EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000015740 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: REXO5
Alias: -
Full Name: RNA exonuclease 5
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 12872 bases
Position: chrKB743005.1:2388554-2401425
Accession: 101793397
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000015655	RRM_1	PF00076.22	1.7e-17	1	2
ENSAPLP00000015655	RRM_1	PF00076.22	1.7e-17	2	2
ENSAPLP00000015655	RNase_T	PF00929.24	5.8e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000016456	REXO5-201	2208	XM_005018498	ENSAPLP00000015655	736 (aa)	XP_005018555	U3J827

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
apla03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	49.668	ENSG00000005189	REXO5	97	66.667	Homo_sapiens
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	36.283	ENSAPOG00000008514	REXO5	93	36.283	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	49.933	ENSAMEG00000006178	REXO5	94	49.933	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	37.109	ENSAPEG00000010627	REXO5	93	37.109	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000015740	REXO5	78	39.446	ENSATEG00000004682	REXO5	97	38.856	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	51.897	ENSACAG00000009744	REXO5	93	51.897	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	48.059	ENSANAG00000034379	REXO5	94	48.059	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000015740	REXO5	81	37.403	ENSACLG00000004778	REXO5	99	37.403	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	49.330	ENSBTAG00000006449	REXO5	92	49.330	Bos_taurus
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	48.391	ENSCJAG00000009363	REXO5	93	52.482	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	49.534	ENSCAFG00000017924	REXO5	99	50.337	Canis_familiaris
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	48.725	ENSCAFG00020021846	REXO5	93	48.725	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	50.133	ENSCHIG00000022443	REXO5	93	50.133	Capra_hircus
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	46.144	ENSCPOG00000008940	REXO5	88	51.709	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	48.456	ENSCCAG00000034936	REXO5	93	48.456	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	49.534	ENSCATG00000044063	REXO5	94	49.534	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	47.270	ENSCLAG00000008033	REXO5	88	47.270	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	49.401	ENSCSAG00000007562	REXO5	94	49.401	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000015740	REXO5	72	58.442	ENSCHOG00000009146	-	72	58.442	Choloepus_hoffmanni
ENSAPLG00000015740	REXO5	100	69.689	ENSCPBG00000019062	REXO5	94	69.689	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	49.467	ENSCANG00000035776	REXO5	94	49.467	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	48.248	ENSCGRG00001016179	-	94	48.248	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	47.942	ENSCGRG00000010868	-	94	47.432	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	48.919	ENSEASG00005007266	REXO5	98	51.724	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	49.597	ENSECAG00000018769	REXO5	83	49.597	Equus_caballus
ENSAPLG00000015740	REXO5	88	56.936	ENSEEUG00000003572	REXO5	89	56.936	Erinaceus_europaeus
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	48.738	ENSFCAG00000015160	REXO5	94	48.738	Felis_catus
ENSAPLG00000015740	REXO5	100	82.201	ENSFALG00000014026	REXO5	99	82.201	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000015740	REXO5	97	33.761	ENSFHEG00000013388	REXO5	92	33.761	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000015740	REXO5	50	46.113	ENSGMOG00000003287	-	98	46.113	Gadus_morhua
ENSAPLG00000015740	REXO5	100	84.239	ENSGALG00000002239	REXO5	95	84.239	Gallus_gallus
ENSAPLG00000015740	REXO5	97	35.211	ENSGAFG00000011045	REXO5	91	35.211	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000015740	REXO5	50	44.444	ENSGACG00000019507	-	79	44.444	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000015740	REXO5	100	68.649	ENSGAGG00000008242	REXO5	94	68.649	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	49.535	ENSGGOG00000004539	REXO5	94	49.535	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000015740	REXO5	97	37.139	ENSHBUG00000017976	REXO5	92	37.139	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000015740	REXO5	92	45.481	ENSHGLG00000012652	REXO5	99	45.809	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	45.442	ENSHGLG00100013255	REXO5	100	47.134	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000015740	REXO5	67	41.532	ENSHCOG00000008648	REXO5	83	41.365	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000015740	REXO5	83	49.599	ENSSTOG00000007071	REXO5	88	49.599	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000015740	REXO5	98	47.268	ENSJJAG00000023821	-	93	47.268	Jaculus_jaculus
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	35.521	ENSKMAG00000009488	REXO5	93	35.521	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000015740	REXO5	97	35.509	ENSLBEG00000009276	REXO5	92	35.901	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000015740	REXO5	82	46.252	ENSLACG00000001758	REXO5	99	46.252	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	48.059	ENSLAFG00000006157	REXO5	94	48.059	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	49.534	ENSMFAG00000036613	REXO5	94	49.534	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	49.534	ENSMMUG00000016748	REXO5	94	49.534	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	49.534	ENSMNEG00000045028	REXO5	94	49.534	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	49.534	ENSMLEG00000029851	REXO5	94	49.534	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	34.699	ENSMAMG00000006915	REXO5	90	34.699	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000015740	REXO5	97	36.877	ENSMZEG00005013657	REXO5	92	36.877	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000015740	REXO5	100	83.832	ENSMGAG00000010369	REXO5	99	83.832	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	48.868	ENSMICG00000014886	REXO5	94	48.868	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000015740	REXO5	62	49.342	ENSMOCG00000010062	-	97	49.342	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	49.934	ENSMODG00000007059	REXO5	89	49.934	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	45.491	MGP_CAROLIEiJ_G0030385	-	93	45.491	Mus_caroli
