EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000015761 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: POP5
Alias: -
Full Name: POP5 homolog%2C ribonuclease P/MRP subunit
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 930 bases
Position: chrKB744033.1:657865-658794
Accession: 101791672
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000015622	RNase_P_Rpp14	PF01900.19	1.2e-14	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000016423	POP5-201	324	XM_005026654	ENSAPLP00000015622	108 (aa)	XP_005026711	U3J7Z4

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000015761's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
apla03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG
apla03013	RNA transport	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000015761's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000015761	POP5	82	73.034	ENSG00000167272	POP5	55	73.034	Homo_sapiens
ENSAPLG00000015761	POP5	87	58.511	ENSAPOG00000023686	POP5	56	58.511	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000015761	POP5	98	68.868	ENSAMEG00000008503	POP5	51	75.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000015761	POP5	86	59.140	ENSACIG00000018362	pop5	56	59.140	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000015761	POP5	89	58.333	ENSAOCG00000001930	pop5	56	59.574	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000015761	POP5	89	58.333	ENSAPEG00000006795	pop5	56	59.574	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000015761	POP5	94	57.426	ENSATEG00000016792	pop5	57	61.053	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000015761	POP5	100	55.556	ENSACAG00000003091	POP5	57	60.638	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000015761	POP5	82	73.034	ENSANAG00000023744	POP5	55	73.034	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000015761	POP5	90	59.794	ENSACLG00000021131	-	56	60.638	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000015761	POP5	89	56.250	ENSAMXG00000038175	pop5	55	56.842	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000015761	POP5	96	71.154	ENSBTAG00000005385	POP5	52	75.281	Bos_taurus
ENSAPLG00000015761	POP5	82	74.157	ENSCJAG00000001309	POP5	55	74.157	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000015761	POP5	100	65.789	ENSCAFG00000010389	POP5	52	74.157	Canis_familiaris
ENSAPLG00000015761	POP5	100	65.789	ENSCAFG00020020663	POP5	52	74.157	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000015761	POP5	96	71.154	ENSCHIG00000016402	POP5	52	75.281	Capra_hircus
ENSAPLG00000015761	POP5	82	71.910	ENSTSYG00000027616	POP5	53	71.910	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000015761	POP5	94	66.667	ENSCAPG00000016873	POP5	77	70.115	Cavia_aperea
ENSAPLG00000015761	POP5	99	63.393	ENSCPOG00000012337	POP5	53	70.787	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000015761	POP5	82	71.910	ENSCCAG00000023154	POP5	55	71.910	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000015761	POP5	82	73.034	ENSCATG00000036825	POP5	55	73.034	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000015761	POP5	100	65.487	ENSCLAG00000007808	POP5	53	70.787	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000015761	POP5	82	73.034	ENSCSAG00000002246	POP5	55	73.034	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000015761	POP5	81	72.414	ENSCHOG00000013969	POP5	54	70.652	Choloepus_hoffmanni
ENSAPLG00000015761	POP5	98	72.477	ENSCPBG00000011331	POP5	55	76.344	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000015761	POP5	82	73.034	ENSCANG00000028001	POP5	55	73.034	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000015761	POP5	100	68.142	ENSCGRG00001017974	Pop5	53	75.281	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000015761	POP5	100	68.142	ENSCGRG00000010102	Pop5	53	75.281	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000015761	POP5	90	55.670	ENSCSEG00000008332	-	56	56.383	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000015761	POP5	77	60.241	ENSCSEG00000011103	pop5	55	60.241	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000015761	POP5	87	56.383	ENSDARG00000053452	pop5	56	56.383	Danio_rerio
ENSAPLG00000015761	POP5	82	70.787	ENSDNOG00000045952	-	55	69.149	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000015761	POP5	99	66.964	ENSDORG00000029401	Pop5	57	71.579	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000015761	POP5	96	63.303	ENSETEG00000009283	POP5	51	67.816	Echinops_telfairi
ENSAPLG00000015761	POP5	83	53.333	ENSEBUG00000016369	pop5	55	53.333	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000015761	POP5	82	73.034	ENSEASG00005004714	POP5	52	73.034	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000015761	POP5	82	73.034	ENSECAG00000010012	POP5	52	73.034	Equus_caballus
