.877	ENSORLG00000020656	aco1	99	80.877	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000015490	ACO1	100	81.102	ENSORLG00020010991	aco1	99	81.102	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000015490	ACO1	100	80.765	ENSORLG00015011785	aco1	99	80.765	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	79.435	ENSOMEG00000000660	aco1	99	79.435	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.387	ENSOGAG00000010522	ACO1	99	87.387	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	88.613	ENSOARG00000014707	ACO1	98	88.613	Ovis_aries
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.725	ENSPPAG00000033498	ACO1	99	87.725	Pan_paniscus
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.162	ENSPPRG00000009875	ACO1	99	87.162	Panthera_pardus
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.050	ENSPTIG00000016606	ACO1	98	87.050	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.725	ENSPTRG00000020843	ACO1	99	87.725	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.387	ENSPANG00000025270	ACO1	99	87.387	Papio_anubis
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	81.081	ENSPKIG00000023168	aco1	99	81.081	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000015490	ACO1	100	89.651	ENSPSIG00000008030	ACO1	100	89.651	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	82.074	ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.074	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.050	ENSPEMG00000018464	Aco1	99	87.050	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	86.246	ENSPCIG00000029321	ACO1	99	86.813	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	81.038	ENSPFOG00000013405	aco1	99	81.091	Poecilia_formosa
ENSAPLG00000015490	ACO1	90	82.080	ENSPLAG00000023422	aco1	97	82.080	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000015490	ACO1	90	82.000	ENSPMEG00000011800	aco1	98	82.000	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	81.285	ENSPREG00000021791	aco1	99	81.285	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.387	ENSPPYG00000019150	ACO1	95	87.387	Pongo_abelii
ENSAPLG00000015490	ACO1	78	88.679	ENSPCAG00000013222	ACO1	91	88.679	Procavia_capensis
ENSAPLG00000015490	ACO1	89	87.326	ENSPCOG00000021198	ACO1	99	87.326	Propithecus_coquereli
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