EuRBPDB

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000015674 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SBNO1
Alias: -
Full Name: strawberry notch homolog 1
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 23124 bases
Position: chrKB742840.1:1389952-1413075
Accession: 101801572
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000015631	ResIII	PF04851.15	9.3e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000016432	SBNO1-201	4176	XM_005016290	ENSAPLP00000015631	1391 (aa)	XP_012951926	U3J803

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAPLG00000015674	SBNO1	70	68.934	ENSAPLG00000007158	SBNO2	73	68.934

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	92.103	ENSG00000139697	SBNO1	100	92.098	Homo_sapiens
ENSAPLG00000015674	SBNO1	82	81.472	ENSAPOG00000003196	sbno1	96	81.498	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	91.768	ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	91.762	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	75.372	ENSACIG00000008088	sbno1	98	75.377	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	75.901	ENSAOCG00000014859	sbno1	97	75.771	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	75.901	ENSAPEG00000006069	sbno1	97	75.771	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	76.885	ENSATEG00000006667	sbno1	98	76.550	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	90.683	ENSACAG00000015441	SBNO1	88	90.683	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	91.750	ENSANAG00000029958	-	99	94.937	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	74.964	ENSACLG00000024913	sbno1	98	75.091	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	79.715	ENSAMXG00000019473	sbno1	98	80.102	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	91.960	ENSBTAG00000020505	SBNO1	98	92.387	Bos_taurus
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	91.750	ENSCJAG00000016599	SBNO1	100	91.744	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	91.905	ENSCAFG00000007503	SBNO1	97	95.635	Canis_familiaris
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	91.176	ENSCAFG00020015363	SBNO1	99	92.586	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	92.098	ENSCHIG00000008382	SBNO1	97	95.437	Capra_hircus
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	92.181	ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	92.175	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000015674	SBNO1	96	92.412	ENSCAPG00000000384	SBNO1	99	94.756	Cavia_aperea
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	91.810	ENSCPOG00000008109	SBNO1	99	94.756	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	87.455	ENSCCAG00000035316	SBNO1	100	87.446	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	90.432	ENSCATG00000008239	SBNO1	98	95.298	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	91.966	ENSCLAG00000008995	SBNO1	99	95.118	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000015674	SBNO1	83	93.788	ENSCSAG00000002064	SBNO1	100	93.696	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000015674	SBNO1	96	88.750	ENSCHOG00000008814	SBNO1	96	88.739	Choloepus_hoffmanni
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	95.758	ENSCPBG00000025968	SBNO1	99	95.758	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	87.097	ENSCANG00000042688	-	100	86.944	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	91.463	ENSCGRG00001017470	Sbno1	99	93.852	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	91.463	ENSCGRG00000004756	Sbno1	99	93.852	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	75.071	ENSCSEG00000011919	sbno1	98	75.662	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	75.653	ENSCVAG00000007038	sbno1	98	75.917	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	79.199	ENSDARG00000099080	sbno1	98	79.506	Danio_rerio
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	89.686	ENSDNOG00000017147	SBNO1	98	91.881	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	85.222	ENSDORG00000015261	Sbno1	84	91.622	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000015674	SBNO1	93	85.893	ENSETEG00000005620	SBNO1	93	85.893	Echinops_telfairi
ENSAPLG00000015674	SBNO1	75	62.639	ENSEBUG00000013823	sbno1	93	62.056	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000015674	SBNO1	51	88.277	ENSEASG00005012595	-	92	89.124	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	92.324	ENSECAG00000006127	SBNO1	100	92.319	Equus_caballus
ENSAPLG00000015674	SBNO1	83	92.308	ENSEEUG00000003793	SBNO1	83	92.308	Erinaceus_europaeus
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	78.224	ENSELUG00000002886	sbno1	98	78.320	Esox_lucius
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	92.247	ENSFCAG00000015331	SBNO1	99	92.241	Felis_catus
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	98.634	ENSFALG00000009273	SBNO1	100	98.634	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	90.302	ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	90.761	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	76.362	ENSFHEG00000007360	sbno1	98	76.496	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000015674	SBNO1	94	79.084	ENSGMOG00000018229	sbno1	98	79.163	Gadus_morhua
ENSAPLG00000015674	SBNO1	88	98.698	ENSGALG00000003392	SBNO1	99	98.698	Gallus_gallus
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	76.396	ENSGAFG00000003960	sbno1	98	76.509	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000015674	SBNO1	94	78.995	ENSGACG00000015633	sbno1	98	78.809	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	95.111	ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	97.649	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	92.032	ENSGGOG00000015000	SBNO1	99	95.298	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	69.379	ENSHBUG00000011910	sbno1	98	69.420	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	91.750	ENSHGLG00000014165	-	99	94.756	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000015674	SBNO1	91	85.573	ENSHCOG00000003246	sbno1	95	85.573	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	79.345	ENSIPUG00000015830	Sbno1	98	78.862	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	92.032	ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	94.937	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	92.181	ENSJJAG00000001741	Sbno1	100	91.960	Jaculus_jaculus