ENSAPLG00000015761	POP5	100	59.259	ENSELUG00000023394	pop5	58	62.766	Esox_lucius
ENSAPLG00000015761	POP5	100	65.789	ENSFCAG00000042614	POP5	52	74.157	Felis_catus
ENSAPLG00000015761	POP5	93	84.000	ENSFALG00000007537	POP5	56	84.043	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000015761	POP5	100	64.220	ENSFDAG00000009972	POP5	53	71.910	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000015761	POP5	96	57.692	ENSFHEG00000022341	pop5	57	61.702	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000015761	POP5	70	56.579	ENSGMOG00000001073	pop5	58	56.579	Gadus_morhua
ENSAPLG00000015761	POP5	87	59.574	ENSGAFG00000005937	-	56	59.574	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000015761	POP5	89	57.292	ENSGACG00000012710	-	58	57.895	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000015761	POP5	98	71.560	ENSGAGG00000016005	POP5	55	75.269	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000015761	POP5	82	73.034	ENSGGOG00000013505	POP5	55	73.034	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000015761	POP5	90	58.763	ENSHBUG00000011718	-	56	59.574	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000015761	POP5	99	65.179	ENSHGLG00000011786	POP5	53	71.910	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000015761	POP5	99	65.179	ENSHGLG00100014284	POP5	53	71.910	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000015761	POP5	89	56.250	ENSHCOG00000011809	pop5	58	57.447	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000015761	POP5	87	54.255	ENSIPUG00000003437	pop5	56	54.255	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000015761	POP5	100	64.602	ENSSTOG00000012577	POP5	53	70.787	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000015761	POP5	82	71.910	ENSJJAG00000001080	Pop5	55	70.213	Jaculus_jaculus
ENSAPLG00000015761	POP5	87	59.574	ENSKMAG00000011158	-	55	59.574	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000015761	POP5	97	54.286	ENSLBEG00000008652	pop5	52	56.842	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000015761	POP5	99	65.421	ENSLACG00000018188	POP5	59	71.277	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000015761	POP5	87	63.830	ENSLOCG00000002924	pop5	56	63.830	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000015761	POP5	99	65.741	ENSLAFG00000014545	POP5	55	72.340	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000015761	POP5	82	73.034	ENSMFAG00000045933	POP5	57	73.034	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000015761	POP5	82	73.034	ENSMMUG00000040120	POP5	55	73.034	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000015761	POP5	82	73.034	ENSMNEG00000041716	POP5	55	73.034	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000015761	POP5	82	74.157	ENSMLEG00000029377	POP5	55	74.157	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000015761	POP5	88	57.895	ENSMAMG00000002108	pop5	57	57.895	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000015761	POP5	90	58.763	ENSMZEG00005000069	-	56	59.574	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000015761	POP5	100	69.027	ENSMAUG00000019670	Pop5	53	76.404	Mesocricetus_auratus
ENSAPLG00000015761	POP5	100	65.789	ENSMICG00000008692	POP5	52	73.034	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000015761	POP5	91	66.327	ENSMOCG00000013322	Pop5	52	71.591	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000015761	POP5	88	61.053	ENSMMOG00000010471	pop5	58	61.053	Mola_mola
ENSAPLG00000015761	POP5	90	58.763	ENSMALG00000017797	-	56	60.638	Monopterus_albus
ENSAPLG00000015761	POP5	100	67.257	MGP_CAROLIEiJ_G0027618	Pop5	53	74.157	Mus_caroli
ENSAPLG00000015761	POP5	100	67.257	ENSMUSG00000060152	Pop5	53	74.157	Mus_musculus
ENSAPLG00000015761	POP5	100	66.372	MGP_PahariEiJ_G0024198	Pop5	53	73.034	Mus_pahari
ENSAPLG00000015761	POP5	100	67.257	MGP_SPRETEiJ_G0028616	Pop5	53	74.157	Mus_spretus
ENSAPLG00000015761	POP5	91	71.429	ENSMPUG00000003221	POP5	53	75.281	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000015761	POP5	82	73.034	ENSMLUG00000014657	POP5	53	73.864	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000015761	POP5	82	74.157	ENSNGAG00000002594	Pop5	52	74.157	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000015761	POP5	82	73.034	ENSNLEG00000015839	POP5	54	73.034	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000015761	POP5	100	70.370	ENSMEUG00000015288	POP5	57	73.118	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000015761	POP5	82	71.910	ENSOPRG00000004327	POP5	52	71.910	Ochotona_princeps
ENSAPLG00000015761	POP5	100	62.037	ENSODEG00000010351	-	59	68.182	Octodon_degus
ENSAPLG00000015761	POP5	82	69.663	ENSODEG00000006549	-	53	69.663	Octodon_degus