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	45.442	ENSMUSG00000030924	Rexo5	98	47.957	Mus_musculus
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	45.357	MGP_SPRETEiJ_G0031499	-	93	45.357	Mus_spretus
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	49.333	ENSMPUG00000013643	REXO5	93	49.333	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	44.980	ENSNGAG00000002025	-	98	48.156	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000015740	REXO5	71	38.376	ENSNBRG00000006877	REXO5	83	38.321	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	49.001	ENSNLEG00000012334	REXO5	94	49.001	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	47.844	ENSMEUG00000015298	REXO5	99	47.844	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000015740	REXO5	87	58.586	ENSOPRG00000011398	REXO5	82	58.586	Ochotona_princeps
ENSAPLG00000015740	REXO5	97	35.938	ENSONIG00000000148	REXO5	98	42.142	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	49.603	ENSOANG00000014291	REXO5	100	49.603	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	49.266	ENSOCUG00000009913	REXO5	92	49.266	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000015740	REXO5	97	34.811	ENSORLG00000009738	REXO5	93	34.811	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000015740	REXO5	97	35.117	ENSORLG00020010270	REXO5	93	35.117	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000015740	REXO5	97	35.248	ENSORLG00015009678	REXO5	93	35.248	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000015740	REXO5	97	35.209	ENSOMEG00000019491	REXO5	92	35.209	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	47.803	ENSOGAG00000011564	REXO5	94	47.803	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	49.734	ENSOARG00000013401	REXO5	94	49.733	Ovis_aries
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	49.668	ENSPPAG00000035005	REXO5	94	49.668	Pan_paniscus
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	47.530	ENSPPRG00000022345	REXO5	93	47.410	Panthera_pardus
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	48.999	ENSPTIG00000012096	REXO5	94	48.871	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	49.668	ENSPTRG00000007851	REXO5	94	49.668	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	49.534	ENSPANG00000006898	REXO5	94	49.534	Papio_anubis
ENSAPLG00000015740	REXO5	97	39.124	ENSPKIG00000014406	REXO5	94	39.124	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000015740	REXO5	100	67.388	ENSPSIG00000012172	REXO5	94	67.388	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000015740	REXO5	94	59.948	ENSPCIG00000029238	-	94	51.120	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000015740	REXO5	97	32.349	ENSPFOG00000012767	REXO5	92	32.778	Poecilia_formosa
ENSAPLG00000015740	REXO5	97	32.221	ENSPLAG00000006408	REXO5	92	32.650	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000015740	REXO5	97	32.519	ENSPMEG00000007726	REXO5	92	32.908	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000015740	REXO5	96	33.504	ENSPREG00000000146	REXO5	92	33.504	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	49.202	ENSPPYG00000007163	REXO5	94	49.202	Pongo_abelii
ENSAPLG00000015740	REXO5	96	47.172	ENSPCAG00000006265	REXO5	99	47.172	Procavia_capensis
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	48.602	ENSPCOG00000018775	REXO5	94	48.602	Propithecus_coquereli
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	47.682	ENSPVAG00000003293	REXO5	99	47.682	Pteropus_vampyrus
ENSAPLG00000015740	REXO5	76	40.702	ENSPNYG00000006922	REXO5	81	38.971	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000015740	REXO5	97	36.785	ENSPNAG00000018866	-	92	36.785	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	45.845	ENSRNOG00000014513	Rexo5	94	45.845	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	49.198	ENSRBIG00000035163	REXO5	83	49.198	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	49.600	ENSRROG00000034741	REXO5	94	49.600	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	47.855	ENSSBOG00000029650	REXO5	99	46.719	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	51.788	ENSSHAG00000005042	REXO5	94	51.788	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000015740	REXO5	97	41.553	ENSSFOG00015007581	REXO5	93	41.553	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000015740	REXO5	97	35.425	ENSSMAG00000000709	REXO5	91	35.371	Scophthalmus_maximus
ENSAPLG00000015740	REXO5	97	35.355	ENSSDUG00000014528	REXO5	93	34.943	Seriola_dumerili
ENSAPLG00000015740	REXO5	98	34.655	ENSSLDG00000007641	REXO5	92	34.399	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	49.402	ENSSSCG00000007855	REXO5	93	49.402	Sus_scrofa
ENSAPLG00000015740	REXO5	100	82.065	ENSTGUG00000009219	REXO5	99	82.065	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	35.422	ENSTRUG00000015295	-	92	35.346	Takifugu_rubripes
ENSAPLG00000015740	REXO5	89	46.098	ENSTBEG00000008797	REXO5	84	46.098	Tupaia_belangeri
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	48.575	ENSTTRG00000016439	REXO5	93	48.583	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000015740	REXO5	92	47.323	ENSUAMG00000017756	REXO5	99	47.323	Ursus_americanus
ENSAPLG00000015740	REXO5	53	43.609	ENSUMAG00000010466	-	92	43.210	Ursus_maritimus
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	46.289	ENSVPAG00000003459	REXO5	93	46.289	Vicugna_pacos
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	49.534	ENSVVUG00000023257	REXO5	94	49.534	Vulpes_vulpes
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	46.225	ENSXETG00000016735	rexo5	98	46.225	Xenopus_tropicalis
ENSAPLG00000015740	REXO5	66	42.308	ENSXCOG00000015997	REXO5	57	42.308	Xiphophorus_couchianus
ENSAPLG00000015740	REXO5	99	33.417	ENSXMAG00000014770	REXO5	94	33.417	Xiphophorus_maculatus