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	76.433	ENSKMAG00000009696	sbno1	98	76.525	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	76.251	ENSLBEG00000007623	sbno1	98	76.143	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	82.618	ENSLACG00000017227	SBNO1	99	85.008	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	82.361	ENSLOCG00000005725	sbno1	97	82.575	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	91.248	ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	91.170	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	92.253	ENSMFAG00000031429	SBNO1	100	92.032	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	92.319	ENSMMUG00000011496	SBNO1	100	92.098	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	90.603	ENSMLEG00000033260	SBNO1	99	95.298	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	76.815	ENSMAMG00000005473	sbno1	98	76.741	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	98.922	ENSMGAG00000003274	SBNO1	100	98.922	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000015674	SBNO1	50	87.822	ENSMAUG00000004834	-	100	88.252	Mesocricetus_auratus
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	91.248	ENSMICG00000006573	-	100	91.098	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000015674	SBNO1	95	94.604	ENSMOCG00000009390	Sbno1	99	94.575	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	72.837	ENSMMOG00000008691	sbno1	97	72.374	Mola_mola
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	93.314	ENSMODG00000012470	SBNO1	98	93.314	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	75.828	ENSMALG00000001056	sbno1	98	75.357	Monopterus_albus
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	91.954	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	95	97.368	Mus_caroli
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	91.739	ENSMUSG00000038095	Sbno1	94	97.368	Mus_musculus
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	91.942	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	95	97.368	Mus_pahari
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	91.739	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	95	97.368	Mus_spretus
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	92.324	ENSMPUG00000001658	SBNO1	100	92.319	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	91.822	ENSMLUG00000017159	SBNO1	100	91.816	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	92.181	ENSNGAG00000012620	Sbno1	98	95.464	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	74.839	ENSNBRG00000019189	sbno1	98	74.819	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	88.442	ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	89.614	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000015674	SBNO1	67	78.195	ENSMEUG00000008768	-	93	84.300	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	89.391	ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	89.383	Ochotona_princeps
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	91.960	ENSODEG00000009997	SBNO1	99	94.756	Octodon_degus
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	76.160	ENSONIG00000015348	sbno1	98	76.231	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000015674	SBNO1	98	91.028	ENSOCUG00000002441	SBNO1	93	92.125	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	75.634	ENSORLG00000001593	sbno1	99	75.163	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	75.687	ENSORLG00020015216	sbno1	98	75.430	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	75.828	ENSORLG00015002726	sbno1	98	75.501	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	75.760	ENSOMEG00000019313	sbno1	98	75.556	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000015674	SBNO1	50	84.957	ENSOGAG00000010781	-	100	85.817	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	91.894	ENSOARG00000004404	SBNO1	98	92.319	Ovis_aries
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	92.037	ENSPPAG00000024635	SBNO1	99	95.479	Pan_paniscus
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	92.247	ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	92.241	Panthera_pardus
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	91.679	ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	91.960	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	91.966	ENSPTRG00000005597	SBNO1	99	95.298	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	92.103	ENSPANG00000011640	SBNO1	99	95.298	Papio_anubis
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	81.272	ENSPKIG00000001441	sbno1	98	81.136	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	95.279	ENSPSIG00000009572	-	100	95.279	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000015674	SBNO1	92	91.058	ENSPSIG00000009256	-	100	90.747	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	91.248	ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	93.852	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	93.175	ENSPCIG00000010985	SBNO1	99	93.391	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	76.554	ENSPFOG00000005069	sbno1	98	76.741	Poecilia_formosa
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	76.483	ENSPLAG00000015015	sbno1	98	76.669	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	76.570	ENSPMEG00000021212	sbno1	98	76.758	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	76.147	ENSPREG00000017746	sbno1	98	76.327	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	91.888	ENSPPYG00000005084	SBNO1	100	91.882	Pongo_abelii
ENSAPLG00000015674	SBNO1	84	90.541	ENSPCAG00000008634	SBNO1	88	87.879	Procavia_capensis
ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	92.468	ENSPCOG00000024277	SBNO1	99	95.091	Propithecus_coquereli
ENSAPLG00000015674	SBNO1	87	94.643	ENSPVAG00000015304	SBNO1	87	94.643	Pteropus_vampyrus
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	76.479	ENSPNYG00000004291	sbno1	98	76.340	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	79.431	ENSPNAG00000015622	sbno1	98	79.550	Pygocentrus_nattereri
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ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	92.109	ENSRROG00000034230	SBNO1	99	95.298	Rhinopithecus_roxellana
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