ENSAPLG00000015761	POP5	90	59.794	ENSONIG00000011172	pop5	56	60.638	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000015761	POP5	84	72.527	ENSOANG00000001792	-	82	73.118	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPLG00000015761	POP5	100	67.544	ENSOCUG00000006537	POP5	52	75.281	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000015761	POP5	100	49.550	ENSORLG00000014745	pop5	55	54.348	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000015761	POP5	100	50.000	ENSORLG00020001168	pop5	55	54.348	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000015761	POP5	100	48.214	ENSORLG00015013535	pop5	56	52.128	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000015761	POP5	100	52.679	ENSOMEG00000017643	pop5	57	57.895	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000015761	POP5	93	67.000	ENSOGAG00000008528	POP5	58	69.149	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000015761	POP5	96	70.192	ENSOARG00000012764	POP5	51	75.000	Ovis_aries
ENSAPLG00000015761	POP5	82	73.034	ENSPPAG00000043719	POP5	55	73.034	Pan_paniscus
ENSAPLG00000015761	POP5	100	65.789	ENSPPRG00000006474	POP5	52	74.157	Panthera_pardus
ENSAPLG00000015761	POP5	100	65.789	ENSPTIG00000012194	POP5	52	74.157	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000015761	POP5	82	73.034	ENSPTRG00000005543	POP5	55	73.034	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000015761	POP5	82	73.034	ENSPANG00000014166	POP5	55	73.034	Papio_anubis
ENSAPLG00000015761	POP5	87	59.574	ENSPKIG00000025154	pop5	57	59.574	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000015761	POP5	98	73.148	ENSPSIG00000013154	POP5	77	75.789	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000015761	POP5	100	50.893	ENSPMGG00000000812	-	58	53.684	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPLG00000015761	POP5	100	68.142	ENSPEMG00000017493	Pop5	53	75.281	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000015761	POP5	87	60.000	ENSPFOG00000013000	pop5	57	60.000	Poecilia_formosa
ENSAPLG00000015761	POP5	87	59.574	ENSPLAG00000014070	pop5	56	59.574	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000015761	POP5	87	59.574	ENSPMEG00000024039	pop5	56	59.574	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000015761	POP5	87	59.574	ENSPMEG00000012863	POP5	56	59.574	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000015761	POP5	87	59.574	ENSPREG00000020151	pop5	56	59.574	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000015761	POP5	82	73.034	ENSPCOG00000017618	POP5	52	73.034	Propithecus_coquereli
ENSAPLG00000015761	POP5	82	74.157	ENSPVAG00000002233	POP5	52	74.157	Pteropus_vampyrus
ENSAPLG00000015761	POP5	90	59.794	ENSPNYG00000002679	pop5	56	60.638	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000015761	POP5	85	51.087	ENSPNAG00000012662	pop5	52	51.087	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000015761	POP5	92	66.667	ENSRNOG00000001199	Pop5	53	71.910	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000015761	POP5	82	71.910	ENSRBIG00000043505	POP5	57	71.910	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000015761	POP5	82	71.910	ENSRROG00000045063	POP5	57	71.910	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000015761	POP5	82	73.034	ENSSBOG00000032691	POP5	61	72.289	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000015761	POP5	87	63.830	ENSSFOG00015005630	pop5	56	63.830	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000015761	POP5	87	57.292	ENSSMAG00000018868	pop5	57	57.292	Scophthalmus_maximus
ENSAPLG00000015761	POP5	97	58.095	ENSSDUG00000001282	-	57	62.105	Seriola_dumerili
ENSAPLG00000015761	POP5	99	56.250	ENSSLDG00000003801	-	57	62.105	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPLG00000015761	POP5	99	56.250	ENSSLDG00000017031	pop5	57	62.105	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPLG00000015761	POP5	86	73.118	ENSSPUG00000015531	POP5	56	73.118	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000015761	POP5	90	59.794	ENSSPAG00000015306	pop5	57	60.000	Stegastes_partitus
ENSAPLG00000015761	POP5	96	70.192	ENSSSCG00000009912	POP5	52	74.157	Sus_scrofa
ENSAPLG00000015761	POP5	100	81.481	ENSTGUG00000009602	POP5	57	84.043	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000015761	POP5	99	62.037	ENSTRUG00000016214	pop5	57	63.830	Takifugu_rubripes
ENSAPLG00000015761	POP5	81	60.227	ENSTNIG00000011465	pop5	52	60.227	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPLG00000015761	POP5	82	74.157	ENSTBEG00000010131	POP5	53	74.157	Tupaia_belangeri
ENSAPLG00000015761	POP5	100	67.544	ENSTTRG00000000153	POP5	52	74.157	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000015761	POP5	98	69.811	ENSUMAG00000006137	POP5	52	75.281	Ursus_maritimus
ENSAPLG00000015761	POP5	97	69.369	ENSVPAG00000010365	POP5	52	75.281	Vicugna_pacos
ENSAPLG00000015761	POP5	100	65.789	ENSVVUG00000021154	POP5	52	74.157	Vulpes_vulpes
ENSAPLG00000015761	POP5	87	68.085	ENSXETG00000031793	POP5	82	68.085	Xenopus_tropicalis